Entry information : IbaCP02
Entry ID 2802
Creation 2007-02-08 (Christophe Dunand)
Last sequence changes 2016-01-13 (Christophe Dunand)
Sequence status complete
Reviewer Achraf Jemmat
Last annotation changes 2016-01-13 (Achraf Jemmat)
Peroxidase information: IbaCP02
Name IbaCP02
Class Catalase peroxidase    [Orthogroup: CP001]
Taxonomy Bacteria Proteobacteria Gammaproteobacteria Idiomarinaceae Idiomarina
Organism Idiomarina baltica    [TaxId: 190892 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type N/D
Inducer N/D
Repressor N/D
Best BLASTp hits
Perox score E-value IbaCP02
start..stop
S start..stop
IlCP02 1309 0 4..721 8..725
SYspCP01_PCC6803 1156 0 1..721 31..751
SputCP01_CN-32 1138 0 2..721 7..727
SHspCP01_W3-18-1 1138 0 2..721 7..727
Gene structure Fichier Exons
ExonStart..EndSize ExonStart..EndSize ExonStart..EndSize ExonStart..EndSize
N° 1 77394..79568 2175  
complement(77394..79568)


exon

Literature and cross-references IbaCP02
Literature Brettar,I. et al., Direct Submission. Submitted (20-JAN-2006) J Craig Venter Institute, 9704 Medical. Center Drive, Rockville, MD 20850, USA
DNA ref. GenBank:   AAMX01000005.1 (79568..77394)
Protein sequence: IbaCP02
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   725
PWM (Da):   %s   81972.23  
PI (pH):   %s   4.81
Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
.........1.........2.........3.........4.........5.........6.........7.........8.........9.........0.........1.........2
MSSGKCPVMH GSMTNTGKTN THWWPNSLKL EILRQHDTKA NPMDAGFNYA EEFKKINLEE LKEDVKKLMT DSKSWWPADW GHYGGFMIRM AWHSAGSYRL ADGRGGGGTG NQRFAPLNSW  PDNVSLDKAR RLLWPVKKKY GNKLSWADLF ILAGTMAYES MGLKVFGFAG GREDIWHPEE DIYWGSEKEW LDATKNRYDS DQERESLENP LAAVQMGLIY VNPEGVDGQP DPLRTAKDVR  ETFKRMAMND EETVALTAGG HTVGKCHGNG KEENLGPEPE AADVEEQGLG WRNSAGKGMG RDTMSSGIEG AWTTHPTQWD NGYFYLLFNY DWELKKSPAG AWQWEPIDIK EEDKPVDVED  PSIRHNPIMT DADMAMIKDP EYRKISEKFY NNPDYFAEVF ARAWFKLTHR DLGPKDRYLG ADVPEEDLIW QDPIPKVDYS LSDSEVAELK KKLLESGLTD YELISTAWDS ARTFRGSDYR  GGANGARIRL APQKDWHGNE PEKLQRVLAT LERVRSELDK PVSIADLIVL GGTAAVEKAV HKAGYDFTVP FTPGRGDATD EWTDAESFEP LEPLHDGYRN YLKKDYQVSA EELMLDRTQL  MGLTAPEMTV LVGGLRVLGA NYGESKHGVF TDRVGTLTND FFVNLTDMEN VWKKAGDHYE VRDRATDTVK WTANRIDLVF GSNSILRAYS ELYAQDDNQE KFVKDFIEAW VKVMDADRFD 
VKAA* 

