Entry information : StPrx47 (PGSC0003DMG400011640)
Entry ID 1950
Creation 2006-08-31 (Christophe Dunand)
Last sequence changes 2015-09-03 (Christophe Dunand)
Sequence status complete
Reviewer Achraf Jemmat
Last annotation changes 2015-11-13 (Achraf Jemmat)
Peroxidase information: StPrx47 (PGSC0003DMG400011640)
Name (synonym) StPrx47 (PGSC0003DMG400011640)
Class Class III peroxidase    [Orthogroup: Prx007]
Taxonomy Eukaryota Viridiplantae Streptophyta Solanaceae Solanum
Organism Solanum tuberosum (Potato)    [TaxId: 4113 ]
Cellular localisation N/D
Tissue types Leaves
Roots
Stolons
Tubers
Inducers Cold stress
Drought
Heat shock stress
Salt stress
Repressor N/D
Best BLASTp hits
Perox score E-value StPrx47
start..stop
S start..stop
LePrx11 624 0 1..322 1..322
CanPrx18 591 0 1..322 1..324
NtPrx11-1A 589 0 1..322 1..321
NtPrx78-1A 564 0 1..322 1..319
Literature and cross-references StPrx47 (PGSC0003DMG400011640)
Cluster/Prediction ref. Phytozome Gene 11:   24389439
Protein sequence: StPrx47 (PGSC0003DMG400011640)
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   323 (297)
PWM (Da):   %s   34819.59 (32080.2) Transmb domain:   %s   o10-32i
PI (pH):   %s   10.19 (9.98) Peptide Signal:   %s   cut: 26 range:26-322
Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
MASSKNNTMV FLFLLVTLLI GSSSAQLSTS FYSKSCPKLY QTVKSTVQSA IKKETRMGAS LLRLFFHDCF VNGCDGSLLL DDTSSFTGEK RAAPNVNSVR GFEVIDNIKS AVEKACPGVV  SCADILAVTA RDSVVILGGP NWNVKLGRRD ARTASQGAAN SSIPAPTFNL NRLISSFSAV GLSTKDMVAL SGSHTIGQAR CTTFRARIYN ETNSIDSSFA RTRQNSCPRN SGSGDNNLAP 
LDLQTPSKFD NNYFKNLVNK KGLLHSDQQL FNGGSADSIV RSYINNPSSF NSDFVTAMIK MGDIRPLTGS NGEIRKNCRR RN* 

