Entry information : CsaRboh09
Entry ID 16412
Creation 2020-03-24 (Baptiste Sarrette)
Last sequence changes 2020-04-07 (Baptiste Sarrette)
Sequence status N/D
Reviewer Not yet reviewed
Peroxidase information: CsaRboh09
Name CsaRboh09
Class Respiratory burst oxidase homolog    [Orthogroup: Rboh003]
Taxonomy Eukaryota Viridiplantae Streptophyta Cucurbitaceae Cucumis
Organism Cucumis sativus    [TaxId: 3659 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type
Inducer
Repressor
Best BLASTp hits
Perox score E-value CsaRboh09
start..stop
S start..stop
ClanRboh08 1362 0 78..810 38..774
DgloRboh08 1031 0 77..810 56..795
DdruRboh09 1016 0 73..810 65..809
ToriRboh11 1015 0 98..810 87..799
Literature and cross-references CsaRboh09
Protein sequence: CsaRboh09
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   810
PWM (Da):   %s   93868.65  
PI (pH):   %s   9.23
Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
MTNFLFSRER NWHQQSTTTQ EKCIHFFSFE FGESVIAMEL RKTEEKLSVS SSLSSSLSSS SSCSSSYWSS RGENHEDRSS KSSPRMRFID FLRDKEWEWK LAEKRFDQLC WICAGNEPAI  KSSNFPFCIG MSESQEFAYQ LLRALRRRKN WKIDITKSEF HILWCHFTHS DATTTLFHLC DRNMDGKVTE NDIKQIIMLT ASTNKLSVTH EEGEDYAALV MEELDEEKQG YLELHQFENL  FKISSSNVLS PLNKQSSNKH IWQSHDSFQE SIYEAEILLR SRWRRAWTVA LWLIICLALF TWKFIQYRQR KAFEVMGYCL SIAKGAAETL KFNMALVLLP VCRNTITWLR RNSSLNSVIP  FNDNVNFHKL VAGGIVAGVI LHGGTHLACD FPRISGCEKS IFKKTIAAQF NYHQPSYVEM LATTESLTGI IMVILMFIAF LLATKWPRRK STSLPRSIQQ VTGYNTFWYS HHLFIFVYAL  LIVHSIFLFL TDKTTEKTTW MYIAVPVLLY SGERIFRAIR SCLYEVNVLK ARTYSGKVLF LKLSKPERFK YQSGMYVLIQ CPQISPFEWH PYSLTSAPQD SHLSVHIRNL GDWSYELYSL  FHEGIFPSKN YPKIFIDGPY GAASQDHVKY NNVVLIGLGI GATPFMSIMK DIVIKFTEKS NRRGDSGKGN QSTSKTYLYW VTREQSSFDW FKDFMNDLTF TDQTQLAVEM HNFLTSVYHE 
GDVRSVLIRA IQALHYTRRG IDIVSKTPVQ THFGRPNWIN IFSSLARRHA RERIGVFYCG PLALARELEG LCTKFSTKTS TRFVFHKENY * 

Retrieve as FASTA  
Remarks Cucsat_evmmodelChr1285
CDS
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGACTAATT TTTTGTTCTC AAGAGAGAGA AACTGGCATC AACAGAGTAC TACTACTCAA GAAAAATGCA TACATTTTTT CAGTTTTGAA TTTGGAGAGT CAGTCATAGC AATGGAGCTT  CGAAAAACAG AGGAGAAACT CTCTGTATCT TCATCATTAT CTTCTTCCTT GTCGTCATCG TCGAGTTGTT CGTCGTCGTA TTGGTCTTCG AGGGGCGAGA ATCATGAAGA CAGATCTTCG  AAGAGTAGTC CGAGAATGAG GTTTATTGAT TTTCTTCGTG ACAAGGAATG GGAATGGAAA TTGGCTGAGA AGCGGTTCGA TCAGCTCTGT TGGATTTGTG CTGGTAATGA ACCCGCCATC  AAGTCCTCTA