Entry information : FthCP01_LVS
Entry ID 3651
Creation 2006-08-25 (Filippo Passardi)
Last sequence changes 2015-12-20 (Achraf Jemmat)
Sequence status complete
Reviewer Christophe Dunand
Last annotation changes 2015-12-20 (Christophe Dunand)
Peroxidase information: FthCP01_LVS
Name FthCP01_LVS
Class Catalase peroxidase    [Orthogroup: CP001]
Taxonomy Bacteria; Proteobacteria; Gammaproteobacteria; Gammaproteobacteria
Organism Francisella tularensis subsp. holarctica    [TaxId: 119857 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type N/D
Inducer N/D
Repressor N/D
Best BLASTp hits
Perox score E-value FthCP01_LVS
start..stop
S start..stop
FtCP01_SCHU 1495 0 1..728 14..741
FnovCP01 1462 0 1..728 14..739
FphCP01 1383 0 1..728 14..739
YpsCP01 888 0 10..727 24..735
Literature and cross-references FthCP01_LVS
Literature Chain,P. et al., Complete genome sequence of Francisella tularensis LVS (Live
Vaccine Strain). Unpublished


Protein ref. GenBank:   CAJ79943.1 UniProtKB:   Q2A298
DNA ref. GenBank:   AM233362.1 (1436527..1434341)
Protein sequence: FthCP01_LVS
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   728
PWM (Da):   %s   81048.11  
PI (pH):   %s   5.19
Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
MLLASSNAIA EDTKTKNDNL SPQSVDLSPL RNLNKLDSPM DKDYNYHQAF KKLDTEQLKK DMQDLLTQSQ DWWPADFGNY GPFFIRLSWH DAGTYRIYDG RGGANRGQQR FSPLNSWPDN  VNLDKARQLL WPIKQKYGDA VSWSDLIVLA GTVSLESMGM KPIGFAFGRE DDWQGDDTNW GLSPEEIMSS NVRDGKLAPA YAATQMGLIY VNPEGPDGKP DIKGAASEIR QAFRAMGMTD  KETVALIAGG HTFGKTHGAV PEDKVKQAIG PAPDKAPIEQ QGLGWHNSYG TGNGDDTMGS GLEGSWTSTP TFWNHDFLHN LYNLDWKKTL SPAGAHQWTP TNAKPENMVP DAHKLGVKHK  PIMFTTDLAL KEDDGFNKYT QEFYNNPEEF KEEFAKAWFK LTHRDMGPKS RYIGPWIPEQ NFIWQDPVPA ADYKQVSTQD IAQLEQDIIN SGLTNQQLIK TAWDSASTYR KTDYRGGSNG  ARIALAPEKD WQMNEPAKLE VVLTKLKEIQ TNFNNSKTDG TKVSLADLIV LGGNVGVEQA AKQAGYNIQM PFVPGRTDAT QAQTDIESFN YLKTKSDGFI NYTDGSISAD KLPQTLVEKA  SMLDLNIPEM TVLVGGMRAL DVNYDNSQEG VLTTTPGQLN NSFFVNLLDM STQWKKSDKK DGEYIGIDRK TGKQKWTASP VDLIFGSNSE LKAVAQVYAE NGNEQKFVND FAKAWHKVMM 
LGRFDVQQ 

Retrieve as FASTA  
Remarks Complete sequence from genomic. Strain="LVS".
DNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGCTACTAG CTTCTAGCAA TGCTATCGCA GAAGATACCA AAACGAAAAA TGATAATCTT TCACCACAGA GCGTAGATTT ATCACCATTG CGCAATTTAA ATAAGCTTGA TAGCCCAATG  GATAAAGATT ATAACTATCA TCAAGCTTTC AAAAAACTAG ATACTGAACA GCTTAAAAAA GATATGCAAG ATCTTTTAAC CCAGTCACAA GACTGGTGGC CTGCTGATTT TGGCAATTAT  GGTCCTTTCT TTATTAGACT ATCGTGGCAT GATGCTGGTA CATACAGAAT ATATGATGGT AGAGGAGGCG CTAATCGTGG ACAACAAAGG TTCTCCCCTT TAAATAGCTG GCCAGATAAT  GTTAATCTTG ACAAAGCAAG GCAACTTTTA TGGCCAATCA AACAAAAATA TGGTGATGCT GTTTCATGGT CTGATTTGAT TGTTTTAGCT GGTACTGTTT CTTTAGAATC AATGGGAATG  AAGCCTATAG GGTTTGCTTT TGGTAGAGAA GACGACTGGC AAGGTGATGA TACAAACTGG GGACTATCAC CTGAAGAGAT AATGTCTAGT AATGTAAGAG ATGGCAAACT TGCTCCTGCA  TACGCCGCAA CACAAATGGG GCTAATATAT GTAAATCCAG AAGGTCCTGA TGGTAAACCT GATATCAAAG GTGCAGCTAG TGAAATTCGT CAGGCCTTCC GAGCTATGGG GATGACAGAT  AAAGAAACTG TCGCCCTAAT TGCAGGCGGT CATACATTTG GTAAAACTCA TGGTGCAGTT CCAGAGGATA AAGTCAAGCA AGCAATTGGA CCTGCTCCTG ATAAGGCGCC TATTGAGCAG  CAAGGTCTAG GCTGGCACAA TAGTTATGGC ACTGGAAATG GTGATGATAC TATGGGTAGC GGTCTTGAAG GCTCTTGGAC TTCTACTCCA ACTTTTTGGA ATCATGATTT CTTACATAAC  CTTTACAACT TAGACTGGAA GAAAACACTT AGCCCTGCTG GAGCTCACCA ATGGACTCCT ACAAATGCTA AGCCAGAAAA TATGGTTCCT GATGCTCACA AGCTGGGTGT AAAACATAAA  CCTATAATGT TTACAACAGA CTTAGCGCTA AAAGAAGATG ATGGATTTAA TAAATATACT CAAGAGTTCT ACAATAATCC TGAAGAATTT AAAGAAGAGT TTGCTAAAGC ATGGTTTAAA  TTAACACATA GAGATATGGG ACCAAAATCT AGATATATAG GTCCTTGGAT TCCTGAGCAA AACTTTATTT GGCAGGATCC TGTTCCAGCA GCAGACTATA AGCAAGTGTC TACACAAGAT  ATTGCCCAAC TTGAGCAAGA TATTATAAAC TCTGGATTAA CTAATCAGCA ACTTATAAAA ACTGCTTGGG ATTCAGCTTC TACTTATCGT AAAACCGACT ATAGAGGTGG CTCAAATGGT  GCAAGGATTG CTTTAGCTCC AGAGAAAGAT TGGCAAATGA ATGAACCAGC TAAACTTGAA GTTGTTCTTA CTAAGCTTAA AGAGATTCAA ACCAACTTTA ACAATAGCAA AACTGATGGT  ACAAAAGTAT CATTGGCTGA CTTAATAGTG CTAGGTGGTA ATGTGGGTGT TGAGCAAGCA GCTAAACAAG CTGGTTATAA TATACAAATG CCTTTTGTAC CAGGTAGAAC AGATGCTACT  CAAGCTCAAA CTGACATAGA GTCTTTCAAC TATCTAAAAA CCAAATCTGA TGGTTTTATA AACTATACAG ATGGTAGTAT AAGTGCTGAT AAATTACCAC AGACTTTAGT AGAAAAAGCT  AGCATGCTTG ACTTAAATAT CCCAGAAATG ACAGTGTTAG TCGGTGGTAT GCGTGCTCTT GATGTCAATT ATGATAACTC ACAAGAAGGT GTATTAACTA CTACTCCAGG TCAGCTTAAT  AATAGCTTCT TTGTGAACTT GCTAGATATG TCTACTCAAT GGAAAAAATC TGATAAAAAA GATGGTGAGT ACATTGGTAT AGATAGAAAA ACTGGTAAGC AAAAGTGGAC AGCATCGCCA  GTTGATCTAA TTTTTGGATC AAACTCAGAG CTTAAAGCAG TAGCTCAAGT TTATGCTGAA AATGGTAATG AGCAAAAATT TGTAAATGAC TTTGCAAAAG CTTGGCATAA AGTTATGATG 
CTTGGCAGAT TTGATGTTCA ACAA 

Retrieve as FASTA  
