Entry information : LeAPx08 (Solyc11g018550.2.1[2.3])
Entry ID 2490
Creation 2007-02-14 (Felipe Teixeira)
Last sequence changes 2014-08-25 (Christophe Dunand)
Sequence status complete
Reviewer Not yet reviewed
Last annotation changes 2014-08-25 (Christophe Dunand)
Peroxidase information: LeAPx08 (Solyc11g018550.2.1[2.3])
Name (synonym) LeAPx08 (Solyc11g018550.2.1[2.3])
Class Ascorbate peroxidase    [Orthogroup: APx002]
Taxonomy Eukaryota Viridiplantae Streptophyta Solanaceae Solanum
Organism Lycopersicon esculentum (Tomato)    [TaxId: 4081 ]
Cellular localisation Thylakoid-bound
Tissue types Flowers
Leaves
Pericarps
Roots
Shoot meristems
Inducer N/D
Repressor N/D
Best BLASTp hits
Perox score E-value LeAPx08
start..stop
S start..stop
StAPx06 825 0 1..421 1..423
NtAPx01-1B 749 0 2..421 18..435
CroAPx04 685 0 35..421 54..442
NtAPx01-1A 658 0 2..371 18..385
Literature and cross-references LeAPx08 (Solyc11g018550.2.1[2.3])
Literature Aoki,K., Yano,K., Suda,K., Suzuki,T., Sakurai,N., Suzuki,H., Takahashi,H., Watanabe,Y., Arie,T., Ichinose,Y., Kodama,M., Ezura ,H. and Shibata,D. Full-length cDNA sequences from tomato (Solanum lycopersicum cv Micro-Tom) leaves treated with pathogens
Protein ref. UniProtKB:   Q3SC88
EST ref. GenBank:   BG130114
Cluster/Prediction ref. UniGene:   Les.13640
Protein sequence: LeAPx08 (Solyc11g018550.2.1[2.3])
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   421
PWM (Da):   %s   46057.58 Transmb domain:   %s   o398-420i
PI (pH):   %s   8.28
Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
MTSLTGATSH LLPSATIAAI SASTTARLAI SFSSSSSSSL KCIRSSPLLP HIFRYQKRSL IGTTSSGRFS TFASPKCAAS DPDQLKSARE DIKELLKTTF CHPILVRLGW HDAGTYNKNI  EDWPQRGGAN GSLRFEVELK HGANAGLVNA LKLLQPIKDK YAGVTYADLF QLASATAIEE ARGPKIPMKY GRIDVSGPDE CPEEGRLPDA GPPNPSSHLR DVFYRMGLND KEIVALSGAH  TLGRSRPERS GWGKPETRYT KDGPGSPGGQ SWTVQWLKFD NSYFKDIKEQ RDEDLLVLPT DAVLFEDSSF KEYAEKYAVN QDVFFKDYAE AHAKLSNLGA KFDPPEGFSI DNNPTQVQPE 
KFVAAKYSTG KRELSDAMKQ KIRAEYEGLG GTPDKPLPTN YFLNIIIVIG VLAILTYLLG N 

Retrieve as FASTA  
Remarks Sequence from 18 ESTs.
DNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGACTTCCC TCACAGGCGC CACCTCTCAT CTCCTCCCCT CCGCCACCAT CGCCGCCACA TCCGCCTCCA CGACGGCGAG ACTTGCCATT TCATTCTCCT CCTCCTCTTC TTCTTCTCTT  AAACGCATTC GATCATCTCC TCTCCTTCCC CACATATTCC GCTACCAGGT TCATTGCTCT TCTCCTTTAG TTATTATTTT TTTTCTTCTA TATTCTCGTT TTGAACTCAA TTTTGTTTTC  TTTTAGAAAC GATCATTGAT TGGAACAACT TCTAGTGGAA GATTCAGTAC ATTCGCTTCG CCGAAATGCG CTGCTTCTGA TCCCGATCAG TTGAAAAGTG CAAGAGAGGA CATTAAGGAG  CTGTTGAAGA CCACATCCTG TCATCCTATT TTGGTAATTT TTTTTCTTTC ATTCTCTTTA CTAAATAAGG CGAGGATTGA AATTTGAACC TATATGCTCT TCCCTCCTTT TACCTATTTT  AGGTTCGCTT GGGCTGGCAT GATGCTGGAA CTTATAATAA GAATATCGAG GACTGGCCTC AAAGAGGTGG AGCTAATGGG AGCTTAAGAT TCGAAGTTGA ACTAAAACAT GGAGCAAATG  CTGGTAAATA TTCAATGTCT TGTTATACTT TTTGCTTGCT TAGTGTTTAT TTTTGGTTGA CAAGCTTGCA ATTCAGGACT TGTTAATGCA CTGAAACTTC TCCAGCCAAT CAAAGACAAA  TATGCTGGTG TGACATATGC AGACTTGTTT CAGTTGGCCA GTGCCACTGC CATTGAGGTC GTTACTAGTT TTGGCTTTTG TGTGTGCCTG AAAGTGGATT CACACACTAA ATTTTTTGTG  CTTTTCAAAA CTTACAGGAG GCTGGAGGCC CAAAAATTCC CATGAAATAT GGGAGAATAG ATGTTTCTGG ACCTGATGAA TGTCCAGAAG AGGGAAGGCT TCCTGGTGAG AGATTTTTAG  CTGTTATCTA TTTTTCTTTG CTTAGGTTAT TTTTTTTAAT GATAAGGGAA ACCCGCAGCC GCTACCTTTT GGGTGCCTAC AGAGTAAAAC CCCTGCTCCT ATGCAATAGC TCGCAAACCA  CATCGCAAAC CACATAGGAG AGGTAACCCG CACTAGGCAA GCCTGGTGCA GCGAGCTCGA CCCAGAAGGC AAACCCCTTG CTTTCACTGG CAAGGGGTTT TGAACTTGAG ATCTCCAACA  TGGATGTCCC AAGCTCAAAC CACTGGGTCA CCTTGAAGGG TTCTTGCTTA GGTTATCATG CATGAAAACT AATGATCAGG AGAATATTGA ATGAATTTTA TCCCAGTGTT TAGTATTTAA  TGGACTCCTG CAGAGCCAAC AATTTCATAA AAAGCTATTT TTTCCTTATT GTCTTTGAGA CCTAGTGATT AGTGAAGTTC AATTGGTTTG CACAAGGTGT AAGTTTGGTA AGAGACTGCA  TAAAACTTTT TTCTTTTATC TGAAGGTTCA TCCAATTATG GAGATTAAAA GAATAATGTA CATCTGTTAT TTAACGGAAA AAAAGAGAGA TCACCATAAA TACCTTGGTC TTTGCTGATG  CCAGAGGAAT TGCCAAACAC TGCTAAATTT GTTTAAGACA AAATTATGTG TTCCTAATTG CAAAGCTATC TAGCCAACAT TTTTTCAATT CAAGTCCAAA TGTACTCTTT AAAAAGTACA  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TTGTATGTCT TAGATGGTCT ACCGTGACTT CCTTTTTCTA ATCCTTCATA TTTGAAGAGT CTAACCCTTT GCATTGCATT TTGTCTAACA GTCTCCTATT GCATAATTAT CCTCCATTTG  CTTTAATAAA TATATATAAC TAACTTAATC TTATTAATTA GATGCTGGCC CCCCTAACCC TTCATCTCAT TTGCGAGATG TCTTCTACAG AATGGGACTA AATGATAAGG TAACATTCGT  CAAAGTAGTT CTCTAATTCA AATTCATCTC ATCAATGATC TCAACTTCCT TGCCCGATGT ACGCTTCTCA CTAGTGAGTT TTTGTTTTCT AGGAAATTGT TGCACTTTCT GGGGCACACA  CTTTGGGGAG ATCCAGACCA GAGCGTAGTG GTTGGGGCAA GCCAGAAACA AGATACACGG TATCCATTTC CTCTCTACTT GATATTATCA TTAATTGTAA