Entry information : PtaPrx08(PTA00020779)
Entry ID 2042
Creation 2007-09-05 (Christophe Dunand)
Last sequence changes 2007-09-05 (Christophe Dunand)
Sequence status complete
Reviewer Not yet reviewed
Last annotation changes 2020-12-28 (Christophe Dunand)
Peroxidase information: PtaPrx08(PTA00020779)
Name PtaPrx08(PTA00020779)
Class Class III peroxidase    [Orthogroup: Prx059]
Taxonomy Eukaryota Viridiplantae Streptophyta Pinaceae Pinus
Organism Pinus taeda (loblolly pine)    [TaxId: 3352 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type Roots
Inducer N/D
Repressor N/D
Best BLASTp hits
Perox score E-value PtaPrx08
start..stop
S start..stop
PtaPrx117 678 0 1..372 1..372
PabPrx185 589 0 10..372 4..366
PabPrx166 575 0 1..372 1..371
PabPrx176 514 0 1..370 1..368
Literature and cross-references PtaPrx08(PTA00020779)
Literature Pratt,L. et al., An EST database from untreated loblolly pine (Pinus taeda) roots, unpublished.
EST ref. GenBank:   DR061148 [5' end]   DR061229 [3' end]   CF670585.1 [Fragment]
Cluster/Prediction ref. UniGene:   Pta.15407   Pta.31125
Protein sequence: PtaPrx08(PTA00020779)
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   372 (344)
PWM (Da):   %s   39819.44 (36764.8) Transmb domain:   %s   i7-29o
PI (pH):   %s   3.8 (3.72) Peptide Signal:   %s   cut: 29 range:29-372
Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
MKNYMALHTF TVISVFLFVS VAIISANGYD IDTDDLPTPV DGLSWTFYNE TCPDLESIVN ATLQQALEAD ITQAAGLLRI HFHDCFVQGC DASLLLTGTS SDPGELEDTP NLTLRASAIA  IINEIKAAVE ANCSGVVSCA DIVTLAARGS VATAGGPDYP VPLGRRDSLD YANSTVVDDN LPSPVSNLTT LETHFDSKGL NLTYLVALSG GHTIGLGHCT SFDNRLYNLT TGDTIVDSTL  NTTFASTLYS ICPVVNDTVN ATNLDLITPN VFDNNYYVDL QNGEGLFTSD ASLYTDSTDS EDIVNSFAAN QTLFFQNFIL GMLKMGQLDV LTGTEGEIRT NCSVVNNASL YYQQIIEPIV 
GPEERSPSSQ FT 

Retrieve as FASTA  
Remarks Complete sequence from genomic (incorrect prediction, splicing errror exons 2/3) and 9+3 ESTs (two unigenes).
DNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGAAGAACT ACATGGCTTT ACACAACTTT ACCGTTATTT CTGTTTTTTT ATTTGTTTCT GTCGCTATTA TCTCTGCCAA TGGATATGAT ATAGATACAG ACGATCTACC AACGCCTGTG  GATGGGCTCT CATGGACATT TTACAACGAG ACTTGCCCAG ACTTGGAGTC CATTGTTAAC GCAACACTAC AACAGGCGCT GGAGGCCGAT ATCACCCAAG CAGCAGGATT GTTGAGAATT  CATTTTCACG ATTGTTTTGT GCAAGTAAGC AGATATTTAG CTTCGTTACT TACCTGGGTG ATTGGGAGCC TTGAGCCTGG AGATTTTAAT TAGATTTTGT CTCTTTTAAT TAAGTTATGA  GCATGGCTTT TGTTTTAAAA ACGATATAGC GGATTCACTT AGTATACTAG ATTTATTGGA TCGCGCTTTT AAATTTAAAG CATGTTCTTA CTTTTAATCT TCCCAAACTT ATTAGAGAAT  GATATGAAGT TTTCAGTAAC TCTTTGATGA TTTTTTTGTT ATTTTTTAAG