Retrieve as FASTA  
Remarks Complete sequence from genomic. Strain="OS145".
DNA
Send to BLAST
.........1.........2.........3.........4.........5.........6.........7.........8.........9.........0.........1.........2
ATGAGTTCAG GTAAATGTCC AGTCATGCAC GGCAGTATGA CAAACACAGG CAAAACGAAC ACCCACTGGT GGCCCAATTC ACTTAAGCTC GAGATTTTAC GTCAGCACGA CACCAAAGCG  AACCCGATGG ATGCGGGCTT TAACTACGCA GAAGAGTTTA AAAAAATAAA CTTGGAAGAG TTAAAGGAAG ACGTAAAAAA ATTGATGACC GACAGTAAGT CTTGGTGGCC AGCCGACTGG  GGTCACTATG GCGGTTTTAT GATTCGTATG GCGTGGCACT CAGCAGGTTC TTATCGTCTC GCTGATGGCC GCGGTGGTGG CGGTACAGGT AATCAACGTT TTGCACCGTT AAACAGCTGG  CCTGACAACG TAAGTTTAGA TAAAGCACGC CGTCTGTTGT GGCCGGTGAA AAAGAAATAC GGCAACAAAC TGTCTTGGGC TGACTTGTTT ATTCTTGCTG GTACCATGGC CTATGAGTCA  ATGGGGCTCA AGGTGTTCGG TTTTGCCGGG GGACGCGAAG ATATCTGGCA TCCAGAAGAA GATATTTATT GGGGTAGTGA GAAAGAATGG TTGGATGCAA CTAAGAACCG TTATGACTCC  GATCAAGAGC GTGAGTCACT CGAGAATCCG TTAGCCGCCG TGCAAATGGG TCTTATCTAT GTCAACCCAG AGGGTGTTGA CGGTCAACCC GATCCGTTGC GTACTGCGAA AGACGTGCGT  GAAACGTTCA AACGCATGGC TATGAATGAT GAGGAAACGG TCGCTTTGAC AGCCGGTGGT CACACGGTTG GTAAATGTCA TGGTAACGGA AAAGAAGAGA ATTTAGGCCC TGAACCTGAA  GCAGCCGATG TGGAAGAGCA AGGCCTAGGC TGGCGCAACA GCGCTGGCAA GGGTATGGGA CGTGACACAA TGTCGAGCGG TATTGAAGGC GCTTGGACAA CTCATCCTAC TCAGTGGGAT  AACGGCTACT TCTACTTGTT ATTCAACTAT GATTGGGAAC TTAAGAAAAG CCCGGCAGGC GCTTGGCAGT GGGAACCTAT CGACATCAAA GAGGAAGACA AGCCCGTTGA TGTAGAGGAT  CCTTCGATTC GTCACAACCC AATCATGACG GACGCCGACA TGGCGATGAT TAAAGATCCA GAGTATCGCA AGATTTCTGA GAAGTTTTAC AATAATCCCG ACTATTTTGC CGAAGTGTTT  GCGCGTGCTT GGTTTAAATT GACGCACCGC GATTTAGGTC CAAAAGATCG GTATCTTGGA GCCGATGTGC CTGAAGAGGA TTTGATCTGG CAAGATCCAA TCCCGAAAGT GGACTACAGC  CTGTCTGATA GCGAAGTGGC TGAGCTCAAG AAAAAGCTAC TTGAAAGCGG TTTAACCGAT TACGAGTTGA TTTCTACGGC ATGGGATAGT GCACGTACAT TCCGTGGGTC AGACTATCGT  GGCGGTGCTA ATGGCGCCCG CATTCGTCTT GCTCCACAAA AGGATTGGCA CGGTAATGAG CCCGAGAAAT TACAACGTGT GTTGGCGACG TTAGAGCGTG TTCGAAGCGA ACTCGACAAG  CCTGTAAGTA TTGCTGACTT GATTGTTTTA GGTGGCACGG CCGCAGTTGA GAAAGCTGTG CACAAAGCAG GATACGATTT CACTGTCCCG TTCACGCCAG GGCGCGGTGA CGCGACCGAC  GAGTGGACCG ACGCTGAGAG CTTTGAACCA CTTGAGCCCT TACACGACGG GTACCGCAAT TACTTGAAGA AGGACTACCA AGTTTCAGCA GAGGAGTTGA TGCTCGACCG TACTCAACTG  ATGGGGTTAA CGGCACCTGA GATGACAGTG CTCGTCGGTG GTCTACGCGT ACTTGGCGCG AACTATGGTG AATCCAAACA TGGCGTTTTC ACTGACCGTG TGGGCACATT GACCAATGAC  TTCTTTGTCA ACTTGACTGA TATGGAAAAT GTCTGGAAGA AAGCGGGTGA TCATTATGAA GTCCGTGATC GAGCGACTGA TACGGTCAAG TGGACAGCCA ATCGTATTGA TTTGGTATTT  GGTTCAAACT CAATTTTGCG TGCTTATTCT GAGCTGTATG CGCAAGATGA TAACCAAGAG AAGTTTGTAA AAGACTTCAT CGAAGCTTGG GTTAAGGTAA TGGATGCTGA TCGGTTTGAT 
GTTAAAGCAG CTTAG 

