Entry information : CroPrx03-1A (CRO_T002898)
Entry ID 16423
Creation 2020-04-15 (Christophe Dunand)
Last sequence changes 2020-04-15 (Christophe Dunand)
Sequence status complete
Reviewer Not yet reviewed
Peroxidase information: CroPrx03-1A (CRO_T002898)
Name (synonym) CroPrx03-1A (CRO_T002898)
Class Class III peroxidase    [Orthogroup: Prx003]
Taxonomy Eukaryota Viridiplantae Streptophyta Apocynaceae Catharanthus
Organism Catharanthus roseus    [TaxId: 4058 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type
Inducer
Repressor
Best BLASTp hits
Perox score E-value CroPrx03-1A
start..stop
S start..stop
CroPrx03-1A_other 735 0 1..365 1..365
CroPrx03-1B 682 0 28..365 23..360
CroPrx03-1B_Other 677 0 28..365 23..360
CroPrx01 571 0 29..365 22..363
Literature and cross-references CroPrx03-1A (CRO_T002898)
Protein sequence: CroPrx03-1A (CRO_T002898)
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   365
PWM (Da):   %s   39959  
PI (pH):   %s   6.39
Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
MVFMCSFSSS SSSTSLLLFL ISSLLISTHF NVHIEAQTTP PIVSGLSFTF YDSSCPDLES IIRNRLRRVF RNDIGQAAGL LRLHFHDCFV QGCDGSVLLV GSASGPGEQD APPNLSLRQE  AFRIIDDLRR RVHSRCGRIV SCSDILALAA RDSVVLSGGP EYDVPLGRRD GLNFATQNET LNNLPPPSSN TSELLTSLAT KNFNATDVVA LSGGHTIGVG HCVSFEERLY PTQDPTMDQT  FARNLRLTCP ALNTTNTTVL DIRSPNRFDN RYYVDLMNRQ GLFTSDQDLY TDRRTRSIVT DFAVNQTLFF EKFVYAMIKM GQLNVLTGNQ GEIRANCSVR NAASGRSSSL VSVVEDAAEV 
GLSMF 

Retrieve as FASTA  
Remarks Complete sequence from genomic. Incorrect prediction (two exons 1 in the ORF : two splicing variants confirmed with ESTs from other strains)
DNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGGTTTTTA TGTGTTCCTT TTCCTCTTCT TCTTCTTCAA CTTCTCTGCT GCTCTTTCTC ATTTCCTCTC TTTTGATTTC TACCCACTTT AATGTCCATA TCGAAGCTCA AACAACTCCA  CCTATAGTGA GTGGACTGTC ATTCACCTTT TATGATTCCA GTTGCCCAGA CCTGGAATCC ATTATCAGAA ACCGCCTCAG GCGGGTCTTC AGAAACGATA TTGGACAAGC TGCTGGCTTG  CTTCGCCTTC ATTTTCATGA TTGCTTTGTC CAGGTAACAC CACTTTGATC AACTCTATTC ACTCAGGCTG AACTTCGATA GCTTTTATTT TGCAAGGAAG GGGTACTTTT GTGTTGAATT  TTTTGAGAGG TGAATTGTTT GTGACTCTCA TATCCACACT CATCAAACAT GCGACCTCTA CTGAGGCATA TCACCACTAA TGTTGCATAT ATCTCCCATT GCGAAGACGA CAACAACTAT  AAGACAACTA TAAAAGTTAT GTAATTTAAT ACAAGTCACA TGGTCTATAA GTAGGAATAT AAGTCGGGTC CATTATAGAA TTCGTCTGTT