Entry information : AtPrx45 (At4g30170 / PER45 / AtperoxP45 / ATP8a / Atperox8A / Atp8)
Entry ID 211
Creation 2006-04-10 (Filippo Passardi)
Last sequence changes 2015-06-03 (Christophe Dunand)
Sequence status complete
Reviewer Achraf Jemmat
Last annotation changes 2015-11-10 (Achraf Jemmat)
Peroxidase information: AtPrx45 (At4g30170 / PER45 / AtperoxP45 / ATP8a / Atperox8A / Atp8)
Name (synonym) AtPrx45 (At4g30170 / PER45 / AtperoxP45 / ATP8a / Atperox8A / Atp8)
Class Class III peroxidase    [Orthogroup: Prx019]
Taxonomy Eukaryota Viridiplantae Streptophyta Brassicaceae Arabidopsis
Organism Arabidopsis thaliana    [TaxId: 3702 ]
Cellular localisation N/D
Tissue types Callus
Etiolated hypocotyls
Mixed tissues
Roots
Rosettes
Stamen Abscission Zone
Whole seedlings
Inducers Drought
Hormon treatment
Stress treatment
Repressor N/D
Best BLASTp hits
Perox score E-value AtPrx45
start..stop
S start..stop
AlyPrx45 612 0 1..325 1..325
AhalPrx16 611 0 1..325 1..325
TsPrx45 606 0 1..325 3..327
BrPrx45-1Aa_other 602 0 1..325 1..325
Gene structure Fichier Exons
ExonStart..EndSize ExonStart..EndSize ExonStart..EndSize ExonStart..EndSize
N° 1 14762922..14763137 216 N° 2 14763293..14763481 189 N° 3 14763819..14763984 166 N° 4 14764076..14764482 407
join(14762922..14763137,14763293..14763481,14763819..14763984,14764076..14764482 )


exon

Literature and cross-references AtPrx45 (At4g30170 / PER45 / AtperoxP45 / ATP8a / Atperox8A / Atp8)
Literature REFERENCE 1 Cai S, Lashbrook CC. Stamen abscission zone transcriptome profiling reveals new candidates for abscission control: enhanced retention of floral organs in transgenic plants overexpressing Arabidopsis ZINC FINGER PROTEIN2. Plant Physiol. 2008 Mar;146(3):1305-21
Protein ref. UniProtKB:   Q96522
DNA ref. Phytozome 11:   Chr4 (14762922..14764482)
mRNA ref. GenBank:   NM_119163
Cluster/Prediction ref. Phytozome Gene 11:   19647742 UniGene:   At.24710
Omic ref. AtProteome:   At4g30170 ATTED-II:   At4g30170 e-FP Browser:   At4g30170 ePlant:   At4g30170 Genevestigator:   At4g30170 TAIR:   At4g30170
Protein sequence: AtPrx45 (At4g30170 / PER45 / AtperoxP45 / ATP8a / Atperox8A / Atp8)
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   325 (300)