ATTGTTGTAC TTTTGAGGCA  ATTTTGCTAG TTTCTGTTCT GACTTACTTT TTTCCAGCTG TAATGTTAAT CTATAAAGAT GACTGACCAA TTGAGGAATC ATGTCCGTTA AAAAGCATGC TGCATAACTC AAAATGCTTC  TTTGTATTAT ACCATTCTCA AAACAGAAAA AACATCTTTG TATTTATGTG TCAAAGATAG ACATAATTAT GCTGTTAGTT GTCTAAGAAT CATTATTCTA AACCCGTCCT CTTAAAATTA  AATGAAATGT TTGGACTTTG TTATCAGAAG ACATTTTCCT CAAATTAATT TGAATAATAT TCTCACTTAG CCCTTCGTAT GGAAATAGGA TCTACTGAGG GGATGTGTGA TTGGAACCTA  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GGTAAATTTT AAATTGCTTA CTACATTTTC CTTCTGTTAA TTAGTTAAAG TTCCACACTT GCATTTTAAT TCCTGGGGAG ATACATTCAG TTTAAATTTT ACATCTCTGA TTGCTGCAGG  ATTAAATACA ACTTATCATA TTTAGTTCTG CTATTTCATT TAATAAAATC CAAGACCAAG CTATTACCAA AATTTTGCAT TCAAACGTAA AATTGTTAGT TTAATGAAAT GAGAGAAATA  AGTTCAACGA GTCTTGCCTA TTTGAATTGC AGAGAGAGCT CTCGGATGCT ATGAAACAAA AGATTCGAGC AGAATACGAA GGCTTGGGAG GAACCCCAGA TAAGCCTCTC CCGACGAACT 
ATTTTCTCAA TATCATAATT GTGATTGGTG TTTTGGCAAT TTTGACATAT TTGCTTGGAA ACTAA 

Retrieve as FASTA  
CDS
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGACTTCCC TCACAGGCGC CACCTCTCAT CTCCTCCCCT CCGCCACCAT CGCCGCCATA TCCGCCTCCA CGACGGCGAG ACTTGCCATT TCATTCTCCT CCTCCTCTTC TTCTTCTCTT  AAATGCATTC GATCATCTCC TCTCCTTCCC CACATATTCC GCTACCAGAA ACGATCATTG ATTGGAACAA CTTCTAGTGG AAGATTCAGT ACATTTGCTT CGCCGAAATG CGCTGCTTCT  GATCCCGATC AGTTGAAAAG TGCAAGAGAG GACATTAAGG AGCTGTTGAA GACCACATTC TGTCATCCTA TTTTGGTTCG CTTGGGCTGG CATGATGCTG GAACTTATAA TAAGAATATC  GAGGACTGGC CTCAAAGAGG TGGAGCTAAT GGGAGCTTAA GATTCGAAGT TGAACTAAAA CATGGAGCAA ATGCTGGACT TGTTAATGCA CTGAAACTTC TCCAGCCAAT CAAAGACAAA  TATGCTGGTG TGACATATGC TGACTTGTTT CAGTTGGCCA GTGCCACTGC CATTGAGGAG GCTAGAGGCC CGAAAATTCC CATGAAATAT GGGAGAATAG ATGTTTCTGG ACCTGATGAA  TGTCCAGAAG AGGGAAGGCT TCCTGATGCT GGCCCCCCTA ACCCTTCATC TCATTTGCGA GATGTCTTCT ACAGAATGGG ACTAAATGAT AAGGAAATTG TTGCACTTTC TGGGGCACAC  ACTTTGGGGA GATCCAGACC AGAGCGTAGT GGTTGGGGCA AGCCAGAAAC AAGATACACG AAAGATGGAC CAGGAAGCCC TGGAGGACAA TCATGGACTG TGCAGTGGTT GAAATTTGAC  AATTCCTACT TTAAGGACAT TAAAGAACAA AGAGATGAAG ATCTACTAGT TTTGCCTACA GATGCTGTTC TTTTTGAAGA TTCTTCATTT AAGGAATATG CAGAGAAGTA TGCTGTAAAT  CAAGATGTAT TTTTCAAAGA TTACGCGGAA GCCCATGCCA AACTGAGCAA CCTTGGTGCT AAATTTGATC CGCCTGAGGG TTTCTCAATA GACAATAATC CTACACAAGT TCAACCAGAG  AAGTTCGTGG CAGCAAAATA CTCAACTGGA AAGAGAGAAC TCTCGGATGC TATGAAACAA AAGATTCGAG CAGAATACGA AGGCTTGGGA GGAACCCCAG ATAAGCCTCT CCCGACGAAC 
TATTTTCTCA ATATCATAAT TGTGATTGGT GTTTTGGCAA TTTTGACATA TTTGCTTGGA AACTAA 

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