Entry information : AtPrx63 (At5g40150 / PER63 / AtperoxP63 / ATP26a / AtP26)
Entry ID 229
Creation 2006-02-10 (Filippo Passardi)
Last sequence changes 2015-06-03 (Christophe Dunand)
Sequence status complete
Reviewer Achraf Jemmat
Last annotation changes 2015-11-05 (Achraf Jemmat)
Peroxidase information: AtPrx63 (At5g40150 / PER63 / AtperoxP63 / ATP26a / AtP26)
Name (synonym) AtPrx63 (At5g40150 / PER63 / AtperoxP63 / ATP26a / AtP26)
Class Class III peroxidase    [Orthogroup: Prx002]
Taxonomy Eukaryota Viridiplantae Streptophyta Brassicaceae Arabidopsis
Organism Arabidopsis thaliana    [TaxId: 3702 ]
Cellular localisation N/D
Tissue types Flower buds
Flowers
Green siliques
Siliques
Inducer N/D
Repressor N/D
Best BLASTp hits
Perox score E-value AtPrx63
start..stop
S start..stop
AlyPrx63 644 0 1..328 1..328
CagraPrx18 621 0 1..328 1..328
CrubPrx80 621 0 1..328 1..328
BstrPrx39 619 0 1..328 1..327
Gene structure Fichier Exons
ExonStart..EndSize ExonStart..EndSize ExonStart..EndSize ExonStart..EndSize
N° 1 16059750..16060736 987  
complement(join(16059750..16060736))


exon

Literature and cross-references AtPrx63 (At5g40150 / PER63 / AtperoxP63 / ATP26a / AtP26)
Protein ref. UniProtKB:   Q9FL16
DNA ref. Phytozome 12:   Chr5 (16060736..16059750)
mRNA ref. GenBank:   NM_123378
Cluster/Prediction ref. Phytozome Gene 12:   19668224 UniGene:   At.88
Omic ref. AtProteome:   At5g40150 ATTED-II:   At5g40150 e-FP Browser:   At5g40150 ePlant:   At5g40150 Genevestigator:   At5g40150 TAIR:   At5g40150
Protein sequence: AtPrx63 (At5g40150 / PER63 / AtperoxP63 / ATP26a / AtP26)
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   328 (301)
PWM (Da):   %s   35983.24 (32977.6)  
PI (pH):   %s   8.15 (8.21) Peptide Signal:   %s   cut: 28 range:28-328
Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
.........1.........2.........3.........4.........5.........6.........7.........8.........9.........0.........1.........2
MAEQSQLKNL TIILLLLCLS FQSLSFAAES HLTVDFYSKS CPKFLDIIRE TITNKQISTP TTAAAALRLF FHDCFPNGCD ASVLVSSTAF NTAERDSSIN LSLPGDGFDV VIRAKTALEL  ACPNTVSCSD IIAVAVRDLL VTVGGPYYEI SLGRRDSRTS KSSLVSDLLP LPSMQISKLI DQFSSRGFSV QEMVALSGAH TIGFSHCKEF TNRVNPNNST GYNPRFAVAL KKACSNSKND 
PTISVFNDVM TPNKFDNMYF QNIPKGLGLL ESDHGLFSDP RTRPFVELYA RDQSRFFNDF AGAMQKLSLH GVLTGRRGEI RRRCDAIN 