PWM (Da):   %s   35691.99 (32917.6)  
PI (pH):   %s   9.37 (9.56) Peptide Signal:   %s   cut: 26 range:26-325
Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
.........1.........2.........3.........4.........5.........6.........7.........8.........9.........0.........1.........2
MEKNTSQTIFSNFFLLLLLSSCVSAQLRTGFYQNSCPNVETIVRNAVRQKFQQTFVTAPATLRLFFHDCFVRGCDASIMIASPSERDHPDDMSLAGDGFDTVVKAKQAVDSNPNCRNKVSCADILALATREVVVLTGGPSYPVELGRRDGRISTKASVQSQLPQPEFNLNQLNGMFSRHGLSQTDMIALSGAHTIGFAHCGKMSKRIYNFSPTTRIDPSINRGYVVQLKQMCPIGVDVRIAINMDPTSPRTFDNAYFKNLQQGKGLFTSDQILFTDQRSRSTVNSFANSEGAFRQAFITAITKLGRVGVLTGNAGEIRRDCSRVN

Retrieve as FASTA  
Remarks Complete sequence from genomic (3 introns), 5 cDNA and 59 ESTs. Mainly found in roots. Also found by proteomic (Feiz, 2004)
Promoter
Send to BLAST
Send to cis Analysis
.........1.........2.........3.........4.........5.........6.........7.........8.........9.........0.........1.........2
AGTCATTGAT GTAAGATCTC TTAACAAACT CTTTTTTCAA TATATTTCTA ATGTGAAATC GGATAATTAT AATATGTAGA AAAGTTGATA CAATCATTTA CTTTCAAATT AATTATCGTC  TAATTCATAT AAAATCATGC GTAGTTGTGG AACTTTATTT ACTACTATTA GTAACTTATT TTACTGTTAT AATGAAATTT TGCGTGAAAA GCTTCTTACT TGTGAATTAA TTCGCATTTG  GCATTACAGT GACATGCCTT GTCGCTTTTT TCCAGTTTAG TGTTTTTTTA ATCGTATATT CGTATGAGAG AATATCATTA ATTAAAAACG TTAAAACAAA ACATTATCAA CTCAATTATT  GACAATATTA CAGCATCAAG GAACATGTTC GTGACCGCGA CGCCCATTTT TTTATTAGGA TAATTTTCTT ACATTTTGTT TTATTGTGGA TCCCTTAATA ATTTCATAGA AAACTAAAAA  AACTGTCCCT AATACGGCAA TCAGGGATTT AATCATTTTC TTAACGACGA TTAAAATTAG GTCTAATACA TTACAATATA TGTATGAAAA CGTTGCATCG TCTCGCATGA CTTAATTGTC  TCCCAAACAT GTAGTATTTG ATGATCTTTG ACGTAATTTT TTTTTGTTAG AGTATCTTTG ATGTATATAT TTATCATCCA ATTTATAATT AGTAGTGTAA TGATATCACA ATACAGTTCT  TACATTTTGA ATGACATTGG TTTCCAGATT TAACTTCATA TGTCTTGCCA AGTAAAATTT GTACGCATTG ATATAGTATC ATGGTCCTGA CTTTAAGCAT TGGCGATGGG TAATGATATT  AATGAAATAT CGGCGAAATT TCTTGGATAA AAAGAAAAGA TTCGTACGCA TGAAACCAAT ATGTGATGTT GGTTCCATAT TCACATAGCA TTTGTAAAAT TTAGAATAAA ATCGAGTTTA  CGTCAGAGCC ATCCAACCAT TACCATTAAA AATTGGATGA ACTGATGAAC AGGTTGAACC AGAAATTGTC ACTCAAAGTT AGAGCTTGGT TGATAGGTTC TTAAGACTAA ACAGTTCCTC  ATCAGTATGT AATATAATGA AATAATTTAA TCTCTTTGTG TGTAAGGTGT TAACTGGACT ACCACTAGAC TGAATTTTTA