Entry information : PvPrx06 (PER6 / Phvul.008G218500)
Entry ID 270
Creation 2006-06-23 (Christophe Dunand)
Last sequence changes 2014-03-19 (Maxime Neel)
Sequence status complete
Reviewer Christophe Dunand
Last annotation changes 2014-03-20 (Christophe Dunand)
Peroxidase information: PvPrx06 (PER6 / Phvul.008G218500)
Name (synonym) PvPrx06 (PER6 / Phvul.008G218500)
Class Class III peroxidase    [Orthogroup: Prx007]
Taxonomy Eukaryota Viridiplantae Streptophyta Fabaceae Phaseolus
Organism Phaseolus vulgaris    [TaxId: 3885 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type N/D
Inducer N/D
Repressor N/D
Best BLASTp hits
Perox score E-value PvPrx06
start..stop
S start..stop
GmPrx61 573 0 1..320 1..326
GmPrx80 570 0 1..320 1..324
GmPrx328 540 0 1..320 1..320
GmPrx158 538 0 1..320 1..320
Literature and cross-references PvPrx06 (PER6 / Phvul.008G218500)
Literature Blee,K.A., Jupe,S.C., Richard,G. and Bolwell,G.P. Molecular cloning and differential expression of six members of the peroxidase family in French bean Unpublished
Protein ref. UniProtKB:   Q9XFL7
DNA ref. GenBank:   AF149281 Phytozome 12:   Chr08 (53104195..53105980)
Protein sequence: PvPrx06 (PER6 / Phvul.008G218500)
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   321 (296)
PWM (Da):   %s   34310.18 (31845.9) Transmb domain:   %s   i7-29o
PI (pH):   %s   8.42 (8.49) Peptide Signal:   %s   cut: 25 range:25-320
Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
MASSCSSFMI TLALLVLVIG GANATLYTNF YSSSCPKLLD TVKCAVESAI SKETRMGASL LRLFFHDCFV NGCDGSILLD DTSSFTGEKN ARPNKNSARG FDVIDKIKSA VEEVCPGVVS  CADILAIAAR DSVHILGGPS WNVKLGRRDS RTASQSAANN GIPPPTSNVN QLISRFNSLG LSPKDLVALS GAHTIGQARC TTFRARIYNE TNIDSSFAHI RQSTCPPNSG SGDNNLAPLD 
LATPTFFDNH YFKNLIQKKG LLHSDQQLFN GASTDSLVRT YNTNPGSFFA DFSAAMIKMG DISPLTGSLG EIRNKCRRVN * 

Retrieve as FASTA  
Remarks Complete sequence from genomic. Cultivar="Moncalm". No EST found.
Promoter
Send to BLAST
Send to cis Analysis
