Entry information : AtPrx65 (At5g47000 / PER65 / AtperoxP65 / ATP43)
Entry ID 231
Creation 2006-02-10 (Filippo Passardi)
Last sequence changes 2015-06-04 (Christophe Dunand)
Sequence status complete
Reviewer Achraf Jemmat
Last annotation changes 2015-11-05 (Achraf Jemmat)
Peroxidase information: AtPrx65 (At5g47000 / PER65 / AtperoxP65 / ATP43)
Name (synonym) AtPrx65 (At5g47000 / PER65 / AtperoxP65 / ATP43)
Class Class III peroxidase    [Orthogroup: Prx002]
Taxonomy Eukaryota Viridiplantae Streptophyta Brassicaceae Arabidopsis
Organism Arabidopsis thaliana    [TaxId: 3702 ]
Cellular localisation N/D
Tissue types Flowers
Siliques
Inducer N/D
Repressor N/D
Best BLASTp hits
Perox score E-value AtPrx65
start..stop
S start..stop
AhalPrx06 676 0 1..334 1..334
AlyPrx65 675 0 1..334 1..334
CagraPrx45 637 0 1..334 1..330
CrubPrx113 636 0 1..334 1..330
Gene structure Fichier Exons
ExonStart..EndSize ExonStart..EndSize ExonStart..EndSize ExonStart..EndSize
N° 1 19069171..19070175 1005  
complement(join(19069171..19070175))


exon

Literature and cross-references AtPrx65 (At5g47000 / PER65 / AtperoxP65 / ATP43)
Protein ref. UniProtKB:   Q9FJR1
DNA ref. Phytozome 12:   Chr5 (19070175..19069171)
mRNA ref. GenBank:   NM_124071
Cluster/Prediction ref. Phytozome Gene 12:   19666858
Omic ref. AtProteome:   At5g47000 ATTED-II:   At5g47000 e-FP Browser:   At5g47000 ePlant:   At5g47000 Genevestigator:   At5g47000 TAIR:   At5g47000
Protein sequence: AtPrx65 (At5g47000 / PER65 / AtperoxP65 / ATP43)
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   245 (306)
PWM (Da):   %s   26656.63 (33838.0) Transmb domain:   %s   i13-32o
PI (pH):   %s   5.19 (6.98) Peptide Signal:   %s   cut: 29 range:29-334
Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
.........1.........2.........3.........4.........5.........6.........7.........8.........9.........0.........1.........2
MSNMQFSRGF NPFVILFCLA VVAPIISADV AILRTDYYQK TCPDFHKIVR EAVTTKQVQQ PTTAAGTLRL FFHDCFLEGC DASVLIATNS FNKAERDDDL NDSLPGDAFD IVTRIKTALE  LSCPGVVSCA DILAQATRDL VTMVGGPYFD VKLGRKDGFE SKAHKVRGNV PMANQTVPDI HGIFKKNGFS LREMVALSGA HTIGFSHCKE FSDRLYGSRA DKEINPRFAA ALKDLCKNHT 
VDDTIAAFND VMTPGKFDNM YFKNLKRGLG LLASDHILIK DNSTKPFVDL YATNETAFFE DFARAMEKLG TVGVKGDKDG EVRRRCDHFN NLNV 

