Entry information : AtPrx37 (At4g08770 / PER37 / AtperoxP37 / ATP38)
Entry ID 203
Creation 2006-07-27 (Filippo Passardi)
Last sequence changes 2015-06-03 (Christophe Dunand)
Sequence status complete
Reviewer Christophe Dunand
Last annotation changes 2016-05-18 (Christophe Dunand)
Peroxidase information: AtPrx37 (At4g08770 / PER37 / AtperoxP37 / ATP38)
Name (synonym) AtPrx37 (At4g08770 / PER37 / AtperoxP37 / ATP38)
Class Class III peroxidase    [Orthogroup: Prx035]
Taxonomy Eukaryota Viridiplantae Streptophyta Brassicaceae Arabidopsis
Organism Arabidopsis thaliana    [TaxId: 3702 ]
Cellular localisation N/D
Tissue types Mixed tissues
Roots
Vascular tissue
Inducer N/D
Repressor N/D
Best BLASTp hits
Perox score E-value AtPrx37
start..stop
S start..stop
AlyPrx37 656 0 16..346 15..345
AhalPrx37 654 0 1..346 1..346
AhalPrx27 652 0 1..346 1..346
AlyPrx38-1 650 0 1..346 1..346
Gene structure Fichier Exons
ExonStart..EndSize ExonStart..EndSize ExonStart..EndSize ExonStart..EndSize
N° 1 5600056..5600262 207 N° 2 5599110..5599301 192 N° 3 5598839..5599007 169 N° 4 5598259..5598731 473
complement(join(5598259..5598731,5598839..5599007,5599110..5599301,5600056..5600 262))


exon

Literature and cross-references AtPrx37 (At4g08770 / PER37 / AtperoxP37 / ATP38)
Literature Pedreira J, Herrera MT, Zarra I, Revilla G. The overexpression of AtPrx37, an apoplastic peroxidase, reduces growth in Arabidopsis. Physiol Plant. 2011 Feb;141(2):177-87. PMID: 21044085
Protein ref. UniProtKB:   Q9LDN9
DNA ref. Phytozome 12:   Chr4 (5600262..5598259)
mRNA ref. GenBank:   NM_116947
Cluster/Prediction ref. Phytozome Gene 12:   19644352 UniGene:   At.4181
Omic ref. AtProteome:   At4g08770 ATTED-II:   At4g08770 e-FP Browser:   At4g08770 ePlant:   At4g08770 TAIR:   At4g08770
Protein sequence: AtPrx37 (At4g08770 / PER37 / AtperoxP37 / ATP38)
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   346 (324)
PWM (Da):   %s   38047.3 (35645.9)  
PI (pH):   %s   7.72 (7.24) Peptide Signal:   %s   cut: 23 range:23-346
Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
.........1.........2.........3.........4.........5.........6.........7.........8.........9.........0.........1.........2
MHSSLIKLGFLLLLIQVSLSHAQLSPSFYDKTCPQVFDIATTTIVNALRSDPRIAASILRLHFHDCFVNGCDASILLDNTTSFRTEKDAFGNANSARGFDVIDKMKAAVEKACPKTVSCADLLAIAAQESVVLAGGPSWRVPNGRRDSLRGFMDLANDNLPAPFFTLNQLKDRFKNVGLDRASDLVALSGGHTFGKNQCQFIMDRLYNFSNTGLPDPTLDKSYLSTLRKQCPRNGNQSVLVDFDLRTPTLFDNKYYVNLKENKGLIQSDQELFSSPDASDTLPLVREYADGQGKFFDAFAKAMIRMSSLSPLTGKQGEIRLNCRVVNSKSKIMDVVEDALEFASSM

Retrieve as FASTA  
Remarks complete sequence from genomic (chromo 4, 3 introns), 4 cDNA and 13 ESTs.