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATACCTTAAT CATTCAAATT TACTCACTCC TATCATATTT CTCGTTTTGT TGAAGTGTGA TTTTTCTTTC ATCTGAACTA CTTTTAAAGA CTCCCCCAAA ATCAACTTTG AAGCCATTGT  TTTTCATTTC AGAGGCAGCT AAAGGTTAAC ATAAAATATA AAAGCATTTG GTTTGTTTAT GTTATTCTTA TTGTCTAAGG TCTCTCTCTT TAGACCATTA GCAATCCCAT CTTTTCAACG  AATTATATAC TTGAGTTACA AGCCAGTGCC GGTCGAATTA ATCTATTTTA TGGCCAGCTA ATTATTTGTA TTCAATTAAA TTGATAGTTA ACTACAATCA CTTTACTATA GTAAAAAGAT  TTAGATAATA TTAGGAGTGT CACCTATGTT TTGGTTCATT AAAAAAATTT AATCCTATTG CATTTTATTT TATAACAATT GTTTTTTTAA ATCCAAATCA AGTTTTTTAA TCAATAATTT  TTTTTATTAG AAAAAAACAA TAAATAAATA TAAATCACTT AAGTGGTGAC TCAACCCTTA TACAAGAATT AAAAACAAGA AATAAGAAGA AAAATAAAAT AGAATCTCAC ATTCCAATCT  ATTCCAAACT AGGAACAAAA ATTACCAACT ATTTCTTATC CAAATAAATA ACACAACCAA AGAAGTGCGT CCTTAACAAC GGTCAAAATA GAACAATACT AAAAACACCA AAAAGTATTA  AAACATAATC AGATTACCAA ACATTAACCT TCAAAATCTT GATCAACAAT AAATTATATT AAACTAAACA TTTGGAGTAT CTAACCTATA TATAACAAGA TATTTATCCA ACCTATATAT  AACAAAATAT TTACTTGCAA TGGGTAACCC CTACAATCTT AGTGACTGTT TACATTACAC ATCAACATAT AACTTTTTTT AGGCTTGAAA CATTAAGCAT AATCATTCAA AGTTCACCAT  GTACCTTGGA TACACAATGT TAAAATAAAT CCTACTGATA TTTGGAAAAC TCTATCGAGA ACGTGGATAT CTCTCTTTTG GAGGGCAACA TTGCATGGAT TATGTTTGAA GAATATAAGG  TGGTGATAGG AAGATCTCTG TTTCATCTTG GCTCCTTGTT GAGGTTCTGT TTTTTTTTTT GTAGCATGAC TTATTTTAGC TAGTGAAGGA TAGTGAGGTG TGTTGGGTAT GAAACTAGGA  CCAATTGGGT TGGGCTGAGT AGACACATGT TTAGTGAGTG GGCTTAATTA TTATGTCCCT TTATTATCTC TATTTATCTC TATTTAAAGA GATCATTCTA CTTGTAATTG GTGTGCAACA  GAATATAATG TAAACCTAAT AATTGCCCGG GTGGATGTAG GTTGTAGTTG ACGACCGAAC CACGTTAAAT CTTGTGTCGT TTATTTTTCT GCAGTTGATT CGTGATTATG TGTGTTGTTT  CCGCGTGCGT TTTTTCCATC AAGGTGTCAA TGTTATTATT TTTTATTGAT AAAAAAACAT AATTCAAAAA AGTTTGCCAC TATATGAATA AAACGGTGCA TTTGGAATCT TTTGATTAAA  GCAGTTGAAG TTTCGATTTA TTTTCAGCTC TGTGGAGTTG TATATATGAA TTGCATGATA AAATATTAGA CATCAAATCG TGGGTTATAT CATATGATAT AACCCTAAAA AAAGCTTACT  AACTACTTTG CCAACACTTT GACAAAGCAT GGGAAGCCGG CAGCACAAGT CATTGCATCA AAGAAAAACG AAGCAGGTTC ACATCGTTAT TGTGAATTGA TTAATCAAAA TACAATCCAA  GTAAACACTC CATGCATTGA CAACTTAGCT ATAGTTCTGC GTGTTAGGTT AGGTAACGGC AAAGAGACAA GGCACCTTGA GATTTAATCC CACATTGACA AACTAACCTT GACACTGGCT 
ATAAAAAGAT GTGACATATG CACTTAGAAA ACACACTCAT CGACCTAAAT ATTACTTACT CTTCTAGAAT TCTCAGACAT 

Retrieve as FASTA  
DNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGGCTTCGT CTTGTTCTAG CTTTATGATC ACTTTGGCCC TTTTGGTCCT TGTGATTGGA GGTGCCAATG CAACACTTTA CACAAACTTC TACTCCAGTT CTTGCCCAAA ACTCCTTGAC  ACTGTGAAAT GCGCAGTGGA ATCAGCCATA TCAAAGGAGA CCCGCATGGG TGCTTCTCTC CTACGTTTGT TCTTCCACGA TTGCTTTGTT AACGTAATTT TTAACACCTG CTAGTTAACT  ATTCTATTTA CTGCTAGACA ATTTTGTTTC TGCATTCGTT TTCAAGTTAT TAGGTTTGGT TGGTTTTGCT TAAAAAGCAT TTTTTATAGC TAGTTTTTGC AACTACATTT CATAGAACTA  TTATAGCAAA ACTACTAAAG TAACCCCGTA TATTTTCTGT CAGTTCAGAT ATCAATAGTT ATGATCAATA TAATTTTTGT CCATGCATAT TTTTGCATTT CTAACTGGTT GACTGTGTAA  AAAAACTGAA ACTAGCAATA TATATAAGTT TTAAACAGTA TATGTGGATT GAATAAATAA GAAGTGGTGC AGGGGTGTGA TGGGTCGATT CTACTTGATG ATACATCAAG CTTCACCGGA  GAGAAGAACG CACGTCCTAA CAAGAACTCT GCTCGTGGAT TTGATGTGAT CGACAAAATC AAGTCAGCTG TGGAGGAAGT GTGCCCAGGT GTGGTCTCCT GTGCTGATAT CCTTGCCATT  GCTGCCAGAG ATTCTGTTCA CATCGTAAGC AATTACTATA TATAAGGCCC GTCATATAAT ATTTTACATA GTATTGACCC ACATGACATG CAAGTAGAAG TGAATTGAAT ATTTGATTGG  ATTTAATCTC AGCTTGGTGG TCCAAGTTGG AACGTGAAAC TTGGAAGAAG AGATTCGAGG ACAGCAAGCC AATCTGCTGC CAACAATGGC ATCCCACCAC CCACTTCAAA CGTCAACCAA  CTCATCTCCA GATTCAACTC TCTTGGACTT TCTCCCAAGG ACTTGGTCGC ACTATCTGGT ACACACAATA ACCTGGATTC AAAATACACT TTTTAGAAAC TGTTTATAAC TTTTGACCTT  GTTCCAGGGG CTCATACAAT TGGACAAGCA AGGTGCACAA CCTTTAGAGC TCGCATCTAC AATGAAACCA ACATAGATAG TTCCTTTGCA CACATCAGAC AATCTACATG CCCTCCAAAC  TCAGGATCAG GGGACAACAA CTTGGCACCC CTTGACCTTG CCACTCCCAC TTTCTTTGAC AATCACTACT TCAAGAATCT CATTCAGAAG AAGGGCCTCC TCCATTCTGA TCAACAACTC  TTCAATGGTG CTTCCACTGA CTCACTGGTA CGTACCTACA ACACCAACCC AGGCTCCTTT TTCGCTGATT TCTCCGCTGC TATGATAAAA ATGGGAGACA TCAGTCCCCT CACCGGCTCC 
CTCGGAGAAA TAAGGAACAA GTGTCGGAGG GTCAACTAA 

Retrieve as FASTA  
CDS
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGGCTTCGT CTTGTTCTAG CTTTATGATC ACTTTGGCCC TTTTGGTCCT TGTGATTGGA GGTGCCAATG CAACACTTTA CACAAACTTC TACTCCAGTT CTTGCCCAAA ACTCCTTGAC  ACTGTGAAAT GCGCAGTGGA ATCAGCCATA TCAAAGGAGA CCCGCATGGG TGCTTCTCTC CTACGTTTGT TCTTCCACGA TTGCTTTGTT AACGGGTGTG ATGGGTCGAT TCTACTTGAT  GATACATCAA GCTTCACCGG AGAGAAGAAC GCACGTCCTA ACAAGAACTC TGCTCGTGGA TTTGATGTGA TCGACAAAAT CAAGTCAGCT GTGGAGGAAG TGTGCCCAGG TGTGGTCTCC  TGTGCTGATA TCCTTGCCAT TGCTGCCAGA