Entry information : GrPrx08(Gorai.009G178400)
Entry ID 2283
Creation 2006-06-14 (Christophe Dunand)
Last sequence changes 2006-06-14 (Christophe Dunand)
Sequence status complete
Reviewer Not yet reviewed
Last annotation changes 2019-02-27 (Christophe Dunand)
Peroxidase information: GrPrx08(Gorai.009G178400)
Name GrPrx08(Gorai.009G178400)
Class Class III peroxidase    [Orthogroup: Prx009]
Taxonomy Eukaryota Viridiplantae Streptophyta Malvaceae Gossypium
Organism Gossypium raimondii    [TaxId: 29730 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type Seedlings
Inducer N/D
Repressor N/D
Best BLASTp hits
Perox score E-value GrPrx08
start..stop
S start..stop
GhPrx36 689 0 1..332 1..332
GaPrx01 686 0 1..332 1..332
TcPrx18 648 0 6..332 3..329
PtrePrx01 623 0 5..332 1..331
Literature and cross-references GrPrx08(Gorai.009G178400)
Literature Kim,H., Yu,Y., Kudrna,D., Hatfield,J., Stum,D., Mueller,C., Udall ,J.A., Rapp,R.A., Wendel,J.F., Rao,K., Soderlund,C. and Wing,R.A.
Global assembly of Cotton ESTs
Unpublished (2004)
EST ref. GenBank:   CO083259
Protein sequence: GrPrx08(Gorai.009G178400)
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   332 (307)
PWM (Da):   %s   37649.35 (34806.8) Transmb domain:   %s   i7-25o
PI (pH):   %s   8.69 (8.21) Peptide Signal:   %s   cut: 26 range:26-332
Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
MRKIMGAKVL FFFALLSFSA VSAFARDEED QGLVMNFYKD SCPQAEDIIK EQVKLLYKRH KNTAFSWLRN IFHDCAVQSC DASLLLDSTR RSLSEKETDR SFGLRNFRYI ETIKEAVERE  CPGVVSCADI LVLSAREGIV SLGGPYIPLK TGRRDGRRSR ADVVEEYLPD HNETISGVLD RFAAMGIDTP GVVALLGAHS VGRTHCVKLV HRLYPEVDPA LSPDHVPHML HKCPDQIPDP 
KAVQYVRNDR GTPMVLDNNY YRNILDNKGL LIVDHQLAYD KRTRPYVKKM AKSQDYFFKE FSRAITLLSE NNPLTGSKGE IRKQCNLANK LH* 

Retrieve as FASTA  
Remarks Complete sequence from genomic and 89 ESTs.
Promoter
Send to BLAST
Send to cis Analysis
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
GAAAAGCCCT ACTACGTCAC GGAAATGCAT TTGCTTTTGG GCTTTGCCTA AAGCCTCCAA ACTCTCTTAT AATTATTATT GAATTCTAGA GAATCCAATT CAATCAAGCT AAATGTGACG  GTGACAATAA CTTTTGCTTT CAGTATCATA ATAATTATAG CTTTGTCGTC TTAGATTTCA ATAATGTATA ATAAACTTGT TAGAAAAATG TAAGTGGGTC CATTGTTTGA ATGGAAGAGA  TGTCCCCCCA CCAAAATAAA AAGGCAAATG TCTGTGAGTG GTAGGCTAGT GGGCTGCTTC TTCTTCATCC AAGATCTGAA TAAATTTGTT AGCTTTCCTT TTGGATGGGA TTAGCAATTC  CTACACGTTA TCCGACGCAT AATAAATACC CCACTTTAAA GTGAAGGGTA TTTTGCTATT