Entry information : HsGPx06
Entry ID 3605
Creation 2006-08-23 (Marcia Pinheiro Margis)
Last sequence changes 2016-06-28 (Harold Duruflé)
Sequence status complete
Reviewer Not yet reviewed
Last annotation changes 2016-06-28 (Harold Duruflé)
Peroxidase information: HsGPx06
Name HsGPx06
Class Animal glutathione peroxidase    [Orthogroup: Gpx1006]
Taxonomy Eukaryota Metazoa Chordata Mammalia Hominidae Homo
Organism Homo sapiens (human)    [TaxId: 9606 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type Testis
Inducer N/D
Repressor N/D
Best BLASTp hits
Perox score E-value HsGPx06
start..stop
S start..stop
PtroGPx06 438 2e-159 1..221 1..221
MmulGPx06 427 3e-155 1..221 1..221
BtGPx06 377 2e-135 1..220 1..220
RnoGPx06 343 7e-122 1..221 1..221
Gene structure Fichier Exons
ExonStart..EndSize ExonStart..EndSize ExonStart..EndSize ExonStart..EndSize
N° 1 1..87 87 N° 2 4840..4993 154 N° 3 9315..9432 118 N° 4 9942..10041 100
N° 5 11246..11452 207  
join(1..87,4840..4993,9315..9432,9942..10041,11246..11452)


exon

Literature and cross-references HsGPx06
Literature Kryukov G.V., Castellano S., Novoselov S.V., Lobanov A.V., Zehtab O., Guigo R., Gladyshev V.N.Characterization of mammalian selenoproteomes. Science 300:1439-1443(2003).
Protein ref. UniProtKB:   P59796
DNA ref. GenBank:   NC_000006.11 (28483520..28472072)
mRNA ref. GenBank:   AY324826
Cluster/Prediction ref. Genebank:   257202 UniGene:   Hs.448570
Protein sequence: HsGPx06
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   221 (202)
PWM (Da):   %s   24667.48 (22490.4)  
PI (pH):   %s   6.5 (6.51) Peptide Signal:   %s   cut: 20 range:20-221
Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
.........1.........2.........3.........4.........5.........6.........7.........8.........9.........0.........1.........2
MFQQFQASCLVLFFLVGFAQQTLKPQNRKVDCNKGVTGTIYEYGALTLNGEEYIQFKQFAGKHVLFVNVAAY*GLAAQYPELNALQEELKNFGVIVLAFPCNQFGKQEPGTNSEILLGLKYVCPGSGFVPSFQLFEKGDVNGEKEQKVFTFLNSCPPTSDLLGSSSQLFWEPMKVHDIRWNFEKFLVGPDGVPVMHWFHQAPVSTVKSDILEYLKQFNTH*

Retrieve as FASTA  
Remarks Complete sequence from genomic (chromo 6, introns 4), 3 cDNA and 1 EST.
Promoter
Send to BLAST
Send to cis Analysis
.........1.........2.........3.........4.........5.........6.........7.........8.........9.........0.........1.........2
