Entry information : AtPrx31 (At3g28200 / PER31 / AtperoxP31 / ATP41)
Entry ID 197
Creation 2006-02-07 (Filippo Passardi)
Last sequence changes 2015-06-03 (Christophe Dunand)
Sequence status complete
Reviewer Achraf Jemmat
Last annotation changes 2015-11-04 (Achraf Jemmat)
Peroxidase information: AtPrx31 (At3g28200 / PER31 / AtperoxP31 / ATP41)
Name (synonym) AtPrx31 (At3g28200 / PER31 / AtperoxP31 / ATP41)
Class Class III peroxidase    [Orthogroup: Prx002]
Taxonomy Eukaryota Viridiplantae Streptophyta Brassicaceae Arabidopsis
Organism Arabidopsis thaliana    [TaxId: 3702 ]
Cellular localisation N/D
Tissue types Callus
Roots
Rosettes
Inducers Dark growth
Hormon treatment
Stress treatment
Repressor N/D
Best BLASTp hits
Perox score E-value AtPrx31
start..stop
S start..stop
AlyPrx31 608 0 16..316 16..316
BstrPrx60 595 0 1..316 1..316
ThPrx31 572 0 16..316 23..323
TsPrx31 572 0 16..316 23..323
Gene structure Fichier Exons
ExonStart..EndSize ExonStart..EndSize ExonStart..EndSize ExonStart..EndSize
N° 1 10518082..10519032 951  
join(10518082..10519032)


exon

Literature and cross-references AtPrx31 (At3g28200 / PER31 / AtperoxP31 / ATP41)
Protein ref. UniProtKB:   Q9LHA7
DNA ref. Phytozome 11:   Chr3 (10518082..10519032)
mRNA ref. GenBank:   NM_113739
Cluster/Prediction ref. Phytozome Gene 11:   19662577 UniGene:   At.22736
Omic ref. AtProteome:   At3g28200 ATTED-II:   At3g28200 e-FP Browser:   At3g28200 ePlant:   At3g28200 Genevestigator:   At3g28200 TAIR:   At3g28200
Protein sequence: AtPrx31 (At3g28200 / PER31 / AtperoxP31 / ATP41)
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   316 (297)
PWM (Da):   %s   35166.03 (32973.9)  
PI (pH):   %s   9.35 (9.20) Peptide Signal:   %s   cut: 20 range:20-316
Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
.........1.........2.........3.........4.........5.........6.........7.........8.........9.........0.........1.........2
MASLKSLFLL FLFFFTAQSR LTTNFYSKTC PRFLDIIRDT ITNKQITNPT TAAAVIRLFF HDCFPNGCDA SVLISSTAFN TAERDSSINL SLPGDGFDVI VRAKTALELA CPNTVSCSDI  ISVATRDLLI TVGGPYYDVF LGRRDSRTSK SSLLTDLLPL PSTPISKIIQ QFESKGFTVQ EMVALSGAHS IGFSHCKEFV GRVGRNNTGY NPRFAVALKK ACANYPKDPT ISVFNDIMTP 
NKFDNMYYQN LKKGLGLLES DHGLYSDPRT RYFVDLYAKN QDLFFKDFAK AMQKLSLFGI QTGRRGEIRR RCDAIN 