GATTCTGTTC ACATCCTTGG TGGTCCAAGT TGGAACGTGA AACTTGGAAG AAGAGATTCG AGGACAGCAA GCCAATCTGC TGCCAACAAT  GGCATCCCAC CACCCACTTC AAACGTCAAC CAACTCATCT CCAGATTCAA CTCTCTTGGA CTTTCTCCCA AGGACTTGGT CGCACTATCT GGGGCTCATA CAATTGGACA AGCAAGGTGC  ACAACCTTTA GAGCTCGCAT CTACAATGAA ACCAACATAG ATAGTTCCTT TGCACACATC AGACAATCTA CATGCCCTCC AAACTCAGGA TCAGGGGACA ACAACTTGGC ACCCCTTGAC  CTTGCCACTC CCACTTTCTT TGACAATCAC TACTTCAAGA ATCTCATTCA GAAGAAGGGC CTCCTCCATT CTGATCAACA ACTCTTCAAT GGTGCTTCCA CTGACTCACT GGTACGTACC  TACAACACCA ACCCAGGCTC CTTTTTCGCT GATTTCTCCG CTGCTATGAT AAAAATGGGA GACATCAGTC CCCTCACCGG CTCCCTCGGA GAAATAAGGA ACAAGTGTCG GAGGGTCAAC 
TAA 

Retrieve as FASTA  
cDNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
CCTAAATATT ACTTACTCTT CTAGAATTCT CAGACATATG GCTTCGTCTT GTTCTAGCTT TATGATCACT TTGGCCCTTT TGGTCCTTGT GATTGGAGGT GCCAATGCAA CACTTTACAC  AAACTTCTAC TCCAGTTCTT GCCCAAAACT CCTTGACACT GTGAAATGCG CAGTGGAATC AGCCATATCA AAGGAGACCC GCATGGGTGC TTCTCTCCTA CGTTTGTTCT TCCACGATTG  CTTTGTTAAC GGGTGTGATG GGTCGATTCT ACTTGATGAT ACATCAAGCT TCACCGGAGA GAAGAACGCA CGTCCTAACA AGAACTCTGC TCGTGGATTT GATGTGATCG ACAAAATCAA  GTCAGCTGTG GAGGAAGTGT GCCCAGGTGT GGTCTCCTGT GCTGATATCC TTGCCATTGC TGCCAGAGAT TCTGTTCACA TCCTTGGTGG TCCAAGTTGG AACGTGAAAC TTGGAAGAAG  AGATTCGAGG ACAGCAAGCC AATCTGCTGC CAACAATGGC ATCCCACCAC CCACTTCAAA CGTCAACCAA CTCATCTCCA GATTCAACTC TCTTGGACTT TCTCCCAAGG ACTTGGTCGC  ACTATCTGGG GCTCATACAA TTGGACAAGC AAGGTGCACA ACCTTTAGAG CTCGCATCTA CAATGAAACC AACATAGATA GTTCCTTTGC ACACATCAGA CAATCTACAT GCCCTCCAAA  CTCAGGATCA GGGGACAACA ACTTGGCACC CCTTGACCTT GCCACTCCCA CTTTCTTTGA CAATCACTAC TTCAAGAATC TCATTCAGAA GAAGGGCCTC CTCCATTCTG ATCAACAACT  CTTCAATGGT GCTTCCACTG ACTCACTGGT ACGTACCTAC AACACCAACC CAGGCTCCTT TTTCGCTGAT TTCTCCGCTG CTATGATAAA AATGGGAGAC ATCAGTCCCC TCACCGGCTC  CCTCGGAGAA ATAAGGAACA AGTGTCGGAG GGTCAACTAA TTCCATTGTT GAAAACACCT ACGTCTTTTG GATTTTATGA TTCCAGATGA ATGCAGGGGT AATAATAAGT TGTTAAGTAT  CTCCTCATCT CATTTTTACG TTTTCTGCTA CAAAGTGTAC CTGCATTTCC CTTTTTCCTT AATTTTGCTT CCGAGTGCTT ATGTTCAAGT TGAAGGCTTT TCATGTACAA CTTCCTTCCT 
CACTTCCTAC TACAGTTTTA CTTATCATTA TTTTGGCTTT TCTTTTTTGC TTTTTATGTC CACTTTCTAC 

Retrieve as FASTA