Entry information : CroPrx03-1B (CRO_T002898)
Entry ID 16422
Creation 2020-04-15 (Christophe Dunand)
Last sequence changes 2020-04-15 (Christophe Dunand)
Sequence status complete
Reviewer Not yet reviewed
Peroxidase information: CroPrx03-1B (CRO_T002898)
Name (synonym) CroPrx03-1B (CRO_T002898)
Class Class III peroxidase    [Orthogroup: Prx003]
Taxonomy Eukaryota Viridiplantae Streptophyta Apocynaceae Catharanthus
Organism Catharanthus roseus    [TaxId: 4058 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type
Inducer
Repressor
Best BLASTp hits
Perox score E-value CroPrx03-1B
start..stop
S start..stop
CroPrx03-1B_Other 729 0 1..360 1..360
CroPrx03-1A 680 0 23..360 28..365
CroPrx03-1A_other 677 0 23..360 28..365
CroPrx01 575 0 24..360 22..363
Literature and cross-references CroPrx03-1B (CRO_T002898)
Protein sequence: CroPrx03-1B (CRO_T002898)
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   360
PWM (Da):   %s   39435.74  
PI (pH):   %s   5.63
Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
MALIAFSSST SLLLFCSLLL VSTHFNFHIE AQTTPPIVSG LSFAFYNSTC PDLESIIRNR LREVFQNDIE QAAGLLRLHF HDCFVQGCDG SVLLVGSASG PGEQDAPPNL SLRQEAFRII  DDLRRRVHSR CGRIVSCSDI LALAARDSVV LSGGPEYDVP LGRRDGLNFA TQNETLNNLP PPSSNTSELL TSLATKNFNA TDVVALSGGH TIGVGHCVSF EERLYPTQDP TMDQTFARNL  RLTCPALNTT NTTVLDIRSP NRFDNRYYVD LMNRQGLFTS DQDLYTDRRT RSIVTDFAVN QTLFFEKFVY AMIKMGQLNV LTGNQGEIRA NCSVRNAASG RSSSLVSVVE DAAEVGLSMF 

Retrieve as FASTA  
Remarks Complete sequence from genomic. Incorrect prediction (two exons 1 in the ORF : two splicing variants confirmed with ESTs from other strains)
DNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGGCTTTGA TTGCCTTTTC TTCTTCAACT TCTCTGCTCC TCTTCTGCTC TCTTCTATTG GTTTCTACCC ATTTTAATTT CCATATTGAA GCTCAAACTA CTCCACCTAT AGTGAGTGGA  CTTTCATTTG CCTTTTATAA TTCTACGTGC CCCGACTTGG AATCCATTAT CAGAAACCGC CTCAGAGAGG TATTCCAAAA TGATATTGAA CAGGCTGCTG GCTTGCTTCG CCTTCATTTT  CATGATTGCT TTGTCCAGGT AATACATATA CCACTTTAAT TTTTTCTTCT TTTTTTCTAC AAGAAGCTGT AGTTGCGGTA GGATTGGTGT CCACTCTGGT AAATTTCTTC TGGTGCAAGA  ATTTATTAAT TATACCAGAA AGTAAGTTGT