GAAGGGCTAG CGACTGACAG AAATAACTAC CCTGTCTCCC ACCTGCAGGA ATGTCTAACA AAGCATCCAT CTTCCTCCTT CTTTGCTCCA CACTCGTGCC TACCCAGCCT CCTGATGACC  AAACCATCCT GTACTACCCA AGCACCTGCT TAGCATGTGT GTGTAGCTGT GTGTGTGTGT GTGTGTGTGT GTATGGATAT GTAGAATTGT ATTTGTTGGT ATATGCATAG GTGTATGTAT  GGTGTGTGTG TGTGTGTGTG TGTGTGTGTT TGAAGATTAA GGAAAAGAAC ACCTATCTCT CCAACTCTCT GATCCTGAAA TATCTATTCC AAAGGAAAAT CATATTTTAG GGTAGATGAA  TCAGACTATC CTGTGTCCCT AAAAAAGCAA TCCCGAGAAG TTGTGACATC TATCCCTTCC CCTTCCTGAA AGTTTTAAAG AAAGCAGGAG CTGGCCGCAA GACTCTAGGC CTCCTTCATA  GCCTCTCTCC TCTAAGATAG GCATGCATTG TTAAACTCTT TTCTCCTTAA TTCTCCTTTA TTCCCCTGCC ACCCAGTAGT TCTCATGTAG GACCTCTGAA GGCAGAGTGA GAGCAGAAAC  CCCACCTCAC ATGAAGGGAA GGGCATCTCC ATGATGGTGG ATCCCAAAAC CCCTCTGGGT CGCACCCTGC CAGAGCCTTC CTTGGTGCCT GTCCCTTAGT GCATTCAGGT CATGGCACCT  GGGCAGGGGT GTCCCTGTAT TCTGAATGAT GGGCTTTCTC CTCACCCTGA GCCTCCTCAA CTTTAAGCTT ATTTTGATCA CTGTCTCAAA TTTAAAAATT CTGCAGCAAC CTGGCTCTGT  GTGGTGTTTT CCCAGTCCCA TATTATGTCC AGTCATACTT CTTCTTTCTC TGTCACTTTG TCCCTGCTTT CTTGATTCCC TTGTCTTGTT CTTCAGTATT TTGTTTTTCT CAAAAATGCT  CTAGAACTTT CCTTGGCACA TATAAAAGCA CGGCTGGAAC TGGTTGCTCA GAGCTGCTGT GACCGTGAGC ACAGATCTCT TCGTGTCAGG TCCCTCTGCA CCCTCCCGTT CAGGTCTCTT  GACCAGGCCC CTACATGACA GGAATCCTTG CCTCTCAAAG AATCCTCTCT CTCTCTCTAC AACAAATATG CATATGTTTG TTTTTTTTTT TAAGTATTTA TTGATCATTC TTGGGTGTTT  CTCAGAGAGG GGGATTTGGC AGGGTCATAG GACAATAGTG GAGGGAAGGT CAGCAGACAA ACATGTGAAC AAAGGTCTCT GGTTTTCCTA GGCAGAGGGC CCTGCTGCCT TCTGCACTGT  TTTTGTCGCT GGGTAGTTGA GATTAGGGAG TGGTGATGAC TCTTAACCAG TATGCTGCCT TCAAGCATCT GTTTAACAAA GCACATCGTG CACCGCCCTT AATCCATTTA ACCCTTAGTG  GACACAGCAC ATGTTTCAGA GAGCACAGGG TTGGGGGTAA GGTTATAGAT TAACAGCATC CCAAGGCAGA AGAATTTTTC CTAGTACAGA ACAAAATGGA GTCTCCTATG TCTACTTCTG  TCTACACAGA CACAATAACA ATCTGATCTC TCTTTCTTTT CCCCACATTT CCCCCTTTTC TATTCGACAA AACCGCCATT GTCATCATGG CCCGTTCTCA ATGAGCTGTT GGGTACACCT  CCCAGACGGC GTGGCGGCCG AGCAGAGGGG CTCCTCACTT CCCAGACAGG GCTGCCGGGC AGAGGGGCCC CCCCACCTCC CAGACGGGGC GGCGGCCGGG CAGAGGGGCT CCCCACTTCC  CAGACCGGGC AGCTGGGCAG AGGCGCCCCC CACCTCCCGG ACTGGGCGGC TGGCCGGGCA GAGGCTGCCC CCCACCTCCC GGACGGGGCG GCTGCCGGGC GGAGACACTC CTCACTTCCC 
AGACGGGGCG GCTGCCGGGC GGAGGGGCTC CCCACTTCCC AGACCAGGCG GCTGCTGGGC GGAGGGGGTC CTCACTTCTC 

Retrieve as FASTA  
Terminator +
Send to BLAST
Send to cis Analysis
