Entry information : PtPrx[P]83
Entry ID 3268
Creation 2006-06-13 (Claudia Cosio)
Last sequence changes 2012-03-08 (Qiang Li)
Sequence status theoretical translation / pseudogene
Reviewer Not yet reviewed
Last annotation changes 2012-03-08 (Qiang Li)
Peroxidase information: PtPrx[P]83
Name PtPrx[P]83
Class Class III peroxidase     [Orthogroup: Prx041]*
Taxonomy Eukaryota Viridiplantae Streptophyta Salicaceae Populus
Organism Populus trichocarpa (Western balsam poplar)    [TaxId: 3694 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type N/D
Inducer N/D
Repressor N/D
Best BLASTp hits
Perox score E-value PtPrx[P]83
start..stop
S start..stop
PtPrx83 279 8e-96 1..170 97..266
VvPrx15 238 1e-79 1..170 91..260
PpePrx23 238 1e-79 1..170 89..261
CsaPrx88 228 2e-75 1..170 90..260
Literature and cross-references PtPrx[P]83
DNA ref. Phytozome 12:   scaffold_3 (10061582..10065121)
Protein sequence: PtPrx[P]83
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   170
PWM (Da):   %s   19144.85  
PI (pH):   %s   9.36
Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
KQAEAIVNSW RRFEVIDRIK YLLEEACPLT VSCADILAIA ARDAAAAIHI PSREVHRGRK DSLKSSSDRA DQFIPAPNSS LETLIANFKQ QGLDIGNLVA FSGSHTMGKA RCLSFRQQIH 
DENAEEHCDK YKRYTPFRRI LRSICPKPRK DSQLAPLDCK TPARFDNKYF 