Retrieve as FASTA  
Remarks Complete sequence from genomic (chromo 5, no intron), 3 cDNA and 27 ESTs from siliques and flowers only.
Promoter
Send to BLAST
Send to cis Analysis
.........1.........2.........3.........4.........5.........6.........7.........8.........9.........0.........1.........2
GGATATATAG AAAGAGCTGG TGAGATTTTG AATGATCAGG TTGAGATTAC TAAACTGCAT TTGCCATTGC TTGGTTTGAT TGTAATCTAC ACCGGTATAA GTGGTTAAGG TAGAAGAAAC  CCGATTGAGT TTGTAATTAC TGCTTTTATA TATTCGTGGA TGAACTTGTT ATTCGGGTGT GTGTATCATA ATGTGCATAA CAAAGATACA CATTGTTATG TCATATATAT TAAATTACAA  GCATTGCAAG ATTGTGCAAG TAAATAATAA TTTTAAGGGT TATGCATTGC CTTTAAAATA GGGAAGACAA GTATATAATT TGTTCTCTTT CTCCACATCT TTTTTTTTTT GTTACCAACC  ATACATTGAA ACATGCAAAT GCATATGCAC CTATTCGTTG ATAAGTTCGC AGCAACATAT TTTACAAGTT CCGGTCTCGT CACGGCTACA AAAAGCGGAT TCATAATTAT ATCCATATTT  TCCAGATACG CAATCCGTAA AGCATGAGTC CGTGTACGGT CCAACCGGGT GTTTGCAATC TGCATCGACA GATTTAGGTC CTGCAAAGAC AGAAGCGTTA GTTTGAAGAA ATATATGCAT  GTGAGTAGTC TTGGCCAATC TAAAACAGAT TCGGATTAAA AAAAAAACTA TGTCAAATAT AAACATGATT ATCAATTTGT TATTGAAAAA CGACGAGGAC TAACCAGAAA TGATGAATAT  GATCATGATG GTGGTAATCA AAATTAGTAG AGGAGAAGAT GATGATCTCT TGGATTCCAT TGTTTTCGTA TTAAGACTTG AGAGATAATG GTGTTTTTAA TCAACTGAGA GATTATGGTT  TTATAGGTTT TTTTTTTGTT TCACTTTTCC ATATATATTG TGACTTTTGA GATATATCAT TAACTAAAAA TAGTTATCAC AGCTATATCT TTTAAAAACT GGTTTTACTG AAAATGGCTG  AATCTAGAAA CAATTATTTT AAGGGAGATT TCGTCTAAAA ATTAAAAACA ACTAATTAAA CACGCTTGTT GTGAGATATA TCATCAACTG AAACTTGTTT GATTGTAATC TAAGTAGATA  AAAGTGATTA AAGTAGAAGA ACATGGTTTG GTTTTCTGAA ACACTTTATT ATTTATTTTT TTTTTGGGCC AAGGTTTTCT GAAACACTAA AAAATTTAAA TTTGTTGTAT AAAATCCATA  AGCATCGAAA AAAGAACAAT TCTTGGATTC ACCCCCCTCT TTAATAACCA ATCAAAATAC AACATGTCAT ATATTTTATT TAAATTAAAT TAAAATTAAA ACTAAAATTA GAAAACAAAA  AAAGTTAAGA AAAGAAAATC TCTACAAACC AAAAATGACA TATAATTCTA TTAAGAAAAA TTCTTGGATT CATCCTCTCT TTAATAACTA ATCAAAATAC ATAATATGAC ATGTCACACT  TTATTTAAAA ATAAATTAAA ATTAAAATCA GAAAACAAAC AAATATAAAA ATAAAATCTG TATACTTTTA ATAAAGGAAG GTTAAATATC AATGTGTGCT TATAAATAAT AACTTGGGTT  TAGATTTTAT AATTACACAG AATTATATGT CCGTTTGTAT TTATAAATGA GAATTAGGGT TTAGATTTTA TAATTTAAAC AAAATCATAT GTCAGGTTGA GTTTATAAAA AAGTGGTTAG  AGTTTAAATT TTAGAATTAA ATAAAATTAT ATATCGGTTT AAACCGTAGA TACCATACTA GATAACAACT ATTTTTGCCA AACCTCTAAT TCGAACCGAA AACCAAACAC AATCAACCGG  TTTAAGAGAA TAAACGTAAT AAACCGGCTC ATATAAGAAA ATAACTGGAT CCTCTATCCC GTGATTGGTG GTTGCACTAA ACCAAAGCGC GTTTTCTTCA CTCTCTCACT CTCACTCTCT 
CTTCTACTTC CATTAAAATC TCACCGCCTC TTTCACTCTC ACTCTCTCAA GCTCAAGAGT TCTGAATCTC CCTTCAACA 

Retrieve as FASTA  
Terminator +
Send to BLAST
Send to cis Analysis
.........1.........2.........3.........4.........5.........6.........7.........8.........9.........0.........1.........2
AACGTCTTAG AGATTCTTCT TAATTGTTAT TACGATTTGT GAGATTTCGT TTTTGTTTAT TTTTTTAATT GTTGATTAGT TAGTTTAGAG CAAATGTTTG AGATTTCGGC GAGATTGAAT  TGTTGATCTA AGGCTCATGT GTGATTATTT ATATATGATT ATAATTAGTC GATTCGTCTT CCGATAACTG AGGATTACTG AATTTGATCA AATAGAATAA TCTTATTTTC TGGTTGCTAA  ATTTTCTTTT CTTTTCACTT ACTATTATAA TATATCAAAA TTTTATTCTG AAATATATAA CATATAGTAT AATTTAAAAA AAAATAACCT ATAATATAGG ATGAGTTATG ATCGAGTGTA  ATGCAAATAA TTGAAGAAAT CAAATTAAAA TTGAAAATTC ATTTAAATTT TGTAAACGGA AGAATCAATT CCCATATCTT AAGGAATTAA AAGTCCTCCA TTAGTTTTCT TTTCAATCTT  TTTCATTGTT CGTTTTCTAA ATTTTATAAA AGCAAAAAGA TAATACGAAG AAAAAGGATG GAATTAACAA AAAGAAAAGC CACCCAAATT GCCAAATAAT TCAAGAATCC ACCCAACCAT  AAAAATTCAC AAAAAAAAAA AAAAAAAACT CATCTCCAAC TAATTACAAT CCCCTACTCT ATTATTTAGA AATTTAAAAA GAAAAAAAGA AAAAGTCGCA AAACCCACAA TTAAAACTAA  AACAAAAGTA ACGAGTTAAA AAATGACACG TCAAAACTCG GCCGAGTTAA CACAAGATTT CTCACCACCG AGTCGACACC GGCTCCGACT AACATCACCG GAATTAAGCA ACTCCTCCCA  ATCAATCTCC TCATTCTCCA CCAAATCATC ATCTTCAATT TTAGCTCTCA ACACTTCCAA AACTCTTCTC GCCTTCTGCT TAGCTCTTTC TCTCCCACTC CTCTCCACTT TCACCAACTC 
CTCCACCGCA TTCGCCGCCA TAGCCAACCC TTTAAACCTC 

