Entry information : CsaRboh03
Entry ID 16406
Creation 2020-03-24 (Baptiste Sarrette)
Last sequence changes 2020-04-07 (Baptiste Sarrette)
Sequence status N/D
Reviewer Not yet reviewed
Peroxidase information: CsaRboh03
Name CsaRboh03
Class Respiratory burst oxidase homolog    [Orthogroup: Rboh001]
Taxonomy Eukaryota Viridiplantae Streptophyta Cucurbitaceae Cucumis
Organism Cucumis sativus    [TaxId: 3659 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type
Inducer
Repressor
Best BLASTp hits
Perox score E-value CsaRboh03
start..stop
S start..stop
ClanRboh03 1870 0 1..935 1..934
CcaRboh05 1660 0 1..935 1..945
CcaRboh01 1660 0 1..935 1..945
CsRboh01 1652 0 1..935 1..946
Literature and cross-references CsaRboh03
Protein sequence: CsaRboh03
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   935
PWM (Da):   %s   106727.98  
PI (pH):   %s   9.5
Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
MRAAPKHERR WASDSVPGNA NIMSSGLSSP GTESSAAEEF VEVTLDLQDD DRIILRSVEP ATVINVDNAV SVGSETPKSA SISRSQTFRR SSSSLLRQFS QELKAEAVAK ARQFSQELKA  ELKRFSWSHG HSSGGGNGFD SALAARALRR RQAQLDRTRS GAHKALRGLR FISSKSNGVD AWNEIQSNFD KLAKDGFLYR SDFAQCIGMK DSKEFALELF DALSRRRRLK VEKISKEELF  EFWSQITDQS FDSRLQIFFD MVDKNEDGRI TEEEVKEIIM LSASANKLSR LKEQAEEYAA LIMEELDPER LGYIELWQLE TLLLQKDTYL NYSQALSYTS QALSQNIQGL RNKGPITRIR  TKLLYYLQEN WRRIWVLTLW IMILVGLFTW KFFQYKHKQA YKVMGYCLLT AKGAAETLKF NMAIILLPVC RNTITWIRST RLGFFVPFDD NINFHKTIAA AIVVGVILHV GNHLACDFPR  LVQSSDENYN YVTDYFGPDK PTYLDLVKGW EGVTGILMVI LMTVAFTLAT RWFRRSLIKL PKPFDRLTGF NAFWYSHHLF FIVYVLLVIH GVYLYLEHRW YRKTTWMYLA VPILLYAGER  TLRFFRSGFY SVRLLKVAIY PGNVLALQMS KPPQFRYKSG QYMFVQCPAV SPFEWHPFSI TSAPGDDYLS VHIRQLGDWT QELKRVFAEA CEPPVAGKSG LLRADETTKK CLPKLLIDGP  YGAPAQDYRN YDVLLLVGLG IGATPFISIL KDLLNNIVKM EEQADSIADG GKESDLSFGS TDSSSSARVS PKRKKILKTT NAYFYWVTRE QGSFDWFKGV MNEVAEMDQR GVIEMHNYLT 
SVYEEGDARS ALITMVQALN HAKNGMDIVS GTRVRTHFAR PNWKKVFSRI CSKHCSAKIG VFYCGAPILA KELSNLCYEF NQKGPTKFHF HKEHF* 

Retrieve as FASTA  
Remarks Cucsat_evmmodelChr5492
CDS
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGAGAGCGG CGCCGAAGCA CGAACGGCGC TGGGCGTCCG ATTCGGTTCC TGGAAATGCC AATATTATGA GCTCAGGATT ATCATCTCCA GGAACAGAAT CCAGTGCGGC GGAGGAGTTT  GTTGAGGTTA CTCTTGATCT ACAGGATGAC GATAGAATCA TTTTGCGGAG TGTTGAGCCG GCTACGGTTA TTAACGTTGA TAACGCTGTT TCTGTTGGAT CTGAAACTCC TAAGTCTGCT  TCGATTTCGA GATCGCAGAC GTTTAGACGG AGTTCGTCTA GTCTGTTGCG GCAATTTTCG CAGGAATTGA AAGCGGAAGC GGTTGCTAAA GCTAGGCAGT TCTCGCAGGA GTTGAAGGCT  GAGTTGAAGC GGTTTTCGTG GAGTCATGGA CATTCTTCTG GTGGTGGAAA TGGATTTGAC TCCGCCTTGG CTGCTCGAGC TTTGAGGAGG CGACAAGCTC AGCTTGATCG CACTCGTTCT  