Entry information : HvuNAnPrx01
Entry ID 2807
Creation 2006-12-20 (Christophe Dunand)
Last sequence changes 2014-10-17 (Christophe Dunand)
Sequence status complete
Reviewer Harold Duruflé
Last annotation changes 2014-10-22 (Harold Duruflé)
Peroxidase information: HvuNAnPrx01
Name HvuNAnPrx01
Class Other non animal peroxidase    [Orthogroup: NAnPrx001]
Taxonomy Eukaryota Metazoa Cnidaria Hydrozoa Hydridae Hydra
Organism Hydra vulgaris    [TaxId: 6087 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type Embryos
Inducer N/D
Repressor N/D
Best BLASTp hits
Perox score E-value HvuNAnPrx01
start..stop
S start..stop
HviNAnPrx01 537 0 10..367 4..367
HvuNAnPrx02 445 2e-157 22..344 19..341
HvuNAnPrx10 431 7e-151 10..344 60..394
HvuNAnPrx09 421 5e-148 10..344 7..341
Literature and cross-references HvuNAnPrx01
Literature Bode,H., Blumberg,B., Steele,R., Wigge,P., Gee,L., Nguyen,Q., Martinez,D., Kibler,D., Hampson,S., Clifton,S., Pape,D., Marra,M., Hillier,L., Martin,J., Wylie,T., Dante,M., Theising,B., Bowers,Y., Gibbons,M., Ritter,E., Bennett,J., Ronko,I., Tsagareishvili,R., Maguire,L., Kennedy,S., Waterston,R. and Wilson,R. WashU Hydra EST Project
DNA ref. GenBank:   NW_004167007.1 (21320..23943)
EST ref. GenBank:   DT605900.1 [5' end]   Y448562.1 [3' end]
Cluster/Prediction ref. UniGene:   Hma.1106
Protein sequence: HvuNAnPrx01
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   367
PWM (Da):   %s   41165.86 Transmb domain:   %s   i5-27o
PI (pH):   %s   9.08
Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
MKNKIVWSTI AYLLTFFLFA NSVQIIPSSY YFEKAKSDLL NLIESVKNGN DLPMIAGTVR VAFHDCIGKG KCNGCIDHSL SSNRGLKRVT DRLDALYDVS YKGKMSRADF YALAAVIALT  RSTANVPDKY NGLKTFKVGR KDCDTSPVDS ETNSNFPRGS DGTSKTLGFF KREFGFNTRE AVAILGAHTL GRCHLQNSGF VGAWVDNRFS TALPGETLAP TSILDNAYFR MIVDIVPWVQ  VNINGTRIQW QEPKHPIPND KLPESKRSPL LLNSDMSISW IITPTDNLGT VSCTPTSRIN PCRHSNAHTY AKLYAQNNAF WIKEFTRVFN KMISRSEYTL KEVPETNLYE DLYFNNKKVY 
NDAEEVF 

Retrieve as FASTA  
Remarks Complete sequence from genomic and ESTs. One intron detected in the 5'UTR. Some mismatches can be observed between ESTs and DNA (various strains).
DNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGAAGAACA AAATAGTTTG GTCAACAATA GCGTATTTGC TAACTTTTTT TTTGTTCGCT AATTCAGTTC AAATTATTCC TTCAAGTTAT TATTTTGAAA AAGCAAAAAG CGATCTATTA  AATCTAATTG AATCTGTTAA AAATGGTAAT GACTTACCAA TGATTGCTGG CACTGTTCGT GTAGCGTTTC ACGATTGCAT TGGTAAAGGA AAATGTAACG GTTGTATAGA TCATTCATTA  TCATCCAACA GAGGGTTAAA AAGAGTAACG GATCGACTTG ATGCATTATA CGATGTTTCT TACAAAGGAA AAATGTCAAG AGCGGATTTT TATGCATTAG CAGCAGTTAT TGCTCTAACT  AGGTCTACAG CCAATGTTCC TGATAAATAC AATGGGCTCA AAACTTTTAA AGTGGGCAGA AAGGATTGTG ATACGTCACC TGTTGATTCT GAAACCAATT CCAATTTTCC AAGAGGAAGC  GATGGCACGT CAAAAACATT AGGGTTTTTT AAAAGGGAGT TTGGATTCAA CACTAGAGAG GCTGTTGCTA TTTTAGGTGC GCACACACTT GGAAGATGTC ATTTGCAAAA CTCAGGATTT  GTTGGTGCCT GGGTTGATAA TCGATTTTCA ACAGCGTTGC CGGGTGAAAC TTTGGCTCCA ACAAGTATAC TCGATAATGC TTACTTTCGA ATGATTGTTG ATATAGTTCC GTGGGTTCAG  GTGAACATCA ATGGAACAAG AATCCAATGG CAAGAACCAA AACATCCAAT ACCTAATGAC AAGTTGCCAG AATCGAAAAG AAGTCCATTA CTTTTAAACT CTGATATGAG TATTTCATGG  ATTATAACAC CCACAGATAA TCTTGGTACA GTTTCTTGTA CACCAACCTC ACGAATAAAT CCTTGCCGCC ATTCTAATGC TCATACATAT GCAAAACTCT ACGCCCAAAA TAATGCATTT  TGGATAAAAG AGTTTACAAG AGTTTTTAAT AAAATGATAA GTAGAAGTGA ATACACGTTA AAAGAGGTTC CCGAAACAAA CTTATACGAA GATTTGTACT TTAATAATAA AAAAGTGTAC 
AATGATGCCG AAGAAGTATT TTAA 

