Entry information : CsaRboh01
Entry ID 16404
Creation 2020-03-24 (Baptiste Sarrette)
Last sequence changes 2020-04-07 (Baptiste Sarrette)
Sequence status N/D
Reviewer Not yet reviewed
Peroxidase information: CsaRboh01
Name CsaRboh01
Class Respiratory burst oxidase homolog    [Orthogroup: Rboh001]
Taxonomy Eukaryota Viridiplantae Streptophyta Cucurbitaceae Cucumis
Organism Cucumis sativus    [TaxId: 3659 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type
Inducer
Repressor
Best BLASTp hits
Perox score E-value CsaRboh01
start..stop
S start..stop
ClanRboh01 1815 0 1..926 1..926
CcolRboh 1796 0 1..926 1..926
DgloRboh01 1561 0 7..926 11..928
AgluRboh02 1498 0 11..926 15..931
Literature and cross-references CsaRboh01
Protein sequence: CsaRboh01
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   926
PWM (Da):   %s   104244.7  
PI (pH):   %s   9.57
Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
MRPHEPYSGN NSDAESVSSV RRGDRRAFSG PISSSTTKPR KNAKFDLSSS SSSLKAADDD DTYVEITLDI RDDSVAVHSV HTAGPGQDPN SLEDPELSLL AKRTLEKKSS SFRASVLRST  SSRIKQVSQE LKRFTSLNRR TSTRRFDRTK SAATHALKGM KFITAKTGGG GSSAGWAPVE KRFDELTAST NGLLPSSLFG QCIGMNKESK DFAGELFRAL ARRRNITGDS INKAQLKEFW  DQISDDSFDS RLQTFFDMVD TDADGRITEE EVEEIISMSA SANQLSTIQK QAKEYAALIM EELDPGNAGY IMIQNLETLL LQAPNQSVRV SDSRVLSQLL SQKLKPTNET NPIIRTYDKF  LYFVEDNWQR IWVLLLWLGI CAGLFAYKFI QYRNRAVFNV MGYCVSIAKG GAETLKFNMA LILLPVCRNT ITWLRNKTKL GVIVPFDDNL NFHKVIAVGI SVGVGLHAIA HLACDFPRLL  HATEEEYEPL KRFFGEEQPD NYWWFVKGVE GVTGIIMVVL MAIAFTLATP WFRRNKLKVP KPLKKLTGFN AFWYSHHLFV AVYTLLVVHG IYLYLTKEWY KKTTWMYLAV PVLLYGCERL  IRAFRSGIKP VKILKVAVYP GNVLALHMSK PHGFKYKSGQ YMFVNCRDVS PFEWHPFSIT SAPEDNYLSV HIRTLGDWTR KLKDVFSEVC QPPQAGKSGL LRAEFLQGGA PNPKFPKILI  DGPYGAPAQD YKKYDVVLLV GLGIGATPMV SIVKDIIDNI EEKESEANAV ENGQGHSSRG GSKHGKGFRT KKAYFYWVTR EQGSFEWFKG IMNEVAEMDE RGVIELHNYC TSVYEEGDAR 
SALITMLQSL HHAKNGVDVV SGTRVKSHFA KPNWRQVYKK ITLHHPDTKV GVFYCGTPVL TKELSQLASD FTRKTSTKFE FHKENF* 

Retrieve as FASTA  
Remarks Cucsat_evmmodelChr34029
CDS
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGAGACCCC ACGAACCTTA TTCCGGCAAC AATTCCGACG CCGAGAGCGT CAGTAGCGTC AGAAGGGGTG ACCGGAGAGC TTTCAGCGGT CCAATTTCTT CTTCCACTAC CAAGCCTAGG  AAGAATGCTA AATTCGACCT CTCTTCTTCT TCTTCCTCCC TCAAAGCCGC CGATGACGAC GACACCTATG TTGAAATCAC CCTTGATATC CGTGACGACT CTGTCGCCGT TCATAGCGTT  CATACCGCCG GTCCCGGTCA GGATCCCAAC TCTCTTGAAG ACCCTGAACT TTCCCTTCTC GCTAAACGAA CTCTCGAGAA GAAATCGTCC TCTTTCCGTG CCTCTGTTCT TCGTTCCACT  TCTTCCCGTA TCAAACAGGT CTCTCAAGAG CTTAAACGCT TCACCTCACT TAACCGCCGC ACCTCCACTC GCCGATTCGA CCGGACTAAA TCTGCTGCCA CCCATGCTCT