Retrieve as FASTA  
CDS
Send to BLAST
.........1.........2.........3.........4.........5.........6.........7.........8.........9.........0.........1.........2
ATGAGTTCAG GTAAATGTCC AGTCATGCAC GGCAGTATGA CAAACACAGG CAAAACGAAC ACCCACTGGT GGCCCAATTC ACTTAAGCTC GAGATTTTAC GTCAGCACGA CACCAAAGCG  AACCCGATGG ATGCGGGCTT TAACTACGCA GAAGAGTTTA AAAAAATAAA CTTGGAAGAG TTAAAGGAAG ACGTAAAAAA ATTGATGACC GACAGTAAGT CTTGGTGGCC AGCCGACTGG  GGTCACTATG GCGGTTTTAT GATTCGTATG GCGTGGCACT CAGCAGGTTC TTATCGTCTC GCTGATGGCC GCGGTGGTGG CGGTACAGGT AATCAACGTT TTGCACCGTT AAACAGCTGG  CCTGACAACG TAAGTTTAGA TAAAGCACGC CGTCTGTTGT GGCCGGTGAA AAAGAAATAC GGCAACAAAC TGTCTTGGGC TGACTTGTTT ATTCTTGCTG GTACCATGGC CTATGAGTCA  ATGGGGCTCA AGGTGTTCGG TTTTGCCGGG GGACGCGAAG ATATCTGGCA TCCAGAAGAA GATATTTATT GGGGTAGTGA GAAAGAATGG TTGGATGCAA CTAAGAACCG TTATGACTCC  GATCAAGAGC GTGAGTCACT CGAGAATCCG TTAGCCGCCG TGCAAATGGG TCTTATCTAT GTCAACCCAG AGGGTGTTGA CGGTCAACCC GATCCGTTGC GTACTGCGAA AGACGTGCGT  GAAACGTTCA AACGCATGGC TATGAATGAT GAGGAAACGG TCGCTTTGAC AGCCGGTGGT CACACGGTTG GTAAATGTCA TGGTAACGGA AAAGAAGAGA ATTTAGGCCC TGAACCTGAA  GCAGCCGATG TGGAAGAGCA AGGCCTAGGC TGGCGCAACA GCGCTGGCAA GGGTATGGGA CGTGACACAA TGTCGAGCGG TATTGAAGGC GCTTGGACAA CTCATCCTAC TCAGTGGGAT  AACGGCTACT TCTACTTGTT ATTCAACTAT GATTGGGAAC TTAAGAAAAG CCCGGCAGGC GCTTGGCAGT GGGAACCTAT CGACATCAAA GAGGAAGACA AGCCCGTTGA TGTAGAGGAT  CCTTCGATTC GTCACAACCC AATCATGACG GACGCCGACA TGGCGATGAT TAAAGATCCA GAGTATCGCA AGATTTCTGA GAAGTTTTAC AATAATCCCG ACTATTTTGC CGAAGTGTTT  GCGCGTGCTT GGTTTAAATT GACGCACCGC GATTTAGGTC CAAAAGATCG GTATCTTGGA GCCGATGTGC CTGAAGAGGA TTTGATCTGG CAAGATCCAA TCCCGAAAGT GGACTACAGC  CTGTCTGATA GCGAAGTGGC TGAGCTCAAG AAAAAGCTAC TTGAAAGCGG TTTAACCGAT TACGAGTTGA TTTCTACGGC ATGGGATAGT GCACGTACAT TCCGTGGGTC AGACTATCGT  GGCGGTGCTA ATGGCGCCCG CATTCGTCTT GCTCCACAAA AGGATTGGCA CGGTAATGAG CCCGAGAAAT TACAACGTGT GTTGGCGACG TTAGAGCGTG TTCGAAGCGA ACTCGACAAG  CCTGTAAGTA TTGCTGACTT GATTGTTTTA GGTGGCACGG CCGCAGTTGA GAAAGCTGTG CACAAAGCAG GATACGATTT CACTGTCCCG TTCACGCCAG GGCGCGGTGA CGCGACCGAC  GAGTGGACCG ACGCTGAGAG CTTTGAACCA CTTGAGCCCT TACACGACGG GTACCGCAAT TACTTGAAGA AGGACTACCA AGTTTCAGCA GAGGAGTTGA TGCTCGACCG TACTCAACTG  ATGGGGTTAA CGGCACCTGA GATGACAGTG CTCGTCGGTG GTCTACGCGT ACTTGGCGCG AACTATGGTG AATCCAAACA TGGCGTTTTC ACTGACCGTG TGGGCACATT GACCAATGAC  TTCTTTGTCA ACTTGACTGA TATGGAAAAT GTCTGGAAGA AAGCGGGTGA TCATTATGAA GTCCGTGATC GAGCGACTGA TACGGTCAAG TGGACAGCCA ATCGTATTGA TTTGGTATTT  GGTTCAAACT CAATTTTGCG TGCTTATTCT GAGCTGTATG CGCAAGATGA TAACCAAGAG AAGTTTGTAA AAGACTTCAT CGAAGCTTGG GTTAAGGTAA TGGATGCTGA TCGGTTTGAT 
GTTAAAGCAG CTTAG 

Retrieve as FASTA