.........1.........2.........3.........4.........5.........6.........7.........8.........9.........0.........1.........2
AGAATGTGGG AACACCAAAA CCTATGAAGT TGGGGTTTTA GGCCATTTGA CCTACTGATG AGGTCCATAA TGAAATGTCT CCTTACCTCT CAAGGGCTCA TTACTACAAG GTGAGCAAAT  GTAAATTGTC CCAGATAGTA AAGATTTCAT CACAGTAATT ATGATCCAAA TGGAACCAGA GCAAGAGCTC TGGAGTAGGA CGCAGAAGTT GCCTTCATTT CACTGTTACC CACCTTGTGA  CTTTTTATAT GTTATCTCTC TCTCTGAGCT TCAGTTTTCT CATACATGAA ACTATGTGAA TACAGTTCTA GTTGTTTACC ATTGTCAGGC CATGTGGTAA GTGCTTTATA GTTATTATCA  CATTTAATTG TTACAGCAGC CCTACAAGGT AGATAATATT ATTATTCTGA TTTCACAGAT GAGAAAACTG GGGACAGACA CATTAACTTT GATTTCAGAT TCAAGGAGCT AGTCAGTGGC  ACTGACAGGT ATTGAATTCA ATGGTCTTTA TAGCCTCGTA GTCAAAGTTT CAGCCATTTT TTTGAGCTAA AAGCAGGAGA AGGGTAAAGA ACTTGGGAAT GTGTGTAGGT CTGTTCCATA  AGAGGCAAGC ATCTGACCTG CTGCCTTAAG GAGCTGCATA GCTGGATCAG GTATCAGTGA TCAGGACATA GATTATAGGC TTTTGAAAAG AGTTCAGAAA TCTGAGATAA CTAAAAGCTT  GTCTTTCAAG AGAGTTCATA AGAACTCAAC CCCACCCAGA CTTTAGTTTC AAGAGGCAGA GAATGCCTTT TGTGTGAAGC TGGCAGAGGC AACGCAGGTG GAGCAGGCTC GATGGTGAGG  GGTTTACAAC TGAAGAGGAA GGGGGTGTGT GTAGGGAGTG GAGGTGGGTG TGTATGAATG CCACTCTGCG ATTGGAGGGT GCTTCTTCAA ATTGGTCCCT GCCAGGGGCT CAAAAGGGGC 
TGAAATCCTG GGGACCTCAG AGTCGTCTAA AACTCCTAGC C 

Retrieve as FASTA  
DNA
Send to BLAST
.........1.........2.........3.........4.........5.........6.........7.........8.........9.........0.........1.........2
ATGTTCCAGCAGTTCCAGGCCTCCTGTCTTGTCCTGTTTTTCCTGGTTGGCTTTGCTCAGCAGACCCTAAAGCCTCAAAATAGGAAGGTGAGCATGGGGCAGGGGATCCGAGCTGATTCC
AGCACGTGATGACCAACCTGGCTGCCAGAGTTGCAAGGAGTTCTCTACTCTCCCCTTTCGAAGGACAAGATCTGCATTCCCAGCCCTTCTTCACAAATCCTGACATTGCTATCCTTAGCA
GGCTCTCCCTAAATCCACTGTCTCTTACTTGCATCTTTTCCTCTGCACCTAGTAGCTCTTTGAACTGAATGTATGTGGAGTGGGGTTGGGGGGCTGCCTCAGCACATTCCCCTTTGCCAC
TTCCCCCTGGTGGCCCCTTGATAGCCTAGAGCCTGTCCCCTTCATGCTGGTCCATAACTTGGAGTAGCGCTGTGGATCCCAACAAATGAGGCATGAAGTCGCAAATGGATTGACAGGGAG
GCTGCCCTGGTTACTCCTGGAGAGGCTGCTCAGCCAGAAACCCAGAGGGAGAGGTGAGAGAATCTGGGCTTGCGATCTGCACTAGGAGTTTCTAGGTCACAGAAAGAGGAGCTCCCCACC
ACCACACCCCTAGAAAAATAAAATGCATAAGGCCAATATGGTTGTCCACTAATATTAATTTTAGGGAAGGTCATGAGGTGAGGTAGAGACAAAGCTCAGCTCAGAGTAGGCTTTGTTCTC
AGATCTTGGTGTTGCTCCCAAATCTCCTGATGCCATTTAGAAAAGTCCCCCCACTGGATGTCCATAGTCACCCCTGTGAAAGATGTGTATATATGTCTTAGGATGCGGACTGAGCAGATC
ACCTGAGGCACCCGCAAATTTTAACTTTAAAATCAGATGAATTTATTCAAAAGCAGCCTCAGTGGTGGCCATATGCCAATTATATATCTTTTGTTAGTTCCTTTCTGTCCTCTATAAAAG
