Entry information : MtPrx29 (Medtr5g074970.1[4.0] / Medtr5g074970.1[3.5] / Medtr5g082850.1[3.0])
Entry ID 354
Creation 2006-01-30 (Christophe Dunand)
Last sequence changes 2010-09-16 (Haythem Mhadhbi)
Sequence status complete
Reviewer Messaoudi
Last annotation changes 2014-07-29 (Messaoudi)
Peroxidase information: MtPrx29 (Medtr5g074970.1[4.0] / Medtr5g074970.1[3.5] / Medtr5g082850.1[3.0])
Name (synonym) MtPrx29 (Medtr5g074970.1[4.0] / Medtr5g074970.1[3.5] / Medtr5g082850.1[3.0])
Class Class III peroxidase    [Orthogroup: Prx160]
Taxonomy Eukaryota Viridiplantae Streptophyta Fabaceae Medicago
Organism Medicago truncatula (barrel medic)    [TaxId: 3880 ]
Cellular localisation N/D
Tissue types Flowers
Germinating seeds
Leaves
Mycorrhizal roots
Seedling roots
Seedlings
Shoots
Inducers Colletotrichum inoculation
Drought
Elicitor treatment (glucan, oligosaccharides, yeast extract, Phytophthora crude extract)
Insect damage (Spodoptera exigua, Meloidogyne, Aphib)
Methyl jasmonate treatment
Nitrogen starvation
Pathogen interaction
Phosphate starvation
UV irradiation
Repressor N/D
Best BLASTp hits
Perox score E-value MtPrx29
start..stop
S start..stop
PvPrx03 476 5e-171 1..326 1..324
GmPrx121 472 2e-169 23..326 23..324
GmPrx50 471 7e-169 23..326 23..324
QsPrx02 466 4e-167 1..326 1..329
Gene structure Fichier Exons
ExonStart..EndSize ExonStart..EndSize ExonStart..EndSize ExonStart..EndSize
N° 1 31854213..31854437 225 N° 2 31855931..31856122 192 N° 3 31856694..31856862 169 N° 4 31857523..31857917 395
join(31854213..31854437,31855931..31856122,31856694..31856862,31857523..31857917 )


exon

Literature and cross-references MtPrx29 (Medtr5g074970.1[4.0] / Medtr5g074970.1[3.5] / Medtr5g082850.1[3.0])
Literature Liu,J. et al., unpublished
DNA ref. Phytozome 11:   chr5 (31854213..31857917)
Cluster/Prediction ref. Phytozome Gene 11:   31085970 UniGene:   Mtr.5534
Omic ref. Gene atlas:   Mtr.31.1.S1_at   Mtr.32367.1.S1_s_at Legoo:   Mtr.32367.1.S1_s_at
Protein sequence: MtPrx29 (Medtr5g074970.1[4.0] / Medtr5g074970.1[3.5] / Medtr5g082850.1[3.0])
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   326 (298)
PWM (Da):   %s   35658.14 (32526.6) Transmb domain:   %s   i9-28o
PI (pH):   %s   9.81 (9.92) Peptide Signal:   %s   cut: 29 range:29-326
Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
.........1.........2.........3.........4.........5.........6.........7.........8.........9.........0.........1.........2
MALSSSKVSLNLFCFVLFMFFLIDGSFSQLSENFYAKKCPNVFKAVNSVVHSAVAREPRMGGSLLRLHFHDCFVNGCDGSVLLDDTPSNKGEKTALPNKDSLRGFEVIDAIKSKVESVCPGVVSCADIVAIAARDSVVNLGGPFWKVKLGRRDSKTASLNDANSGVIPPPFSTLNNLINRFKAQGLSTKDMVALSGAHTIGKARCTVYRDRIYNDTNIDSLFAKSRQRNCPRKSGTIKDNNVAVLDFKTPNHFDNLYYKNLINKKGLLHSDQELFNGGSTDSLVKSYSNNQNAFESDFAIAMIKMGNNKPLTGSNGEIRKQCRRAN

Retrieve as FASTA  
Remarks Complete sequence from genomic (chromo 5, 3 introns) and 63 ESTs.
