Entry information : MtPrx41 (Medtr7g029030.2[4.0])
Entry ID 365
Creation 2006-01-17 (Christophe Dunand)
Last sequence changes 2016-05-20 (Catherine Mathe)
Sequence status complete
Reviewer Not yet reviewed
Last annotation changes 2016-05-20 (Catherine Mathe)
Peroxidase information: MtPrx41 (Medtr7g029030.2[4.0])
Name (synonym) MtPrx41 (Medtr7g029030.2[4.0])
Class Class III peroxidase    [Orthogroup: Prx029]
Taxonomy Eukaryota Viridiplantae Streptophyta Fabaceae Medicago
Organism Medicago truncatula (barrel medic)    [TaxId: 3880 ]
Cellular localisation N/D
Tissue types Leaves
Roots
Inducers Elicitor treatment (glucan, oligosaccharides, yeast extract, Phytophthora crude extract)
Glomus intraradices infection
Glomus versiforme infection
Methyl jasmonate treatment
Mycorrhiza
Nodulation
Pathogen interaction
Phytophthora infection
Repressor N/D
Best BLASTp hits
Perox score E-value MtPrx41
start..stop
S start..stop
GmPrx56 507 0 1..320 1..326
GmPrx272 503 0 1..320 1..325
VvPrx65 449 3e-160 9..320 7..322
CclPrx43 447 2e-159 11..320 8..324
Gene structure Fichier Exons
ExonStart..EndSize ExonStart..EndSize ExonStart..EndSize ExonStart..EndSize
N° 1 10090507..10090716 210 N° 2 10088487..10088678 192 N° 3 10086731..10087291 561  
complement(join(10086731..10087291,10088487..10088678,10090507..10090716))


exon

Literature and cross-references MtPrx41 (Medtr7g029030.2[4.0])
Literature Manthey,K. et al., unpublished
DNA ref. Phytozome 11:   chr7 (10090716..10086731)
Cluster/Prediction ref. Phytozome Gene 11:   31077145
Omic ref. Gene atlas:   Mtr.43371.1.S1_at Legoo:   Mtr.43371.1.S1_at
Protein sequence: MtPrx41 (Medtr7g029030.2[4.0])
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   320 (297)
PWM (Da):   %s   34601.3 (31979.1)  
PI (pH):   %s   5.03 (5.00) Peptide Signal:   %s   cut: 24 range:24-320
Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
.........1.........2.........3.........4.........5.........6.........7.........8.........9.........0.........1.........2
MEKIRIVFMAMVMAFTIFSSGECQLVENFYVSSCPNVELVVAQAVTNKFTQTITTGQATLRLFLHDCFVEGCDASVMIASPNGDAEKDAKENLSLPGDGFDTVIKAKQAVESVCPGVVSCADILAIATRDVIALLGGPSFSVELGRRDGLNSKASNVEANLPKPTFNLNQLNTIFSKHGLSEKDMIALSGAHTVGFSHCDQFTNRLYSSQVDPTLDPTYAQQLMSGCPRNVDPNIVLALDTQTEHTFDNLYYKNLVNGKGLLSSDQVLFTDDASRSTVVEFANDGSKFFEAFVVAIKKLGRVGVKTGKEGEIRRDCSKFN*