GTGGCGTACAATGCCTATCATATAATGCAGTGATTCCCAGACTTGAGCTTACCTAAGAGATAGCTGGTTAAAGCACAATTGCTGGGCCCCACCCAAGACTTTCTGATTCAGTAAGTTTTA
GGGGGAGCCCAGGAATTTGCATTTCTAAAATGCTTCCGGTTGATACTCATGCAGGTCTCCACACCTGAAGCTTTGAGCTTTAATCTCTGTTACTGGATTCATATGAAGTGTAAGATGGTG
CCTATTACAAGCCATAAGACAGCTTACTTACTTACTTTCCAGAAAGGTAACAGATCACTTGAACGGACAACCTCCAAGGGTCATCAGATCTATGTCAGCCACTGCTGCCTGGTTGGGTGT
GGAATTCTCGATGTAAAATAGCATCTTGTGAATTAAAAGCTGTGTTCTAGGGTATTCTGTCTTCTTCAAACAGATGTAAGCAAACTAGAGCAGAACTGAAAACTGGGTAGGAAGGATTGA
GCTCTTCGAGTCTGCAGTTTTCGTGGGATTCTGCATCTCATTTCACAGAGTGACATCCTCATGAGAACCAAATCTTTGGAAGTTGTTGCACCCAGAGCTAAGGTAGCACAAAGGCAAGAA
AATGGAGGCATACAAATGACAGCTCACATGGTGATTTCCGTGTGACTTTTTATTATAGTAGCAAGAAAGACAAATGCTGGAAATTATTTAGCTCAGACGTAAGGTGTCATGAAGGCAAAA
CGAATGCAGGCATATAGATGATAACTCCATCATAGTGGGTTTCTTAGGCTAATGTTCCCAAATATTGTGACTAATGTATATGCACAGATGTGTACAGAAATATGGACTTGAAAGGGCTTG
CCCCTTGGTCAAGCCTCCTTCTCTCCAAGGATAATGAAGGAGAAGCTGTGGCCTTGTGTCGTGGTAACAGACTCAGAAGATGATAAAGAGTTTCTTGCCCCACTCTGCCCACAGTAGCTC
ACCCACAGGCAATTCCTTCCCTGCATGGGGTATGCTTTTATGGACTGAGATCCTGTGAAGCCCAGTTTAAATTACTCTAAAATTCTATGATTTTTCTTCATATGGCCAGGACTTATAGCC
TCTCTTACCACATAACATGTTAGCCTTTTGTTCCAGGTTCTGTATGCCTTTTATTCTTGGCATGCTTGTGGGTAGAAAAGTTTTTCCGCTCTGTGCTATTTTATGAACTTTAATTCATGA
GCAGTTCAGGCTGTTTCACCACAATATAAAGAAGTGGGTGCCAAGGATGAGTTTTCAAGGTACCAGCGAAACCGGAAAAGTTCCCTTGTCCCTCTCACAAGGCATGCGACGGGGCGTGTG
GCTCGCTGCTTCAGTTCCCCGCCGCTCAAACCTGTACGGGAGCAGAGGGGGAGCATACAAACTAGCAGATTGTGGAGCTCCAACCTTAAGGCAGTGTCTAGGAGTGAATGTTTACAACTG
AAGCCCCAGTGGGCGTGTGTTACAGGGTGCTCTTAGTTCAGCCACCCATAGGCAGCTTGTGTTAGCTCCATTAGACCCCTGCCTTATCACAAAGACAGAGGACTTTCTGTATCCCAGGGA
TCTTGCCTTGGTTTACGAGAAGAATCGGATCACACGTGGGCATGGAGAATAAGTGCAAGGTTTTATTAAGTGGAAGTAGCTCTCATCAGATGGGGGAGCCAAAAGAGAGATGGTTTTTCC
CTGGAGCCCGGCCAAACTCCATGTCCTTCCGCTGTCAATGGCCTTCCAGTGTGCTCCTACTGTGTTCAAAATTGGTGGGTTTTTGGCCTCACTGACTTCAAGAATGAAACCCAGTTCTTT
AAGGCAGCGTGTCCAGAATTTGTTCCTTCTGATGTTCGGATGTGTTCAGAGTTTGTTCCTTCTGGCGGGTTTGTGGTCTTGCTGGCTCAAGAGTGAAGCTGCAGAGGCTCAAGAGTGAAG
CTGCAAAGCCTCGCGGTCAGTGTTACAGCTCTTAAGGCAGCGCGTCTGGAGTTGTTCATTCCTCCCGGTGGGTTCGTGGTCTCGCTGGCTTCAGGAGTGAAGCTGTAGACCTTCACGGTG
AGTGTTACAGCTTGTAAAGGCAGTGTGGACCCCAAGAATGAGCAGCAGCAAGACTTATTGCAAAGAGCGAAAGAACAAAGCTCCCACAGTGTGGAAGGGGACCCACGGGGGCTGCCACTG
CTGGCTCCGGCAGCCGCCTTTTATTCTTATCTGGCCACACCCACATCCTGCTGATTGGTCCATTTTACAGAGAGCCGAGTGGTCTGTTTTGACAGGGTGCGGATTGGTGCCTTTACAATC
