Entry information : MtuCP01_Rm20
Entry ID 3691
Creation 2006-09-22 (Filippo Passardi)
Last sequence changes 2016-01-06 (Achraf Jemmat)
Sequence status complete
Reviewer Christophe Dunand
Last annotation changes 2016-01-06 (Christophe Dunand)
Peroxidase information: MtuCP01_Rm20
Name MtuCP01_Rm20
Class Catalase peroxidase    [Orthogroup: CP001]
Taxonomy Bacteria Actinobacteria Actinobacteria (class) Mycobacteriaceae Mycobacterium
Organism Mycobacterium tuberculosis    [TaxId: 1773 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type N/D
Inducer N/D
Repressor N/D
Best BLASTp hits
Perox score E-value MtuCP01_Rm20
start..stop
S start..stop
MtuCP01_Rm29 1510 0 1..740 1..740
MtuCP01_H37rv 1510 0 1..740 1..740
MtuCP01_Rm08 1509 0 1..740 1..740
MtuCP01_G6108 1509 0 1..740 1..740
Literature and cross-references MtuCP01_Rm20
Literature Orru,G. Direct Submission (18-OCT-2000)
Protein ref. GenBank:   AAK06514.1 UniProtKB:   Q9APA6
DNA ref. GenBank:   AF314112.1
Protein sequence: MtuCP01_Rm20
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   740
PWM (Da):   %s   80424.21  
PI (pH):   %s   4.83
Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
MPEQHPPITE TTTGAASNGC PVVGHMKYPV EGGGNQDWWP NRLNLKVLHQ NPAVADPMGA AFDYAAEVAT IDVDALTRDI EEVMTTSQPW WPADYGHYGP LFIRMAWHAA GTYRIHDGRG  GAGGGMQRFA PLNSWPDNAS LDKARRLLWP VKKKYGKKLS WADLIVFAGN CALESMGFKT FGFGFGRVDQ WEPDEVYWGK EATWLGDERY SGKRDLENPL AAVQMGLIYV NPEGPNGNPD  PMAAAVDIRE TFRRMAMNDV ETAALIVGGH TFGKTHGAGP ADLVGPEPEA APLEQMGLGW KSSYGTGTGK DAITIGIEVV WTNTPTKWDN SFLEILYGYE WELTKSPAGA WQYTAKDGAG  AGTIPDPFGG PGRSPTMLAT DLSLRVDPIY ERITRRWLEH PEELADEFAK AWYKLIHRDM GPVARYLGPL VPKQTLLWQD PVPAVSHDLV GEAEIASLKS QIRASGLTVS QLVSTAWAAA  SSFRGSDKRG GANGGRIRLQ PQVGWEVNDP DGDLRKVIRT LEEIQESFNS AAPGNIKVSF ADLVVLGGCA AIEKAAKAAG HNITVPFTPG RTDASQEQTD VESFAVLEPK ADGFRNYLGK  GNPLPAEYML LDKANLLTLS APEMTVLVGG LRVLGANYKR LPLGVFTEAS ESLTNDFFVN LLDMGITWEP SPADDGTYQG KDGSGKVKWT GSRVDLVFGS NSELRALVEV YGADDAQPKF 
VQDFVAAWDK VMNLDRFDVR 

Retrieve as FASTA  
Remarks Complete sequence from genomic.
DNA
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GTGCAGGACT TCGTCGCTGC CTGGGACAAG GTGATGAACC TCGACAGGTT CGACGTGCGC 