Retrieve as FASTA  
Remarks Complete sequence from genomic (chromo 3, no intron), 5 cDNA and 18 ESTs. mainly roots
Promoter
Send to BLAST
Send to cis Analysis
.........1.........2.........3.........4.........5.........6.........7.........8.........9.........0.........1.........2
CTTTAAAATA ATGTAAAATA TGTAGTTTTT TTCAAGGCCA AAACAAACGT TTCTTTTTGT AATTGTTCAA CACAAGTTGA TTCACAATCG AAATAATTTA TGTGCGAAAA CTCAGTTAAT  AGTTGTGAAA TATTACTTCA AAAAACACTG GTAAATTGGT AATGCGTGTC TTCTGAAATT ATTATGATGC CACTTGATTA ATATTAGATT ATTCCTAAGT GAGACATTTC TCTTTGATAT  TGGTGACATA ATTTTATCTA GGCTTCAATA TATATATATA TATGGTCAAA TTCATTCAAT ATATTTCTTT CAATGAAAGT TGTCGTTTCT ATGTTTATAA ATTTATTTTA TGTATATATG  ATTATTCTTT ACTTATAGTT TATTTACGTT CAACTTACTC TTTTATATTT GTGTCGTTAT TTATGTATAT TCAAGTAAAC AAAGAATTAT ACAAAAGGTT GTCTTTTTGA CACATTTTAA  CTCATAGCAA AATATATTTC AAAAGTAGAA ACATATGTTC ATGTTCAATC TCCACGGATC GAATATGGGT AAAGTCGGAA ATCGGCATAG TACGTGTAAG ACTGTAGAGT CGAAAAAAAA  ACAGAGAAAG TGAGACTTTT CATGTCATAT AACATGTAAA TGATTTTTTT TATAAAACCC ATCCATATCG TATATGCTGG ATTACCGAAT CGCCACGTAA AATTAAATTA ATCAAACAAA  AATGAAAAAT CCATGAGACT TTGTGGAGAT TGCTTCACTG TCTTCTCCGC GTGGATGAGA GATCAATAAC ACATACAAAA AAAGAGTTTA GGCTGCATGT GAACTACGTA ATGTCCGTCA  ATTTCTCTGT TTCGCCAATT TTTGCTATTA ACTTAATTTA TTTACACCAA TAATTGAACT AAACACATGC ATTATCATTT ATGTAATATC CCTATATGCA CACATAGCAA ATTCTGTTTT  TAGTAACTTC CTTTCCTAAA CCAATACGGC AATACCGCTT ATTAGTTTTG CCTTTACCCA AACATATGAA TGTTTTCTTT ACCTCAATCA AATTTCACCT AAATCTCTAT ATAGAATGTT  GTACTAGGTT TTTAGTTTAT AAATAATAGG CATTTTGATG ATCTTACATT TCTGATAAAT AATTACACTG GCCTCTCTCT TTTGTTTTTG AAGTAAAAAA TATTTTGGAA AATTACCATT  TGATCTTCAA ATTAGTAATT AGCGAACGCA TTTTCGCCAA ATAACTATAC ACTATTTTAT AAAATCATAC AATTTAACGT TTGTCATCAA AGTTATTTAC TTAAATATGA CCAAAATTTT  GTTATCTAAC TAACTACATC TTATAAATAA TGGAAATTTC TGCTAAACCG AATTAAAAAT AATCTAAATT TTGGATTAGT TTTTCATTTT CTGGTTATCC AACTATTTTT GTAAAATTTC  TTAAATATAA CCCATTACAA GACACTTTTC TTTCTGGTTT GGCTCGAAAT TTCACCGATT CAAATCTAAA TCTTTAGTAC GTAAACCGGT CTACATTAAA TAAACCAATC CATATACTGT  AATTAAAGTT ACACAAGTAA ACCGGATCCA ACCTAAGACC ATCTCTATTG GGGGTATCTC ATAAGAGTTT CTCATAATTA AAAAAATAAA AATAATGAAA ATGAAGGAAA GAGAGTGTAG  AAAGTTTCTC ACTTGAAAAA CTCTGAGATA CTCTTTACAA CCCATTGTGA CAATTCTCAT CTTACTATTG GTTTAATTTT TTAACAAAAA TAATTTTTTT AATCAAATAA TCAAATTATA  ATATAATATT AAATTTTTTT TGTTCGAAAA ATTTTGTGGG TTTATCATGG ATGGAAATGC CCTATGCTTT GACCTTACAC ACATCCCCGT GATTGGTGTG GACCGTACAT CGGCGCGTGA 
ACTCCACTGT CCCTCCCACT TACTTCATCT CCTTCCATAT AATCCCAAAC CCCCCTCTCT CTCTCTCTCT CTTCTCAACA 