CCTGAGCTAGACACAAAAGTGCTCCACTTCCCCACTAGATTAGCTAGATACAGAGTGTCCACACAAAGGTTCTCCATGTCCCCACCAGAGCAGCTAGATACAGAGTGTCAACTGGTGCAT
TCACAAACCCTGAGCTAGACACAGGGTGCTGATTGGTGTGTTTACAAACCTTGAGCTAGATACAGAGTGCCGATTGGTGTATTTACAATCCCTTAGCTAGACATAAAGGTTCTCCCAGTC
CCCACCAGACTCAGGAGCCCAGCTGGCTTCAGCCAGTGGATGCCGCACCACGGCCGCAGGCCGAGCTGCCTGCCAGTCCCGCGCCCTGCGCCCGCACTCCTCAGCCCTTGGGTGGCCGAT
GGGACTGGGCGGCGTGGAGCAGGGGGCGGTGCTCGTCGGGGAGGCTCGGGCCGCGCAGGAGCCCACGGAGCGGGAGGAGGCTCAGGCATGGCGGGCTGCAGGTCCCAAGCCCTGCCCCGC
GGGGTGGCAGCTAAGGCCCAGCGAGAAGTCGAGCACAGCAGCTGCTGGCCTTGGTGCTAAGCTCCTCAGTGCCCGGGGCCGGCTGGCCGCTCCGAGTGCGGGGCCCGCTGAGCCCACTCC
CACGTGGAATTCGCGCTGGCCCGCAAGTGCCACGCGCAGCCCTGGTTCCCTCCAGCGCCTCTCCCTCCACAACTCCTCGGAAGCTGAGGGGGCCGGCTCCGGCCTTGGCCAGCCCAGAAG
GGGGCTCCCACAGTGCAGCCGCGGGCTGAAGGGCCTCTTAAGCGCGACCAGAGTGGGCGCCAAGGCCGAGGAGGCGCGGAGAGCGAGCAAAGGCTGTGAGGGCTGCTAGCATGTTGTCAC
CTCTCACCACGATGGTGCATTGCTCTCCACGTCCAGCCAGTTGAGTGTGTTCCTCCGCTGATGTGCTTCTCTCCACATCCAGCGCCAGTGCCTCTGGCTGCTAGGGTCTCAGAGTTTTTA
TAGGCACAGACCCATTTGAGTGAGAAGGCAGGAGTGCCTGTCCTCATGTAGGTCCGTAGGCACAGGCCCGAGGGTGGAGCCCTAGTTAGGTACCCGCCTTTCTCTACCCAGCACTTCCCG
GCCGCCCCTCCCCCATCACCAGTGATTACCCCATTGGCAAGCCTGGAAAGGCCCTTCAGTGGCATCTGGAGAAGTTATGGGCCTGATTTTGGGGGACAGGAATTACAATATAAGAACATG
TAGATGAGAAGTTTGTGCAAAACTTACTTATGAGAAATCCTGCAAAATCTGTTAAGAGTATCTGAGAGAGGACGGCATGACTTGAACGGAGTGTTAGGATGTCGGGGGAGAATGCAGTGT
CAGGGAACAGAGGTAAATGTTATTAATCTTCTGGAAACGGGAAGAATATTATGAAATGCTTGTCTTGCCACACACACAAAAAAATGGCTTGTAATTTAGAAGACATAAATTCTAGCTATG
GCATCAGCTCTAACTAAAAATTTTACTTGGAAAGATCCCTTCAGTTCTTAGAATTTCAAGATATTACATGAAGGGTCTTCGAGTGTTTTGAAAAAGTCCACAAATGTTGGGAATTATTTT
TTATCTTATATCGTTATGGTTATTTTTGTAAAATTCCAGGTGGATTGCAACAAAGGGGTAACAGGCACCATCTATGAGTATGGAGCCCTCACCCTCAACGGCGAGGAGTACATCCAATTC
AAGCAGTTTGCAGGCAAGCACGTCCTGTTTGTCAATGTGGCCGCCTATTGAGGCTTGGCAGCTCAGTATCCTG
GTAAGAACTCACGTTTCAACTCTTTTGGAAGCAGCATTGCCAGATAG
CCATATTCTAATTCCAGAAGGTTTTACCAATGTGTTATTGGAGGATGCGATGGGAGAACTGATCAGGTGACTCTACCTCCCTAAATGCTGCTCCTGCTCTGCTCCTTAGAATATCAGGAT
AATTATTTCCAGATTTGAGAACTAAGACCTTCCCAAAGACTTAAAGACCACCAGGAGCACACTTGCAGTTGAACAAGTTGAATGTGTTACTCGGTACCCTGAAGGAGAACATGTTCTATA
GAGAACCATGGGGTTTCTTAATAAGAAAGTATTAGAAAGGACTTACTATAGAATCTGAACTTTTGTTACGTGATTTGGAGACGAGTTCAAGGAATTGAAGTTCTGTTCTGGATTGGATGC
CATCAAGAACTGTGAGCAATTATATGATTTGGTGTCTTAATCAATCATATCTACATGGGGAGAGAAACGAAGACTAAAGCTGTAACTGGTAAAGAAGCAGCAGTCACTCATATTGGCAAG
