Entry information : FvPrx01 (mrna27591.1-v1.0-hybrid)
Entry ID 2254
Creation 2005-09-22 (Christophe Dunand)
Last sequence changes 2014-03-27 (Maxime Neel)
Sequence status complete
Reviewer Christophe Dunand
Last annotation changes 2014-03-27 (Christophe Dunand)
Peroxidase information: FvPrx01 (mrna27591.1-v1.0-hybrid)
Name (synonym) FvPrx01 (mrna27591.1-v1.0-hybrid)
Class Class III peroxidase    [Orthogroup: Prx003]
Taxonomy Eukaryota Viridiplantae Streptophyta Rosaceae Fragaria
Organism Fragaria vesca    [TaxId: 57918 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type Seedlings
Inducer Heat shock stress
Repressor N/D
Best BLASTp hits
Perox score E-value FvPrx01
start..stop
S start..stop
PpePrx02 637 0 12..355 14..357
MdPrx09 561 0 26..355 21..338
PtPrx67 548 0 1..355 1..353
NtPrx15 535 0 1..355 1..354
Literature and cross-references FvPrx01 (mrna27591.1-v1.0-hybrid)
Literature Shulaev,V. and Slovin,J. Fragaria vesca EST database (FVdbEST): A tool for strawberry functional genomics. Unpublished (2004)

DNA ref. Phytozome 12:   LG2 (1523757..1521220)
EST ref. GenBank:   CX661281.1 [Fragment]
Protein sequence: FvPrx01 (mrna27591.1-v1.0-hybrid)
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   356 (326)
PWM (Da):   %s   38548.3 (35438.7) Transmb domain:   %s   i5-27o
PI (pH):   %s   5.41 (5.97) Peptide Signal:   %s   cut: 30 range:30-355
Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
MASTFASLCS LLLIVSSVLV SSYFGVSEAQ PSVPVVKGLS WSFYDSSCPK LDSIVRKQLK KVFKEDIGQA AGLLRLHFHD CFVQGCDGSV LLDGSASGPS EQQAPPNLSL RAKAFQIIND  LREIVHSKCG RVVSCADLTA LAARDAVFLS GGPEYEVPLG RKDGLNFATR NETLANLPAP TSNTTKLLTD LAKKNLDATD VVALSGGHTI GLGHCTSFTG RLYPTQDASM DKTFANDLKQ 
VCPAADTNAT TVLDIRSPDT FDNKYYVDLM NRQGLFTSDQ DLYTDKRTRD IVTSFAVNQT LFFEKFVHSM IKMGQLSVLT GSKGEIRANC SMRNSDNANY LSSVVEEDEE SLSEF* 

Retrieve as FASTA  
Remarks Complete sequence from genomic (introns 1 and 2) and 1 EST.
Promoter
Send to BLAST
Send to cis Analysis
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
AGTGTGGAAA GAGAAAGATG TCTTCGGTCT ATTTCTTCAT GTTGCAATGG TGGCAGTAGG TAAGGAGCTT GAATGGTTTT GTGTTGTGGC TTGGCATCTT TGGCATGATA GAAACAACTG  TGTTCATGGC AAGGAAGTAG TCTCGGTTGA TGTCTTGGTT CGAAATGTGG TGTCCTGGTG GGAGAGGTTA GAAGGAGTTG ACGAGAGAAA CACAAATCCA AGCTCTGCAA ATCATAGTAA  TAATGGAGTT AGAGAGACTA TAAGATGGAG CAAACCCAGA TCAGGGTTTA TAAAGCTTAA CATTGACGGG GCTATTGATA CTCATGAAGG GGTCTTTGGT ACTGGTGCAG TGTGTAGGAA  TGACCAAGGT