Entry information : CsaRboh05
Entry ID 16408
Creation 2020-03-24 (Baptiste Sarrette)
Last sequence changes 2020-04-07 (Baptiste Sarrette)
Sequence status N/D
Reviewer Not yet reviewed
Peroxidase information: CsaRboh05
Name CsaRboh05
Class Respiratory burst oxidase homolog    [Orthogroup: Rboh001]
Taxonomy Eukaryota Viridiplantae Streptophyta Cucurbitaceae Cucumis
Organism Cucumis sativus    [TaxId: 3659 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type
Inducer
Repressor
Best BLASTp hits
Perox score E-value CsaRboh05
start..stop
S start..stop
ClanRboh04 1708 0 1..925 1..936
DgloRboh05 1359 0 1..925 1..927
VvRboh07 1305 0 14..925 8..917
DtriRboh04 1295 0 14..925 9..950
Literature and cross-references CsaRboh05
Protein sequence: CsaRboh05
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   925
PWM (Da):   %s   105619.14  
PI (pH):   %s   9.07
Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
MTRSWSSFAL PNSNNSRRST YTRRLPDDHG DHDLLHHHDH DPQGMLPIFL NDLVNHQDFV EVTLEVEDDS VLVRSIAPVA PSSDLQDDAA LSITARIRNK FPWLRSASSR ASTASSLDRD  DTAQVPMSAR DARRLNAQLQ RTRSRAQAAL RGLRFISKTT NASDANELWQ RVHSRFHSLA QAGLLARDDF AECIGMVDSK EFALRIFDAL ARRKGLRISK INIEELHEFW LKISDQSFDA  RLQIFFDMAD SNEDGRITRE EVQELILLSA SANNLSKLKE RAEEYASLIM EELDPENLGY IELWQLETLL LQRDTYMNYS RPLSTATSVG WSQNLSSFNP KHIIKSATTT FNSVIFQNWQ  RIWILFLWAS TMAALFTWKF LQYKNKAAFD IMGYCLPTAK GAAETLKLNM ALILLPVCRN TLTWLRSTAA RSLVPFDDNI NFHKLIACFI AIGIAVHGGV HLACDFPRLA NSSAEEFEVI  SSDFHNKKPN YKELLMSVEG VTGVVMVILM GISFTLATRR FRRNVVRLPW LFNRLAGFNA FWYSHHLMGF VYLLLLVHGT FLFLAHNWTQ KTTWVYISFP LLLYLGERSL RACRSEYYSV  EILKVSVLPG NVFSLVMLKP RGFKYISGQY IFLQCPSISQ FEWHPFSITS APGDEYLSVH IRTVGDWTRE LKRVFTDHVN SRPLLGRAKL GHLVNMERKS QPRLLVDGPY GAPAQDYQNY  DVLLLVGLGI GATPFVSILK DLLNNSRTNE DQQTPAESTT TETSRSEDSF GSLNTSTPSG KRKLQSRTQA QAYFYWVTRE ASSLEWFKGV MDEVAEMDKK GQIELHNYLT SVYEESDARS 
TLITMVQALN HAKHGVDILS GTRARTHFAR PEWKEVFGRI ASKHAYKTVG VFYCGMPMLA KQLRRLSQQF TLKTTTRFEF HKEYF* 

Retrieve as FASTA  
Remarks Cucsat_evmmodelChr51838
CDS
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGACAAGGT CTTGGTCCTC TTTTGCCCTT CCCAACTCCA ACAACTCTCG CCGTTCCACC TACACTCGTC GACTTCCCGA CGACCACGGA GACCACGATC TCCTCCACCA TCATGATCAT  GATCCTCAAG GAATGTTGCC TATCTTCTTG AATGACCTTG TTAATCACCA AGACTTTGTC GAGGTCACTT TGGAAGTTGA GGATGATTCT GTTTTGGTTC GCAGCATTGC TCCTGTTGCT  CCCTCCTCTG ACCTTCAAGA TGACGCCGCT CTTTCCATCA CTGCTAGAAT TCGTAACAAA TTCCCTTGGC TTCGGTCTGC CTCTTCTCGT GCCTCCACTG CCTCCTCTCT CGACAGGGAC  GACACTGCGC AGGTACCCAT GTCTGCTCGT GACGCTCGCC GCCTTAATGC TCAGCTGCAA CGTACCCGAT CTAGAGCTCA AGCTGCCCTT CGAGGCCTTA GATTCATTAG