ATTTTCCCTT TTGCATTGGA ATGTCAGAAT CTCAGGAGTT TGCATATCAA CTGTTGAGAG CACTGAGAAG AAGAAAGAAT TGGAAAATAG ATATCACTAA AAGTGAATTT  CATATCCTCT GGTGCCACTT CACTCATTCC GATGCAACAA CAACTCTATT TCACCTTTGT GATAGGAACA TGGATGGAAA AGTTACTGAG AACGATATCA AACAGATAAT AATGTTAACT  GCTTCTACCA ATAAGTTATC CGTGACCCAC GAAGAAGGAG AAGATTATGC TGCCTTAGTC ATGGAAGAGC TAGATGAAGA AAAGCAGGGC TACCTTGAGC TACATCAATT TGAGAACCTC  TTCAAGATAA GCTCATCAAA CGTTCTCTCT CCTCTAAACA AACAATCATC AAATAAACAC ATTTGGCAAA GCCATGATTC ATTTCAAGAG TCCATATATG AGGCTGAAAT TTTGCTTAGA  TCTCGATGGA GACGAGCATG GACGGTAGCA TTGTGGTTGA TCATCTGCCT TGCATTGTTC ACCTGGAAAT TCATTCAGTA CCGCCAACGA AAGGCATTCG AAGTCATGGG TTACTGCCTC  TCAATTGCCA AGGGGGCAGC AGAGACTTTG AAATTTAACA TGGCTCTAGT CTTGCTTCCT GTTTGTCGAA ACACGATTAC ATGGCTTCGC AGAAATTCAT CTCTCAACTC CGTCATTCCT  TTCAACGACA ATGTAAACTT CCACAAGTTA GTTGCAGGAG GCATTGTAGC AGGAGTTATA CTTCATGGAG GAACTCATCT TGCTTGTGAT TTTCCAAGAA TTAGTGGTTG TGAGAAGTCA  ATTTTTAAGA AAACTATTGC TGCTCAGTTC AACTACCATC AGCCATCTTA TGTTGAAATG TTGGCCACAA CTGAGAGTTT AACAGGCATT ATTATGGTCA TATTGATGTT CATTGCATTT  TTGCTCGCTA CGAAATGGCC GCGTCGCAAA TCGACCTCGC TTCCGAGGTC TATTCAACAA GTCACAGGAT ACAATACCTT TTGGTATTCT CACCATTTGT TCATATTTGT CTATGCATTA  CTCATTGTTC ACTCCATATT CTTATTCCTA ACTGATAAAA CAACAGAGAA AACGACTTGG ATGTATATAG CAGTTCCAGT TTTATTATAT TCTGGAGAGA GGATTTTTAG AGCAATTAGA  TCTTGTTTAT ACGAAGTGAA TGTTTTGAAG GCAAGGACTT ATTCAGGAAA AGTTTTGTTT CTCAAACTGA GCAAACCAGA AAGATTCAAA TATCAAAGTG GGATGTATGT ATTAATTCAA  TGCCCTCAAA TCTCCCCATT TGAATGGCAT CCGTATTCTT TAACTTCTGC ACCACAAGAT AGCCACCTCA GTGTACATAT CAGAAATTTG GGAGATTGGA GTTATGAGCT CTACAGCCTG  TTCCATGAGG GAATATTTCC TTCGAAGAAT TACCCCAAAA TATTCATTGA TGGGCCCTAT GGTGCTGCTT CTCAAGACCA TGTCAAGTAC AACAATGTGG TACTAATTGG TCTAGGTATT  GGAGCCACAC CATTCATGAG CATCATGAAA GACATTGTAA TCAAGTTTAC TGAAAAATCG AATCGTCGTG GAGACAGTGG AAAAGGCAAC CAAAGTACAT CAAAAACCTA TCTTTATTGG  GTTACAAGAG AACAAAGCTC CTTTGATTGG TTTAAAGATT TCATGAATGA TTTAACATTT ACAGACCAAA CTCAGTTAGC TGTGGAGATG CACAATTTCC TCACTAGTGT ATATCATGAA  GGGGATGTAA GGTCTGTTTT GATAAGAGCA ATTCAAGCCT TGCATTATAC TCGACGTGGC ATCGACATTG TCTCCAAGAC TCCCGTACAA ACTCATTTTG GTCGACCGAA TTGGATAAAC  ATCTTCTCAA GTTTAGCTCG GAGGCACGCA AGAGAAAGAA TCGGAGTTTT CTATTGTGGT CCTTTGGCTT TGGCAAGAGA ACTAGAGGGA TTATGCACCA AATTCTCCAC CAAAACCTCA 
ACTAGATTTG TATTCCACAA GGAAAACTAT TAG 

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