CACTGCTTAG GAGTTTTGGC TGCTCCAGGG ACGGGGTATC TAAGTCCTCA CGCAGTAGAA GTGATGGCGT TGGTTCATGG TTTGTATTTT TGTCGAAGCG CTGGGTTTAC  TCACATAGAG ATTGAGGGAG ATGCCATGAG TGTATTTGCA GCTTTGGATA ACTCAGTAGA TGACTTTAGT AATGAAGGTG CCCTTTTGGA CGAAGCAAAG GTTCTTATAA ATTCTTTTCA  GTATCGTAGT TGGGGTTTCA TTCCTAGAGA TGGAAATAAG GCAGCTCATA TGGTCGCCAG AGCGGCTTTA TTCCTCCCTC ATCCAACATA CTGGTGGCAG CTTGTTCCAG ACTGGTTAGC  TCCTACTATT GCTAATGAGT CAGTGTAGTG AGACTAGTTT CTACATTGAG TAGTTATTTT GAGTTGTTCT CAAGTGGAGT GTGGTACTCT TTCTAATGTT TGTTAGGTTT AATGAGGCCA  CTAATACTCT TTATTGTACT TCTTCTATTG AAATAAACTA TTTGATCAAA AAAAATATAT CACAAATCGG TATAAACACT TATAACACAA TTGAACATGG AAAGGCACAT CTGTTCTAAC  CATCTAGCTA CCTTAACACA ATTGAACATG GAAAGGGGTT CTGTTCTAAC TATCTAGCTA CAATGTACAC GTCAAATGTT AAATGTTCGA TTAATTAACT ATTTGTAGCA AGTCAAAGCT  TGGTTGGTAA GGAATTAGGG GAGATTGTGT ATAGACACAA GCTATCGTAT GAGCCTTTTT AACTCGCATT AGAAAAATCG CAAAAGAGAT TAATTTCGTT CCCAAGTATT AATAGCTAGT  AACCCTACAC CTTATTCATA CTGAATTTCG CACACATTTT CATACTGAAT TTATAGTAAC CCTACACCTT ATTGATACAT CCATTTAGCT TGGTATCAAG TTTTAGCCAC CCTAGCTACA  CCTTAATACA GATTTTTTTT CTGCGTCTTA TAATAAACTC TACGGATTAT ATCATTTCAA CTCTTCTCAA ATGCCGTAGA AGCAACCATG AATCTTTCAA ACACACATAT TATAGCTAAT  AAGTGTATGA TGCATTTCTT CATAAACTTT CACACGCATT CAAGGGTTAG GTGATGGAGT ACGTATTCGC AAACAATTAA CAAGCTTACC GATCATATTT TGGTAGCAAA ACTCAAGTAA  ACAATCCCCG TATTCCACAT AGCTCACTTC CATGAAAGTT ACTGCCTTTT GACAATTCCA CCCTGACTTG TATATTATTG AAGGGAAATT ACAAGCTTAC GTTCTTGGGT GGCAAGTTTG  ATTATGCTGG CCATTACAGT TCAAATTTTC ACTTCTTTTT TTGTACCTTG TACCTCCTCT GTTGGATAAG ATTTCAAATG CTCGACTTTT CAACATGCCT ACAGAGCCGA GCAAAGCTTT  CAATGAATAT GAAAGGCAAC GTGGTTCTTT TGTTTTGTTT TCTTTTTTCA AAAGTCATTC ACCCAGAAGT CATTATTAAA TTTTCTTGTA TAAAAAATTG GTATAATCTA AGCTCAAAAG 
CTCGAAATAT GGAACACATC TGCCTATAAA AAGAGGGCAT CTGTTTCTCT GAAACACACA CCACTACTTT CTCGATCACC 

Retrieve as FASTA  
DNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGGCTAGTA CTTTTGCTTC TCTTTGCTCT CTGCTTCTGA TCGTTTCTTC TGTTTTAGTT TCTTCCTACT TTGGTGTCTC AGAGGCACAA CCCTCTGTTC CTGTAGTTAA AGGGCTATCA  TGGTCCTTCT ATGACTCTAG CTGCCCTAAG CTTGACTCCA TTGTAAGGAA GCAGCTCAAG AAGGTCTTCA AGGAAGACAT TGGCCAGGCT GCTGGCTTGC TTCGACTCCA TTTCCATGAC  TGCTTTGTTC AGGTAACTAA CTTCAACAAA GCACAGCTTA TATATCTTTG ATTTTCTTTG TATGAGAGCT AGCTATTTCC CTTAATTTAA TCCCAGCCCG AAGGTTAATT ACTTGGCTGA  TCAGTAATTA ACGTAACATT GAGCATTATG TTTACATATA TGGTTAAAAT GGACCATGCA TCTTTCTTTT GGTAGTGCTG ATTTGTGCTC ATTTCTGTAT AGTTTGTTAT GGTTCTCCAT  