ATTAAGTCTT ATCCTATAGT CTTTTCAATA AGTTCACAAT  TGCAAGTACT TAATAAACAA AATAATTAAT CAGTTAATTA TGACAAATTA GTCAACATCC GATCACATTC CACGTTGTAA AGTTAAATTT TAAGGTAGAT ACTAATCATA CTTGTAAAAT  GAATAAGATG AGTTCTTCTT CTTGTCACCT CTCGATCTTG TTTTAAGTAG TTGGTGAGAT GTGATAAACT TGTAACATGC CACTGAGTTG TCAAAGACAA GCATCTATAC AGTTATTAAA  AAAAAAGGTT AAGCATGTAA AAATACACAC ACATGTCGTA GTAAATATAC ACCTTTTTAT AATTAATTAT ATTGTAACGA ATTTGTTGTT TTGTTATAAT ATATAGATTA ATGCATGATG  TTTTGCGATT AAAGCCAGAC GAGTTGTAAT ATCCACAGCC TTGATAAGCT CTACATGCAG TGAACAATTT TATACATTTA GAAAAAATAA TCACTATCTC GACCATATAG ACCAGGCCAC  TACATTACAG CTAATCTCTG GATTTACTTG ATAATTAAGA CAAATATAGA ACATTAAAAT ACTAACTCGA TGCCTCACCT TAGCCTCCTC TCAAATTGTC AATATCTAGA TGGAGTGTTA  CATCCACATT CCTAACAGTT TTTACTCTTT ATTTTAATAT ATCCTTCAAC AGATCATCAT CAGAATAATC ATCAAATCAT TATTATATAT TTAACTAGCC CAAATTGTAC CATACCTATC 
AATTTAAATT TCTCTTTCTA TCTACTATAA AAAGTGACTC TCTAAGAACT CCAAAGATTA GAACATTGAA TTGAATTAGC C 

Retrieve as FASTA  
Terminator +
Send to BLAST
Send to cis Analysis
.........1.........2.........3.........4.........5.........6.........7.........8.........9.........0.........1.........2
TGTGATTTGA GGTTTTCTTT CTTTTATTCC TTAAAGAGGA TTTTTTTTTT TAATAATAAA ATTTAATTTC TTGTTGTCAA AATAAGGAGT TCATAAGTGT GAAACATGGA AACTTAAATT  AATAAGATGG GTTTATTTCG TTGACAAAAA AAAAAAAAGA TGGGTTTATT TCGTTTCTCT CTTCTCCTTT TTATGGTATT CCAGGGAGGA TACAAAATAT CAAAGTAGAG ATCTTGGATA  GATTTATTAC TGTTAAAGAT AACTGGAGAA CAAACAACTT TTTTTTTTTT TTTTGTAAAC AACAAACAAT TCATTTTATT GCAAAATTTA TAAAAGATTT GAAACGAGAA ACATTACCAA  TTTATTCTTG ACAAAGTTAT CAAATATCTA TATCTTCACC GCTAAAATCT TTCCATTCGA CTATAATCCT CAATCCTCTT TATGCATAAT TGCTATTGTT AACTTGGGCT ACACTTGGAG  TCTGGACTTG CTGATTTGTT GCATTTGTAA TGGAGAGGCC CATTATTCTG ACCCAATCTA AAAGTTCTAA CAACTGCAGC TTTCTTCTTC TTCTTCTGCT TAATTTTTCT TTATTTACGA  CCAATGTTTT CAAACTCGAA ACGATTTGGC TAGTCAGAAT GGAGAGGCCC ATTATCCTCG TTAACTTGGT AAGTTTGTGA CTTTGGTAAA CTTAAATGAT TTATTTAGAT AAATGATCAT  AAATGTTAAT ATATAAATTA TCAATGATAA AGCTGTAACT TCAAGCCTTC AGATTTTTTT TACGTTTTGA GCAAAATACC CTTAGCATTT CGTATAATCA TATGTTAAAC AGCGTGGTAT  CACTATAAGA TCAAACCAAA TAATCAAATT GCATATAATC ATTATTAATT TTTTTTATTT TTATTTTTAA TTGTATATTA TTTCTCTAAG CAACATGTTA TATATTTTGT CTAAAACTGT 