Retrieve as FASTA  
CDS
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGAAGAACA AAATAGTTTG GTCAACAATA GCGTATTTGC TAACTTTTTT TTTGTTCGCT AATTCAGTTC AAATTATTCC TTCAAGTTAT TATTTTGAAA AAGCAAAAAG CGATCTATTA  AATCTAATTG AATCTGTTAA AAATGGTAAT GACTTACCAA TGATTGCTGG CACTGTTCGT GTAGCGTTTC ACGATTGCAT TGGTAAAGGA AAATGTAACG GTTGTATAGA TCATTCATTA  TCATCCAACA GAGGGTTAAA AAGAGTAACG GATCGACTTG ATGCATTATA CGATGTTTCT TACAAAGGAA AAATGTCAAG AGCGGATTTT TATGCATTAG CAGCAGTTAT TGCTCTAACT  AGGTCTACAG CCAATGTTCC TGATAAATAC AATGGGCTCA AAACTTTTAA AGTGGGCAGA AAGGATTGTG ATACGTCACC TGTTGATTCT GAAACCAATT CCAATTTTCC AAGAGGAAGC  GATGGCACGT CAAAAACATT AGGGTTTTTT AAAAGGGAGT TTGGATTCAA CACTAGAGAG GCTGTTGCTA TTTTAGGTGC GCACACACTT GGAAGATGTC ATTTGCAAAA CTCAGGATTT  GTTGGTGCCT GGGTTGATAA TCGATTTTCA ACAGCGTTGC CGGGTGAAAC TTTGGCTCCA ACAAGTATAC TCGATAATGC TTACTTTCGA ATGATTGTTG ATATAGTTCC GTGGGTTCAG  GTGAACATCA ATGGAACAAG AATCCAATGG CAAGAACCAA AACATCCAAT ACCTAATGAC AAGTTGCCAG AATCGAAAAG AAGTCCATTA CTTTTAAACT CTGATATGAG TATTTCATGG  ATTATAACAC CCACAGATAA TCTTGGTACA GTTTCTTGTA CACCAACCTC ACGAATAAAT CCTTGCCGCC ATTCTAATGC TCATACATAT GCAAAACTCT ACGCCCAAAA TAATGCATTT  TGGATAAAAG AGTTTACAAG AGTTTTTAAT AAAATGATAA GTAGAAGTGA ATACACGTTA AAAGAGGTTC CCGAAACAAA CTTATACGAA GATTTGTACT TTAATAATAA AAAAGTGTAC 
AATGATGCCG AAGAAGTATT TTAA 

Retrieve as FASTA  
cDNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
AAAAAATATT ATTTTTGTTA TAAAATTTAA CACTAAACTG ATCAGACGCC CTTGTTAGCT ATTAGTTTCA ACGCAACAAT GAAGAACAAA ATAGTTTGGT CAACAATAGC GTATTTGCTA  ACTTTTTTTT TGTTCGCTAA TTCAGTTCAA ATTATTCCTT CAAGTTATTA TTTTGAAAAA GCAAAAAGCG ATCTATTAAA TCTAATTGAA TCTGTTAAAA ATGGTAATGA CTTACCAATG  ATTGCTGGCA CTGTTCGTGT AGCGTTTCAC GATTGCATTG GTAAAGGAAA ATGTAACGGT TGTATAGATC ATTCATTATC ATCCAACAGA GGGTTAAAAA GAGTAACGGA TCGACTTGAT  GCATTATACG ATGTTTCTTA CAAAGGAAAA ATGTCAAGAG CGGATTTTTA TGCATTAGCA GCAGTTATTG CTCTAACTAG GTCTACAGCC AATGTTCCTG ATAAATACAA TGGGCTCAAA  ACTTTTAAAG TGGGCAGAAA GGATTGTGAT ACGTCACCTG TTGATTCTGA AACCAATTCC AATTTTCCAA GAGGAAGCGA TGGCACGTCA AAAACATTAG GGTTTTTTAA AAGGGAGTTT  GGATTCAACA CTAGAGAGGC TGTTGCTATT TTAGGTGCGC ACACACTTGG AAGATGTCAT TTGCAAAACT CAGGATTTGT TGGTGCCTGG GTTGATAATC GATTTTCAAC AGCGTTGCCG  GGTGAAACTT TGGCTCCAAC AAGTATACTC GATAATGCTT ACTTTCGAAT GATTGTTGAT ATAGTTCCGT GGGTTCAGGT GAACATCAAT GGAACAAGAA TCCAATGGCA AGAACCAAAA  CATCCAATAC CTAATGACAA GTTGCCAGAA TCGAAAAGAA GTCCATTACT TTTAAACTCT GATATGAGTA TTTCATGGAT TATAACACCC ACAGATAATC TTGGTACAGT TTCTTGTACA  CCAACCTCAC GAATAAATCC TTGCCGCCAT TCTAATGCTC ATACATATGC AAAACTCTAC GCCCAAAATA ATGCATTTTG GATAAAAGAG TTTACAAGAG TTTTTAATAA AATGATAAGT  AGAAGTGAAT ACACGTTAAA AGAGGTTCCC GAAACAAACT TATACGAAGA TTTGTACTTT AATAATAAAA AAGTGTACAA TGATGCCGAA GAAGTATTTT AACTTAACAC ATTTTTTTAT 
ATATTTTTTT TATATTTTGT TATGTTACTC TCAAGATTTA TTGAAAGTTT ATCTAAAATT TTTATTAAGA AAAGATTTGT AAACA 

Retrieve as FASTA