Promoter
Send to BLAST
Send to cis Analysis
.........1.........2.........3.........4.........5.........6.........7.........8.........9.........0.........1.........2
ATTACCAGAA AACACTCTAT TAACATAAAT CATTTACCAA AACAAAGAAA AAATGTTATT TTTTCTTCTC TTTAGTTTAC GAATAATGTT TTTGTAGTGA AAGTTTCTTG TAAGTACTTT  CAATTAATTA ATATATCTAT GATTCAACTA CTAAGTACCA AATCTCACAT ATTACAGCAG CCCCCTTGGT TTGACGAATG ATATCACTAG CAGCCTCTTT GGTTTGACTA GCACCCGGCT  TGCTTTTGTC AAACCATGAA ACTTTCTTTC ATTTCATTAT TAGTCTCGTG GGTCTCTCAA CCACTCCATT GTCCTCTTTT TTTGGTTCGA ATCTAGGACT TTTTGTGTCA TACGACGAAG  GACTTGCCAC TAGGTCATCA ACTTCAGTCG TCTTTTAATA ATCAATATAG ATGAGTTTAT GTGGAAAATG CAAAAAGTTC TTAGAAAATG GGGAATTAAA AAAAACTTAG TGCTAGCACA  TGTTTTGTTT TTGTATTGAT ATGTGCTAGC ACTAAGTTTT TTTTAATTCC CCATTTTCTA AGAACTTTTT GCATTTTCAT CTTTACAATT TCAATTCATA TTTATATTCT TGCCTAACAA  AACCAATATA AGTAAAGACA TGCACTTTGC TTCTTTCTAT GTGTTTTCTT CACTTTTAGA CACATGATTC AATTTTTTTA ATAGTTAGGA TGCTCAGAAA CCGTTACTCG TATATCTCTC  CAAGACTAAA TAAAATTAAC GTTCTTTTGG AGAGCAGATC CTTTCTAACG CAGATCAGTA TCCTCTAAAA TCTCTATATT TTCAGTAACC AAATGGTTTA ACTACTAAAT ATCAAATATT  CGTCGTGTGT TACATGACTA ATTTTTAATA TACCATACAT AATTTTACAA GTTTATCCAC TCTTTTCCTT ATTTTCTACA ATTCTTTTCC TTATTTTTTT GGACAAAAGA CAATTATTTT  CCTTCTTTTT TCCCAACAAT TACTGTTAAA ACAAATCACA AAAGACAAGT ATACAGTAAA ACCTCCATAT ATTAATACTC TATAAATTAA TATATTTTTC CGATTCCAAA TTGGGACCAA  TGTAAAAAGA GATACAATCG ATAAATTTAA TGATAATATT TTTTTTGAAA AATGCTATGT ATACATATAG TACCATAATA TTATAAAATA ATATAAAAAA ATCAAATGAA ATATAATTTT  TAGTAATGTT TCTTTTGCTT AAATTCATAT TAGCTTTTGT TTAAATTTAA TTCTAATATG TTTACTGTAT CAAGTATTTT GGTGTTGTTT ACTAGACATG AAAATTATTT TGTACATGTA  AATGGTTCTA GAAAGATATT TTATTTAGTA AAAAAATCTT ATATTTTCAT TGAAAATTAA AAAAGTTATG AAATTAAGAA ACTCTCTCTA TAAATTAATA AATTATAACA TTATTAATTT  ATCGATAAAT TAATAGCTTT TTAAATTAAT AGAATTTTGC AGTCCTAATA CTATTAATTT ATAGAAGTTT TACTGTATAT GCACAAAAAA TAATAAACAT ACAGTATTGG TATAGCCAAA  AAAAAAAATG GATACATAAT CTTACGTGAA TGGCTAGATA AAAACGTCTA ATTTCAATAG AAAACACTGA TAAATAACCC TATTTACAGA AGAGAAAGTT TAAATGTATT TAAAGTGTGA  AATAAAGAGA TTCTGAATAA GAATACGCTA TAATTAAAGT ATTTTTAGAC TTTAAAACCT AGTAGCCGAA AGAAAACAGA TGCTTTTAAA CCACTTTGTA CAGAGTCATT CAACAAATAA  CAATGTCTTA TTCAAAGTAT AACATTCCAT ATGTAATATA CTATTCACGG ATACACAACT TGAATAAAAG TATGTCAAAT AATCCACAAA AGTAAAAGCC GCCAAGCTAG AACCTTGGCC 