AATAGGGTGGTACCTGGTCATTGTTGCGATTTGGACAATGTTCGTGCTTTGTCTATGTTCAGTTACAATTATGCAGTGGCCTTGTTTTTGCCTTGATTCATCATGATCACATGTTATGTG
ATATTGTTTGTATGAAACTGTTCTATGAAGTTGTTTATGTTTCCTAGCAGAGTGCTAAAGCCTAGCTGTGACTCCCAGGCCAGATACCTGGCTTTCAAGGACTGATTTTATGCTTCTCAT
CGGTTACTTCTGATAAAAACAGGAGAGATGAGTGATCTTTGATATTCTGGAAAATGCCCTTGGGTTCTGTAGGCACCTGCAAATGACCAAGAGGGAAATGAAGTTTTCTGTCTGGGCAGC
CTTTGATTGGTACAAGGGCTGTGTAGTGTGACTGGCAATGTAGAAGAATGCTCCATCTCGCCAACCTTGGCCTAACCTTCTGTGGTAGCTGAGGTGTGTTTCCATTTTCTTTGTGCCCTT
ATTGGAGAAGAGTTTTGCATTACTGTTGGTCCAGAAAAGGTTATTTAAAATTTTAGATCAATTATACTAGAGATAGATACAGCTTTGGACGGGCCAAGAACTTTATTTTATGCTTTTAAA
AAATGGCTCAAGATAAATTTAAAAGATTTATTGCACCAAATGCCACAGAGAAGTGGATCAAAATAATACATGAACAAATTTTGTTTTGTTTTGAGACAGTCTCGCTCTGTCGCCCAGGCT
GGAGTGCAGTGGTGTGATCTCAGCTCACTGCAACCTCTGCCTCCTAGGTTCAAGTGATTCTTGTGCCTCAGCCTCCCGAGTAGCTGTGATTACAGGCATGCACCACTATATCTAGCTAAT
TTTTTTTTTTTTTTTTTTGCATTTTTAGCAGAGGCAGTGTTTTGCCATGTTGGCCAGGCTGGTCTCGAACTCCTGACCTCAAATGATCCACAAGTCTTGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATT
ACAGGCATGAGCCACCGCACCTGGTCTATACAAAAACAAGTTTTAAGAAAAATTTTCCACACATTGACACTATTATCTGTTCAGCTGATCAAAAATATATAAACCCTATCAATTTTTCTT
AATGGATTTTCAGTAATAAAAATCCCAGAATTTTAGCCCTTTTAAGTAACACTTAAAGTCAAGCATATTGTAATCTCATGTCTAAAAGATCTGGCTCACCAAATTTTGACATTTTAAAAT
TAACATTCAGAGGATGCTACATGATTTAAGCCAAAATTCTAATAAAATTCCGGCTCCTCCAAAGTACAAATGGCTCACATTTACCAAGAGTAGCTGAATACTTTTCCAATTTAATGGTAA
AATTATGCATAAAAAGATGCTCTCAAAAGTACAGATTAGGATAAGAATCACACATTTAAAATAATTTGGGGGTCCCTTTGTTATTACTATTATTTTTGAGACAGGGTCTTGCTCTGTCGC
CCAGGCTGGAGTGCAGGGGCACAATCTTGGCTCACTGTAACCTCTGCCTCTGGGATTCAAGCTATTCTCTTGCCTCAGCCTCCCAAATAGCTGGGACTACAGGTGCATATCACCTCGCCC
AGCTAATTTTTTTTTTTTTTAATAGAGACTGGGTTTCACTATGTTGGTCAGGCTGCTCTCGAACTCCTGGCCTCAAGTGATCCAACTGCTTCAATCTCCCAAAGTGCTGGGATTATAGGC
ATGAGCCACCACACCCGGCCTCAATTTTTTTATTTTTATGTACACTCAAGTCTAGGGAAAACCTGAAAAGCTACAGACTAAATTTTTATTATAAGAGCCCAAACAACAATTTAGTATCAT
TTAGTAAGTGAGAAAGTTAAAAGAACTTGCCAAAGGAATAGAATCAAGTTCTGCCAATTGTGTCTACTATAGGACCTCAGGACCTAGGTATTAGAGCCCAAACGACAGTTTTGTATCATT
TAGCAGGCAAGAATTCTCCTCCCTTCAAAAAGTTAAATTTGAAAAATATGGTAAATTTTAAAAGTTGTGATGTGTAAACGCAGTTCCATGGAATGTGAAGCTGCTCTTAAATTTGTTTTA
ATTTAATTTAATTTTAACTTAAATTTGCTACATATTGAATAGGCAATATACTTCCAACATTCAAAATTCAAGAGATATAAAAAGGTTTAACAGTGGCACTTGCCATGTTCCCTTCTCTTT
AGGCAACCATTATTATCAGTTTATGGTGTATATTTCCAGAAATCTGTTATGCATATACAAGCAAACATTTCTCTCTCACTTTCTTTCTCTCAAGCACATACACATACACAAACATACACA