CDS
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGCTACTAG CTTCTAGCAA TGCTATCGCA GAAGATACCA AAACGAAAAA TGATAATCTT TCACCACAGA GCGTAGATTT ATCACCATTG CGCAATTTAA ATAAGCTTGA TAGCCCAATG  GATAAAGATT ATAACTATCA TCAAGCTTTC AAAAAACTAG ATACTGAACA GCTTAAAAAA GATATGCAAG ATCTTTTAAC CCAGTCACAA GACTGGTGGC CTGCTGATTT TGGCAATTAT  GGTCCTTTCT TTATTAGACT ATCGTGGCAT GATGCTGGTA CATACAGAAT ATATGATGGT AGAGGAGGCG CTAATCGTGG ACAACAAAGG TTCTCCCCTT TAAATAGCTG GCCAGATAAT  GTTAATCTTG ACAAAGCAAG GCAACTTTTA TGGCCAATCA AACAAAAATA TGGTGATGCT GTTTCATGGT CTGATTTGAT TGTTTTAGCT GGTACTGTTT CTTTAGAATC AATGGGAATG  AAGCCTATAG GGTTTGCTTT TGGTAGAGAA GACGACTGGC AAGGTGATGA TACAAACTGG GGACTATCAC CTGAAGAGAT AATGTCTAGT AATGTAAGAG ATGGCAAACT TGCTCCTGCA  TACGCCGCAA CACAAATGGG GCTAATATAT GTAAATCCAG AAGGTCCTGA TGGTAAACCT GATATCAAAG GTGCAGCTAG TGAAATTCGT CAGGCCTTCC GAGCTATGGG GATGACAGAT  AAAGAAACTG TCGCCCTAAT TGCAGGCGGT CATACATTTG GTAAAACTCA TGGTGCAGTT CCAGAGGATA AAGTCAAGCA AGCAATTGGA CCTGCTCCTG ATAAGGCGCC TATTGAGCAG  CAAGGTCTAG GCTGGCACAA TAGTTATGGC ACTGGAAATG GTGATGATAC TATGGGTAGC GGTCTTGAAG GCTCTTGGAC TTCTACTCCA ACTTTTTGGA ATCATGATTT CTTACATAAC  CTTTACAACT TAGACTGGAA GAAAACACTT AGCCCTGCTG GAGCTCACCA ATGGACTCCT ACAAATGCTA AGCCAGAAAA TATGGTTCCT GATGCTCACA AGCTGGGTGT AAAACATAAA  CCTATAATGT TTACAACAGA CTTAGCGCTA AAAGAAGATG ATGGATTTAA TAAATATACT CAAGAGTTCT ACAATAATCC TGAAGAATTT AAAGAAGAGT TTGCTAAAGC ATGGTTTAAA  TTAACACATA GAGATATGGG ACCAAAATCT AGATATATAG GTCCTTGGAT TCCTGAGCAA AACTTTATTT GGCAGGATCC TGTTCCAGCA GCAGACTATA AGCAAGTGTC TACACAAGAT  ATTGCCCAAC TTGAGCAAGA TATTATAAAC TCTGGATTAA CTAATCAGCA ACTTATAAAA ACTGCTTGGG ATTCAGCTTC TACTTATCGT AAAACCGACT ATAGAGGTGG CTCAAATGGT  GCAAGGATTG CTTTAGCTCC AGAGAAAGAT TGGCAAATGA ATGAACCAGC TAAACTTGAA GTTGTTCTTA CTAAGCTTAA AGAGATTCAA ACCAACTTTA ACAATAGCAA AACTGATGGT  ACAAAAGTAT CATTGGCTGA CTTAATAGTG CTAGGTGGTA ATGTGGGTGT TGAGCAAGCA GCTAAACAAG CTGGTTATAA TATACAAATG CCTTTTGTAC CAGGTAGAAC AGATGCTACT  CAAGCTCAAA CTGACATAGA GTCTTTCAAC TATCTAAAAA CCAAATCTGA TGGTTTTATA AACTATACAG ATGGTAGTAT AAGTGCTGAT AAATTACCAC AGACTTTAGT AGAAAAAGCT  AGCATGCTTG ACTTAAATAT CCCAGAAATG ACAGTGTTAG TCGGTGGTAT GCGTGCTCTT GATGTCAATT ATGATAACTC ACAAGAAGGT GTATTAACTA CTACTCCAGG TCAGCTTAAT  AATAGCTTCT TTGTGAACTT GCTAGATATG TCTACTCAAT GGAAAAAATC TGATAAAAAA GATGGTGAGT ACATTGGTAT AGATAGAAAA ACTGGTAAGC AAAAGTGGAC AGCATCGCCA  GTTGATCTAA TTTTTGGATC AAACTCAGAG CTTAAAGCAG TAGCTCAAGT TTATGCTGAA AATGGTAATG AGCAAAAATT TGTAAATGAC TTTGCAAAAG CTTGGCATAA AGTTATGATG 
CTTGGCAGAT TTGATGTTCA ACAA 

Retrieve as FASTA