Entry information : HsGPx05-B
Entry ID 3629
Creation 2006-08-23 (Christophe Dunand)
Last sequence changes 2010-10-21 (Christophe Dunand)
Sequence status complete
Reviewer Harold Duruflé
Last annotation changes 2016-06-28 (Harold Duruflé)
Peroxidase information: HsGPx05-B
Name HsGPx05-B
Class Animal glutathione peroxidase    [Orthogroup: N/D] N/D
Taxonomy Eukaryota Metazoa Chordata Mammalia Hominidae Homo
Organism Homo sapiens (human)    [TaxId: 9606 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type N/D
Inducer N/D
Repressor N/D
Best BLASTp hits
Perox score E-value HsGPx05-B
start..stop
S start..stop
PtroGPx05 173 6e-57 1..89 1..89
HsGPx05-A 172 2e-56 1..89 1..89
MmulGPx05 168 6e-55 1..89 1..89
MfaGPx05 168 6e-55 1..89 1..89
Gene structure Fichier Exons
ExonStart..EndSize ExonStart..EndSize ExonStart..EndSize ExonStart..EndSize
N° 1 1..87 87 N° 2 3438..3591 154 N° 3 6308..6369 62  
join(1..87,3438..3591,6308..6369)


exon

Literature and cross-references HsGPx05-B
Literature Rejraji,H., Vernet,P. and Drevet,J.R. GPX5 is present in the mouse caput and cauda epididymidis lumen at three different locations. Mol. Reprod. Dev. 63 (1), 96-103 (2002)
Protein ref. UniProtKB:   O75715
DNA ref. GenBank:   NC_000006.11 (28493791..28500156)
mRNA ref. GenBank:   NM_003996
Cluster/Prediction ref. Genebank:   2880 UniGene:   Hs.248129
Protein sequence: HsGPx05-B
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   100 (77)
PWM (Da):   %s   11290.75 (8729.3)  
PI (pH):   %s   8.45 (8.19) Peptide Signal:   %s   cut: 24 range:24-100
Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
.........1.........2.........3.........4.........5.........6.........7.........8.........9.........0.........1.........2
MTTQLRVVHLLPLLLACFVQTSPKQEKMKMDCHKDEKGTIYDYEAIALNKNEYVSFKQYVGKHILFVNVATYCGLTAQYPGMSVQGEDLYLVSSFLRKGM

Retrieve as FASTA  
Remarks Alternative transcript of HsGPx05-a. Site of alternatively spliced exon 3.
Promoter
Send to BLAST
Send to cis Analysis
.........1.........2.........3.........4.........5.........6.........7.........8.........9.........0.........1.........2
