Entry information : CsaRboh04(Cucsa.107010/ Cucsat_evmmodelChr4594)
Entry ID 16407
Creation 2020-03-24 (Baptiste Sarrette)
Last sequence changes 2020-04-07 (Christophe Dunand)
Sequence status complete
Reviewer Not yet reviewed
Last annotation changes 2020-06-01 (Christophe Dunand)
Peroxidase information: CsaRboh04(Cucsa.107010/ Cucsat_evmmodelChr4594)
Name CsaRboh04(Cucsa.107010/ Cucsat_evmmodelChr4594)
Class Respiratory burst oxidase homolog    [Orthogroup: Rboh001]
Taxonomy Eukaryota Viridiplantae Streptophyta Cucurbitaceae Cucumis
Organism Cucumis sativus    [TaxId: 3659 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type N/D
Inducer N/D
Repressor N/D
Best BLASTp hits
Perox score E-value CsaRboh04
start..stop
S start..stop
ClanRboh07 1768 0 1..947 1..949
CclRboh01 1515 0 1..947 1..946
CsRboh01 1513 0 1..947 1..946
DgloRboh04 1511 0 1..947 1..948
Literature and cross-references CsaRboh04(Cucsa.107010/ Cucsat_evmmodelChr4594)
Protein sequence: CsaRboh04(Cucsa.107010/ Cucsat_evmmodelChr4594)
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   947
PWM (Da):   %s   108099.5  
PI (pH):   %s   8.98
Sequence
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QRGLIEMHNY LTSVYEEGDA RSTLITMVQA LNHAKNGVDI VSGTRVRTHF ARPNWKKVLS KITSKHCGAR IGVFYCGAPV LAKELGELCH EINQKGSAKL DFHKEHF* 

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Remarks Incorrect prediction from Phytozome
DNA
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ATGACCACGA CTCCAGAGCA GGAGTGCCGA TGGGGATCGG ACGATATTAC ACAGCTTGAC ACGATGATTT TCGGATCACA GTTCAGCAAC CTGACGGAGG AGTTTGTGGA GGTGACGCTT  GATGTACAAG AAAACAACAC GGTTGTGCTT CGAAGTGTTG AACCAGCCAC TATAATCAAT ATCGACGATG GCGTCTCCGG TGGTTCTGCA ACGCCGGCCT TAACTTCCCC TTCGACTTCT  AGATCTACCT CGGTTAAGCG GAGTTCTTCG CATCGGTTTC GGCAGTTCTC TCATGAACTC AAGGTGGAAG CCAGAGCTAA GGCGAAGCAT TTCTCTCACG AATTGAAGAC CGAATTGAGG  AAATTCTCAT GGAGCCGGAG CCATGTGTCG AAAGCATTCC CCGCGTCATC TTCAACCGTG AACTCGAACG GTGGTGTTGG AGCAGAGCAA AACGGAATGG ATTCGGCATT AGCTGCTAGA  GATTTGAGAA GGCAACGAGC AAAGCTTGAT CGAACTCGTT CCGGGGCCGA GAAGGCTTTA TATGGATTAA GATTCATAAG CAAAAAAAAC AAAACGACTG GCGTCGATTC GTATAGTGAA  CTTGAGAGCA ATTTCAATAA GCTTGCCAAG GACGGATTTC TCAGCCGCGC CGATTTCGCG CAATGCATAG GTATAAACTA TAAACTTGGC CGTCAACACA GCTACTAATA ATTTCAGTAT  ATATTTTGGA GAAAATTTCA ATTGATTTCG TTTTTTTTTT TTTTTGGTTT TTGATTTGAA TTAAAGGAAT GAAAGATTCA AAAGAGTTTG CTCTGGAGTT GTTCGATGCT CTAAGTCGGA  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CDS
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TTGGCCAAAG AACTTGGTGA GCTCTGCCAT GAGATTAACC AAAAGGGTTC AGCAAAGTTA GATTTTCATA AGGAGCATTT TTAA 

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cDNA
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TTGGCCAAAG AACTTGGTGA GCTCTGCCAT GAGATTAACC AAAAGGGTTC AGCAAAGTTA GATTTTCATA AGGAGCATTT TTAA 

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