Retrieve as FASTA  
Remarks Complete sequence from genomic (no intron), 4 cDNA and 8 ESTs.
Promoter
Send to BLAST
Send to cis Analysis
.........1.........2.........3.........4.........5.........6.........7.........8.........9.........0.........1.........2
AGCGATGGAA ATAGAATCAG ACGGTGTCGG CCATGCCGTC GGCGATCCAA AATCCTGGTA ATCGAACTCT GAATCGCCTT GAGTATTGAA TTCCAAAAAG GTATACTCGT CGGCCACCGT  GTCCGGCTGC GATGCGGTGT CAAAGAGATC GCTCTGTTGA GAATCCATTA GAAAAATCAG GGGAGAAATC AAGCTCCCTG GTTACGATCG TATCGCTCTT CTTCAATTTT TTTTTTTTTT  TTGTGCAGTA CGAGAGAGTT AGGGTTAGGG TTATGTATGC GCTTTAGTGA AACATTAGAG AGAATTGGAA ACGAATGTCC GTGTCAATGA AGAAGAAAAG AGGGGCGCGT GAGAGAGATA  AATACATAAG ATGTATGTTA TTTATACGCG CCATGCTCTA TGTAATATGG GCTTTGCGCA CGAGATATTG GGCCCAATTA CTAATTTTTA GACACCAAAG CCTCCCTTCA TATTTTTTTG  GGGTTTTCAA TTAAATTTCT ACATATTTCT AAATATTTAG GTTTGTTGAA TGATGTTTAT TTCTTATTTT ATCACTCTAT TTTTCTAACA CTTTAAATAA TTGATTATCT TATTTTTATT  TGAATTAGAT TTACTTTTTT ACTATTTTAT TTTAGAAAAA AATTATGAAC AAGTTTGGAA ACCAAAGTTT TCTATGATAA GTTCACATGT TAAGTAAATA TTTAATTTTA ACATTCAACT  TCTCATATTA GATTATGTTA ATAACTACTT TTGAGAAACC AAATTTTCTA TAATAAGATA GCATGATAAG TAAAAAAAAA TTCTTAACAT TCAACTTCTC ATATTAGAAT ATTTAATATA  GAAAATACAA GAATTTGGTT CCGGTATAGA GAAACTTATT ATGCAAATGG TACAGCTAGA AGAATAAAAG TGGTATAATA AACCATTCTT CCAATTCTAT ACTTTTGGGA TGACAAAAAA  GTTTTTTTTT TTAAATGATT ACATTGAAAA GGGTGAAAAT TAAAAAATAA TAATTATTCA ACTCTTTTTT TTTACTATGT CGCAGGTGGA ATTGATTGAA TAACATTATT CATCTTCTTT  TTTTTTATTC ATATATTTAT TCCATTAAAT TCCTTTATGA AATCATTTGC ACTCTTAGAT ATTTGCGATT TTGCGTAGGT TAAATAAGAA AATATGTAAT TTTGTGGTCT AGCAATTTAT  GTTACCAAAG GCATAACTCT CATTCGAACT TACAAAAAGA TCTGCCCCAT ATGAGAGTTA GGCTCGTTAT ATGTAATACA AAATTGAGAT TGATACGAAT CTGACGAAAA TATCAAATTC  AATCAGATCT CTAATAATGT TGAGCTTGCG TGATTTCTAC ATGAGTAGGT ATTTTTATTT GAGTCTAGTT CATCAAACAT TTGCTAGAAA ACTGTTCTTG GATCAAATTA ACGTAAGCAT  ACCAAACATC ATGTTGTCAC AATCATTGGC ACCTTCACCT TCACAGGTTG TTGATTCAAC AAAATTATAA AATAACGTCA AGTTTAAAGT TTAGTTGATA AACTATGAAT GATTTTAATT  TGTTTGTTTG TTTGTGCGAA ATGAATAATT TTAATTAATA TTAGTTTTTT CCTTCACATG AGTTTCTATT CTCTCGTATT TATCAATTTC ACGTGTGTAT GCATCCTATT AAAGCAACTA  TCATATTACC ACATTTGTCG AACATAAGAA AATTTCTAGA ACCAAAACAA ATTCAAAGCA ACCAAAACCA TACAAAAAAT AGATAAATTA CAAAAATAGA AAAGAATAAA CGAAAAACAA  CCACACGTAC ATATAAGGAA ATGAAAACCA TCCTTTACGT AGCCTCTTCT TAGTAACCTC CTAAGCCATG AAATAGTCGC AAAGGCCCTT TCTTCGTCTT CGTTTCTAAT TGCTTTCGAC 
GACAATCGAT CGTAGAGAAG TCTACCTCGT AGACATCTCT CTCACAAATC CAATTCAATT ACCATTGTTT GTTATTATCT G 

Retrieve as FASTA  
Terminator +
Send to BLAST
Send to cis Analysis
.........1.........2.........3.........4.........5.........6.........7.........8.........9.........0.........1.........2
GAAGAAAAAG AAAACACAAA ACCATATAAA TATAATATTA TTTCTGTTTT ATTTGCGGAG GAGTTGAGGA GAAGAAAGGT TTGGTTGGTA TATATGTTTA ATAACTACCT ATTATAAGCA  AGATCTTGTA ACAATTCAAG TTGGGATGTT TAATTTTTCC ATGAAAATTC AAACTGTTGT ATTGAAAGTA TATAGATAAA ATAACATATT ATATATCGAA CAATTGTAGT TAACATACAT  TTTGTAGTTG ATATTTGATA ATGTTACACA ACAATCAATT CATTTGTTTC CAGTTAAATG ACAGAAATCA CAGAATTAGA GAGGATTATT GTCATTTCAT TAATTTCCAC TGCAATATGA  ATATACTAGT GATTTAATCC TTTAATTTTC TTTGAAATTA GTTTTTTTTT TTTTTGTAGA GGGATGAATA AAAATTGTAT TCCATGAATT TTATTGTAAA TGGTAAGATT TTAGCTGTAT  ATTCTATTTA TTCCAGTTAT TTTACAGTTA AACCACAAAA AGTTACGCCT ATAATGCATG CCTAGTTATT TTAATATTAT GCTAATTACT GGTTTGAATG GCAATCTTAA TACATATAGC  CTTAATATTT CGTGGAAATT ACAAATTACA ATATTGATCA AACTTGGTTT TAATTTGGGA TATCATTACA ACGTTTCAAC TTGAACTGTT GTTGTTGTGA TGTTTTTGAG GTTGGCTTTC  GGTCCACCGC AATTTTCGTT AATTGTAGCC TTATGTTTAA GGGGAGTGGC GACCCGTGAC ATGAGCCATC TAAGAATAGC ATGTGTTTCA ATAACTTTCA TGTTGGAAAA TTTTGGTTGC  TTATAAATTG GATCACAAGT TAACTCTCTA TAGTTCTTTA ATCTATTCTC TCTAGTGTTC TTCCCAAACA AACAAATGAA GCTCTTGTTT TACCTTGTTG TGTTCTTTCT CCTTTTAAAT 
GGTTTCACAG CCAACAGAGT TGCAAATTCC CTGATTCGA 