Retrieve as FASTA  
Terminator +
Send to BLAST
Send to cis Analysis
.........1.........2.........3.........4.........5.........6.........7.........8.........9.........0.........1.........2
GTTTATGTTT TTAATTTATT TAATTTTTGG GTTATATTGG ATTGTGAATC TTCTGAGTTA TTACACTCAT ATGTTTTTGT GTAATGTAAA AGATATATGG TTGATTGTTC TAATTAAGAG  ATTGGTTTTG GTACAAAGAT TGTTAACCTT TGTGCAGAGA TTGAATTTGA TGATTATGTA AAGGAAATGT TCTGCATTTC AGCTCTAAAA TTTGAGTCCG GTTCAGTGAG AGTAAACCAA  ACTGAAGTAG TTGTAGTTTG AGTTTGGTAA TCATTCATTA GTGGCTGATT GATAATTAAT ATGTTGGTTG AGATAAGAGA TGTGATTTAA TGGATACGGA GTTGGTAGCT CAACGAGTGA  ACTTTTGGAA TCTGGAGCAT CTAGGGGGTT TAGAGTTTGA GCACCACCAA CAATAAAGAG AGATTTACAT TACAATGGAA ACCTTCTTTC TTCGATCTAA TTAACTATAT TTGTGGTTTC  TTGTTGGAAA AGATTATAGT TTTTGGCCCA TATACAAAAA TTAGGCCTTG GTTTCTGGTA AAGTTGTAAA TTTCTAGTGT TTTATTTATA TCTTGTGACA GAATGTGGTA TGCTATTTGT  GTGCATTTGA AAAATGGATC AGTTACAAGT AGTCACACAA TCAAGCCCAA ACCTAGTTAT TAGTCCTCCT TCATCTCGGC TCAGACACAA GTCCAGTTTT GTCGGTTCTT AGAAAGAGTC  TTAAGAGCAC CCTCAATGGT AGTTGTTTAA TAGAAAGAAA CTCTAGAAGC TCTTAGAGCA CCATTATTGA TAATTGCTTA GGTTAATTCT TAGAAAACTT TGGTTATGAA TTTAATGTTT  TTAATCATAT ATTTGTTAAG AGAGTCTCTT ATATAAGAGA CAAATTGAAG TTTTCTTAGT TTTTGTTTCA GAAATTTTAA AATTAATTCA TAAAAAGTTC TAAGAACTAA GTTAAGAGTA 
ATCTAAGACA CTAGCAATAA TGATGCTCTT AGCACAATAT 

Retrieve as FASTA  
DNA
Send to BLAST
.........1.........2.........3.........4.........5.........6.........7.........8.........9.........0.........1.........2
ATGGCTTCAC TCAAATCTCT CTTCCTCCTC TTCCTCTTCT TCTTCACAGC TCAATCTCGC TTAACCACAA ACTTCTACTC AAAAACATGC CCAAGATTCC TCGACATCAT CCGTGACACA  ATCACAAACA AACAAATCAC TAATCCCACC ACCGCAGCCG CCGTTATCCG TCTCTTCTTC CACGACTGTT TCCCTAACGG CTGCGACGCC TCCGTCCTCA TCTCCTCCAC CGCCTTCAAC  ACCGCAGAAC GTGACTCTTC CATCAACCTC TCACTCCCCG GAGACGGTTT CGACGTCATT GTCCGAGCCA AAACAGCTCT CGAACTCGCT TGTCCCAACA CAGTTTCTTG CTCAGACATC  ATCTCCGTCG CAACACGTGA TCTTCTAATC ACCGTCGGTG GTCCTTACTA CGACGTTTTC CTCGGCCGTC GTGATTCAAG AACGTCGAAA TCTTCTCTTT TAACCGATCT TCTTCCTCTT  CCTTCCACAC CAATCTCTAA AATCATTCAA CAGTTTGAAT CAAAAGGTTT CACTGTTCAA GAAATGGTTG CTCTTAGTGG AGCACATTCT ATAGGGTTTT CACATTGTAA AGAGTTTGTG  GGTCGGGTGG GTCGGAATAA TACCGGGTAT AACCCGAGAT TCGCAGTGGC TTTGAAGAAA GCTTGTGCTA ATTACCCTAA AGATCCGACT ATCTCTGTGT TTAATGATAT TATGACTCCT  AATAAGTTTG ATAATATGTA TTATCAGAAT CTTAAAAAGG GTCTTGGGTT ACTTGAATCG GATCATGGAT TATATTCTGA CCCTAGAACC AGATATTTTG TTGATCTTTA TGCTAAGAAT 
CAAGATCTGT TTTTCAAAGA TTTTGCTAAA GCTATGCAGA AGTTGAGTCT TTTTGGTATA CAGACTGGTA GAAGAGGAGA GATCCGAAGA AGGTGCGATG CTATTAATTG A 