AATAAATTAT GTGGGTACAA CAAGAAATAT TTGAATCCTA GTTCTTGATA AAAAATTTTA CTCCATTCAC TATTAAAACA GAGTCTGATA  ATTGTATTAT TATAATTTGG AAGTAACTAT AGTCATTATT TAAAAGTATC TATACGTAAT TTATTTTCAT CTTCTTTAAT AAATTTTAAA TTATAAGTCA CTGTTACTAG TATATTTGTG  TTTGTGGATA CACTATTTAA CATCCACAAA CACAAATATG AATACGGTAA TGCATCAAAG TAACATTAAA TATCCAAGAA ACCTTAAATA TACAACAATC GAACCTAACT ATAACAGAGG  ATGGTCGTCC TCACCGCTTG ATTGGCCCCC TCCGCACTAC TCTGACTGTT CGGCCAACTA ATCCCACCAG GTATCTGCCA ATCGAGAAGC AATTCAAAAG ATGGTAGATC GCTTATTAAT  ATGCGTACCT TAGTGAAGTA TCCAGCCCTA AACCCGTGAC TGAGGTAATT CCCTTAAGCA ATTCTCCACT AGATTTTGCT CAGACGGGCC TATCACTCCC TTCGCAAAGA CCCTCTAAAT  CATGATTTCC ACTATAATTA CTACGTTAGA ACAAACAAAA TATATATTTA AAAGTGTTTT TTGACAAATA AACAAGTTTA CTCGAAAATA ATTTATATAA TTATGCTTTA TAACACTCCC  TTCCCTACCC CCGCCCCCCA CGCGGAACCA TGAAACGCAT GCTACATATA TGAAGAAGAA AAAGATTAAA AATAATGAGC AGTAGGGCCA CCAGGAGGTT CCTTGTAATA TCAGGACATT  GAATTGTGAA GTTATGATTA TGTAATTAAT TAACTCTGTC ACTCAGTCGT CGTCACCCTA AACCTCCTCA TTATAAATAC CTTCCATTTT GTTCCTTCCC TCCTTCACAA TACCGATCCA  TCTAGCTAGC TGGAAGGAAC GAGCCATGGT TTTTATGTGT TCCTTTTCCT CTTCTTCTTC TTCAACTTCT CTGCTGCTCT TTCTCATTTC CTCTCTTTTG ATTTCTACCC ACTTTAATGT  CCATATCGAA GCTCAAACAA CTCCACCTAT AGTGAGTGGA CTGTCATTCA CCTTTTATGA TTCCAGTTGC CCAGACCTGG AATCCATTAT CAGAAACCGC CTCAGGCGGG TCTTCAGAAA  CGATATTGGA CAAGCTGCTG GCTTGCTTCG CCTTCATTTT CATGATTGCT TTGTCCAGGT AACACCACTT TGATCAACTC TATTCACTCA GGCTGAACTT CGATAGCTTT TATTTTGCAA  GGAAGGGGTA CTTTTGTGTT GAATTTTTTG AGAGGTGAAT TGTTTGTGAC TCTCATATCC ACACTCATCA AACATGCGAC CTCTACTGAG GCATATCACC ACTAATGTTG CATATATCTC  CCATTGCGAA GACGACAACA ACTATAAGAC AACTATAAAA GTTATGTAAT TTAATACAAG TCACATGGTC TATAAGTAGG AATATAAGTC GGGTCCATTA TAGAATTCGT CTGTTTTCGC  AGGCTTAGGT CCAAACTAAA AAATTGAAAA GTTTTGATTT TAATAAATTG ATAAAGTTGA GCTTAAGTTT TTTTTTTTTT TTTTTTnAAG AAATTGTAGC CCTGTTGGTA AGATGGTGTC  CACTAAATAA ATCTCATTCC GTGCCATAGT TTGTAAATTA TAGGAGATAG AAATTATAAT GAGTAAGTTC TATTTGTCAA ATGTAATATT TGAATCCTAG TAAACAAATT GAAAAAATCT  TACTCTATTC ACTGCTAAAA TAACTATGGA CGACTAGTAC AAAAGTTTGA TAATTATAGT ATTATATTCT GGAAGGAACT TTAGCTCTTG TCGGAAGATG TTTACGGGTT