Retrieve as FASTA  
DNA
Send to BLAST
.........1.........2.........3.........4.........5.........6.........7.........8.........9.........0.........1.........2
ATGTCGAATA TGCAATTCTC TCGTGGTTTT AATCCCTTTG TTATCCTCTT CTGTCTCGCC GTGGTTGCAC CAATTATATC GGCTGATGTC GCTATCTTGA GAACGGACTA TTACCAAAAA  ACATGTCCTG ATTTCCACAA AATTGTGCGT GAAGCCGTTA CAACCAAACA AGTCCAACAA CCAACAACTG CGGCCGGGAC CCTCCGTCTC TTTTTCCATG ATTGTTTCCT TGAAGGTTGT  GATGCATCTG TCTTGATCGC GACCAACTCG TTCAACAAAG CGGAACGCGA TGATGATCTC AATGATTCCC TCCCGGGAGA TGCTTTTGAC ATCGTCACCC GCATCAAGAC AGCTCTCGAG  TTGTCTTGTC CTGGTGTAGT ATCATGCGCG GATATTCTAG CGCAGGCTAC ACGTGACCTT GTCACAATGG TAGGAGGACC TTACTTTGAC GTAAAGCTTG GTCGTAAAGA CGGATTCGAA  TCCAAAGCTC ATAAAGTCAG AGGAAATGTC CCAATGGCAA ACCAGACTGT TCCTGACATC CACGGGATAT TCAAGAAAAA CGGTTTTAGT CTTCGCGAGA TGGTAGCATT AAGCGGGGCT  CACACCATTG GATTCTCTCA CTGCAAAGAG TTTTCCGACA GACTCTACGG ATCCCGTGCT GATAAAGAAA TCAACCCGCG ATTCGCAGCC GCTCTCAAAG ATCTTTGCAA AAACCACACC  GTGGATGATA CAATCGCCGC GTTTAACGAC GTGATGACTC CAGGAAAGTT CGACAACATG TACTTCAAGA ACCTAAAGCG AGGGCTAGGG CTTTTAGCGT CTGACCACAT CCTTATTAAA  GACAACAGCA CCAAGCCGTT TGTGGATCTA TACGCAACTA ACGAGACAGC ATTCTTTGAG GATTTCGCTC GTGCGATGGA GAAACTTGGC ACGGTCGGCG TCAAGGGCGA TAAAGATGGA 
GAAGTGAGAC GTAGGTGCGA CCACTTCAAC AATCTCAACG TTTAA 