CTTTTCCCAA ATTAAACTGG TCCAAGTTTT GGCAAGACCT AGAAGTTTAT ATCTAAGGCA  CTGGATTACA TTATTGCTGC CTATATTCAT TAACCCATAG TTTGTTTTGT CTCTAGTATT TTGTTTTCAT CCCATTCATC TCATCTAAAC TGACATAAAT TTTTATTAAC TGGCTGTATC  ATTATTTACT ATCTCAGAAT AATCTTTCCA TTTCTTTTTT ATACCATGTC TCATACATGC TTAAACCATA TCTTTAAGAA TGACCTACCA ATCATTATTA CTTCTATTAA AGGTACATTC  CATAAGCCTT TTTATGTATT TATTTGTCAC TTAATTTAAA CCTTCAAATT TATACTATTT ACCCCCAAAT TATTAAATGC GTGCACAAAA ATGTTGAAAC CACTAGGCAT GTGCAGGTTC  AAAGTTCAAT GCTTTTTAAG CATTTAAAAT TTGAGAAACC TGAACGCATT CTAGCCTTCT TCCTCCAGAT CCCGCATTGC AATTAATAAT AGGGTAAATT ACATTAAAGT TTATTAAATT  TTCAAAAATT TACAATGTGG TCATTAAGTT ATTTGAAAGC TCTCATTCTC TTATACACTT TAACTTTTTT TTCATGAAAC AACCTTAAAT ATTACAAATC TATGAACTAA AGTTTAAACA  ACTTTTTTCT TCGATCTCTA GCATTAGTCA TCAGATCGAC TTAGATCTAA GGTATTTTCA TCTACTCATT GACGGGTACT GATCCCCACT GTATCAATCA TTGAATCGTT GCTTGAAGCT  CGCTAATCAG ACTTTAAAAA ATTTAATAGA ATTATTTAAA TAAAACTTTT AAATAATTTA ATGATTATTT TATAATTTTT TAAAATTAAT GATTAAAATG TAAATTTACT AATAGTTTAA  TCACGTTAAT ATCAAAAGAA TACTGCTAGC GGTAATAAAT TATATGCTTT TGATTACAAC AGTCAAACTT AAATCTTATA TCCTCTTCAG AGAATTTAGA AAAATTTTTA TCTGAGTTCC  TTTACTATTC AGTAATCACA TTTGAGATTG AAACCATTGA TTTTGTTTCA ACATTTTAGC ATGCTTTACA TTGGGAAGGC TAAAGGCTTT AGTACTGATT ATGGAAAGAA CAAATCTGGT  ATTGGAGAGA CAAATAACAC TAACTCCCCC TCCAACATCA TCATTCAACA ACAAACCAGG ATAAATTTAC TAGATATGTT TTCAAAAATC TTCTAGGTAC CTGCCTTTAA AAGGTAAACT  TGATTCTGAC AATGGACCCT AATCTTACAC CTTTATTCCA TGATCCTCCA TCATACACCG TTGGATCAAC TGGCTTCGGA TCTCTAGCCC CCTCTATCGG TCATTTCTCT TAGTTTTGTC  ATTTTCCGTT GTTAACTCCC ACAGGTGTTA CTGTGTACTC ACTCAGAGAC TAAAAAAGAG TGGTAGTTAA TGGCAAGTGT ATAAAAATAT TAGTAACTGT ACTTATTTTT TTATACCAGA 
TCTGTTACAC TCTGAATTAT TTAAGCAGCA CGTCACAAGG GATCTAGAGC AAGGTTGGTG ACCTTGGGTT GAGTGTAGAG 

Retrieve as FASTA  
DNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGAGGAAAA TCATGGGTGC CAAAGTTCTC TTCTTCTTTG CTTTGCTTTC CTTTTCAGCT GTGTCGGCAT TTGCACGGGA TGAGGAAGAC CAAGGTCTTG TTATGAACTT CTACAAGGAT  TCTTGTCCTC AGGCTGAAGA CATTATCAAG GAGCAAGTTA AGCTACTGTA CAAGCGACAC AAAAACACTG CTTTTTCTTG GCTGAGAAAC ATTTTCCATG ACTGTGCTGT CCAGGTATAT  ATTTCTATGA ATCTATACGC TACAGTGTTT TTTCAACTAC TTTATACTAT TTTCTTGTTC TTGATAGTTA CAAGTACTGT TTTTTCATAT TTTGGAGTAG TCATGTGATG CTTCACTGCT  GCTGGACTCC ACAAGAAGGA GCTTGTCTGA GAAGGAGACA GACAGGAGCT TTGGCCTAAG GAATTTCAGG TACATTGAGA CCATCAAAGA AGCTGTAGAA AGGGAATGTC CTGGAGTTGT  TTCTTGTGCT