AAATTCCTTC  TCAATCATAC AAAAATTTGT AAACTACGAG TCAGTCTCAT CGATAAATCA CATCTCTTGC AATATTATGT AAATCTTACA TGTTAGAAAA ATGGTTTGAA ACTTATTGGT AAATTAAAAT  TCATTAATTA TCTAACTAAC TCTTGTCTAC ATGAATGACT TATATTTGAT GGTTATTGTT ATACGTAGGG ATGCGATGGA TCAGTGCTGT TAGTGGGATC AGCAAGCGGA CCGGGAGAGC  AGGATGCGCC ACCAAACTTG AGTCTCCGAC AGGAGGCTTT CAGGATCATC GATGACCTCC GAAGGCGCGT GCATAGTAGA TGTGGGAGAA TTGTTTCTTG TTCCGATATA CTTGCTCTCG  CTGCACGCGA CTCTGTTGTT CTCGTAAGTT TTTACTATCT CCATTTCATG TTACACGTCA CTCAAGTGTA TTCTTTCTAT CTCAAAATAT ATATTATTTT TATTACAATA ATTAATGTTT  GTCGGAGGAA AATTTAGTTT ATCTCTTTTT TAATCTAGAT AATTTAATAA TTTACTTAAT TCATGTGACA TATCTTATAT ATGATAGATA ATGTGAAACG AAGATAGTAA TAGTATATAT  AGGTGAAAAT ACTATTGTCA TTCATCAGCA AAAAGCTCAA CCAATTAGTA TAAAAAAGGG AGAAATCTGC AAACATCATA GTACTTTATA TGAATACTTG TTCGTAAAAT TCAATCGTAA  ATCTTATTTT CTCATTTTTT TTTTCATATA GTAGATAAGA GGTGCGGTTC AAATTCAGAA CTTATAAAAT GATGAATAAT ACTTTTTGAA CTACTACATT GTCACTTTCA ATCCTAATTC  GTGCATAATT GGACAGTGAA GCTGTCAATA GAAGAGTAAA GTATTTTTGC GTTCTATACT AAGGATGAAT TTTCAAAAAA AAAAAAAAGA AAAGAAAAAG GATGAATTAT GGCCTTAAAT  TGTGTGTAGG TTATTTGTTC AATCATTGTC CAACAATAGC ATAAGAGTTT GGGTACACTT GGATTAGATG TTATTTTAAA AGTAGGATAG ATTTTTTTTC TTAGCTTTCC TAAAAGATAA  AATTTTTTTG TAAGATAAGA GATGAAGTCC AAAGTTAGAA ATTAAAGATT TATTTAAATT ATTTTTTAAT TCTTAACATT TTTTATTTTA ATCATGATAA AAAAATCATT TTTCTTTTTT  GAAAAACAGA ATCCAAACAC ACTCTAATTA AAGAATTCGT ATATAGAAAC AAAAGCTAAA AATTCATGAG TTTATCTAGG AAAACTCTAA AATATTTTTT AAAAACAAAA AATTCAAACA  TGTAAGTTTG GGAAATATAT GAGGCAGAAT AGACAGACAT CAAACAACTT TGGTAGATGG ACGAAGATAT ATAAGTCTTA TTTTTCCTTA ATAAATGTAC GGGTTGGTTT TGGTTGAAAT  TGAACTGTTA AAGTGTCTTT TTCGTGTGTA ATCCAATCTG AGATCAGTTT ATGGATTATA ATACTGGCCA CCTATATGTA GTTAGTGAAG AGGAAGCAGA CCAATAAATA CATGGAGTTG  TTACAAAATT CGAAGGTCAA GCGCCATGTT TTTATTATTA TTATTATTAT TATTATTATT ATTATTATTA TTTTGGTAAA TCATGGTCTA TTTGGATTGT TATTCATTTC ATAAAATTTT  TTATCCTTTT TTCTTTATTT TCTCTCCCAA AAGTCAAATA TAAACTTAAG GAATAATTCA CTCTTCTCAA CTTTGTTACA ATACAAGGTG AGTAATTTTT TATGCATGTA TATAAAGAAA  TTTTTAAAAA TATTGAGAGC CAAAATTTAA AAAAAAATTA TAATTATAAG CGAATTATAT