CAGAAATGATTATGCACATTGCTTTTTCACATATATCACATACAGTGGGGACAGGAGTGGTGGCTCACACCTATAATCCCAGCACTTTGGGAGACCAAGGTAATCCCAGCACTTTGGGAG
ACCAAGGTGGCCGGATCACTCTTGAACATCAGGAGTTTCAGACCAGCCTTGCCAACATGGTGAAACCCTGTCTGTACTAAAATTACAAAAAATTAGCTGGGCATGGTGGCACATGCCTGT
AATCCCAACTACTCAGGAGGCTAAAGCATGAGAATCTCTTGAACCTGGGAGGCGGAGATTGCAGTGAGCTGAAATCCTGCCACTGCACTCCAGCCTGGGTGACAGAGAGACTCTGTCTAA
AAACAAAACAAAAAAACATGGTGAGCTTCCTCATTCATTTTAAGGCATAGTATTCCATTGTGTTGCTGTGATATAATTTATTAAATTAGTTCATGAGAATTTTAAAGAGCACCTCATTCA
AATTTTACTCCAGATGAGAAAATTGAGAGAATTAAAGAAACTTGCCAAAGGAATAGAATCAAGGTCTGTTAAGTGTGTCTGCTATAGAAAGGAAATATTCTTGATGGCCAAAGATAAGAG
AGAGATGAGTTTCGATAGCAACCGAAGAACTATAGAAAAACAGGAAGGCACTCTCTATTTAAGAGGAGGTTCTTAGGGGACATTCCAGCAGGCAGAGCTGAATCTGAATGACAATGGCCA
GTACAAGTTCTGAGGTCTGAATAAATCTTACCTGAAAATAGCTGAAGATGGAAATTATGATTCAAGTCTAAACAGACAAGCTGGAAGGTTCCTGACAGTAGTAAAGAGCAATTTGGAGTT
TATGGCCTGGCGTCCCAGGGAGTGTTCCAGGGCATGTTGCAGCATCAGTTAGGTCACTGGAATTGAGGAGAGGGTACAGAATACTGTAGAGGATAGCCTTGGAATTTCTCTTTCTCTACC
ACTCCCAGGGTGGAGCACCAAGGAGTACTCCTGGGAATGGGACTGGAACTGGAGTGTCTGGTTGTGTCACCATGGGACATTGTATGAGTGGGGCCGGGGGGATGCAGGGATAGGTGGGTA
GGATTTCCATTTTGTTTGCTTTTTCCTTACAATTTTTTTTGATCAATTCATCAACTAAGGAAGACAGTGGCATTCAAATCTGACTTCTCTTTAGAGTCAAACAGGACTCCCACACAAGGC
TACCAACGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTTTAAAAAAAAAAATAAGAGTTCTCATTGGATGGTAAAGTGTAGCCAGGCATGGGAGCTACTGTATAAGAAAAACAGCAGCCAT
TCAGATGCATTTCTGGAAACGTGTGCTCTAGTCTTTTTTTTTTTTCTCTACTCCTTTGATCTCTGTAACCTTGAATCTTTCCCTTCTTAGTCCTCGGTTTATTCATGTGATAAATGGATA
CATTCAGTGATCTTTCACTGCTTGAGGTAGGCCTCCTGACCAGCCCACCCCTGCTATTCATTGTCCACTTACAGAACTGAATGCACTACAGGAGGAGCTGAAGAATTTTGGTGTCATTGT
GTTGGCCTTTCCCTGCAACCAGTTTGGAAAACAAGAACCAGGAACAAACTCAGAAATACTTCTTGGTCTCAA
GTGAGTGCTTGCATGGGACCCTGCAGATGCCCTGTCGGGATTTCCATT
CCTCATTCCACCTAGATGCCTGCCTATTCTGGAAACTTCTGGGATAGGCCATAGATACATGGGTTGAAGCATATCCTTATGATGTTTTGAATTCAATCTATTCTATTCACAGTGCTCAAA
TATTCTCTTTACTTTTGAATTATTTGATGGTGAGGCTAAGGGAAGATTGAATGGAAAAGAAGCATAGAGAAAAGAAGGGAGTATAAGAAATAAGAAATGGAAGTGAAGCAGGAAACCTAA
GCTCAAAATATTGCCTTCCAATTTTCTTAGAATTCTCTATTGGCGCCATAAAGCCTATTGCATAAAATCCTGCTTCCCACAGACTATCTTTTCTTATCTTCCCTGTGCACAGCCTCTTCC
CTTTATCTTGAATTTCCTGTGGTAGTGAATTGGTGGTGGCCATTATTTTCCATCCATGTCTTAATTTGTATCTTGCTGGGAACAACTTTGGTTCACTGCAGGTATGTGTGTCCAGGTAGT
GGCTTTGTCCCCAGTTTCCAGCTCTTTGAGAAAGGGGATGTGAATGGAGAAAAAGAACAGAAGGTCTTTACTTTCCTGAAG