CTAAATCTTT GTTCAATAGG AGCTATAGGG TAGTAATTAT CAAAGTCATT GGTGCTTGTT ATACATTGAG TCATTGACCA AAGCATGTAT CTATAATAGG TCTTGAGCTA CCTCTCAACC  AAAATTTTGA ACCACAGCTG AGATCCATCT TGAATAATCT TTATACATAA ACCAACTGAT TTACTATTAC ATGCAGTTAG TATAATAATC AGATGGGTAT GTCAGTCACT CAGTTAATTA  TAGTCCTGCC TTTTAAAAAA GAGTTGGTGA GAGTTTTGGA TGGGAGCTAG CGCTGAGGCT GCTACATAAT GTGTACATGT CAAATGAATT CAATAAGCAT TATTGATGAT ATTTGCAGGG  ATGTGATGGG TCAGTTTTAC TGGATGGATC AGCGAGTGGT CCAAGTGAGC AGCAGGCACC TCCAAACCTG AGTTTGAGAG CCAAGGCCTT CCAAATCATC AATGACCTCC GTGAGATTGT  TCACAGCAAA TGTGGGAGGG TCGTTTCTTG TGCTGATTTA ACTGCTCTTG CTGCTAGGGA TGCTGTTTTC CTGGTATTTC TTTTCTCCTC CTGCCATTTC TATTGCTTTA CATATCACTT  TTTACCTCTA TCAAATTTAG AAATGAGTTA AAAGACAATT ATTGAGCTAG GTATATGTAT ATCCAAGTGA ATATAGGCAA ATTTTTGAAA TATTTACTGT GAGTGCAGAT ATTTTTGCTT  CTCTGCTGTC CATATTTCAA AGATATTTTA TCCTACATGA ATCAATGGAT GGCATTGTTG GGGCCGGTGG ATAATGAATT TGTTTGTGCT AAATGTATTT TGGATACTAA ACAATCTTGA  CTAACCCAAC AGCTTATATA TAAATAAGAA GAGTAATCTA CGCTAGCCTA GCCTAGCTAG TTGATAAGTA CTTGTGAGGG CATTGATTGA GTTTTAACAC ACAAAGTGCT TTTCAAAAGC  ATGAGAGTCA TGAGACTAGC TCATTCCTCT TCTTATCTTA TGCCTTGTTA TACAAGTTGT TTTCTTTATC ATCTGAGGAA TCTTAATTAA TTATGAGCTA ATTGATTTCT TAATCCCTAG  TCCATGAGTA GTTGAGATTT AAAATGTTAC GCAGATGTGA AAGTAGGGAA GCTTACAAGG AGAGGGAATC CAGGATATAC TTTAGTTAAT TAAGATGTTC ATATTAACAT GTGGTTTTTC  TTTAATTAAT TAATTAATAT ATTTCACTTC ACAAATAACA GATCTTAAAA GCTTTAGTGG TTAGAGTTTT GCTGCTTTTC CAAATTTTTT GTAGTGAGAT GAGCCACTAA CAATGATCGA  CATGTACTTT AATTAGGAAC AAGTGCAAAT ATTAAAACCT ATAGAGTATA TATAATGTGA AGAACATTTA TAAGTTGGAT CATAGCAAAT TGTTGATTAA TATTTCTTCT TCTGCAGTCA  GGTGGCCCTG AATATGAAGT ACCACTGGGA AGAAAGGATG GACTAAACTT TGCAACAAGG AATGAAACCC TTGCTAACCT CCCCGCACCA ACAAGCAACA CCACAAAACT CCTCACAGAT  CTTGCCAAGA AAAACTTGGA CGCCACTGAT GTCGTTGCTC TATCTGGTGG CCACACCATC GGCCTTGGCC ACTGCACCTC CTTCACTGGC AGGTTATATC CGACTCAAGA TGCTAGTATG  GACAAAACTT TTGCCAATGA CCTTAAGCAA GTGTGTCCAG CAGCCGACAC AAACGCCACA ACCGTGCTTG ATATCCGCTC GCCTGACACA TTCGACAACA AGTACTACGT TGATCTCATG  AACCGCCAAG GTCTATTCAC ATCGGACCAA GATTTGTACA CAGATAAAAG AACACGCGAC ATTGTCACTA GCTTCGCCGT CAACCAGACA TTGTTCTTCG AGAAGTTTGT TCATTCCATG  ATCAAGATGG GGCAATTGAG CGTGCTAACT GGTTCGAAAG GTGAAATTCG CGCTAATTGC TCAATGAGGA ACTCAGACAA CGCTAATTAC TTGAGCTCCG TGGTGGAAGA GGATGAAGAG 
AGTTTGTCTG AGTTCTAA 

Retrieve as FASTA  
CDS