Retrieve as FASTA  
Remarks cDNA from 24 ESTs. Complete sequence from genomic (chromo 7, 2 introns)
DNA
Send to BLAST
.........1.........2.........3.........4.........5.........6.........7.........8.........9.........0.........1.........2
ATGGAGAAAATAAGAATAGTATTTATGGCTATGGTTATGGCTTTTACCATATTTTCTAGTGGAGAATGCCAATTAGTAGAGAATTTCTATGTTTCAAGTTGCCCTAATGTTGAACTTGTG
GTGGCTCAAGCAGTGACAAATAAGTTTACACAAACTATCACCACTGGACAAGCTACTCTTCGTCTATTTTTGCATGATTGCTTTGTTGAG
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GTAAGCATTATCATTTTATGGGTGCTGTTAACCGGTGCCCGAACACCGAT
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CTCCGCGGCAGTTTACTGTCGATGGAAAATAACCACATCGATAGTTAACTACCGCATATTTTATTCACCGGTAGTTAATTGTGAATCAGGTTATTTTCGTAAAATACTGATATTTTTTAG
CAAACATTGAAGTGTGAACAACAATTTTCTACTAGCTATTGGACAACCAAACTATATTTGGTTTGCTAATTTTCCAGTTGTTATTTGCACCCCCACACTTGTGAACTTGGGTGGCTTTTT
GTACATAGTCTTTCATTTTAAAAAACTATTTCCTTTCTTGTTTATCTAAGACAATACCTTCACTTGTTCTTGAATACAAAAATAAAATAAAAAAATACTATAAAATTTGTTTCATACTCA
TAAAATAATTATTACAAAATAAAATCCAAACTAATTAAAGAGTAGTTTTAATCATATCATTAATAGAAGATGTAAGTAGTAAAATTGACTATTTTATTTTATGGGTGTTGGTTAAGACTT
TGGAGTGTGATACTCCTCAAAATTTCAGATTCGGTTTTATCCGATGTCAATTCGGGTGGACAAGTTTTACTTCCTAATATATTTTTTTTTGGTGTATTTTAAACCACTTCATTTAATTAA
TTATTTGTCGTCTTATAATCAAAATCGAATTGATGTATATTATTATATTCAACTATGTATCACAGCTAGGAGGTCCATCATTCAGCGTTGAACTTGGACGAAGAGACGGACTCAATTCCA
AAGCATCAAATGTTGAAGCAAATCTTCCAAAACCAACTTTCAATCTGAATCAACTAAACACTATTTTCTCCAAACACGGCCTAAGCGAAAAAGACATGATTGCACTCTCAGGAGCACACA
CCGTAGGATTCTCACATTGTGACCAATTCACAAACCGTTTATACTCATCTCAAGTGGACCCCACTTTGGACCCAACCTATGCTCAACAACTAATGTCAGGTTGCCCTAGAAATGTTGACC
CAAACATTGTGCTTGCCCTTGATACTCAAACTGAACATACTTTTGATAATTTGTATTACAAAAATTTGGTTAATGGAAAAGGGTTATTAAGTTCAGATCAAGTTTTATTCACTGATGATG
CTTCAAGATCTACGGTTGTTGAATTTGCTAATGATGGTAGTAAATTCTTTGAGGCATTTGTTGTGGCTATTAAGAAGCTTGGAAGAGTTGGGGTAAAAACTGGTAAAGAGGGAGAGATTA
GGAGAGATTGTAGCAAATTTAATTAG