DNA
Send to BLAST
.........1.........2.........3.........4.........5.........6.........7.........8.........9.........0.........1.........2
ATGGCACTTTCTTCTTCTAAAGTTTCACTAAACTTATTTTGCTTTGTTTTGTTCATGTTTTTTCTTATAGATGGTTCTTTTTCTCAACTATCTGAAAATTTCTATGCTAAGAAGTGTCCC
AATGTTTTTAAGGCTGTAAACTCAGTTGTTCACTCTGCTGTTGCTAGAGAACCTCGTATGGGAGGATCTCTTCTTCGTCTCCATTTTCATGACTGCTTTGTCAAT
GTAAATTTATCTTCA
AACTAAGTTCTTATATATGCTTTTCTTTAGTTATATATTGTTATAAACCATCATTGAGAGAAATTGGTATACCATTTAATGATGATGAAATTAGAGAGATATTTCATTTTTTTGTCACAA
TTTTTTTTTCCTATTATTATACACCATTTCTATATTATCCACCACTAAGAAAACTAGTGAGAAAAATTTTAGAGAAGGAAAACATGAACTTTTTCTTTAAATCCTTCACTAAATAGTGTG
ATGATAGTATTAGAAAGTGATTTCATTTCTTCCTCAATAAATTTTGATGCCAATTTATTTGTTCTAATAGTGATATATAATAAATATTTTTTTTTTGACAAATAATCAATATTATTATTT
AGTAACCAATTGTTCATATGAGGATTTCAAATGTGAAAAGAAAAATATTAATATAGATAATAGATTGAATATATTATTTTTTGGTAGTTTGATAATGAATTGAATATGATTAGTGAGTTG
TATTGAGTGAATTGAATAGGGTCATATACACTTTTCATGTCGTTACGCTACTAGACTATTTATACTTTATTTTTATTCTGTACCTATCTCTTTCAAGGAGTCTTATTGAGTGACGTACCA
ATTACAATAATGGAACATTTCATGCATAATTAAAAAAGAATTAAAATGAACTGTCTATTGTTTGCATGATTATGCACCACTCATCTTTGAAAGCGATTTACCATGTCCCCAACATAGGTT
GGTGAATATATTTTAAATAAATTAGCCAAAAAATTACTAAATTTATGTCGGTTGAATGTGTATTTTACACAATTTCCTATTTGAATATGTACTAAATTATGCATGAATATGCACTTTTAA
ATTCTTGAGATAGGGTGTTTTTTTTTTTGGCAAGTACCCTTGTAATTTTTCAATCTTGTGAGTTAAATACTCTTTGTACTTATCTTTTTATCATTATCTAATAAATTTGGCTGTTCAAAA
AAAAATTCTTTTAAAAACATGAAAGTTTTTTTAGTAGTAATGGAAAACAACAGTACTTTTTTTTGAGGGGAAAACAACAGTACAAATTAGTCTTTTATTTCTTGTCAAAAAGATTAACTG
TTTATTTGCATCGCGAATAAGCATATTCCGAAGAAAAAAGTGAAAGATAAATTCCAAAAATGCCTTTTTGAAGCTTGATGTTTAAACTTGTTTAAACTGTAAATGTGCTAACAAATAATT
TATGTTCATTTTGACGTTCTTTACTTTAAACATACACCTCATATTAATTAGACATGCGTTACTAACTTTTTTACAAATTTAAACGGTGTGCGTGTGACTTTACAAATTTACCACATTTGA
CATGTCAGATAATTTAAATGTGGTTGACTACGTGCAATCACATGAATTTGAATTGTAAACAACTCAAATATTTATTTACCAATCGCCCTAAAACTTCATAAAGATAGGTTTTTGGTGAAC
TTACTTATCATAAATCGCTTTTTACTTATTGAAAACAGGGTTGTGATGGATCAGTGCTACTTGATGACACACCCTCTAATAAAGGAGAGAAGACAGCACTTCCCAACAAAGATTCTTTGA
GAGGTTTTGAAGTAATTGATGCCATAAAGTCTAAGGTGGAGTCAGTATGCCCTGGTGTGGTCTCATGTGCTGATATTGTAGCCATTGCTGCTCGTGATTCTGTTGTAAAT
GTGAGTACAA
AATCAATATGTTAAACACTGAAATTTTAGTAATTTTTCAATTATAAATTCACTACTAGAAGAACTTTAATAATCAACAAAAATTAGAGACACCAGAAAACAGCAAAAACTATAAAATATT
TAAATTCAGAGCAGCCTCGATGTGGGGAGAGACTGTAGACTAGGATGTTGTCGAATTTGATAGTTGCATAAATTATATTATCCAACAAGTTATATGCATATTAGTTTATTTTTATTGAAG