TATAAAAAGA ATCGTTAAGA CAAACCTACA TTCACTCAAA TTAAACCATA ACCAAATAAT TCTCTTAAAA GAGCTAAGAA A 

Retrieve as FASTA  
Terminator +
Send to BLAST
Send to cis Analysis
.........1.........2.........3.........4.........5.........6.........7.........8.........9.........0.........1.........2
GGAAATGTTT TTCTTTAACA ATAAATAAAT TATCAATGTT GTCAAGATGT TATCTTTTTT TCTTACTTCC TTGTTTGTTT TGTGTTACTT ATTTAAATTC TATATAACTA TTAAACCTTG  AATCCATAAA TTATTTTTAC CTATAATGAA AGAAACATTA AATTATCAAT ACTAAGTAAT GGTCGTACGT CGATATTGTT GAACGTGGCG GATAAGTAAA ACGGGTTTTA CTTCTTCTTA  ATCTTACTTT CTCTATTGTA ATATGGTTAT ATACCTAAAT TAGTGTTTTC TCTTGAAGTT AGACATAGCT AGTGATAGCT ATTCACGTAA GTTTCTATAT ATGTTTATGT ATTCACATGA  AGTTTATAAA CTTATTGTAC ACGTTGATAA ATTTCAACAA TTATTGTAGA AAAAGGAAAA GAGTAATTAA GCAAATAATT AAAATCATAT ATATATATAT ATATATATAT ATATATATAT  ATTATGTAGT ACAAAGTAAT CATGTGCATA AAAGCGAGAA AAAAAAAACA CAGAGAATAA AGCGTAGGTC TTTAATCAAG TTGGATTATC CAAATCGTAA AACTATATTG GTTTTGTTAG  TCAAGAATAT AAAAATGAAT GTGTCGAACA CATACCGCTA CAAAGAAAAA ACAAACTATG TGCCTAAAAA CATTTTGCAT TGTTCACATA AACTCATATT TATCAATAAA TATAAGACAA  CTAAAGTTGA TGACCTAGTC AGTCTTTCAT ATGACACCAA AAGTCCCGAT TCCAACTCCG ATAAGATATA ATAAAATGGG TTGAAGAAAG CAAACCGGGT GCAAGTCAAA CCAAACATGT  TGATTTACTT CGTCAAATTA AAGAGGCTGC TCACTGTGTA ATATATGCAA TTTCGTAGTA GTTAACAGAT CCTTAATATA TTAGATAATT AAAAATATAA TGATTTATTT ACTTCAAACA 
CTTTATGTCG TTAGTTTTGT TATTGTTACT ACAATATGTT 

Retrieve as FASTA  
DNA
Send to BLAST
.........1.........2.........3.........4.........5.........6.........7.........8.........9.........0.........1.........2
ATGCATTCCTCTTTGATAAAATTGGGATTTCTTCTTCTTCTTATTCAGGTATCATTGTCTCATGCTCAACTAAGCCCTTCCTTTTACGATAAAACATGTCCGCAAGTCTTTGACATTGCA
ACCACTACCATTGTCAATGCTCTAAGATCGGACCCTCGCATCGCTGCAAGCATCCTTCGTCTTCATTTCCACGACTGCTTTGTTAAT
GTAAGATACCATTAGAATCAATATATTCATGTA
TATTTTAACTCTTTTGGTTCCCTATAGTGTAGCCCTAATAAAGAGCGCGAGGGAATGCTTTATGGATATTATAAACTTGAAATTAGGATATAAAAATGTGATAGACTTTTTGTTTTGTTG
TTCGACTCAAATAGTTTGTTTCATGGTTTATTCATTTCAAACTGTGAAATTATTTTGGTAGTTTTGTTATTGAAATTTTGGCTTTCTTTTAGTTAGTTAAAAAATTGAAAAAAACAGGAA