GGTGCTCATA AAGCGCTTCG CGGCCTGAGA TTCATTAGTA GCAAGAGCAA TGGCGTTGAT GCTTGGAACG AAATACAGAG CAACTTCGAT AAGCTCGCCA AGGATGGATT CCTCTACCGC  TCCGATTTCG CACAATGTAT AGGAATGAAA GATTCGAAGG AATTTGCTCT GGAACTGTTC GATGCTTTGA GTCGAAGACG GAGATTGAAG GTCGAGAAAA TCAGTAAAGA AGAGCTGTTC  GAGTTCTGGT CACAAATCAC CGATCAAAGT TTCGATTCGC GGCTGCAGAT CTTCTTCGAC ATGGTCGACA AAAACGAAGA CGGACGAATT ACCGAAGAAG AAGTGAAAGA GATTATTATG  CTGAGTGCTT CCGCAAACAA GCTATCGAGG TTGAAGGAAC AGGCAGAGGA ATATGCGGCT CTCATTATGG AGGAGTTGGA CCCTGAAAGG CTCGGCTACA TTGAGCTGTG GCAATTGGAA  ACCCTTTTGC TACAAAAGGA TACGTATCTG AACTACAGTC AAGCCCTCAG CTATACCAGC CAAGCATTGA GCCAGAACAT ACAGGGACTA AGGAACAAAG GCCCCATAAC AAGGATAAGA  ACAAAACTGC TCTACTATTT GCAGGAGAAT TGGAGGAGAA TATGGGTGCT GACGTTATGG ATCATGATAT TGGTTGGGCT TTTCACGTGG AAGTTCTTCC AGTACAAGCA TAAGCAAGCC  TACAAGGTCA TGGGTTACTG TCTCCTAACG GCTAAGGGTG CGGCTGAGAC CCTGAAGTTC AACATGGCTA TCATTTTGCT GCCCGTATGT AGAAATACCA TCACCTGGAT AAGGTCGACC  AGGCTGGGAT TTTTTGTACC ATTCGACGAC AATATCAATT TTCATAAGAC GATTGCGGCA GCTATTGTAG TTGGCGTCAT TCTCCATGTA GGGAACCACC TTGCCTGTGA TTTTCCAAGA  CTCGTACAGT CATCAGATGA AAACTATAAT TATGTGACGG ATTACTTCGG ACCAGACAAG CCTACCTACC TAGACTTGGT TAAGGGATGG GAAGGTGTGA CTGGTATACT AATGGTCATC  TTGATGACAG TAGCATTCAC TCTAGCTACC CGATGGTTCA GGAGGAGCCT GATTAAGCTG CCCAAGCCGT TTGATAGGCT GACGGGTTTC AATGCCTTCT GGTATTCACA CCACCTGTTT  TTCATTGTTT ACGTCTTACT CGTCATCCAT GGCGTATACC TCTACCTCGA ACACAGATGG TACCGTAAGA CGACTTGGAT GTATCTGGCC GTCCCAATTT TACTATATGC TGGGGAAAGG  ACCCTTAGAT TCTTCCGCTC AGGATTTTAC AGTGTTCGAC TCCTCAAGGT TGCTATTTAC CCGGGGAATG TTCTTGCATT ACAAATGTCT AAACCTCCTC AGTTCCGTTA TAAGAGTGGG  CAGTACATGT TTGTCCAATG CCCCGCTGTC TCTCCATTTG AATGGCATCC GTTTTCGATT ACTTCTGCTC CAGGGGATGA CTATCTGAGT GTTCACATAC GGCAGCTGGG TGATTGGACA  CAAGAGTTAA AGAGGGTATT TGCTGAAGCT TGTGAGCCAC CAGTTGCTGG GAAGAGTGGG TTGCTCAGGG CTGATGAAAC GACCAAAAAA TGTTTGCCCA AGCTCTTAAT AGATGGACCT  TATGGTGCAC CTGCACAAGA CTACAGAAAT TATGATGTTC TATTACTTGT TGGTCTTGGT ATTGGAGCAA CACCTTTCAT TAGCATTTTG AAGGATTTGC TTAACAACAT TGTCAAAATG  GAGGAGCAGG CAGATTCAAT AGCAGATGGG GGTAAAGAGT CAGATCTTAG TTTTGGAAGC ACGGATTCTT CCTCGTCTGC CAGGGTTTCT CCCAAGCGAA AGAAGATTCT GAAGACAACT  AATGCTTACT TTTACTGGGT AACTAGGGAG CAGGGATCGT TTGACTGGTT CAAAGGGGTC ATGAATGAAG TCGCTGAGAT GGATCAAAGG GGTGTCATTG AGATGCACAA CTACCTAACC  AGTGTGTACG AGGAAGGAGA CGCTAGATCA GCCCTCATTA CGATGGTCCA AGCACTAAAT CATGCAAAAA ATGGAATGGA TATTGTTTCT GGCACCAGGG TAAGAACTCA TTTTGCAAGG  CCCAACTGGA AGAAAGTTTT CTCCAGAATT TGTTCGAAGC ATTGTAGTGC CAAAATCGGA GTATTCTACT GTGGAGCACC AATTCTTGCA AAAGAACTTA GCAACCTTTG CTATGAATTC 
AATCAAAAGG GCCCAACTAA GTTCCATTTT CACAAAGAAC ATTTCTGA 

Retrieve as FASTA