TTCATGAGTA AACTAGTATG TCGTTTTGAG TGTCTACCAT 

Retrieve as FASTA  
DNA
Send to BLAST
.........1.........2.........3.........4.........5.........6.........7.........8.........9.........0.........1.........2
ATGGAGAAGAATACTTCTCAAACCATCTTCTCCAACTTTTTTCTTCTCCTTCTCCTTTCTTCATGTGTCTCTGCTCAGCTCCGGACAGGTTTCTACCAGAACTCATGTCCGAACGTGGAA
ACCATTGTACGTAACGCTGTCCGTCAGAAATTCCAGCAGACTTTCGTTACCGCTCCGGCCACTCTTCGCCTCTTCTTCCACGATTGCTTCGTTCGT
GTACGTTACAATTTTCTTTTGATA
TTTTCGTACAATATAAGAAGTTTATTTCTGATCGAAATGTATCCCCAAAACATCTAGATTTAGAGTTTACGATGTTTATCTTCTATGTATCATTTTCAAATAAAACATTATCTTTACGTA
TGAATGTATAGGGATGTGATGCGTCAATAATGATAGCATCACCATCGGAGAGAGACCATCCAGATGACATGTCATTGGCCGGAGACGGATTCGACACGGTGGTGAAGGCGAAGCAAGCCG
TTGATAGCAATCCCAATTGCCGCAACAAAGTCTCATGTGCTGACATTTTGGCTCTCGCCACTCGTGAAGTCGTCGTTTTG
GTACACTAATATATATATATATATATATATATATATATAT
ATATATATATATATTTTACATCACTTAGTTATTCCTCTATTATTCCTTTAATACATATTATATAATGTCCGAGGTATTGAAAATTCGTTTTTTCTACAGTATATATCGTTTTCAGTTTTC
TTGTGCGAAAAAGCTAATCATATCATTAAATATAATACAAGTACAAGTAACAACTACACAGTGACACTTTTTATTGGCGGTTTGTAATTTAAGACAAGTACAAGTAACAACTACACAGGT
CATATAGTAATCTGATCAGATAATAACAATAGTAATCTGACTAAATAAAAATTGCAGACCGGAGGACCAAGCTACCCGGTGGAGCTAGGGAGGAGAGATGGCAGAATCTCCACGAAGGCC
AGCGTTCAAAGCCAATTGCCTCAGCCCGAGTTTAACCTAAACCAGCTCAACGGCATGTTTAGCCGTCACGGCCTCTCTCAAACCGATATGATTGCCCTCTCAG
GTACCAAAACCGAACTT
AACCTATTATATTTTTCTACTTTAACCAAATTCTTATGGTATAGTATTAATGTTATTGTGACGTTATAATTCAGGAGCACACACTATAGGATTTGCACATTGTGGAAAAATGTCAAAGAG
AATATACAATTTTAGCCCTACAACACGTATCGACCCGAGTATAAACCGTGGATACGTGGTTCAGCTTAAGCAAATGTGCCCGATCGGTGTCGACGTAAGAATCGCAATCAACATGGATCC
GACCAGTCCACGTACTTTCGATAATGCTTATTTCAAGAATCTCCAACAAGGAAAGGGTTTGTTCACGTCAGATCAAATCTTGTTCACAGATCAACGGTCAAGATCTACAGTTAATTCGTT
TGCCAATAGTGAAGGAGCTTTTAGACAAGCTTTCATCACAGCGATCACGAAGTTAGGTCGGGTTGGTGTTTTGACTGGTAATGCTGGTGAGATTCGAAGGGATTGTTCACGTGTCAATTA
G

Retrieve as FASTA  
CDS
Send to BLAST
.........1.........2.........3.........4.........5.........6.........7.........8.........9.........0.........1.........2
ATGGAGAAGAATACTTCTCAAACCATCTTCTCCAACTTTTTTCTTCTCCTTCTCCTTTCTTCATGTGTCTCTGCTCAGCTCCGGACAGGTTTCTACCAGAACTCATGTCCGAACGTGGAA
ACCATTGTACGTAACGCTGTCCGTCAGAAATTCCAGCAGACTTTCGTTACCGCTCCGGCCACTCTTCGCCTCTTCTTCCACGATTGCTTCGTTCGT
GGATGTGATGCGTCAATAATGATA