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGGCTAGTA CTTTTGCTTC TCTTTGCTCT CTGCTTCTGA TCGTTTCTTC TGTTTTAGTT TCTTCCTACT TTGGTGTCTC AGAGGCACAA CCCTCTGTTC CTGTAGTTAA AGGGCTATCA  TGGTCCTTCT ATGACTCTAG CTGCCCTAAG CTTGACTCCA TTGTAAGGAA GCAGCTCAAG AAGGTCTTCA AGGAAGACAT TGGCCAGGCT GCTGGCTTGC TTCGACTCCA TTTCCATGAC  TGCTTTGTTC AGGGATGTGA TGGGTCAGTT TTACTGGATG GATCAGCGAG TGGTCCAAGT GAGCAGCAGG CACCTCCAAA CCTGAGTTTG AGAGCCAAGG CCTTCCAAAT CATCAATGAC  CTCCGTGAGA TTGTTCACAG CAAATGTGGG AGGGTCGTTT CTTGTGCTGA TTTAACTGCT CTTGCTGCTA GGGATGCTGT TTTCCTGTCA GGTGGCCCTG AATATGAAGT ACCACTGGGA  AGAAAGGATG GACTAAACTT TGCAACAAGG AATGAAACCC TTGCTAACCT CCCCGCACCA ACAAGCAACA CCACAAAACT CCTCACAGAT CTTGCCAAGA AAAACTTGGA CGCCACTGAT  GTCGTTGCTC TATCTGGTGG CCACACCATC GGCCTTGGCC ACTGCACCTC CTTCACTGGC AGGTTATATC CGACTCAAGA TGCTAGTATG GACAAAACTT TTGCCAATGA CCTTAAGCAA  GTGTGTCCAG CAGCCGACAC AAACGCCACA ACCGTGCTTG ATATCCGCTC GCCTGACACA TTCGACAACA AGTACTACGT TGATCTCATG AACCGCCAAG GTCTATTCAC ATCGGACCAA  GATTTGTACA CAGATAAAAG AACACGCGAC ATTGTCACTA GCTTCGCCGT CAACCAGACA TTGTTCTTCG AGAAGTTTGT TCATTCCATG ATCAAGATGG GGCAATTGAG CGTGCTAACT 
GGTTCGAAAG GTGAAATTCG CGCTAATTGC TCAATGAGGA ACTCAGACAA CGCTAATTAC TTGAGCTCCG TGGTGGAAGA GGATGAAGAG AGTTTGTCTG AGTTCTAA 

Retrieve as FASTA  
cDNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGGCTAGTA CTTTTGCTTC TCTTTGCTCT CTGCTTCTGA TCGTTTCTTC TGTTTTAGTT TCTTCCTACT TTGGTGTCTC AGAGGCACAA CCCTCTGTTC CTGTAGTTAA AGGGCTATCA  TGGTCCTTCT ATGACTCTAG CTGCCCTAAG CTTGACTCCA TTGTAAGGAA GCAGCTCAAG AAGGTCTTCA AGGAAGACAT TGGCCAGGCT GCTGGCTTGC TTCGACTCCA TTTCCATGAC  TGCTTTGTTC AGGGATGTGA TGGGTCAGTT TTACTGGATG GATCAGCGAG TGGTCCAAGT GAGCAGCAGG CACCTCCAAA CCTGAGTTTG AGAGCCAAGG CCTTCCAAAT CATCAATGAC  CTCCGTGAGA TTGTTCACAG CAAATGTGGG AGGGTCGTTT CTTGTGCTGA TTTAACTGCT CTTGCTGCTA GGGATGCTGT TTTCCTGTCA GGTGGCCCTG AATATGAAGT ACCACTGGGA  AGAAAGGATG GACTAAACTT TGCAACAAGG AATGAAACCC TTGCTAACCT CCCCGCACCA ACAAGCAACA CCACAAAACT CCTCACAGAT CTTGCCAAGA AAAACTTGGA CGCCACTGAT  GTCGTTGCTC TATCTGGTGG CCACACCATC GGCCTTGGCC ACTGCACCTC CTTCACTGGC AGGTTATATC CGACTCAAGA TGCTAGTATG GACAAAACTT TTGCCAATGA CCTTAAGCAA  GTGTGTCCAG CAGCCGACAC AAACGCCACA ACCGTGCTTG ATATCCGCTC GCCTGACACA TTCGACAACA AGTACTACGT TGATCTCATG AACCGCCAAG GTCTATTCAC ATCGGACCAA  GATTTGTACA CAGATAAAAG AACACGCGAC ATTGTCACTA GCTTCGCCGT CAACCAGACA TTGTTCTTCG AGAAGTTTGT TCATTCCATG ATCAAGATGG GGCAATTGAG CGTGCTAACT 
GGTTCGAAAG GTGAAATTCG CGCTAATTGC TCAATGAGGA ACTCAGACAA CGCTAATTAC TTGAGCTCCG TGGTGGAAGA GGATGAAGAG AGTTTGTCTG AGTTCTAA 

Retrieve as FASTA