Retrieve as FASTA  
Remarks Partial sequence from genomic (chromo 3). Exons 1 and 4 are missing. Frame shift.
DNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
AAGCAAGCAG AAGCTATCGT AAACTCATGG CGTAGATTTG AAGTCATTGA TAGGATTAAG TATCTATTAG AAGAAGCATG CCCCCTCACA GTGTGCAGAT CTGAATTAAG CTTAAGACAG  AACTATAAAT GAACCTTTTA AAATATTTAA GAAATATTTT TTTATTTTTT ATGTATGTCT GGCAAGTAGA GGACTTTGCG CAATTTTCAT TCCATTCTCG GGGATCTTTT GTTAAGTAAA  GAAAATCTTA TACCTGACTT GTTTTTTGTA GCTTTTTGTT AAATAGAAGC CTTGGACCAT TGTCCAAATG ACCTAAGCTT AAACCTGCTC TAACAGTATC ATGTGCTGAT ATTTTAGCCA  TTGCTGCTCG TGATGCTGCT GCAGCGATAC ATATGCAAGT ATACCTCTAT CTCTTTCTTT CATCTTACTG TCTTATTATA AACTCCATAT GTGCCTTCAA TATCATAAAT GGTGAGAAAG  ATGGTCATTC GTATGTCACA ACTAATTCCT CGATGACATT AATTTGTTGA GATAAACTAA TTAATTTCTT AATACAATTG ATAATTGCTC ATGTCTTTCA GCTTGGCAGC CCAAGTCGGG  AAGTTCATCG AGGCAGAAAG GACTCCCTGA AGTCAAGTTC TGACCGCGCC GATCAGTTTA TCCCTGCACC AAATTCCTCT TTGGAGACTC TAATTGCCAA TTTTAAGCAA CAGGGTCTTG  ACATAGGAAA CTTGGTTGCT TTCTCAGGTA GAATTCTGAC AACCCTTTAA AGAATTATTT TTATAGTATT TTTTTTTAAT AGTACGGTCA CTGGATTAGG TTAAAACCAT AGTTTTGAAA  CCCGATCCGG TGGTCGACCC GGTCTAATGA CCGGGTCACG GGTCAGATGG GGTGACCCGG GTCAACCCAA AAAAAAAACT AGCAAGCAGA AGGGGTATTG AATTCAAGTC CGGGCCTTGG  ATGTTTAAGA AAAATCGATA CATTGACTTC TCAGTGGCGC TTAGAGCAAA GTGATCATGA AACATGTGTG GGCCATTCCC CAGCGTGGCT GATCTTTCAT GTTCTCTTCC ATAAGCATCT  GGCTCATTCC CCAGCGCGCG CACACACACA GAAGAAAGAA AAAAAAATAG AAAACCCAGA GAGCAAGAGA GAAATTAATT AACTTTTCTC AGTCATTGTG ATCTCAAACG TGAACAGTTT  CCTTCTTCAG CAGTAAGCAG CCTCTATCAA CCGTGAGCTT CAATCACGCC AATAATAGCA TGAGTTCATC CCCAAGCATC AACAACTTTG CTTTCAACTA AGAATCTCAT CCCCAACATT  GGTTTTGGTC AAGATCAGCG GCAGCTCAGC CTCAGCCATA TCTATCAACT GTGAGCCTCA ATCACATGAC CTTAGCGCGT CTCTTTTCGT TCTCTTTCCT GTCCGTGAAG GTGGATCAAA  GAAAGGCATC TTGCTTCTCT CCTGGAGATC CACTTTTCCG ACTAATGACA GAGCCCCCCC GGCTAGGAGG CATTTATTCA TCTTCATCAT TTAAAACGAT GTAGTTTAAT GTGTCTGTAT  GAAAAAAAAA AGAAAAAAAA AAGAGAGAGA GACCGGGTCT CAGCCGGGTT TACCCGGGTC GCCTGGGTTC CGGGTCGACC CGCCTGGTCG ACCGGGTTTT TCCGGGCCAA CTTCCAGGCG  GGTTTTTACT TAGACCCGGA CCGGTCCCAG GCCCGGGTCG GCCGGGTCCC GGGTCGACCC GCCGGGCCGG TCCAGGTTTC AAAACTGTGG TTAAAACACG GGCTAAGCTC AGTCAGTTAC  CGACAACTTC AAGATTAAGT GTTACGATTC AGGAAAGGTA AATTCGGATT TTGATGTAAG AAATGCATTT ATTCAGTTTT ATAGCAACAG TTATAATTTT TAATCCGATT GTTGGATCGG  GCTAAAATTT TACGTGGAGT TTCTTGACAT GGTATCCTAC CTTGAGTTAA AATTTCAGGT TAATCGGAGT CAAAAAGGCA TCGAAACACG GGTCAACAGA GGTTGTACGA ATTTTGTTAT  TTACTTCCTT TTGACTTGTG GACTTTCTAT TTGGCTGGGA AAGAAGACTT CAGAATAACT TCTACCTTTA GATCAGATTT CATAGTCTAT TTGAGGACTT CTTAATGGTG ACAAATCTGA  TTCTAGCATA TTTAGGATGG TAATTTTTGG ATTTTTATTA TTTTTATTAT TTTCTTCTTA GTCTTTGGGT TATTATTACT TATTTGGGTT AATTGTAAGT GGGTTTAATA TAAGTCCACC  TAAGGGGGGT CCATTAGGGT TTATTTAAGT CTAGAGTTAG TATAAATAAA GGCATAACCA GACATGTAAA TTAGACAATT CAGATTAATA AAACTTATTG TTTGCCACAC ATTGTGTGTG  TGTGTTGGTG AGATAATCTC TCTTCCATGG TTCTCTAATT AAATGAAAAA CGACTTATCA AAGAACAACT ATCTTTGTGG CGTCATCCTT ATACTTCTCG TTCGCGAATC AATATTCATT  GGGTGGGGGT TTCCGTTTCC AATAGTGCTG GTGCATAGGT ACAAGTTATC TTTGTGTCAC ACTCCTATCA AACCTTATTT ACTTGGCTTT CCGGGAATTG GTGTCTTTGC GTGTGGGTTG  CGTGACCATG TCTGGGTTTT ATAGTATTTT TTTTTAACAG TACGGTCACT GGATTAGGTT AAAACACGGG CTAAGCTCAA TCAGTTACCG ACCACTTCAA GATTAAGTGT TGAACTACTT  AAACCGAGGC AACTAAGACC AGACAGGAAA AAAAAATACA TCGGATCCAG GAGCATGCAA GTCCAGACCA TATTCCTAGC AAAGGACAGA GGCTGACCAG GAAAAGAAGA AGAAAAGAAA  AACGAACAAA ATGCACAAGG ATAATATATA CCACTAGAAT TCAATCAAGC CCTTTATAAT TTTTGTATGA TTTCCAAGAG TAAATATTTT TTTTCCTAAA ATTATATAAA TACCAGTAAA  AACATAGGAT GGTGACAATT GCTTGATATC CCATTATTTA ACAAGTCGTG GGGTTCCGAC TTCCGAGTAT TTGTTAGTTA AAGTGTATAT CCTTTTAATA TATATTTTGT CTTTTAGGGT  TTTTTTGTTT TTTTATTTAA TTTTTTTTTT ACTTTAAATG ATGCAAAATA CTAATATACA TATATACCTA CGGAGAGATT ATTAGGCAAC TTATGCTGCT CCCTAGCTAC CTCAAAATGG  TGCTGTAACT TTCAAGAAAT AATTTAGTAC CAAAAAACAA ATCTCAATAA ATTATACTAA AAATGAATTC TCGAATATAT TGTGCTTGTG CATGAGGTAG CCATACAATG GGGAAGGCAA  GATGCTTAAG CTTTAGGCAA CAAATACACG ATGAGAACGC TGAAGAACAT TGTGATAAAT ACAAGAGATA TAACTCCCTT TCGAAGAATC CTACGGTCCA TATGTCCAAA ACCTAGAAAA 
GACAGTCAAT TGGCTCCGCT TGATTGTAAA ACCCCAGCTA GATTTGACAA TAAGTACTTT 

Retrieve as FASTA  
CDS
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
AAGCAAGCAG AAGCTATCGT AAACTCATGG CGTAGATTTG AAGTCATTGA TAGGATTAAG TATCTATTAG AAGAAGCATG CCCCCTCACA GTATCATGTG CTGATATTTT AGCCATTGCT  GCTCGTGATG CTGCTGCAGC GATACATATC CCAAGTCGGG AAGTTCATCG AGGCAGAAAG GACTCCCTGA AGTCAAGTTC TGACCGCGCC GATCAGTTTA TCCCTGCACC AAATTCCTCT  TTGGAGACTC TAATTGCCAA TTTTAAGCAA CAGGGTCTTG ACATAGGAAA CTTGGTTGCT TTCTCAGGTA GCCATACAAT GGGGAAGGCA AGATGCTTAA GCTTTAGGCA ACAAATACAC  GATGAGAACG CTGAAGAACA TTGTGATAAA TACAAGAGAT ATACTCCCTT TCGAAGAATC CTACGGTCCA TATGTCCAAA ACCTAGAAAA GACAGTCAAT TGGCTCCGCT TGATTGTAAA 
ACCCCAGCTA GATTTGACAA TAAGTACTTT 

Retrieve as FASTA