ATATATATAT ATATGATGTA GTTATTATAA TTGTGAAATG TGATATTAAT AAGTAGAATT  GTGCAAATAA TGCAGTCAGG AGGTCCCGAA TACGATGTTC CTTTGGGAAG AAGAGATGGA CTTAACTTTG CAACACAAAA TGAGACACTA AATAACCTTC CACCTCCATC AAGCAACACA  AGTGAGCTCC TTACTTCACT TGCCACAAAA AATTTCAATG CCACAGATGT TGTAGCTCTT TCAGGTGGCC ACACAATTGG TGTAGGCCAT TGCGTTTCCT TTGAAGAAAG ACTCTATCCA  ACTCAAGATC CAACAATGGA CCAAACATTT GCAAGAAACC TAAGACTCAC TTGTCCGGCT TTAAATACAA CTAACACAAC TGTTTTGGAC ATTCGATCAC CAAACAGATT TGATAATAGG  TACTATGTTG ATCTAATGAA CCGACAAGGA CTTTTCACTT CGGACCAAGA TTTGTACACT GATCGAAGAA CAAGAAGTAT TGTTACTGAT TTTGCTGTTA ATCAAACCTT ATTCTTTGAG  AAGTTTGTCT ACGCAATGAT AAAGATGGGA CAATTGAATG TCTTGACGGG GAATCAAGGT GAAATCAGAG CCAATTGTTC AGTTCGGAAT GCCGCCAGCG GACGTTCTTC CAGCTTGGTA 
TCGGTTGTGG AAGATGCTGC AGAAGTTGGC TTGTCCATGT TTTAA 

Retrieve as FASTA  
CDS
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGGCTTTGA TTGCCTTTTC TTCTTCAACT TCTCTGCTCC TCTTCTGCTC TCTTCTATTG GTTTCTACCC ATTTTAATTT CCATATTGAA GCTCAAACTA CTCCACCTAT AGTGAGTGGA  CTTTCATTTG CCTTTTATAA TTCTACGTGC CCCGACTTGG AATCCATTAT CAGAAACCGC CTCAGAGAGG TATTCCAAAA TGATATTGAA CAGGCTGCTG GCTTGCTTCG CCTTCATTTT  CATGATTGCT TTGTCCAGGG ATGCGATGGA TCAGTGCTGT TAGTGGGATC AGCAAGCGGA CCGGGAGAGC AGGATGCGCC ACCAAACTTG AGTCTCCGAC AGGAGGCTTT CAGGATCATC  GATGACCTCC GAAGGCGCGT GCATAGTAGA TGTGGGAGAA TTGTTTCTTG TTCCGATATA CTTGCTCTCG CTGCACGCGA CTCTGTTGTT CTCTCAGGAG GTCCCGAATA CGATGTTCCT  TTGGGAAGAA GAGATGGACT TAACTTTGCA ACACAAAATG AGACACTAAA TAACCTTCCA CCTCCATCAA GCAACACAAG TGAGCTCCTT ACTTCACTTG CCACAAAAAA TTTCAATGCC  ACAGATGTTG TAGCTCTTTC AGGTGGCCAC ACAATTGGTG TAGGCCATTG CGTTTCCTTT GAAGAAAGAC TCTATCCAAC TCAAGATCCA ACAATGGACC AAACATTTGC AAGAAACCTA  AGACTCACTT GTCCGGCTTT AAATACAACT AACACAACTG TTTTGGACAT TCGATCACCA AACAGATTTG ATAATAGGTA CTATGTTGAT CTAATGAACC GACAAGGACT TTTCACTTCG  GACCAAGATT TGTACACTGA TCGAAGAACA AGAAGTATTG TTACTGATTT TGCTGTTAAT CAAACCTTAT TCTTTGAGAA GTTTGTCTAC GCAATGATAA AGATGGGACA ATTGAATGTC  TTGACGGGGA ATCAAGGTGA AATCAGAGCC AATTGTTCAG TTCGGAATGC CGCCAGCGGA CGTTCTTCCA GCTTGGTATC GGTTGTGGAA GATGCTGCAG AAGTTGGCTT GTCCATGTTT 
TAA 

Retrieve as FASTA