TTCGCAGGCT TAGGTCCAAA CTAAAAAATT  GAAAAGTTTT GATTTTAATA AATTGATAAA GTTGAGCTTA AGTTTTTTTT TTTTTTTTTT TnAAGAAATT GTAGCCCTGT TGGTAAGATG GTGTCCACTA AATAAATCTC ATTCCGTGCC  ATAGTTTGTA AATTATAGGA GATAGAAATT ATAATGAGTA AGTTCTATTT GTCAAATGTA ATATTTGAAT CCTAGTAAAC AAATTGAAAA AATCTTACTC TATTCACTGC TAAAATAACT  ATGGACGACT AGTACAAAAG TTTGATAATT ATAGTATTAT ATTCTGGAAG GAACTTTAGC TCTTGTCGGA AGATGTTTAC GGGTTAAATT CCTTCTCAAT CATACAAAAA TTTGTAAACT  ACGAGTCAGT CTCATCGATA AATCACATCT CTTGCAATAT TATGTAAATC TTACATGTTA GAAAAATGGT TTGAAACTTA TTGGTAAATT AAAATTCATT AATTATCTAA CTAACTCTTG  TCTACATGAA TGACTTATAT TTGATGGTTA TTGTTATACG TAGGGATGCG ATGGATCAGT GCTGTTAGTG GGATCAGCAA GCGGACCGGG AGAGCAGGAT GCGCCACCAA ACTTGAGTCT  CCGACAGGAG GCTTTCAGGA TCATCGATGA CCTCCGAAGG CGCGTGCATA GTAGATGTGG GAGAATTGTT TCTTGTTCCG ATATACTTGC TCTCGCTGCA CGCGACTCTG TTGTTCTCGT  AAGTTTTTAC TATCTCCATT TCATGTTACA CGTCACTCAA GTGTATTCTT TCTATCTCAA AATATATATT ATTTTTATTA CAATAATTAA TGTTTGTCGG AGGAAAATTT AGTTTATCTC  TTTTTTAATC TAGATAATTT AATAATTTAC TTAATTCATG TGACATATCT TATATATGAT AGATAATGTG AAACGAAGAT AGTAATAGTA TATATAGGTG AAAATACTAT TGTCATTCAT  CAGCAAAAAG CTCAACCAAT TAGTATAAAA AAGGGAGAAA TCTGCAAACA TCATAGTACT TTATATGAAT ACTTGTTCGT AAAATTCAAT CGTAAATCTT ATTTTCTCAT TTTTTTTTTC  ATATAGTAGA TAAGAGGTGC GGTTCAAATT CAGAACTTAT AAAATGATGA ATAATACTTT TTGAACTACT ACATTGTCAC TTTCAATCCT AATTCGTGCA TAATTGGACA GTGAAGCTGT  CAATAGAAGA GTAAAGTATT TTTGCGTTCT ATACTAAGGA TGAATTTTCA AAAAAAAAAA AAAGAAAAGA AAAAGGATGA ATTATGGCCT TAAATTGTGT GTAGGTTATT TGTTCAATCA  TTGTCCAACA ATAGCATAAG AGTTTGGGTA CACTTGGATT AGATGTTATT TTAAAAGTAG GATAGATTTT TTTTCTTAGC TTTCCTAAAA GATAAAATTT TTTTGTAAGA TAAGAGATGA  AGTCCAAAGT TAGAAATTAA AGATTTATTT AAATTATTTT TTAATTCTTA ACATTTTTTA TTTTAATCAT GATAAAAAAA TCATTTTTCT TTTTTGAAAA ACAGAATCCA AACACACTCT  AATTAAAGAA TTCGTATATA GAAACAAAAG CTAAAAATTC ATGAGTTTAT CTAGGAAAAC TCTAAAATAT TTTTTAAAAA CAAAAAATTC AAACATGTAA GTTTGGGAAA TATATGAGGC  AGAATAGACA GACATCAAAC AACTTTGGTA GATGGACGAA GATATATAAG TCTTATTTTT CCTTAATAAA TGTACGGGTT GGTTTTGGTT GAAATTGAAC TGTTAAAGTG TCTTTTTCGT  GTGTAATCCA ATCTGAGATC AGTTTATGGA TTATAATACT GGCCACCTAT ATGTAGTTAG TGAAGAGGAA GCAGACCAAT AAATACATGG AGTTGTTACA AAATTCGAAG GTCAAGCGCC  ATGTTTTTAT TATTATTATT ATTATTATTA TTATTATTAT TATTATTTTG GTAAATCATG GTCTATTTGG ATTGTTATTC ATTTCATAAA ATTTTTTATC CTTTTTTCTT