TAATGACGAC AAATGCCATA AATTTAAGAG TATAATTCAA CCCTTTGAAA CTCAGGTCCA AATAGGGGGA AAAAATGAGT AACTAATTTT TTTTAATTTT AAAGAGCTAA TAATCTAATG  AGGAATATAT AAATTGTTCA AGAATACAAA TAATATGCAT ATTAAACATA TTAAATACAC TTATGATAGT GAGGGGAAGG AAAGTGGAGT TTGGGAAGCA AAGGATATAA ATAATAAATA  AAACAAGAGA GGGGACTTGC AAGGACAAAT GATTGTGAAC TTAGGAGCAT GATTAATTAA ATATTAGTGC TAGGGGTCCA AAAATTAAAA CTGTATGGTA GACAAAAGGG AAGAATGTCT  TGGTCCATCT CCTGTGAAGT CAGCAGTGAT TAACTATGTT ATTTATGTGA GAAACCCAGA AATTCCCGGG GCTCCAGGCC TGCATTCATC AATTCATATA GTCTAAAATT TTAGCCAAGA  CTACTGAGAG GTCATTGGAA ACTGTTGCTG AATGAATGGG GCTTGTATAC CAGTTGAAAG GCAAAGCAAC TTTATTTTTA GAGGGACTTG TGTCTCATTT CCATGATTCT TCTTGGGCTC  TGGGCTTCCA GGCTATTAAG AGTAGTACTT GCCACTATCT ATTCACAATA GCAAAGACAT GGAATCAACC TAAATGCCCA CCAATAATAG ACTAGATAAA ATATGGTACA TATGCACCAT  GGAATACTAT GCAGTCATAA AAAAAAACAA GATCATGTCC TTTGCAGGGA CATGGATGGA GCTAGAGGGC ATTATCCTTA GCAAACTAAT GAAGGAACAG AAAACCAAAT ACCACATGTT  CTCACTTATA AGTGGAGGAT AAATGATGAG AGCACCTGGA CACATAGAGG GGAACAACAC ACACTGGGGC CTATTAGAGG GTGGAGGGTG GAAGGAGGGA GGGGATCAGG AAAAATAACT  ACTGGGCACT AGGCTTAATA CCTGGGTGAT GAAATAATTT GTAGAACAAA CCCCTATGAC ACAAGTTTAC CTATATAACA CACCTGCACA TGTACCCCTG AACTTAAAAT AAAAGTTAAA  AAAAATAGAA AAAAAAGAGG AATGCTTGCA ATTTTTGTAA ATATATTATT TTTTAAAAGT TATTTACTTT TTTAAAGCAC TGCATTCAGA ATGTCAGATT ATTGTCCAGA AAGTTGGCAA  CATTAGTATT CGCCATTCCC CCACCCATCG TGTAAGAGAC TCCTATACCA GACGGAGCCC AGGCTGGGAA TCACCATTCC TTTTAACTTT TGCCAATCTG ATAAGTGTGG AATGTGTCTT  TTCGTATTTA TACTTCTTTG ATTATTGGTG AGAGAGAACA CTGTATCCTA CCACAGATGC CATTTGATTT TCTGCCTCAT GCCCATTTTT TTCTGTTGGT CTGGTAGTTT TTTCTTACTG  ATATATAAGC ACTTGAAATC ATTTCTAAGG ATTTGTATTA ATTTGCTGTC CTTCGCATAC ATTGTGACTA TTTCCCCTCC TCGAGCCAGT TTCCTCCTAA CTCTTTTTGA GAGATCCTAG  ATGGCCGGCC CATTCTTTGA TTTATTTTTA AGCTCAAATA ATATTAGAAA TAACATTTGA AATGTCTAGA CCAACCCTTT TGCAGTGACT TTACTGGGAG GTTGCATCAG CATCTAGACA  CTTCCATACA TTGAGGAAAA ACAGACAGCC GTGTTTAAGG ACCTCAGAGG GCTTGCTATC ACCCATTTAT AATTTTCCCA GAACTTATGA GTCCCAGGTC CTCATTGCAG TGGTAAGCGC  TGAGTGCTCA CGGGGGTGTG TGTGGGACAG GATGTGGTTT GAGTTCTGTG ATCCTCACCC CGACCTCATG CGTCGGGAAT CCTTGCAGCC CTGTGACTGG CCTGTGGGGG CTTGGGCTAA 