Retrieve as FASTA  
DNA
Send to BLAST
.........1.........2.........3.........4.........5.........6.........7.........8.........9.........0.........1.........2
ATGGCGGAAC AATCTCAACT CAAGAATCTC ACCATCATCC TCCTCCTCCT CTGCTTATCC TTCCAATCAC TATCCTTCGC CGCCGAATCT CACCTAACCG TCGATTTCTA CTCCAAATCA  TGCCCTAAAT TCCTCGACAT TATCCGCGAA ACCATCACCA ACAAACAGAT CTCAACTCCA ACAACCGCCG CCGCAGCTCT CCGCCTCTTC TTCCACGACT GTTTCCCCAA CGGCTGCGAC  GCCTCCGTCC TCGTTTCTTC CACCGCTTTC AACACCGCCG AACGCGATTC ATCAATCAAT CTCTCTCTCC CCGGAGACGG ATTCGACGTA GTAATCCGAG CTAAAACAGC TCTCGAACTC  GCTTGTCCCA ACACAGTCTC TTGCTCCGAT ATCATCGCCG TCGCGGTACG TGATCTCCTC GTAACCGTCG GTGGACCTTA CTACGAAATC TCCCTCGGCC GTCGCGATTC ACGAACTTCG  AAATCATCTC TCGTCTCCGA TCTCCTCCCG CTCCCGTCGA TGCAGATATC GAAGCTCATC GATCAATTCA GCTCCAGAGG CTTCTCCGTT CAAGAAATGG TTGCTTTGAG TGGTGCTCAC  ACCATCGGAT TCTCACATTG CAAGGAGTTC ACGAACCGGG TCAACCCGAA TAATAGTACC GGGTATAACC CGAGATTCGC GGTAGCTTTA AAGAAAGCTT GTTCGAATTC CAAAAATGAC  CCTACGATAT CTGTCTTCAA CGACGTTATG ACTCCGAACA AATTCGATAA TATGTATTTC CAGAATATTC CGAAAGGTCT CGGGTTACTT GAATCGGATC ACGGTTTATT CTCCGACCCG  AGAACCCGTC CGTTCGTTGA GTTATACGCG AGAGACCAAT CTCGGTTCTT TAACGACTTT GCCGGAGCTA TGCAGAAGTT GAGTCTTCAC GGTGTTTTGA CCGGACGGCG AGGAGAGATC 
CGACGAAGGT GTGATGCGAT CAACTAA 

Retrieve as FASTA  
CDS
Send to BLAST
.........1.........2.........3.........4.........5.........6.........7.........8.........9.........0.........1.........2
ATGGCGGAAC AATCTCAACT CAAGAATCTC ACCATCATCC TCCTCCTCCT CTGCTTATCC TTCCAATCAC TATCCTTCGC CGCCGAATCT CACCTAACCG TCGATTTCTA CTCCAAATCA  TGCCCTAAAT TCCTCGACAT TATCCGCGAA ACCATCACCA ACAAACAGAT CTCAACTCCA ACAACCGCCG CCGCAGCTCT CCGCCTCTTC TTCCACGACT GTTTCCCCAA CGGCTGCGAC  GCCTCCGTCC TCGTTTCTTC CACCGCTTTC AACACCGCCG AACGCGATTC ATCAATCAAT CTCTCTCTCC CCGGAGACGG ATTCGACGTA GTAATCCGAG CTAAAACAGC TCTCGAACTC  GCTTGTCCCA ACACAGTCTC TTGCTCCGAT ATCATCGCCG TCGCGGTACG TGATCTCCTC GTAACCGTCG GTGGACCTTA CTACGAAATC TCCCTCGGCC GTCGCGATTC ACGAACTTCG  AAATCATCTC TCGTCTCCGA TCTCCTCCCG CTCCCGTCGA TGCAGATATC GAAGCTCATC GATCAATTCA GCTCCAGAGG CTTCTCCGTT CAAGAAATGG TTGCTTTGAG TGGTGCTCAC  ACCATCGGAT TCTCACATTG CAAGGAGTTC ACGAACCGGG TCAACCCGAA TAATAGTACC GGGTATAACC CGAGATTCGC GGTAGCTTTA AAGAAAGCTT GTTCGAATTC CAAAAATGAC  CCTACGATAT CTGTCTTCAA CGACGTTATG ACTCCGAACA AATTCGATAA TATGTATTTC CAGAATATTC CGAAAGGTCT CGGGTTACTT GAATCGGATC ACGGTTTATT CTCCGACCCG  AGAACCCGTC CGTTCGTTGA GTTATACGCG AGAGACCAAT CTCGGTTCTT TAACGACTTT GCCGGAGCTA TGCAGAAGTT GAGTCTTCAC GGTGTTTTGA CCGGACGGCG AGGAGAGATC 
CGACGAAGGT GTGATGCGAT CAACTAA 