ATTTATACAC AGCCTTATTA TAATCTAAAG CGTATTATTA AGGTATATAT ATGTTTAGGT TTATTAAAAA  TATTATTAAA TTATAGATAT TACACTTGAG GTTAGATTAT GAGTTTTGAG TGTGAATTAA AATTGTTTTT ATTTGGTTAA AAGTTTATTT TCTTCGGAAC ATATTAATTA TGGAACACCT  AGAAGCATCT CCAAGAATGC AAAGCCTGTC CTCCAGCCCG CAAATGATTC CAAGTGAATG GATAACAACC TTTAATGGTA GTAGGAATAG TTATAATAGA TTTTCTAAAA AAATTGATGT  CAAATTTATT CTGAGTTTGA ATATATTTAA AAACATTTTC TAATTATTAT ATTTTTAATA ATCCCATAnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn  nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn  nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn  nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn  nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn  nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn  nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn  nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn  nnnnnnnnnn nATTTATGCA AAATCTCAAT ACATATAAAA TTTATTTTCA AACATCTATA CAAAGTTTAT ACATCTTTAT ATCTATTGAA TTTTTTTTAT ACATGTTTAT ATCTATTGAA  AAAATTATAA AAAATTTATA CATGTTAACT TTATTGTAAA TATCTATACA AAGTTATGTT AAATTTGTAC ATGTTTATAT CTATTGGTTC CAGATAGATT GCAGATTTTC AAATTATGCA  TTTATCCTAA TTTGGAAGAT GGGCATGTAT CTTTATTTCT AATCGACCCT ATACACCTAA AACCCTAATT ATTCATTATT ATTATCACCC ATCGAATAAA GAAAGAACAG TTTTTTTGAG  GCAAAAATAT CAGCAATAGT TTTTAGGCAA AAATATCGCG AAGGTTTAAA ACATTCGTTA TACATAAAAC CACGCAAGAT ATCTTAAAAC CATCTAGTAT ATTCTTAAAC TTTCCCATAG  TTGTAAAACC TGGAATCTGA ATATGAATTC TGAATTACAA GGGTTGAGTG TTCGAATATT GCGCCCCTTT ACATGTTACA GTTTTCTAAA TGCTATGAAT CTAATATTGT TGCTCTTTTC  GGGAAAGGGT TGCGATGCAT CTCTGTTGCT GACAGGAACA TCAAGCGATC CCGGTGAACT GGAGGATACT CCAAACCTCA CACTGAGAGC CAGCGCCATC GCGATAATCA ACGAAATCAA  GGCCGCTGTA GAAGCCAACT GCAGCGGTGT TGTATCGTGC GCGGATATTG TGACTTTGGC TGCTCGTGGT TCCGTCGCTA CGGTAGGTAC CACGATACTT TTGTGGCATT ATTTTTATGG  TTCTGCTGTC TCTGATGGAA AATTACAATT GGATTGATAC AAGTTGTCAT TTTGAAGGCG GGAGGTCCGG ATTATCCAGT ACCGCTTGGG CGCAGAGATA GCCTTGACTA CGCCAATTCA  ACGGTCGTTG ATGACAATTT ACCAAGTCCA GTTTCAAACT TAACGACGCT GGAGACCCAT TTTGATTCCA AGGGATTGAA TTTGACATAT TTGGTAGCCC TTTCAGGTTT GATTTTTCGA  CTCTTTAGCT TTTATTCTAG TGATACTTCA TTTATGTAGA TTGCAGAGTT TGTAAATATT TCTAAATCTG ACTATCAAGA GAAATGAACC TATTAACTTG ACTTATGACA AATTCTGAAA  TATGTAATAA ACACAAGAAT GGCCATACAA TTACATCCTG TATCCTTACT CAGATTCCGG ATTTCCAATA TCCCTCTGAT GACATACGTA GTAAAAATGT TAGGGCATCC TTCATTGAGC  TTTGTAATAT CATAGAATCT AAACTTATGG CAGGTAATAA GGTTCAACAA TTGACTCTTC TTCATCTGAT TGTGGAAGAT ACACCATATA GCTTCAAAAT TATGACAATG CATGTTATTT  CAATTGACAA TTTCAATCCC ATGTTGCGTA CCTTAGTTAG AGAAGATTTT GGAATGTTAA TTTAATCTGT AATATAGAAG