GTCCCTGCCA AGATACCAAA AGACTGCAGA GGTGGGCAAA GACCTCAGGC CCCCAGACTA GCAATCTACA AACACTAGTC 

Retrieve as FASTA  
Terminator +
Send to BLAST
Send to cis Analysis
.........1.........2.........3.........4.........5.........6.........7.........8.........9.........0.........1.........2
ATGGTGAAAA AGAACAGAAA GTCTTCAGTT TCTTGAAGGT GAGTAAATTC CTGGCATAAG CCTCCTCCTC TTTTCTAATA TTGCTAACAT AGAGTTGGTG TGGCAGAAAT GGATCCAAGG  GCTCATGCCC AGAGGTGGGA TTGGTCTTTG TGGAGAAAAA TCTCCAGATC AGCATTCCAC ATTGCACATG CTGATCTGGA GATTAATCTG TGAGTATCTA TGGGGCTCTA ACTCTGTGTG  GTGAAGAAAG TTGTGTGGAA TGGCAACTTT TACTAGGACC ACCCTCTTTT GCTCATTGAC ATTCATTCAT TAATTCATTC CAGGTACACT TGATGAATGC CCGCTACTTA TAAAGCAATC  TAAATAATAA GGATATAAAG ATGAATAAGG CATAGTCTGT ACTCTTGATG AGTTTATAAT GGAGAGAGAG TTAGAAACCA TTAGCTATGT AGCTGGGGTG GTGGTTCATG CCTATAATCC  CAGCACTTTG GAAGACTGAG GCAGGACAGG AGAATTGCTT GAGGCCAGGA GTTCAAGACT AGCCTGAGCA ACATAGTGAG ACCCTGTCTC TACAAAACAA ATCAAAAAAT TAGCTGGGTG  TGGTGGCACG TACCTGTAGT CTCAACTACT CGGGAGGCTG AGGCCAGAGG ATTGCTTGAG CTCCGGAGCT GGAGGCTGAA GTGAGCTATG ATTGTGCCAC TGCATTCCAC ACTAGGCAAC  CAAGCAAGAC ACTGTCTCAA AAAAACAAAA ACAAAAAAAG TAACAAACCA ACAGGTATGA TACAGTGTAG TAGGTACCTT TTATGAAACA CTGATTTTTA GACATAGAGA ATGCCAGAGC  TGAAACAACC CTAAAGATTA CCAAAGTGAA TTGTTCCTAA ATGCTGGACT GTGAACCAAG ACCAGTCCAT GTTAAGACTT TATATATCCT CAATAAATTG AAGACAATAG AACAGTGTAT 
CATGCCTCTG CACCCCAGCC TGGGCGACAC AGCGAGACTC T 

Retrieve as FASTA  
DNA
Send to BLAST
.........1.........2.........3.........4.........5.........6.........7.........8.........9.........0.........1.........2
ATGACTACACAGTTAAGGGTCGTCCATCTGCTTCCCCTTCTCCTAGCCTGCTTTGTGCAAACAAGTCCCAAGCAGGAGAAGATGAAGGTGAGTGAGCTTCAGAGAGGGCATGGTAGTTAC
TCTTCTGTCCTACTTCTAGACCCTGCCCTCCACTCCTTCTTGTAAGACTCCAACTCCTGCTTTCTTCTTCTTTGCCAGTTCCCCTAAACCTTGCTTTTTTTTCTCCTTGAATCTTCTTCA
TTCCTATGGATGGGTATTCCTTGCGTTGAATATGACTAGGGAAGAAAGGGTCTCCATATGACTAGGGAAGAAAGGGTCTCCATACCTTCTTCAGGTGGAGGTCCCCTGGAGACCTCTCTG
GCCACATCAGTCTCTGCTTCAGAGCTGGGTCTGAGGCTGGGACAGCGATGGGCTTTAGAGTAGGTGGGGACTGGGGTTTGGAGGAGAAGCTGAGTGGACTTGTCTCAGACACAGCTCAGC
AACAACCCCTTGAAGAGGAGGAAAAAACGAATGTGGAAGTTTTAAGGATGGATAAAATCAGAGAGTTATCAGAGAAACATAAAACATGAAAAAAAAAATCAGAGCCCTAAAACAACTGGA