TGAAAGAAATTTACAAAAACAATAGAAATTTACTTTTACATACAAAATTTATGTCTTTTTAGTTAAATTATTTTTTTGGAAGTTTGATTATACTTATTTTGACTAGTTTTGGTTGAATTA
TGGAGACTGGAGAGGCTATATATAAAATGGACCAACAACTTCTCAAAGACATTAATTTGATATTATTAGTACAAGTCTACATAGATTGTAGTGCTTTCTTATCTCGAGTTTCAGATTCTG
TGTCAAAGTATGCTCGAAGATGTTTATAGTGAACTCATATTTTTTGGATTTCAAATATTCTGTCTTCGGATTCACGTGAAAAGATTATGCTATCGATAGTGTGATACATGTAGTAGTATA
ACTTGTTTATATTTAAATTCAAAGAATCTAAGATCAACTGTTTACGGATGTTAAGATTTTCTTTATGTAAACAATGTTGTTAGTTACTAAATGTGAAGAAAAATATTTTGTTTTGAAAAA
GGGATGTGATGCATCGATATTGTTAGACAACACCACATCGTTTAGGACGGAGAAAGATGCGTTTGGGAACGCTAATTCCGCTCGAGGTTTCGATGTGATCGACAAAATGAAGGCTGCCGT
GGAGAAAGCATGTCCTAAAACTGTTTCATGTGCTGATTTGCTCGCCATCGCGGCTCAAGAATCTGTCGTTTTG
GTATGCATCTTTTACTATGCTATCCAAATGGTTTCTAGACCATTTTG
TTTAATTTATAAGGAAGATGAGAGATAATTAGACCAAATATAATTGTTACTTTAGGCGGGAGGTCCTTCATGGAGGGTTCCAAATGGAAGAAGAGACAGCTTAAGAGGGTTCATGGATCT
TGCTAATGATAACCTTCCAGCTCCATTCTTTACCCTTAACCAACTTAAGGATAGATTCAAAAACGTCGGACTCGACCGTGCTTCTGATCTCGTTGCTCTTTCTG
GTACGTTATTTCGTTG
GCAACATTTTCATCTATAGTTGTAGTCACTAATAACTCAATATGATTATTGGTCAAGTTTATTTATTCGTTCTATATTTTCATTTGGTTAGGTGGTCACACCTTTGGCAAAAACCAATGT
CAATTCATAATGGATCGGCTTTATAACTTCAGTAACACTGGTTTACCCGACCCAACCCTTGATAAATCTTACCTCTCCACACTCAGAAAACAATGTCCACGTAATGGAAACCAGAGTGTA
TTGGTAGATTTTGATTTACGTACGCCAACACTCTTTGACAACAAGTATTATGTGAACCTCAAGGAGAACAAAGGACTTATCCAGAGCGACCAAGAGTTATTCTCTAGCCCTGATGCTTCA
GACACTCTTCCTTTAGTCCGAGAATACGCTGATGGTCAAGGGAAATTTTTCGATGCGTTCGCGAAGGCAATGATAAGGATGAGTAGTCTTTCACCTTTAACAGGGAAACAAGGAGAAATA
AGATTGAACTGTAGAGTGGTGAATTCGAAATCTAAAATCATGGATGTGGTAGAAGATGCTCTTGAATTTGCAAGCTCAATGTGA

Retrieve as FASTA  
CDS
Send to BLAST
.........1.........2.........3.........4.........5.........6.........7.........8.........9.........0.........1.........2
ATGCATTCCTCTTTGATAAAATTGGGATTTCTTCTTCTTCTTATTCAGGTATCATTGTCTCATGCTCAACTAAGCCCTTCCTTTTACGATAAAACATGTCCGCAAGTCTTTGACATTGCA
ACCACTACCATTGTCAATGCTCTAAGATCGGACCCTCGCATCGCTGCAAGCATCCTTCGTCTTCATTTCCACGACTGCTTTGTTAAT
GGATGTGATGCATCGATATTGTTAGACAACACC
ACATCGTTTAGGACGGAGAAAGATGCGTTTGGGAACGCTAATTCCGCTCGAGGTTTCGATGTGATCGACAAAATGAAGGCTGCCGTGGAGAAAGCATGTCCTAAAACTGTTTCATGTGCT
GATTTGCTCGCCATCGCGGCTCAAGAATCTGTCGTTTTG