GATATCCTTG TTCTGTCTGC TAGAGAAGGC ATCGTTTCGG TAAAAATTTC TTTCCACCCC TTTAGATTAC TCTTCCTCCA TTCAAATTTA ATTAAAACTA CAATTTCTAT  GTGCTTACTT GAGAGTTCCT TTTGCACTAG ATCAGTAAGA TTAGTGGAGG TTTCGTTTGC TTAATCTACT ACTAACCTTT GCTTTCCCAG TCCTTTGAGG TTTCAACTTC AGTTTCATGT  GCTTAGATCC TATTTTAACT GTAATAAATA CTTAAAATTC CTGGATGCAT ATCTTAATTG TGTGAATTAC TAAGTTTAGC TTAGCTTGTC AGTCAAGTAA AAGTAACCCC AAATTCACTT  GTTTCAGTTG GGAGGCCCTT ACATTCCTCT CAAAACTGGA AGAAGAGACG GTAGAAGGAG CAGAGCAGAT GTTGTGGAGG AGTATCTTCC GGACCACAAT GAGACCATCT CTGGCGTTCT  CGACAGGTTT GCCGCCATGG GTATTGACAC CCCTGGAGTC GTTGCCCTCC TAGGTACTCC TTTTCCATCT TTACATAAGT ATCAGTAAAT GCAAGTGACC GACTGTGTGA GTGAACATTA  TGGAGATTAT ATTTCTAGCA TCTTTTTGGC TCTAAGTTTC CTATTTTGTG CAAAACAGGA GCTCACAGTG TCGGCAGAAC TCACTGTGTG AAGCTGGTGC ATCGGTTGTA CCCAGAGGTT  GACCCTGCCC TCAGCCCCGA CCATGTTCCA CACATGCTCC ATAAATGCCC TGATCAAATC CCAGACCCCA AGGCCGTCCA GTATGTGAGA AACGATCGTG GGACACCCAT GGTTTTGGAC  AACAACTACT ACAGGAACAT ACTGGACAAC AAGGGTTTGT TGATTGTGGA TCACCAACTG GCTTACGACA AAAGGACCAG ACCTTATGTG AAGAAAATGG CCAAGAGCCA AGACTATTTC 
TTCAAGGAGT TCTCAAGGGC CATTACTCTC CTCTCTGAGA ACAATCCTCT CACTGGTAGC AAGGGTGAGA TCAGGAAGCA ATGCAATCTT GCAAACAAGC TTCACTAA 

Retrieve as FASTA  
CDS
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGAGGAAAA TCATGGGTGC CAAAGTTCTC TTCTTCTTTG CTTTGCTTTC CTTTTCAGCT GTGTCGGCAT TTGCACGGGA TGAGGAAGAC CAAGGTCTTG TTATGAACTT CTACAAGGAT  TCTTGTCCTC AGGCTGAAGA CATTATCAAG GAGCAAGTTA AGCTACTGTA CAAGCGACAC AAAAACACTG CTTTTTCTTG GCTGAGAAAC ATTTTCCATG ACTGTGCTGT CCAGTCATGT  GATGCTTCAC TGCTGCTGGA CTCCACAAGA AGGAGCTTGT CTGAGAAGGA GACAGACAGG AGCTTTGGCC TAAGGAATTT CAGGTACATT GAGACCATCA AAGAAGCTGT AGAAAGGGAA  TGTCCTGGAG TTGTTTCTTG TGCTGATATC CTTGTTCTGT CTGCTAGAGA AGGCATCGTT TCGTTGGGAG GCCCTTACAT TCCTCTCAAA ACTGGAAGAA GAGACGGTAG AAGGAGCAGA  GCAGATGTTG TGGAGGAGTA TCTTCCGGAC CACAATGAGA CCATCTCTGG CGTTCTCGAC AGGTTTGCCG CCATGGGTAT TGACACCCCT GGAGTCGTTG CCCTCCTAGG AGCTCACAGT  GTCGGCAGAA CTCACTGTGT GAAGCTGGTG CATCGGTTGT ACCCAGAGGT TGACCCTGCC CTCAGCCCCG ACCATGTTCC ACACATGCTC CATAAATGCC CTGATCAAAT CCCAGACCCC  AAGGCCGTCC AGTATGTGAG AAACGATCGT GGGACACCCA TGGTTTTGGA CAACAACTAC TACAGGAACA TACTGGACAA CAAGGGTTTG TTGATTGTGG ATCACCAACT GGCTTACGAC  AAAAGGACCA GACCTTATGT GAAGAAAATG GCCAAGAGCC AAGACTATTT CTTCAAGGAG TTCTCAAGGG CCATTACTCT CCTCTCTGAG AACAATCCTC TCACTGGTAG CAAGGGTGAG 
ATCAGGAAGC AATGCAATCT TGCAAACAAG CTTCACTAA 

Retrieve as FASTA