CAAGACCACC  AATGCCTCTG ATGCTAACGA GCTCTGGCAA CGAGTCCACT CAAGGTTTCA TTCTCTGGCT CAAGCTGGAC TGCTTGCTAG AGATGATTTT GCTGAATGCA TTGGAATGGT GGATTCAAAG  GAATTTGCGC TGAGAATATT CGACGCGTTA GCAAGAAGAA AAGGATTGAG GATTTCCAAA ATCAACATAG AGGAACTCCA TGAATTTTGG TTGAAGATTT CGGACCAAAG CTTCGATGCT  CGACTCCAAA TCTTCTTTGA CATGGCCGAC AGTAATGAAG ATGGCCGAAT CACAAGAGAA GAAGTACAGG AGCTGATCTT GCTAAGTGCT TCTGCAAACA ATCTTTCGAA ACTCAAAGAG  CGAGCTGAGG AGTACGCTTC CTTGATCATG GAAGAACTCG ACCCTGAAAA CCTCGGATAC ATTGAGCTAT GGCAACTTGA GACTTTGCTT TTACAAAGGG ACACATATAT GAATTACAGC  AGACCCTTAA GCACAGCAAC AAGTGTAGGA TGGAGCCAAA ATCTAAGCTC ATTCAACCCA AAACACATCA TCAAATCAGC AACCACAACA TTTAATTCAG TGATCTTCCA AAACTGGCAA  AGAATTTGGA TTCTTTTTCT ATGGGCCTCA ACAATGGCAG CTCTTTTCAC ATGGAAATTC CTTCAATACA AAAATAAAGC AGCGTTTGAC ATAATGGGCT ATTGTCTTCC CACGGCAAAA  GGCGCCGCCG AGACTCTAAA GCTCAACATG GCCTTAATTC TCCTCCCCGT CTGCCGCAAC ACTCTCACAT GGCTGCGATC GACTGCAGCG AGATCACTAG TCCCGTTCGA CGACAACATC  AATTTTCATA AGCTAATTGC ATGTTTCATA GCGATTGGAA TAGCCGTCCA TGGCGGAGTT CATTTGGCAT GCGACTTCCC GAGATTGGCG AATTCATCGG CAGAGGAATT TGAAGTGATA  TCGAGTGACT TCCACAACAA GAAGCCAAAC TATAAGGAGC TATTGATGAG TGTTGAAGGG GTAACAGGGG TAGTCATGGT GATTTTGATG GGGATTTCAT TTACACTTGC TACTCGTCGT  TTTAGAAGGA ATGTTGTGAG ATTGCCTTGG TTGTTCAACA GATTGGCTGG ATTTAATGCC TTTTGGTACT CTCATCATCT TATGGGATTT GTCTACCTTT TGCTTCTTGT TCATGGAACT  TTCTTGTTTC TTGCTCATAA TTGGACTCAA AAAACGACTT GGGTGTATAT CTCTTTTCCT TTGCTGCTGT ATCTTGGTGA GAGGAGCCTC AGAGCCTGCA GATCAGAGTA TTACTCTGTT  GAGATATTGA AGGTTTCAGT ATTACCAGGA AATGTATTCA GCTTGGTGAT GTTAAAGCCT CGTGGATTCA AATACATAAG TGGACAGTAC ATATTCCTTC AATGTCCATC CATTTCCCAA  TTTGAATGGC ACCCATTTTC TATCACTTCA GCACCAGGAG ATGAGTATCT GAGTGTTCAT ATTAGAACAG TTGGGGATTG GACAAGAGAA CTCAAACGTG TCTTCACCGA TCATGTCAAC  TCTAGACCTC TCCTTGGTAG AGCCAAATTG GGGCATTTGG TCAACATGGA AAGAAAAAGC CAGCCGAGAT TGTTGGTGGA TGGGCCATAT GGTGCTCCTG CACAAGACTA CCAAAACTAC  GACGTGCTTC TTCTGGTGGG ACTTGGAATT GGAGCCACAC CTTTTGTTAG TATCCTCAAG GATCTCCTCA ACAACTCTAG AACCAATGAA GATCAGCAAA CGCCTGCGGA ATCAACAACA  ACGGAAACAA GTAGATCAGA AGATAGCTTT GGATCTTTAA ACACGAGTAC ACCAAGTGGA AAGAGGAAGT TGCAGAGCAG GACACAAGCG CAAGCGTATT TCTATTGGGT AACGAGGGAG  GCTAGTTCGT TGGAGTGGTT CAAAGGGGTG ATGGATGAAG TAGCAGAGAT GGACAAGAAG GGCCAAATTG AACTACACAA CTACTTGACA AGTGTGTATG AAGAAAGTGA TGCAAGGAGC  ACATTGATCA CAATGGTTCA AGCTTTAAAC CATGCCAAGC ATGGTGTCGA CATTCTGTCC GGCACACGAG CAAGGACTCA CTTCGCGAGG CCGGAGTGGA AGGAGGTGTT CGGACGAATT  GCATCGAAGC ATGCATACAA GACAGTGGGA GTGTTCTATT GTGGAATGCC AATGCTGGCC AAACAACTCA GAAGACTATC ACAACAATTT ACTCTCAAGA CTACAACTAG ATTTGAGTTC 
CATAAGGAAT ATTTTTGA 

Retrieve as FASTA