Retrieve as FASTA  
CDS
Send to BLAST
.........1.........2.........3.........4.........5.........6.........7.........8.........9.........0.........1.........2
ATGGCTTCAC TCAAATCTCT CTTCCTCCTC TTCCTCTTCT TCTTCACAGC TCAATCTCGC TTAACCACAA ACTTCTACTC AAAAACATGC CCAAGATTCC TCGACATCAT CCGTGACACA  ATCACAAACA AACAAATCAC TAATCCCACC ACCGCAGCCG CCGTTATCCG TCTCTTCTTC CACGACTGTT TCCCTAACGG CTGCGACGCC TCCGTCCTCA TCTCCTCCAC CGCCTTCAAC  ACCGCAGAAC GTGACTCTTC CATCAACCTC TCACTCCCCG GAGACGGTTT CGACGTCATT GTCCGAGCCA AAACAGCTCT CGAACTCGCT TGTCCCAACA CAGTTTCTTG CTCAGACATC  ATCTCCGTCG CAACACGTGA TCTTCTAATC ACCGTCGGTG GTCCTTACTA CGACGTTTTC CTCGGCCGTC GTGATTCAAG AACGTCGAAA TCTTCTCTTT TAACCGATCT TCTTCCTCTT  CCTTCCACAC CAATCTCTAA AATCATTCAA CAGTTTGAAT CAAAAGGTTT CACTGTTCAA GAAATGGTTG CTCTTAGTGG AGCACATTCT ATAGGGTTTT CACATTGTAA AGAGTTTGTG  GGTCGGGTGG GTCGGAATAA TACCGGGTAT AACCCGAGAT TCGCAGTGGC TTTGAAGAAA GCTTGTGCTA ATTACCCTAA AGATCCGACT ATCTCTGTGT TTAATGATAT TATGACTCCT  AATAAGTTTG ATAATATGTA TTATCAGAAT CTTAAAAAGG GTCTTGGGTT ACTTGAATCG GATCATGGAT TATATTCTGA CCCTAGAACC AGATATTTTG TTGATCTTTA TGCTAAGAAT 
CAAGATCTGT TTTTCAAAGA TTTTGCTAAA GCTATGCAGA AGTTGAGTCT TTTTGGTATA CAGACTGGTA GAAGAGGAGA GATCCGAAGA AGGTGCGATG CTATTAATTG A 

Retrieve as FASTA  
cDNA
Send to BLAST
.........1.........2.........3.........4.........5.........6.........7.........8.........9.........0.........1.........2
CTCTTCTCAA CAATGGCTTC ACTCAAATCT CTCTTCCTCC TCTTCCTCTT CTTCTTCACA GCTCAATCTC GCTTAACCAC AAACTTCTAC TCAAAAACAT GCCCAAGATT CCTCGACATC  ATCCGTGACA CAATCACAAA CAAACAAATC ACTAATCCCA CCACCGCAGC CGCCGTTATC CGTCTCTTCT TCCACGACTG TTTCCCTAAC GGCTGCGACG CCTCCGTCCT CATCTCCTCC  ACCGCCTTCA ACACCGCAGA ACGTGACTCT TCCATCAACC TCTCACTCCC CGGAGACGGT TTCGACGTCA TTGTCCGAGC CAAAACAGCT CTCGAACTCG CTTGTCCCAA CACAGTTTCT  TGCTCAGACA TCATCTCCGT CGCAACACGT GATCTTCTAA TCACCGTCGG TGGTCCTTAC TACGACGTTT TCCTCGGCCG TCGTGATTCA AGAACGTCGA AATCTTCTCT TTTAACCGAT  CTTCTTCCTC TTCCTTCCAC ACCAATCTCT AAAATCATTC AACAGTTTGA ATCAAAAGGT TTCACTGTTC AAGAAATGGT TGCTCTTAGT GGAGCACATT CTATAGGGTT TTCACATTGT  AAAGAGTTTG TGGGTCGGGT GGGTCGGAAT AATACCGGGT ATAACCCGAG ATTCGCAGTG GCTTTGAAGA AAGCTTGTGC TAATTACCCT AAAGATCCGA CTATCTCTGT GTTTAATGAT  ATTATGACTC CTAATAAGTT TGATAATATG TATTATCAGA ATCTTAAAAA GGGTCTTGGG TTACTTGAAT CGGATCATGG ATTATATTCT GACCCTAGAA CCAGATATTT TGTTGATCTT  TATGCTAAGA ATCAAGATCT GTTTTTCAAA GATTTTGCTA AAGCTATGCA GAAGTTGAGT CTTTTTGGTA TACAGACTGG TAGAAGAGGA GAGATCCGAA GAAGGTGCGA TGCTATTAAT  TGAGTTTATG TTTTTAATTT ATTTAATTTT TGGGTTATAT TGGATTGTGA ATCTTCTGAG TTATTACACT CATATGTTTT TGTGTAATGT AAAAGATATA TGGTTGATTG TTCTAATTAA 
GAGATTGGTT TTGGTAC 

Retrieve as FASTA