AGATTTTTAATGGAATAGTCATAGATACAAAAGTTATATCATATATATTTACAATAATAAAATATAGATCAAGTGTGACGTTTAAACAACCACGATACATATAACGATACATATAACTGT
TTAATAAATCTAACACTTATATATCATTCGACAAAAGACTTGTTCTCCAACTAAAAAAAAGGTATAATATAATTTATAAAAATTTAAAAACCCTAATTTCTTTTCTTCCAATAAATGCTT
CTATTTTCAAATCTTTTGACAAGTGTCTTATGCATAAGATATTAGTTTTTAAATTTATTTTTATTCTATCATATTTTGCAGCTTGGGGGGCCTTTTTGGAAAGTTAAACTTGGAAGAAGG
GATTCAAAAACAGCCAGCCTCAATGATGCAAACAGTGGTGTAATTCCACCTCCCTTTTCTACCCTTAACAACCTTATCAATAGGTTTAAAGCTCAAGGACTCTCTACTAAGGACATGGTG
GCCTTATCTG
GTACATGTCTTTTTCCTATTGTTTCTAATTTAAACATTTTTTCTTCTAACTTCCATTATCATCACACAATTATTAGTTTTTATTTTGCCTCATTTGCTTGATATCACACA
TTTGTTTGACTAGGATGTGATGTTTAAACAACCACGTAGACTTTCATGTCATGCCTAATTTTCATTATGTTCTAAGTGACTTCTAATAAAAAAAAAAAAAAAAAGAACAATGAAACAAAA
AAACATGTTTATCCAACCAAGAAAATACATTAAATTATTGGTTATGTTTGAATAAAATGAAAATAGTAACACCGTTTAAATTTCATTTTCAAGACTTAGTAATCTGACTCTAGATTCTTG
GTATATACAAATTCAACTTACATAGCACTATTGATTAATAAATCCAAATATTATTTGAACATTTAGAAATTATTGAAGTGCCAAATTCAACTTACATAGCACTATTTATTTTTTTGTCTC
AACCTTCGATATTAACAGAAAATGAATTCTGATGGTTTTGATAATCTAAAGATCGATTTGAATATAAATAAAATCTTATTAAGGATTATCTCAGATATAATTTAAATTTGGATTCTCTTG
AACGATTCGTTACGAACTAAAACGCATTAATCACTTGAGTTTAACTATTTGTTTTCTTTATGCTTCTTAGGAGCTCACACAATTGGAAAGGCAAGGTGTACCGTTTATAGAGATCGTATT
TACAATGATACAAATATTGATAGTTTATTTGCCAAGTCAAGGCAGAGGAATTGTCCAAGGAAAAGTGGTACAATAAAAGACAACAATGTAGCTGTCCTAGACTTCAAAACACCAAACCAT
TTTGATAACTTATACTACAAGAATCTCATCAACAAAAAGGGACTCCTTCATTCTGATCAAGAGCTTTTCAATGGAGGGTCCACCGATTCATTGGTTAAATCTTATAGCAATAATCAAAAT
GCATTTGAATCTGATTTTGCTATTGCAATGATTAAGATGGGAAATAACAAGCCTCTTACCGGATCAAATGGGGAGATTAGGAAGCAATGCAGGAGAGCCAATTAA

Retrieve as FASTA  
CDS
Send to BLAST
.........1.........2.........3.........4.........5.........6.........7.........8.........9.........0.........1.........2
ATGGCACTTTCTTCTTCTAAAGTTTCACTAAACTTATTTTGCTTTGTTTTGTTCATGTTTTTTCTTATAGATGGTTCTTTTTCTCAACTATCTGAAAATTTCTATGCTAAGAAGTGTCCC
AATGTTTTTAAGGCTGTAAACTCAGTTGTTCACTCTGCTGTTGCTAGAGAACCTCGTATGGGAGGATCTCTTCTTCGTCTCCATTTTCATGACTGCTTTGTCAAT
GGTTGTGATGGATCA
GTGCTACTTGATGACACACCCTCTAATAAAGGAGAGAAGACAGCACTTCCCAACAAAGATTCTTTGAGAGGTTTTGAAGTAATTGATGCCATAAAGTCTAAGGTGGAGTCAGTATGCCCT
GGTGTGGTCTCATGTGCTGATATTGTAGCCATTGCTGCTCGTGATTCTGTTGTAAAT
CTTGGGGGGCCTTTTTGGAAAGTTAAACTTGGAAGAAGGGATTCAAAAACAGCCAGCCTCAAT
GATGCAAACAGTGGTGTAATTCCACCTCCCTTTTCTACCCTTAACAACCTTATCAATAGGTTTAAAGCTCAAGGACTCTCTACTAAGGACATGGTGGCCTTATCTG