CAAGGGGATG  AAGTTTATTA CTGCCAAAAC CGGCGGTGGT GGATCCTCCG CCGGTTGGGC TCCGGTTGAG AAGCGATTCG ATGAACTCAC CGCCTCTACC AACGGACTCC TCCCTTCTTC CTTGTTTGGA  CAGTGCATTG GAATGAACAA AGAATCGAAA GATTTCGCCG GTGAGCTTTT CCGTGCACTT GCTCGTAGGC GTAACATTAC TGGTGATTCC ATCAATAAAG CTCAACTTAA AGAGTTCTGG  GATCAGATCT CCGATGACAG CTTCGATTCC AGGCTACAAA CTTTCTTTGA CATGGTCGAT ACGGATGCTG ATGGAAGAAT CACAGAAGAA GAAGTGGAAG AGATTATTAG TATGAGTGCT  TCAGCTAACC AACTTTCCAC AATTCAAAAA CAAGCAAAAG AATACGCTGC CTTGATCATG GAAGAACTCG ACCCTGGAAA TGCTGGGTAC ATCATGATAC AAAATTTGGA AACCCTGTTA  CTACAAGCTC CAAATCAATC AGTAAGAGTG AGTGACAGCC GAGTTCTAAG TCAATTACTA AGCCAAAAAC TGAAGCCAAC AAACGAAACC AACCCCATCA TAAGAACATA CGACAAGTTC  CTGTACTTTG TAGAAGACAA TTGGCAGAGG ATTTGGGTTT TATTGCTCTG GCTCGGCATC TGCGCGGGTC TCTTCGCTTA CAAATTCATC CAATACCGTA ACAGAGCAGT GTTCAACGTC  ATGGGTTACT GTGTTTCCAT CGCTAAAGGA GGAGCAGAAA CTCTAAAATT CAACATGGCT CTAATTTTAC TCCCCGTTTG TCGTAACACC ATCACATGGC TTCGTAACAA AACCAAACTG  GGCGTCATCG TACCTTTCGA TGACAATCTG AATTTCCATA AAGTTATAGC AGTTGGAATT TCTGTTGGAG TGGGATTACA CGCAATTGCT CATTTGGCTT GCGATTTCCC TCGGCTTCTT  CACGCAACAG AGGAAGAATA TGAACCACTG AAGCGATTCT TTGGAGAGGA ACAGCCTGAT AATTATTGGT GGTTTGTTAA AGGAGTGGAA GGTGTTACAG GGATTATAAT GGTTGTATTA  ATGGCCATTG CTTTCACATT AGCCACTCCA TGGTTTAGAA GAAACAAACT CAAAGTACCC AAACCCTTGA AGAAACTCAC TGGCTTTAAT GCCTTTTGGT ACTCCCACCA TCTCTTCGTA  GCCGTCTACA CCCTCCTCGT CGTCCACGGT ATCTACCTCT ACCTGACCAA GGAATGGTAT AAGAAAACGA CGTGGATGTA TTTGGCTGTA CCAGTATTAC TTTACGGGTG CGAGAGATTG  ATAAGAGCAT TCAGATCAGG GATCAAGCCA GTGAAGATTC TTAAGGTGGC CGTTTATCCT GGAAACGTTC TGGCATTGCA CATGTCTAAG CCACATGGGT TCAAATACAA GAGTGGGCAG  TACATGTTTG TTAACTGCAG AGATGTTTCC CCATTCGAGT GGCATCCATT TTCAATTACT TCGGCTCCAG AAGATAATTA TTTGAGTGTT CATATTCGAA CACTTGGTGA TTGGACAAGG  AAACTTAAGG ATGTATTCTC AGAGGTTTGT CAGCCTCCTC AAGCTGGTAA AAGTGGACTT CTTAGAGCTG AATTTTTGCA AGGAGGAGCT CCTAATCCCA AGTTTCCAAA GATATTGATT  GACGGTCCAT ATGGGGCACC AGCACAAGAC TACAAAAAAT ACGACGTGGT ATTACTAGTG GGTTTGGGAA TTGGGGCGAC ACCGATGGTG AGTATAGTAA AAGACATAAT CGACAACATA  GAGGAGAAAG AATCAGAAGC AAATGCAGTA GAAAATGGGC AAGGGCATAG CAGTCGAGGA GGAAGCAAGC ACGGAAAAGG ATTCCGAACG AAAAAGGCAT ACTTTTACTG GGTGACAAGA  GAGCAAGGGT CATTCGAATG GTTTAAAGGG ATAATGAACG AGGTAGCAGA AATGGACGAG AGAGGGGTAA TCGAGCTGCA CAACTACTGC ACGAGCGTGT ACGAAGAAGG TGACGCTAGG  TCCGCATTAA TAACAATGCT TCAATCATTA CACCATGCTA AGAACGGAGT GGATGTGGTA TCAGGGACTA GGGTAAAGTC ACATTTTGCC AAGCCAAATT GGAGGCAAGT TTATAAAAAG  ATTACCCTCC ATCATCCAGA TACAAAAGTT GGTGTGTTTT ACTGTGGAAC ACCAGTACTT ACAAAGGAGC TTAGTCAATT GGCATCTGAT TTCACTCGTA AAACATCAAC TAAGTTTGAG 
TTTCATAAAG AGAATTTCTA G 

Retrieve as FASTA