AGAAGATGTT GATTTATGTG ATACAGTTAT TTTTGCAGTG  AGTTTGGCAG TTGAAAATAT GTTTTTTTTT TTTTTTAATT ATAAAAAAAA TCAAAATTTT ATTAATTATG TAAGTTTTAT TAGCACAGTT GGTTGAGGAT GGCTTTCTTT TGCATGGCCC  ATTAAATTTT AAGGAGATTG TTGGGTTAGA CATGCTAAAA TCCAGTCAAC TTAGGACGGG TGTAGTCCAA TCAGAGTGAC TTAGAAAGCA AGACTTAGAG GAGATGTTGC ACTACACATG  CTAAAATCAA GTCAGCTTAG AGTTGTCCTG GCCTAGTCAG AGTGACTCAA AAAGCAAGAC TGTTGCACTG AACATGCTAA AATGCAATCA GCTTAAAATT GTTGTAGCCT AGTCAAAGTG  ACTTAAAAGA CCCCTACATC AAGGTTTCTC AAGCCACAAA CCCACCCTGA AAAATAATAC AACTTAACAA ACAAACCAAA ACAAAAAAAT TGTTTATTAA ACTCAATGTG ATAGACCTTG  AAGATGAGTT TTTTTCTCAA TATAATGGAT CTGGAAGGTG AATTTCAAAA ATAAAAAATG AGATTATTAT GGTTACTTAA TAACATGCAA TGTTTCAGGT GGGCACACAA TTGGTCTCGG  TCACTGCACC TCCTTCGACA ACCGATTATA TAACCTCACC ACAGGAGACA CAATTGTGGA TTCAACTTTA AACACCACTT TTGCAAGCAC TCTTTATTCA ATATGTCCAG TGGTTAATGA  CACTGTCAAC GCAACAAACT TGGATCTTAT TACTCCAAAT GTTTTCGACA ACAATTATTA CGTCGACTTG CAGAACGGCG AAGGACTTTT CACCTCCGAC GCGAGTCTGT ACACGGATTC  CACCGATTCT GAAGACATTG TGAACAGTTT CGCAGCTAAC CAGACCCTGT TCTTCCAGAA CTTCATTCTG GGAATGCTTA AAATGGGGCA ACTGGACGTT TTAACGGGAA CAGAGGGAGA 
GATACGTACC AACTGCTCCG TTGTCAATAA TGCTTCTTTA TACTATCAAC AAATTATCGA GCCCATCGTT GGTCCAGAGG AGCGTTCTCC ATCTTCACTG TTCACATAA 

Retrieve as FASTA  
CDS
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGAAGAACT ACATGGCTTT ACACAACTTT ACCGTTATTT CTGTTTTTTT ATTTGTTTCT GTCGCTATTA TCTCTGCCAA TGGATATGAT ATAGATACAG ACGATCTACC AACGCCTGTG  GATGGGCTCT CATGGACATT TTACAACGAG ACTTGCCCAG ACTTGGAGTC CATTGTTAAC GCAACACTAC AACAGGCGCT GGAGGCCGAT ATCACCCAAG CAGCAGGATT GTTGAGAATT  CATTTTCACG ATTGTTTTGT GCAAGGTTGC GATGCATCTC TGTTGCTGAC AGGAACATCA AGCGATCCCG GTGAACTGGA GGATACTCCA AACCTCACAC TGAGAGCCAG CGCCATCGCG  ATAATCAACG AAATCAAGGC CGCTGTAGAA GCCAACTGCA GCGGTGTTGT ATCGTGCGCG GATATTGTGA CTTTGGCTGC TCGTGGTTCC GTCGCTACGG CGGGAGGTCC GGATTATCCA  GTACCGCTTG GGCGCAGAGA TAGCCTTGAC TACGCCAATT CAACGGTCGT TGATGACAAT TTACCAAGTC CAGTTTCAAA CTTAACGACG CTGGAGACCC ATTTTGATTC CAAGGGATTG  AATTTGACAT ATTTGGTAGC CCTTTCAGGT GGGCACACAA TTGGTCTCGG TCACTGCACC TCCTTCGACA ACCGATTATA TAACCTCACC ACAGGAGACA CAATTGTGGA TTCAACTTTA  AACACCACTT TTGCAAGCAC TCTTTATTCA ATATGTCCAG TGGTTAATGA CACTGTCAAC GCAACAAACT TGGATCTTAT TACTCCAAAT GTTTTCGACA ACAATTATTA CGTCGACTTG  CAGAACGGCG AAGGACTTTT CACCTCCGAC GCGAGTCTGT ACACGGATTC CACCGATTCT GAAGACATTG TGAACAGTTT CGCAGCTAAC CAGACCCTGT TCTTCCAGAA CTTCATTCTG  GGAATGCTTA AAATGGGGCA ACTGGACGTT TTAACGGGAA CAGAGGGAGA GATACGTACC AACTGCTCCG TTGTCAATAA TGCTTCTTTA TACTATCAAC AAATTATCGA GCCCATCGTT 
GGTCCAGAGG AGCGTTCTCC ATCTTCACTG TTCACATAA 

Retrieve as FASTA