TTTGGAGTCAGGCATCTTGGATTCTGGCCTCAGTTCTATGCCCAATTCATGGCTCGTTACCTTATTGATAAGACACATGTGTCTGGCAGCAGAAGGGGCAGTTTAGGAAAGGATAATAAT
GAATGCGATAACTTGGAGGCAGAAAATAATCATGAAGTTAGGTAAAGGCAAACTTTCATTTACATAATGGGTTACCACTTTTGACTTTGGACAAATTAACCTCTGTTATCTCATTGTAAA
TTTATGGGTAACAGTAACTACCTTATGGGTGGGTGAATAACAATTATTATGCATATAATACATTCTACAAAATGCAGTTCTAATAACATCTCCCCATCCCTCGCCTCTAAAATTAACTAG
ATAACATCCTGGGTGAACTTCTATTTTGAGAATTGATATGGTTTTTATGTTACCTGTGGTGCTTAATTGAGTGTGGAGACTCTGGGCTGCAGAATTTGCTTAATAAAAGCTGCGTCTAGA
GATAATTGAGACACGTTATATGGACTTCAATAAATTTGAAACAGCAGTCAATATCAGAAGTAAACTGGACTAAAGGAAGTCTTCAAATTGAGAGTCTCTCTAAGCTTTTGCATACTGGTA
CCCAACATGACTGTGAGTGATTGTCATTGCAGTAGCAAAAGAAAAAAAAAAGGCAAATTCTTGCAAATGTTTAACTTGAAACTAGGTAACATGGAGATAGAAACAGATACTTTTACACAA
TATTCTCTTTATAGATCCCTCAATTTTGCTGGTGCATGTATATATGTATAAATTTAGGGAAAGGTGTAAAAACCTGCATAGAAAAATATCTTTTTCCTCAAGAGTAAGAAGTGAGTAGCT
ACAACCTAGTATGCTGGTGATAAAATCAGTGGGATAACAGGACTAGAAAAAAGTTGTGTTTTGTTTTGCTTTGTTTTGCATTACTCCTTCTCTGAATGGGGGGCAGATGATGTTCAACCA
AAATCCTTACTAGACTACTGCATTTCCAGGAAGTCTAGTTTAATCCTAGTTTGTCTGGACATTCCTTATCAAATAATGCCCTTCTCTCTTTTCTCCAGCCAGTTCCTTTCCACCTTTTTC
TCACCGGATGGTTTGGACATAGAGCTTCCTTTTCATATTCCTGTCATATATATTCTGTATTCCATGAGCAATTTGTGGCAGCTTCCCCAGTATAAGAAAAGGGATCAGCATGTGCTGGTG
AGCACTGTGGCATCGGTACACTTGGGGTACTGCATGAACACTGTAAGGGTAGAGACAGAGGAGGAGTAAGATGAGACCTGCCTTGTAGAGGAATTTAATAAAAGAACATGCAATGAGAAT
TTCAGGCAGGGCTAATTTATATTAAGTGGAACTTAACAAATGTTGCATGGAAGTCTGCTCAAATATTAATATGTTCATGAGATTTGAGAAGGAATGGGATAGGTGGAATGGAATATGAAA
GTGGATATTAGACACCTAGAGCACAATGGGCTGATGAGCTGGGTGATGCTGCCCAACAGATTTCAGGGACTCACTTGCAGATGGACTTTAGGGTTCTCCATCTCCTTTCTTGAGAGCTAC
CAAAAGCTGGGATTTCAGAGTATTGGCTTACATGACCACCATGTTAGTAAGAGAGTGACAGGAGAAATTTATTCAAGGTGGGGATAATATTAGATTCTAGAATGTTAAACATGGAAGCCC
ACTTGGAGTTCTAGTAAGAATCTAGATAAATATCTTCATTTTACTCATGGGGAAACTGAAGGCCAGGGATGGGAATTGCCCAGGTTCACAAAGGAATTTAACAATGGAGCTGGCTTCTGA
TTCCCAGGGCAGTGTTCTTTCTACTCTACCTGCTGATGAGTGGAGTAAGAGGTCAGAAGACCTGGGGAAAGATAAGCAACTAAGATATCCTAAAAATAGTTCAGCAATTTAAAACCCTCC
CTTCTCAGAGAGTCCAGACAGGAGGCCTTCAATCCAGAGCCAAGGAGTAGCCTGTTTTTTACAGAAGCATGTAAGGCAAGTGTGCTTTTCTCTTCGGCCCCACTTACTTCCAGCTCCTAC