Retrieve as FASTA  
CDS
Send to BLAST
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ATGCCCGAGC AACACCCACC CATTACAGAA ACCACCACCG GAGCCGCTAG CAACGGCTGT CCCGTCGTGG GTCATATGAA ATACCCCGTC GAGGGCGGCG GAAACCAGGA CTGGTGGCCC  AACCGGCTCA ATCTGAAGGT ACTGCACCAA AACCCGGCCG TCGCTGACCC GATGGGTGCG GCGTTCGACT ATGCCGCGGA GGTCGCGACC ATCGACGTTG ACGCCCTGAC GCGGGACATC  GAGGAAGTGA TGACCACCTC GCAGCCGTGG TGGCCCGCCG ACTACGGCCA CTACGGGCCG CTGTTTATCC GGATGGCGTG GCACGCTGCC GGCACCTACC GCATCCACGA CGGCCGCGGC  GGCGCCGGGG GCGGCATGCA GCGGTTCGCG CCGCTTAACA GCTGGCCCGA CAACGCCAGC TTGGACAAGG CGCGCCGGCT GCTGTGGCCG GTCAAGAAGA AGTACGGCAA GAAGCTCTCA  TGGGCGGACC TGATTGTTTT CGCCGGCAAC TGCGCGCTGG AATCGATGGG CTTCAAGACG TTCGGGTTCG GCTTCGGCCG GGTCGACCAG TGGGAGCCCG ATGAGGTCTA TTGGGGCAAG  GAAGCCACCT GGCTCGGCGA TGAGCGTTAC AGCGGTAAGC GGGATCTGGA GAACCCGCTG GCCGCGGTGC AGATGGGGCT GATCTACGTG AACCCGGAGG GGCCGAACGG CAACCCGGAC  CCCATGGCCG CGGCGGTCGA CATTCGCGAG ACGTTTCGGC GCATGGCCAT GAACGACGTC GAAACAGCGG CGCTGATCGT CGGCGGTCAC ACTTTCGGTA AGACCCATGG CGCCGGCCCG  GCCGATCTGG TCGGCCCCGA ACCCGAGGCT GCTCCGCTGG AGCAGATGGG CTTGGGCTGG AAGAGCTCGT ATGGCACCGG AACCGGTAAG GACGCGATCA CCATCGGCAT CGAGGTCGTA  TGGACGAACA CCCCGACGAA ATGGGACAAC AGTTTCCTCG AGATCCTGTA CGGCTACGAG TGGGAGCTGA CGAAGAGCCC TGCTGGCGCT TGGCAATACA CCGCCAAGGA CGGCGCCGGT  GCCGGCACCA TCCCGGACCC GTTCGGCGGG CCAGGGCGCT CCCCGACGAT GCTGGCCACT GACCTCTCGC TGCGGGTGGA TCCGATCTAT GAGCGGATCA CGCGTCGCTG GCTGGAACAC  CCCGAGGAAT TGGCCGACGA GTTCGCCAAG GCCTGGTACA AGCTGATCCA CCGAGACATG GGTCCCGTTG CGAGATACCT TGGGCCGCTG GTCCCCAAGC AGACCCTGCT GTGGCAGGAT  CCGGTCCCTG CGGTCAGCCA CGACCTCGTC GGCGAAGCCG AGATTGCCAG CCTTAAGAGC CAGATCCGGG CATCGGGATT GACTGTCTCA CAGCTAGTTT CGACCGCATG GGCGGCGGCG  TCGTCGTTCC GTGGTAGCGA CAAGCGCGGC GGCGCCAACG GTGGTCGCAT CCGCCTGCAG CCACAAGTCG GGTGGGAGGT CAACGACCCC GACGGGGATC TGCGCAAGGT CATTCGCACC  CTGGAAGAGA TCCAGGAGTC ATTCAACTCC GCGGCGCCGG GGAACATCAA AGTGTCCTTC GCCGACCTCG TCGTGCTCGG TGGCTGTGCC GCCATAGAGA AAGCAGCAAA GGCGGCTGGC  CACAACATCA CGGTGCCCTT CACCCCGGGC CGCACGGATG CGTCGCAGGA ACAAACCGAC GTGGAATCCT TTGCCGTGCT GGAGCCCAAG GCAGATGGCT TCCGAAACTA CCTCGGAAAG  GGCAACCCGT TGCCGGCCGA GTACATGCTG CTCGACAAGG CGAACCTGCT TACGCTCAGT GCCCCTGAGA TGACGGTGCT GGTAGGTGGC CTGCGCGTCC TCGGCGCAAA CTACAAGCGC  TTACCGCTGG GCGTGTTCAC CGAGGCCTCC GAGTCACTGA CCAACGACTT CTTCGTGAAC CTGCTCGACA TGGGTATCAC CTGGGAGCCC TCGCCAGCAG ATGACGGGAC CTACCAGGGC  AAGGATGGCA GTGGCAAGGT GAAGTGGACC GGCAGCCGCG TGGACCTGGT CTTCGGGTCC AACTCGGAGT TGCGGGCGCT TGTCGAGGTC TATGGCGCCG ATGACGCGCA GCCGAAGTTC 
GTGCAGGACT TCGTCGCTGC CTGGGACAAG GTGATGAACC TCGACAGGTT CGACGTGCGC 

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cDNA
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