TATTTTCTCT  CCCAAAAGTC AAATATAAAC TTAAGGAATA ATTCACTCTT CTCAACTTTG TTACAATACA AGGTGAGTAA TTTTTTATGC ATGTATATAA AGAAATTTTT AAAAATATTG AGAGCCAAAA  TTTAAAAAAA AATTATAATT ATAAGCGAAT TATATATATA TATATATATG ATGTAGTTAT TATAATTGTG AAATGTGATA TTAATAAGTA GAATTGTGCA AATAATGCAG TCAGGAGGTC  CCGAATACGA TGTTCCTTTG GGAAGAAGAG ATGGACTTAA CTTTGCAACA CAAAATGAGA CACTAAATAA CCTTCCACCT CCATCAAGCA ACACAAGTGA GCTCCTTACT TCACTTGCCA  CAAAAAATTT CAATGCCACA GATGTTGTAG CTCTTTCAGG TGGCCACACA ATTGGTGTAG GCCATTGCGT TTCCTTTGAA GAAAGACTCT ATCCAACTCA AGATCCAACA ATGGACCAAA  CATTTGCAAG AAACCTAAGA CTCACTTGTC CGGCTTTAAA TACAACTAAC ACAACTGTTT TGGACATTCG ATCACCAAAC AGATTTGATA ATAGGTACTA TGTTGATCTA ATGAACCGAC  AAGGACTTTT CACTTCGGAC CAAGATTTGT ACACTGATCG AAGAACAAGA AGTATTGTTA CTGATTTTGC TGTTAATCAA ACCTTATTCT TTGAGAAGTT TGTCTACGCA ATGATAAAGA  TGGGACAATT GAATGTCTTG ACGGGGAATC AAGGTGAAAT CAGAGCCAAT TGTTCAGTTC GGAATGCCGC CAGCGGACGT TCTTCCAGCT TGGTATCGGT TGTGGAAGAT GCTGCAGAAG 
TTGGCTTGTC CATGTTTTAA 

Retrieve as FASTA  
CDS
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGGTTTTTA TGTGTTCCTT TTCCTCTTCT TCTTCTTCAA CTTCTCTGCT GCTCTTTCTC ATTTCCTCTC TTTTGATTTC TACCCACTTT AATGTCCATA TCGAAGCTCA AACAACTCCA  CCTATAGTGA GTGGACTGTC ATTCACCTTT TATGATTCCA GTTGCCCAGA CCTGGAATCC ATTATCAGAA ACCGCCTCAG GCGGGTCTTC AGAAACGATA TTGGACAAGC TGCTGGCTTG  CTTCGCCTTC ATTTTCATGA TTGCTTTGTC CAGGGATGCG ATGGATCAGT GCTGTTAGTG GGATCAGCAA GCGGACCGGG AGAGCAGGAT GCGCCACCAA ACTTGAGTCT CCGACAGGAG  GCTTTCAGGA TCATCGATGA CCTCCGAAGG CGCGTGCATA GTAGATGTGG GAGAATTGTT TCTTGTTCCG ATATACTTGC TCTCGCTGCA CGCGACTCTG TTGTTCTCTC AGGAGGTCCC  GAATACGATG TTCCTTTGGG AAGAAGAGAT GGACTTAACT TTGCAACACA AAATGAGACA CTAAATAACC TTCCACCTCC ATCAAGCAAC ACAAGTGAGC TCCTTACTTC ACTTGCCACA  AAAAATTTCA ATGCCACAGA TGTTGTAGCT CTTTCAGGTG GCCACACAAT TGGTGTAGGC CATTGCGTTT CCTTTGAAGA AAGACTCTAT CCAACTCAAG ATCCAACAAT GGACCAAACA  TTTGCAAGAA ACCTAAGACT CACTTGTCCG GCTTTAAATA CAACTAACAC AACTGTTTTG GACATTCGAT CACCAAACAG ATTTGATAAT AGGTACTATG TTGATCTAAT GAACCGACAA  GGACTTTTCA CTTCGGACCA AGATTTGTAC ACTGATCGAA GAACAAGAAG TATTGTTACT GATTTTGCTG TTAATCAAAC CTTATTCTTT GAGAAGTTTG TCTACGCAAT GATAAAGATG  GGACAATTGA ATGTCTTGAC GGGGAATCAA GGTGAAATCA GAGCCAATTG TTCAGTTCGG AATGCCGCCA GCGGACGTTC TTCCAGCTTG GTATCGGTTG TGGAAGATGC TGCAGAAGTT 
GGCTTGTCCA TGTTTTAA 

Retrieve as FASTA