GAGCTCACACAATT
GGAAAGGCAAGGTGTACCGTTTATAGAGATCGTATTTACAATGATACAAATATTGATAGTTTATTTGCCAAGTCAAGGCAGAGGAATTGTCCAAGGAAAAGTGGTACAATAAAAGACAAC
AATGTAGCTGTCCTAGACTTCAAAACACCAAACCATTTTGATAACTTATACTACAAGAATCTCATCAACAAAAAGGGACTCCTTCATTCTGATCAAGAGCTTTTCAATGGAGGGTCCACC
GATTCATTGGTTAAATCTTATAGCAATAATCAAAATGCATTTGAATCTGATTTTGCTATTGCAATGATTAAGATGGGAAATAACAAGCCTCTTACCGGATCAAATGGGGAGATTAGGAAG
CAATGCAGGAGAGCCAATTAA

Retrieve as FASTA  
cDNA
Send to BLAST
.........1.........2.........3.........4.........5.........6.........7.........8.........9.........0.........1.........2
GCACCAGTAA TTATTTGTCT AAGTCTTTAG GATTAGGTGA GGGTAAGAGT TGCCATAATA TCTCTATATA TAATGTTCCA CACTTCTTAG ACTATATCCA TCCATCTTCT AAAGCCTTAT  ACTACTACTT AGCAAAATGG CACTTTCTTC TTCTAAAGTT TCACTAAACT TATTTTGCTT TGTTTTGTTC ATGTTTTTTC TTATAGATGG TTCTTTTTCT CAACTATCTG AAAATTTCTA  TGCTAAGAAG TGTCCCAATG TTTTTAAGGC TGTAAACTCA GTTGTTCACT CTGCTGTTGC TAGAGAACCT CGTATGGGAG GATCTCTTCT TCGTCTCCAT TTTCATGACT GCTTTGTCAA  TGGTTGTGAT GGATCAGTGC TACTTGATGA CACACCCTCT AATAAAGGAG AGAAGACAGC ACTTCCCAAC AAAGATTCTT TGAGAGGTTT TGAAGTAATT GATGCCATAA AGTCTAAGGT  GGAGTCAGTA TGCCCTGGTG TGGTCTCATG TGCTGATATT GTAGCCATTG CTGCTCGTGA TTCTGTTGTA AATCTTGGGG GGCCTTTTTG GAAAGTTAAA CTTGGAAGAA GGGATTCAAA  AACAGCCAGC CTCAATGATG CAAACAGTGG TGTAATTCCA CCTCCCTTTT CTACCCTTAA CAACCTTATC AATAGGTTTA AAGCTCAAGG ACTCTCTACT AAGGACATGG TGGCCTTATC  TGGAGCTCAC ACAATTGGAA AGGCAAGGTG TACCGTTTAT AGAGATCGTA TTTACAATGA TACAAATATT GATAGTTTAT TTGCCAAGTC AAGGCAGAGG AATTGTCCAA GGAAAAGTGG  TACAATAAAA GACAACAATG TAGCTGTCCT AGACTTCAAA ACACCAAACC ATTTTGATAA CTTATACTAC AAGAATCTCA TCAACAAAAA GGGACTCCTT CATTCTGATC AAGAGCTTTT  CAATGGAGGG TCCACCGATT CATTGGTTAA ATCTTATAGC AATAATCAAA ATGCATTTGA ATCTGATTTT GCTATTGCAA TGATTAAGAT GGGAAATAAC AAGCCTCTTA CCGGATCAAA  TGGGGAGATT AGGAAGCAAT GCAGGAGAGC CAATTAACGA AAATCTGGAT AGCACATATA CTTCAGATTG AAGGCATGTT TAATCTTTAG TGTTCAAATC TATGTGTCGG TATTAGTGTT  TCATAAAAGG AAACTTTTAA AACAAATCAA GTGTGTGTTT TTTTTCTTCT TCAAGTACAT ATACCCCAAA AGTGGTGGTA TTCTTTAGTT AATTTATATG TTCTATTGAT TTCTAGTGCC  TTATAAAATT ATATTGTTGC TTTTTAAATT TTACCCAAGT TAATGTAATT TAAATTGCAA AGCAGTGTTG TGACAAAAGT GTCACTTTAA GGACGTGTTT ATGTAGTAAT CACATGAATA 
AATATGAATG TATATTTCAA TATTGAAAAA AATGAATGAA TGAGTTTAAT TAATAT 

Retrieve as FASTA