Retrieve as FASTA  
CDS
Send to BLAST
.........1.........2.........3.........4.........5.........6.........7.........8.........9.........0.........1.........2
ATGTCGAATA TGCAATTCTC TCGTGGTTTT AATCCCTTTG TTATCCTCTT CTGTCTCGCC GTGGTTGCAC CAATTATATC GGCTGATGTC GCTATCTTGA GAACGGACTA TTACCAAAAA  ACATGTCCTG ATTTCCACAA AATTGTGCGT GAAGCCGTTA CAACCAAACA AGTCCAACAA CCAACAACTG CGGCCGGGAC CCTCCGTCTC TTTTTCCATG ATTGTTTCCT TGAAGGTTGT  GATGCATCTG TCTTGATCGC GACCAACTCG TTCAACAAAG CGGAACGCGA TGATGATCTC AATGATTCCC TCCCGGGAGA TGCTTTTGAC ATCGTCACCC GCATCAAGAC AGCTCTCGAG  TTGTCTTGTC CTGGTGTAGT ATCATGCGCG GATATTCTAG CGCAGGCTAC ACGTGACCTT GTCACAATGG TAGGAGGACC TTACTTTGAC GTAAAGCTTG GTCGTAAAGA CGGATTCGAA  TCCAAAGCTC ATAAAGTCAG AGGAAATGTC CCAATGGCAA ACCAGACTGT TCCTGACATC CACGGGATAT TCAAGAAAAA CGGTTTTAGT CTTCGCGAGA TGGTAGCATT AAGCGGGGCT  CACACCATTG GATTCTCTCA CTGCAAAGAG TTTTCCGACA GACTCTACGG ATCCCGTGCT GATAAAGAAA TCAACCCGCG ATTCGCAGCC GCTCTCAAAG ATCTTTGCAA AAACCACACC  GTGGATGATA CAATCGCCGC GTTTAACGAC GTGATGACTC CAGGAAAGTT CGACAACATG TACTTCAAGA ACCTAAAGCG AGGGCTAGGG CTTTTAGCGT CTGACCACAT CCTTATTAAA  GACAACAGCA CCAAGCCGTT TGTGGATCTA TACGCAACTA ACGAGACAGC ATTCTTTGAG GATTTCGCTC GTGCGATGGA GAAACTTGGC ACGGTCGGCG TCAAGGGCGA TAAAGATGGA 
GAAGTGAGAC GTAGGTGCGA CCACTTCAAC AATCTCAACG TTTAA 

Retrieve as FASTA  
cDNA
Send to BLAST
.........1.........2.........3.........4.........5.........6.........7.........8.........9.........0.........1.........2
CTCTTCTTAG TAACCTCCTA AGCCATGAAA TAGTCGCAAA GGCCCTTTCT TCGTCTTCGT TTCTAATTGC TTTCGACGAC AATCGATCGT AGAGAAGTCT ACCTCGTAGA CATCTCTCTC  ACAAATCCAA TTCAATTACC ATTGTTTGTT ATTATCTGAT GTCGAATATG CAATTCTCTC GTGGTTTTAA TCCCTTTGTT ATCCTCTTCT GTCTCGCCGT GGTTGCACCA ATTATATCGG  CTGATGTCGC TATCTTGAGA ACGGACTATT ACCAAAAAAC ATGTCCTGAT TTCCACAAAA TTGTGCGTGA AGCCGTTACA ACCAAACAAG TCCAACAACC AACAACTGCG GCCGGGACCC  TCCGTCTCTT TTTCCATGAT TGTTTCCTTG AAGGTTGTGA TGCATCTGTC TTGATCGCGA CCAACTCGTT CAACAAAGCG GAACGCGATG ATGATCTCAA TGATTCCCTC CCGGGAGATG  CTTTTGACAT CGTCACCCGC ATCAAGACAG CTCTCGAGTT GTCTTGTCCT GGTGTAGTAT CATGCGCGGA TATTCTAGCG CAGGCTACAC GTGACCTTGT CACAATGGTA GGAGGACCTT  ACTTTGACGT AAAGCTTGGT CGTAAAGACG GATTCGAATC CAAAGCTCAT AAAGTCAGAG GAAATGTCCC AATGGCAAAC CAGACTGTTC CTGACATCCA CGGGATATTC AAGAAAAACG  GTTTTAGTCT TCGCGAGATG GTAGCATTAA GCGGGGCTCA CACCATTGGA TTCTCTCACT GCAAAGAGTT TTCCGACAGA CTCTACGGAT CCCGTGCTGA TAAAGAAATC AACCCGCGAT  TCGCAGCCGC TCTCAAAGAT CTTTGCAAAA ACCACACCGT GGATGATACA ATCGCCGCGT TTAACGACGT GATGACTCCA GGAAAGTTCG ACAACATGTA CTTCAAGAAC CTAAAGCGAG  GGCTAGGGCT TTTAGCGTCT GACCACATCC TTATTAAAGA CAACAGCACC AAGCCGTTTG TGGATCTATA CGCAACTAAC GAGACAGCAT TCTTTGAGGA TTTCGCTCGT GCGATGGAGA  AACTTGGCAC GGTCGGCGTC AAGGGCGATA AAGATGGAGA AGTGAGACGT AGGTGCGACC ACTTCAACAA TCTCAACGTT TAAGAAGAAA AAGAAAACAC AAAACCATAT AAATATAATA  TTATTTCTGT TTTATTTGCG GAGGAGTTGA GGAGAAGAAA GGTTTGGTTG GTATATATGT TTAATAACTA CCTATTATAA GCAAGATCTT GTAACAATTC AAGTTGGGAT GTTTAATTTT 
TCCATGAAAA TTCAAACTGT TGTATTGAAA GTATATAGAT AAAATAACAT ATTATATATC GAACAATTGT 

Retrieve as FASTA