CATCCCAGCTTATGAATCAATATCCTTTTCCATTATCCGTGTATTTCCTGGTATCTCACAGCTTTCAAAATAATAGGAAACTTGATTCTTATGTGTGTGTGTGGAGGGGGGAGTGTACAT
AGTAAGTGTGTATATATATGTGTATATATATATATGTGTGTATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATGGTACAAGAGATG
TTTTGATACAGACATGCAATGTGTTATAATCACATTATGGAAAATGGGGTATCCATCCCCTCAAGGATTTCTCCTTTGTGCTACAAACAATCCAATTATATGCTTTTAGTTATTTTAAAA
TGTACAATTAAGTTATTATTGACTATAGTCACCCTGTTGTGCTATCAAATACTAGGTCTTATTTATTCTTTCTAACTATCTTTTTTTTTTCTCATTAATCATCCCAACCTCCCTTCCACC
CTCCTAGTATCTTTCCCAGCCTCTGGTAACCATCCTTCTACTCTCTATCTCCGTGAGTTCAATTGTTTTGATTTTTAGATCCCACAAATAAGTGAGAACATGCAATGCTTGTCTTTCTCT
GCCTGGCTTATGAGACTTGATTTTTTATTTCCAAGTTACAAGAACCAAGTTTCAGTCTTGTCATTGACACTTTAGACAACTCTTATTTGTTTTCTAGATCTTGGTTAGAACATAACTATT
CTTTGACTTCTTTGAAAGATTACACAGATGCCAGGAATTATTGTTACCAGTATTATCACTTAAAAAAAATCTTCCAGATGGATTGCCACAAAGACGAGAAAGGCACCATCTATGACTATG
AGGCCATCGCACTTAATAAGAATGAATATGTTTCCTTCAAGCAGTATGTGGGCAAGCACATCCTCTTCGTCAACGTGGCCACCTACTGTGGTCTGACAGCGCAATATCCTG
GTAAGAGAA
TTCATAGTTACTTCTCTTTGGGACTAAATTTTCCAGCTGATCATATTCTAAATTATACTTGGAATTATATTTTAATTATAATTATGTACCAAAATAAATACTCATAATCAAGTGACTTCA
TCCTCCATATCAGAAGTCAGCAAGCTTGGGTGGACAGGCCAAATTTGGTCAGCCTGGCTTTGTTAACAAAGTTTTATTGGAATGCAGCCGTCCCCGTTCATTTACACATCACCTATGGCT
GCTTTCATGCTGTAAAATAGAGGTTAGTAGTTGTAGGAGTAGTGATGATGGAAACCATGTGGCCCACAAAGTCTGAAATATTTCCTATCTGGCCCTTTACAGAAAAAATGTGCTAACCCC
CTCCCCATGCCCTGCCTCTGCTTTTTCCTGAGATTTCCAGGGGAATCAATATATACTTGAGAACTAGGAGCCTCTCAGAAGATTCCAGAAGTCTTCTTGATAAATACAGGACAGAAGACC
CATGTTTTTGAGACTTTTGCAAGGTTTTACAGGTAACTTACAATGACAAGAAAAAGGAGTTTTATACCTGGAACTGCATTTGATTAGAGTGAGGGCTGGCGGATGAGGCTGTAATAGAAG
CAAATACTCCCTCTCCAACCTCAACCCCTTTTTAGGATGTAGTTTTTCCTCCCTTTTTGTACATTATTCAGGGAAGAATTTTCTCATATTTTAGGGCATGTGGTTTAAAAATCAGTGAAT
AACAATCAGGATGGATTATACCAGAGACAAATGTACTTCTTATATTTGAAGTAATAAGACCTTCATTTTTTGTTTTTAATTATGTTTTGAATAAGCATTATATTCACAAGTCTCAAAGTT
CAAAAGAAAAAAACTTTAGAACCAAAGGTTTCCACCTTCTTCCCCTCCCTTCAGTAGACCAATATTATCTTGTTTACAGAATACATAGATATTCTTGTTTCTGCTCCCCCCTCCCCAGCT
GATAACACACAATAAATACTATTTGCTGCCTTGATTTTTTAATTAATAAAATACATTTGAGTTCAGATCATTTCCTCATTCTTTCTTAAGACTGAATAATATTTATTGGACCACAATTTA
TTTTCCCAGTTTATAGGGACTTTAAGAATCGATTTATTCAGTTTCCACCCTGCAAATAACAGATAACAGAAGGACATAGGGAGGGGTACTGAGGAACCCTGTGAAAACAGGAAGGCAATC