Retrieve as FASTA  
CDS
Send to BLAST
.........1.........2.........3.........4.........5.........6.........7.........8.........9.........0.........1.........2
ATGGAGAAAATAAGAATAGTATTTATGGCTATGGTTATGGCTTTTACCATATTTTCTAGTGGAGAATGCCAATTAGTAGAGAATTTCTATGTTTCAAGTTGCCCTAATGTTGAACTTGTG
GTGGCTCAAGCAGTGACAAATAAGTTTACACAAACTATCACCACTGGACAAGCTACTCTTCGTCTATTTTTGCATGATTGCTTTGTTGAG
GGATGTGATGCTTCAGTTATGATTGCTTCA
CCAAATGGAGATGCAGAAAAAGATGCAAAGGAGAATCTTTCTCTACCAGGAGATGGATTTGACACTGTGATTAAAGCAAAGCAAGCAGTAGAATCTGTATGCCCAGGAGTTGTTTCATGT
GCAGACATTTTGGCAATTGCCACTAGAGACGTTATAGCCTTG
CTAGGAGGTCCATCATTCAGCGTTGAACTTGGACGAAGAGACGGACTCAATTCCAAAGCATCAAATGTTGAAGCAAAT
CTTCCAAAACCAACTTTCAATCTGAATCAACTAAACACTATTTTCTCCAAACACGGCCTAAGCGAAAAAGACATGATTGCACTCTCAGGAGCACACACCGTAGGATTCTCACATTGTGAC
CAATTCACAAACCGTTTATACTCATCTCAAGTGGACCCCACTTTGGACCCAACCTATGCTCAACAACTAATGTCAGGTTGCCCTAGAAATGTTGACCCAAACATTGTGCTTGCCCTTGAT
ACTCAAACTGAACATACTTTTGATAATTTGTATTACAAAAATTTGGTTAATGGAAAAGGGTTATTAAGTTCAGATCAAGTTTTATTCACTGATGATGCTTCAAGATCTACGGTTGTTGAA
TTTGCTAATGATGGTAGTAAATTCTTTGAGGCATTTGTTGTGGCTATTAAGAAGCTTGGAAGAGTTGGGGTAAAAACTGGTAAAGAGGGAGAGATTAGGAGAGATTGTAGCAAATTTAAT
TAG

Retrieve as FASTA  
cDNA
Send to BLAST
.........1.........2.........3.........4.........5.........6.........7.........8.........9.........0.........1.........2
GGATTGCAAA CTAGCTAATT AAAGAGAGGT AGAAGAGATG GAGAAAATAA GAATAGTATT TATGGCTATG GTTATGGCTT TTACCATATT TTCTAGTGGA GAATGCCAAT TAGTAGAGAA  TTTCTATGTT TCAAGTTGCC CTAATGTTGA ACTTGTGGTG GCTCAAGCAG TGACAAATAA GTTTACACAA ACTATCACCA CTGGACAAGC TACTCTTCGT CTATTTTTGC ATGATTGCTT  TGTTGAGGGA TGTGATGCTT CAGTTATGAT TGCTTCACCA AATGGAGATG CAGAAAAAGA TGCAAAGGAG AATCTTTCTC TACCAGGAGA TGGATTTGAC ACTGTGATTA AAGCAAAGCA  AGCAGTAGAA TCTGTATGCC CAGGAGTTGT TTCATGTGCA GACATTTTGG CAATTGCCAC TAGAGACGTT ATAGCCTTGC TAGGAGGTCC ATCATTCAGC GTTGAACTTG GACGAAGAGA  CGGACTCAAT TCCAAAGCAT CAAATGTTGA AGCAAATCTT CCAAAACCAA CTTTCAATCT GAATCAACTA AACACTATTT TCTCCAAACA CGGCCTAAGC GAAAAAGACA TGATTGCACT  CTCAGGAGCA CACACCGTAG GATTCTCACA TTGTGACCAA TTCACAAACC GTTTATACTC ATCTCAAGTG GACCCCACTT TGGACCCAAC CTATGCTCAA CAACTAATGT CAGGTTGCCC  TAGAAATGTT GACCCAAACA TTGTGCTTGC CCTTGATACT CAAACTGAAC ATACTTTTGA TAATTTGTAT TACAAAAATT TGGTTAATGG AAAAGGGTTA TTAAGTTCAG ATCAAGTTTT  ATTCACTGAT GATGCTTCAA GATCTACGGT TGTTGAATTT GCTAATGATG GTAGTAAATT CTTTGAGGCA TTTGTTGTGG CTATTAAGAA GCTTGGAAGA GTTGGGGTAA AAACTGGTAA  AGAGGGAGAG ATTAGGAGAG ATTGTAGCAA ATTTAATTAG TGTGATGGTG GCAAAAAAAT ATAATTAGTT TGTATATGAT TATTGAGTGA TGGTGATCTA AATGTATTAT ATTATTAACA 
ATAATAATAT TACATTCCAA GTTTGCCTCG TGCC 

Retrieve as FASTA