Retrieve as FASTA  
Remarks Complete sequence from genomic (chromo 5, 3 introns) and 8 ESTs + 1 (CN516810) singleton
DNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGGCTTCTT CAAAAAATAA TACTATGGTT TTTTTATTTT TGCTTGTGAC CTTACTAATT GGAAGTTCAT CAGCACAACT TTCAACTAGT TTTTACTCAA AATCATGTCC TAAGCTTTAT  CAAACTGTGA AATCAACAGT GCAATCAGCT ATCAAAAAAG AAACCCGAAT GGGCGCTTCG CTTCTTAGGC TTTTCTTCCA TGATTGCTTC GTTAACGTAA AAAAATCCCT ACCATTTTTT  GTTAAATTTC TTATTTCTTC ATTATTTTAT AGAATTTTCT TCGTTTTGAC TATTACTTTG ACTCTGATGT TTATGCATTA GTATAGCAAA GGTGGTTATT ATATTGTAGT CCAAAGAAAA  AACTTTTAAT ATCTGGCATC AATATAATAG ATCTCATAGA GTGAAGTATG GTCAGTTATA TTAGAATAAC GTTTTATCAA AATAATATAT TATATATATA AATCGAATCG TAGTTAACAT  CCTTAGTGAA ACTTTTCACA TAGGTATATA TACTATTCAT CAATTGGTCA CATGTATCAT TCATTTATTA TTATATGTAC TTACAAAAAT ATTATGTTCG TTTATTATAC TAAAAATATA  TGTTCACTTT TTACTTATCA AATTCAAGAA GTCAAGAGAT GATTTATTAC ATAATTTTTA ATTTATTATT ATTAGTAACT ATAGTTAATT TTCCAAAGCT TAAAGAGTGT TATAACTAGT  AAAATTGTCA TTTTATTTAT TACTCCTTAA AAGATATGTT AGGTTAATAT TGGATTGAAC AAGTAAAAAT TAACGGAGTG AGTAGCTTTG ATTAGTTAGC CCCTACTACT TTGTTTTTTG  GTTATCTAAA TTATTGCTCA ATTTTTTTTC TCTTTTAGGG ATGTGATGGA TCACTACTCC TTGATGACAC ATCAAGCTTT ACTGGAGAAA AAAGGGCTGC TCCAAATGTG AATTCTGTAA  GAGGATTTGA AGTCATTGAC AACATCAAAT CTGCTGTAGA AAAAGCATGC CCCGGCGTTG TTTCTTGTGC TGATATTTTA GCTGTTACGG CTCGTGATTC TGTTGTCATT GTAAGTCCTA  GTTACTTCCC AATTTTAATT TTGAGATAAT TACGGGCATG AACCATTTAT CGTTTAGTTT ACATACTTTC CATTTTAGTC GGTTAAAAAA TGTCATTTTT TTATTTGACA CATGTTTAAT  GATAGTATCA ACATTTTATC TATAGTGGGT CCCACTTATT TGGTAAAAAG TCCACATGTA TTCTTTTATT TAAAAAATTA TTTATTTTAA GGATAATATT TAGAACATTG CAAAGTATTT  CCGTATTTTT TAAATTCTGT GTTCAATCAA ACTACATCAC ACAAATTAGA ACAGAGAGGT ACAAAGTTTA TAGGTAGTAT ATACTTTATA CTAAATATAC ATATAATATA CATATCTATA  CACTATATAT ACAATAGCAG TGTATGTATA TGTTGATATG TATATATTAA AAAATTTAGT TGCTCGGTTG ATTGGTTACC CGAACATCCA CCAGAGGTAG TATATATTAT TATAGGGATT  GACTTTTCAA GTAAAACAAA TGTATTATAA AGTTTATTTT CATCTAATTA TTTTTGTGAC TTATGTAGCT TGGAGGGCCT AATTGGAATG TAAAATTGGG CAGAAGAGAT GCCAGGACTG  CAAGCCAAGG TGCTGCCAAC AGCAGCATTC CAGCTCCTAC TTTTAACCTA AATAGACTCA TCTCAAGTTT TAGTGCTGTT GGCCTTTCTA CCAAGGATAT GGTTGCCTTA TCTGGTTTGT  TCATTTTCCC CTACTTTTTT TCTTATTTAT AATGACGGTA GTGTCCGAAT CAACTTGCAT TCTTTTTGGT ACTACCTAGT ACCTAACATA AGTATAGATA TTCTATTGCG TAACTATGCA  CATCAAGACT TATTCGTCAA AAGTCATAAG GGGAAAGTAT TTCTTAACAG GAGGATTACC GTTACAAAAT TTCAAACTCA AGACTTTCAC TTACAGGGCT GAGGGGTGGG GGTGTAATTT  CGTTTTTGAT CTATCTCACC ATACTCCTCA CTGCAGTGGT GTAGTCACAT ATAGCTCAGG GTGTCCAGTT CATCAAAATA TATAGAAAGA AAATTATACG AAATATATTG GTCAAAAGTT  TTTTTTTCAT ACATATATAT TAAATCTTGA ACACGCTTAA CGAAATTTCT GACTTCATCA CTGCCTCAGA CCTAAGTGAC TTTAAACAAG GTTCCTTTTT GGATAACATT TACGGTGGTT  TGGGTATCTT GATTGACCTA TATCGACAAA TTCATAATAT TAGGGCTTGA GAATGAAGAT CTCACATTAG TGATATCTCT AAAAGCTAAT AAACCAAATA TCAGACAAAT TATGAACAAA  TATACCGAAC CGAAGTTTGA TTTGTCGTAC TGATCTTTGA AAATTTGTTT TTTTAATAAG TATCTACTTT CAATTACCAA TTGCGAAATC AAATTTTGAA AAATACACCC CACCCTCCAA  AAACAGAGGA AATTTCATAC ACAAAATTTG ATTGTTTCTA TGTTTGTGTT TCATAGGTTC TCACACAATT GGACAAGCAA GATGCACAAC ATTTAGGGCA CGTATATACA ATGAGACCAA  CAGCATAGAT TCATCATTTG CAAGAACAAG GCAAAATAGT TGTCCAAGAA ACTCAGGCTC AGGTGACAAC AACTTAGCGC CTCTAGATCT TCAAACACCT TCGAAATTCG ATAACAATTA  CTTCAAGAAT CTTGTGAATA AAAAGGGTCT TCTACATTCC GATCAACAAT TATTCAATGG GGGATCTGCT GATTCGATCG TTAGGTCTTA CATCAATAAT CCTAGTAGTT TCAACTCTGA 
TTTTGTGACT GCTATGATCA AGATGGGCGA TATTCGTCCA CTTACTGGAT CGAATGGTGA AATTAGGAAG AACTGCCGTA GAAGAAATTA A 

Retrieve as FASTA  
CDS
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGGCTTCTT CAAAAAATAA TACTATGGTT TTTTTATTTT TGCTTGTGAC CTTACTAATT GGAAGTTCAT CAGCACAACT TTCAACTAGT TTTTACTCAA AATCATGTCC TAAGCTTTAT  CAAACTGTGA AATCAACAGT GCAATCAGCT ATCAAAAAAG AAACCCGAAT GGGCGCTTCG CTTCTTAGGC TTTTCTTCCA TGATTGCTTC GTTAACGGAT GTGATGGATC ACTACTCCTT  GATGACACAT CAAGCTTTAC TGGAGAAAAA AGGGCTGCTC CAAATGTGAA TTCTGTAAGA GGATTTGAAG TCATTGACAA CATCAAATCT GCTGTAGAAA AAGCATGCCC CGGCGTTGTT  TCTTGTGCTG ATATTTTAGC TGTTACGGCT CGTGATTCTG TTGTCATTCT TGGAGGGCCT AATTGGAATG TAAAATTGGG CAGAAGAGAT GCCAGGACTG CAAGCCAAGG TGCTGCCAAC  AGCAGCATTC CAGCTCCTAC TTTTAACCTA AATAGACTCA TCTCAAGTTT TAGTGCTGTT GGCCTTTCTA CCAAGGATAT GGTTGCCTTA TCTGGTTCTC ACACAATTGG ACAAGCAAGA  TGCACAACAT TTAGGGCACG TATATACAAT GAGACCAACA GCATAGATTC ATCATTTGCA AGAACAAGGC AAAATAGTTG TCCAAGAAAC TCAGGCTCAG GTGACAACAA CTTAGCGCCT  CTAGATCTTC AAACACCTTC GAAATTCGAT AACAATTACT TCAAGAATCT TGTGAATAAA AAGGGTCTTC TACATTCCGA TCAACAATTA TTCAATGGGG GATCTGCTGA TTCGATCGTT  AGGTCTTACA TCAATAATCC TAGTAGTTTC AACTCTGATT TTGTGACTGC TATGATCAAG ATGGGCGATA TTCGTCCACT TACTGGATCG AATGGTGAAA TTAGGAAGAA CTGCCGTAGA 
AGAAATTAA 

Retrieve as FASTA