GCATCACCATCGGAGAGAGACCATCCAGATGACATGTCATTGGCCGGAGACGGATTCGACACGGTGGTGAAGGCGAAGCAAGCCGTTGATAGCAATCCCAATTGCCGCAACAAAGTCTCA
TGTGCTGACATTTTGGCTCTCGCCACTCGTGAAGTCGTCGTTTTG
ACCGGAGGACCAAGCTACCCGGTGGAGCTAGGGAGGAGAGATGGCAGAATCTCCACGAAGGCCAGCGTTCAAAGC
CAATTGCCTCAGCCCGAGTTTAACCTAAACCAGCTCAACGGCATGTTTAGCCGTCACGGCCTCTCTCAAACCGATATGATTGCCCTCTCAG
GAGCACACACTATAGGATTTGCACATTGT
GGAAAAATGTCAAAGAGAATATACAATTTTAGCCCTACAACACGTATCGACCCGAGTATAAACCGTGGATACGTGGTTCAGCTTAAGCAAATGTGCCCGATCGGTGTCGACGTAAGAATC
GCAATCAACATGGATCCGACCAGTCCACGTACTTTCGATAATGCTTATTTCAAGAATCTCCAACAAGGAAAGGGTTTGTTCACGTCAGATCAAATCTTGTTCACAGATCAACGGTCAAGA
TCTACAGTTAATTCGTTTGCCAATAGTGAAGGAGCTTTTAGACAAGCTTTCATCACAGCGATCACGAAGTTAGGTCGGGTTGGTGTTTTGACTGGTAATGCTGGTGAGATTCGAAGGGAT
TGTTCACGTGTCAATTAG

Retrieve as FASTA  
cDNA
Send to BLAST
.........1.........2.........3.........4.........5.........6.........7.........8.........9.........0.........1.........2
AATTTAAATT TCTCTTTCTA TCTACTATAA AAAGTGACTC TCTAAGAACT CCAAAGATTA GAACATTGAA TTGAATTAGC CATGGAGAAG AATACTTCTC AAACCATCTT CTCCAACTTT  TTTCTTCTCC TTCTCCTTTC TTCATGTGTC TCTGCTCAGC TCCGGACAGG TTTCTACCAG AACTCATGTC CGAACGTGGA AACCATTGTA CGTAACGCTG TCCGTCAGAA ATTCCAGCAG  ACTTTCGTTA CCGCTCCGGC CACTCTTCGC CTCTTCTTCC ACGATTGCTT CGTTCGTGGA TGTGATGCGT CAATAATGAT AGCATCACCA TCGGAGAGAG ACCATCCAGA TGACATGTCA  TTGGCCGGAG ACGGATTCGA CACGGTGGTG AAGGCGAAGC AAGCCGTTGA TAGCAATCCC AATTGCCGCA ACAAAGTCTC ATGTGCTGAC ATTTTGGCTC TCGCCACTCG TGAAGTCGTC  GTTTTGACCG GAGGACCAAG CTACCCGGTG GAGCTAGGGA GGAGAGATGG CAGAATCTCC ACGAAGGCCA GCGTTCAAAG CCAATTGCCT CAGCCCGAGT TTAACCTAAA CCAGCTCAAC  GGCATGTTTA GCCGTCACGG CCTCTCTCAA ACCGATATGA TTGCCCTCTC AGGAGCACAC ACTATAGGAT TTGCACATTG TGGAAAAATG TCAAAGAGAA TATACAATTT TAGCCCTACA  ACACGTATCG ACCCGAGTAT AAACCGTGGA TACGTGGTTC AGCTTAAGCA AATGTGCCCG ATCGGTGTCG ACGTAAGAAT CGCAATCAAC ATGGATCCGA CCAGTCCACG TACTTTCGAT  AATGCTTATT TCAAGAATCT CCAACAAGGA AAGGGTTTGT TCACGTCAGA TCAAATCTTG TTCACAGATC AACGGTCAAG ATCTACAGTT AATTCGTTTG CCAATAGTGA AGGAGCTTTT  AGACAAGCTT TCATCACAGC GATCACGAAG TTAGGTCGGG TTGGTGTTTT GACTGGTAAT GCTGGTGAGA TTCGAAGGGA TTGTTCACGT GTCAATTAGT GTGATTTGAG GTTTTCTTTC  TTTTATTCCT TAAAGAGGAT TTTTTTTTTT AATAATAAAA TTTAATTTCT TGTTGTCAAA ATAAGGAGTT CATAAGTGTG AAACATGGAA ACTTAAATTA ATAAGATGGG TTTATTTCGT 
TGAC 

Retrieve as FASTA