GCGGGAGGTCCTTCATGGAGGGTTCCAAATGGAAGAAGAGACAGCTTAAGAGGGTTCATGGATCTTGCTAATGATAACCTT
CCAGCTCCATTCTTTACCCTTAACCAACTTAAGGATAGATTCAAAAACGTCGGACTCGACCGTGCTTCTGATCTCGTTGCTCTTTCTG
GTGGTCACACCTTTGGCAAAAACCAATGTCAA
TTCATAATGGATCGGCTTTATAACTTCAGTAACACTGGTTTACCCGACCCAACCCTTGATAAATCTTACCTCTCCACACTCAGAAAACAATGTCCACGTAATGGAAACCAGAGTGTATTG
GTAGATTTTGATTTACGTACGCCAACACTCTTTGACAACAAGTATTATGTGAACCTCAAGGAGAACAAAGGACTTATCCAGAGCGACCAAGAGTTATTCTCTAGCCCTGATGCTTCAGAC
ACTCTTCCTTTAGTCCGAGAATACGCTGATGGTCAAGGGAAATTTTTCGATGCGTTCGCGAAGGCAATGATAAGGATGAGTAGTCTTTCACCTTTAACAGGGAAACAAGGAGAAATAAGA
TTGAACTGTAGAGTGGTGAATTCGAAATCTAAAATCATGGATGTGGTAGAAGATGCTCTTGAATTTGCAAGCTCAATGTGA

Retrieve as FASTA  
cDNA
Send to BLAST
.........1.........2.........3.........4.........5.........6.........7.........8.........9.........0.........1.........2
TCACTCAAAT TAAACCATAA CCAAATAATT CTCTTAAAAG AGCTAAGAAA ATGCATTCCT CTTTGATAAA ATTGGGATTT CTTCTTCTTC TTATTCAGGT ATCATTGTCT CATGCTCAAC  TAAGCCCTTC CTTTTACGAT AAAACATGTC CGCAAGTCTT TGACATTGCA ACCACTACCA TTGTCAATGC TCTAAGATCG GACCCTCGCA TCGCTGCAAG CATCCTTCGT CTTCATTTCC  ACGACTGCTT TGTTAATGGA TGTGATGCAT CGATATTGTT AGACAACACC ACATCGTTTA GGACGGAGAA AGATGCGTTT GGGAACGCTA ATTCCGCTCG AGGTTTCGAT GTGATCGACA  AAATGAAGGC TGCCGTGGAG AAAGCATGTC CTAAAACTGT TTCATGTGCT GATTTGCTCG CCATCGCGGC TCAAGAATCT GTCGTTTTGG CGGGAGGTCC TTCATGGAGG GTTCCAAATG  GAAGAAGAGA CAGCTTAAGA GGGTTCATGG ATCTTGCTAA TGATAACCTT CCAGCTCCAT TCTTTACCCT TAACCAACTT AAGGATAGAT TCAAAAACGT CGGACTCGAC CGTGCTTCTG  ATCTCGTTGC TCTTTCTGGT GGTCACACCT TTGGCAAAAA CCAATGTCAA TTCATAATGG ATCGGCTTTA TAACTTCAGT AACACTGGTT TACCCGACCC AACCCTTGAT AAATCTTACC  TCTCCACACT CAGAAAACAA TGTCCACGTA ATGGAAACCA GAGTGTATTG GTAGATTTTG ATTTACGTAC GCCAACACTC TTTGACAACA AGTATTATGT GAACCTCAAG GAGAACAAAG  GACTTATCCA GAGCGACCAA GAGTTATTCT CTAGCCCTGA TGCTTCAGAC ACTCTTCCTT TAGTCCGAGA ATACGCTGAT GGTCAAGGGA AATTTTTCGA TGCGTTCGCG AAGGCAATGA  TAAGGATGAG TAGTCTTTCA CCTTTAACAG GGAAACAAGG AGAAATAAGA TTGAACTGTA GAGTGGTGAA TTCGAAATCT AAAATCATGG ATGTGGTAGA AGATGCTCTT GAATTTGCAA  GCTCAATGTG AGGAAATGTT TTTCTTTAAC AATAAATAAA TTATCAATGT TGTCAAGATG TTATCTTTTT TTCTTACTTC CTTGTTTGTT TTGTGTTACT TATTTAAATT CTATATAACT 
ATTAAACCTT GAATCCATAA ATTATTTTTA CCTAT 

Retrieve as FASTA