GTGCATGAGTATAAACCTGGCATGGATGGGTTAGCTAGA
AATGCTCTGAAAGCAGTGGGGCTCATGTCTAGGGTTGTGGTTGGACTCCTTGGAAAAGAGATGCTCAGATAAGTTCAAGGCTCATGGCAATATCTGCTGTGATGCTTTAGCTTTAAGTAG
AGGAAACCCATGATGGACAATAGCTCTGACATGGACTACCCTCCTGTATTGAATGGAATGATTCATTCATTCAGCAATCATTTATCAGATCTCCAGTATGTGCTATATGAGTTAACAAAC
ATTAATAGCGCATAGTCTGTTCCCTGAAGGAACTCACATTTAATCAGGAGACAGACATGGATGATACAGAATACCATGTGGTAAATGCTTTTAGAGTCACAGAGTGGTAAAAATACAGAA
TACCAGGATAGAAGGACCCCCGAGGGTCTCTTTGTCTACTCAGCCCGAAATGCTGGTCTGCAGAACAATGCTGGTCCTGCTGAAATTTTCACTCATCCACAGCAAACAAGGGAAAAAAGA
CAATGCAGAATTTTTCATAAAGCTCAACTTATTGAATATAAGACCAACATTTATTCTGACATTAAATTACTATTACGTTTACCCATATAAATTGCCCTTTACTTACTCAAAAATGGTGCT
ATAATCAATTTTATGTGGTACAACTGAGTATTTAAAAATCCCTTAATTTTTAAATGTGTGCTTACAGTAGACTTTTAATTTTTCTTATTGGCAAAATGAGTATTAGTGATTCTACGTTAA
TATCCAAGGAAATAGTTATTGAAATTTTACTGGCTTATGAAGCCTATGAAGCCCCAAACTCTGCGAGCCACTACTCTAAATCAATCTCTTTTTTTTTCTGCTAAGGAAACGAACTGTAGA
AATGATATGACTTGCCCAAGGAAACAGAAAATAGTCTTTTACTGAATCATCGTGATAAAACCATGGAAATAGAGGAAAGACAGGGAAAGGAGGAATGCTTTCTATTTACCATTATACTCT
CTAACTCTCGGTTATTTGGTAGTTGGTGTATTGGTATTGATACATTGCAGTGTCTGTGGTTGATTGGAAGCATGCAAAGTAGTTAATATATTAAAATACATAATGGTGAGTAGACTCTCT
AGTCTGGAGATAAAACTGTACCACACAGAAGTAGAAATAAAGTAGAAATAAATGTATATCTCTACTTTCTATATCTCTGCTCCAGAACTCCTGCCCTCCGACCTCTGATCTTTTGGGCTC
ATCAAGCCAACTCTTCTGGGAGCCCATGAAGGTCCATGATATCCGCTGGAACTTTGAGAAATTTCTGGTGGGGCCCGATGGAGTCCCTGTCATGCATTGGTTCCACCAGGCTCCAGTCAG
CACAGTCAAGTCAGACATCCTGGAGTACCTAAAGCAGTTCAATACCCACTAG

Retrieve as FASTA  
CDS
Send to BLAST
.........1.........2.........3.........4.........5.........6.........7.........8.........9.........0.........1.........2
ATGTTCCAGCAGTTCCAGGCCTCCTGTCTTGTCCTGTTTTTCCTGGTTGGCTTTGCTCAGCAGACCCTAAAGCCTCAAAATAGGAAGGTGGATTGCAACAAAGGGGTAACAGGCACCATC
TATGAGTATGGAGCCCTCACCCTCAACGGCGAGGAGTACATCCAATTCAAGCAGTTTGCAGGCAAGCACGTCCTGTTTGTCAATGTGGCCGCCTATTGAGGCTTGGCAGCTCAGTATCCT
G
AACTGAATGCACTACAGGAGGAGCTGAAGAATTTTGGTGTCATTGTGTTGGCCTTTCCCTGCAACCAGTTTGGAAAACAAGAACCAGGAACAAACTCAGAAATACTTCTTGGTCTCAAG
TATGTGTGTCCAGGTAGTGGCTTTGTCCCCAGTTTCCAGCTCTTTGAGAAAGGGGATGTGAATGGAGAAAAAGAACAGAAGGTCTTTACTTTCCTGAAG
AACTCCTGCCCTCCGACCTCT
GATCTTTTGGGCTCATCAAGCCAACTCTTCTGGGAGCCCATGAAGGTCCATGATATCCGCTGGAACTTTGAGAAATTTCTGGTGGGGCCCGATGGAGTCCCTGTCATGCATTGGTTCCAC
CAGGCTCCAGTCAGCACAGTCAAGTCAGACATCCTGGAGTACCTAAAGCAGTTCAATACCCACTAG

Retrieve as FASTA