TCTGTTTTTTAAAAAGGCCTAGAGGAGGTACCAGTTGGCTGAGCTGAATCTGAGTGGGACTGGTTAGTGTTTGTCAAGGGACTAAAGGCATCTGGCTCAGAAAGGGTTAACAAAGAAGAT
GATTATAAAAGTCTGAGCAGACAAGTTGGAAAACTTCCTGGTAGTGGACGAAGGCAGCTGAAGCTTGTTTTTCAGCATATTACTGAGGATTTTTAGTAAGAATGCATCTTCAGCATCTTA
AGGACTGTTGAAAAATGTTAGGATTGTTGATTTCAGATTTCTCTGTTTGTCTTTGCCTTTGTCAGTTTTACTTCCACTCCACTCAGGGTGAGCCAGGCTGCACAGAGGAGAGAAGCTCAG
TCCTGGCTAACATGGCGAAACCCCGTCTCTACTAAAAATACAGAAATATTAGCTGGGCATGGTAGCAAGTGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGTCTAAGGCAGGAGAATCACTTGGAT
CTGGGAGACGGAGGTTGCAGTGAGCCGAGATCGCGCCACTGCACTCCAGCCTGGGCGACAGAGTGAGAATCTGTCTCAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAGAAAAGAAAAGAAAAGAAAA
GAAAAGAAAAGAAAAGTCACCTGTTGAACTTTTGAATAATAAAGAAGACTAAGCCCCATTTCAGAGGAACAGAAAACTCTCTGAAATGGGACCTGGGCATCCCTATTTTTAGGAAAGGGC
CTTCAGCTGATTCTGATGTGCTGCAGGTATGGAAAACACTGCACCATGACAAAGGGCTTTTGAGCGCACGTCTGAAGATCCGGCCTCTAACTTCAGCTATGCTACTAACAGCCCTTCTGA
TGCAGAGCTGTTTCCCTCCCTGGGCCTCTGTTTCCTTCTCTGTAAAATGGGTAACCCCAGGGAATCATCCTTGCACAAGGCAGAACCTCTACCTAGACCAAAATTGTTCCTCCTCTAACT
GCAGAACTAAATGCACTCCAGGAGGAGCTGAAGCCCTATGGTCTAGTTGTGTTGGGCTTTCCCTGCAACCAATTTGGAAAGCAAGAACCAGGAGATAACAAAGAGATTCTTCCTGGGCTC
AAGTACGTGTCTTCTTGAAATCCAATAGGAGGCGCCTGTGTACCTTTCCTCAGTCTCCAGAGGCCCTTCCAGCTCAGGAACTTTCTGGGGAGGTATGGATTAATAGGCTCAGGGGCATTA
CAAGCAGAGTTTAACTTTGGCCTACCGTGATGAGCGTCTGGCAGTTTCCAGACTCTCTCTCCATCCCTGGCTGAGACTTGGATGGACTATGGAGGACAGAAGGGATGGAGGAAAAGAGAC
AAGTCATGGGATAGAGAGAAATAAAGTGAGTCAGAGAGCCCAAAGTCAAAACATGGCCATATTCCTCCCCACCCACAACGATACTTCCCTCTTTCTCCCCTTTCTCATGACTTCAAATCC
TAGTGTCCCATTATAATCTTTACTTGCATATCCTGGAGCTTCCTGGGAACATTATGGCTTGTTGCAGGTATGTCCGTCCAGGGGGAGGATTTGTACCTAGTTTCCAGCTTTTTGAGAAAG
GGGATGTGA

Retrieve as FASTA  
CDS
Send to BLAST
.........1.........2.........3.........4.........5.........6.........7.........8.........9.........0.........1.........2
ATGACTACACAGTTAAGGGTCGTCCATCTGCTTCCCCTTCTCCTAGCCTGCTTTGTGCAAACAAGTCCCAAGCAGGAGAAGATGAAGATGGATTGCCACAAAGACGAGAAAGGCACCATC
TATGACTATGAGGCCATCGCACTTAATAAGAATGAATATGTTTCCTTCAAGCAGTATGTGGGCAAGCACATCCTCTTCGTCAACGTGGCCACCTACTGTGGTCTGACAGCGCAATATCCT
G
GTATGTCCGTCCAGGGGGAGGATTTGTACCTAGTTTCCAGCTTTTTGAGAAAGGGGATGTGA

Retrieve as FASTA