Retrieve as FASTA  
cDNA
Send to BLAST
.........1.........2.........3.........4.........5.........6.........7.........8.........9.........0.........1.........2
AGAATTAAAT AAAATTATAT ATCGGTTTAA ACCGTAGATA CCATACTAGA TAACAACTAT TTTTGCCAAA CCTCTAATTC GAACCGAAAA CCAAACACAA TCAACCGGTT TAAGAGAATA  AACGTAATAA ACCGGCTCAT ATAAGAAAAT AACTGGATCC TCTATCCCGT GATTGGTGGT TGCACTAAAC CAAAGCGCGT TTTCTTCACT CTCTCACTCT CACTCTCTCT TCTACTTCCA  TTAAAATCTC ACCGCCTCTT TCACTCTCAC TCTCTCAAGC TCAAGAGTTC TGAATCTCCC TTCAACAATG GCGGAACAAT CTCAACTCAA GAATCTCACC ATCATCCTCC TCCTCCTCTG  CTTATCCTTC CAATCACTAT CCTTCGCCGC CGAATCTCAC CTAACCGTCG ATTTCTACTC CAAATCATGC CCTAAATTCC TCGACATTAT CCGCGAAACC ATCACCAACA AACAGATCTC  AACTCCAACA ACCGCCGCCG CAGCTCTCCG CCTCTTCTTC CACGACTGTT TCCCCAACGG CTGCGACGCC TCCGTCCTCG TTTCTTCCAC CGCTTTCAAC ACCGCCGAAC GCGATTCATC  AATCAATCTC TCTCTCCCCG GAGACGGATT CGACGTAGTA ATCCGAGCTA AAACAGCTCT CGAACTCGCT TGTCCCAACA CAGTCTCTTG CTCCGATATC ATCGCCGTCG CGGTACGTGA  TCTCCTCGTA ACCGTCGGTG GACCTTACTA CGAAATCTCC CTCGGCCGTC GCGATTCACG AACTTCGAAA TCATCTCTCG TCTCCGATCT CCTCCCGCTC CCGTCGATGC AGATATCGAA  GCTCATCGAT CAATTCAGCT CCAGAGGCTT CTCCGTTCAA GAAATGGTTG CTTTGAGTGG TGCTCACACC ATCGGATTCT CACATTGCAA GGAGTTCACG AACCGGGTCA ACCCGAATAA  TAGTACCGGG TATAACCCGA GATTCGCGGT AGCTTTAAAG AAAGCTTGTT CGAATTCCAA AAATGACCCT ACGATATCTG TCTTCAACGA CGTTATGACT CCGAACAAAT TCGATAATAT  GTATTTCCAG AATATTCCGA AAGGTCTCGG GTTACTTGAA TCGGATCACG GTTTATTCTC CGACCCGAGA ACCCGTCCGT TCGTTGAGTT ATACGCGAGA GACCAATCTC GGTTCTTTAA  CGACTTTGCC GGAGCTATGC AGAAGTTGAG TCTTCACGGT GTTTTGACCG GACGGCGAGG AGAGATCCGA CGAAGGTGTG ATGCGATCAA CTAAAACGTC TTAGAGATTC TTCTTAATTG  TTATTACGAT TTGTGAGATT TCGTTTTTGT TTATTTTTTT AATTGTTGAT TAGTTAGTTT AGAGCAAATG TTTGAGATTT CGGCGAGATT GAATTGTTGA TCTAAGGCTC ATGTGTGATT 
ATTTATATAT GATTATAATT AGTCGATTCG TCTTCCGATA ACTGAGGATT ACTGAATTTG ATCAAATAGA ATAATCTTAT TTTCTGGTTG CTAAA 

Retrieve as FASTA