Entry information : MtPrx64 (Medtr0147s0010.1 + Medtr4g012865.1 [4.0] / Medtr4g012870.1 / Medtr4g009100.1)
Entry ID 3814
Creation 2008-10-08 (Christophe Dunand)
Last sequence changes 2014-07-30 (Christophe Dunand)
Sequence status complete
Reviewer Harold Duruflé
Last annotation changes 2016-06-30 (Harold Duruflé)
Peroxidase information: MtPrx64 (Medtr0147s0010.1 + Medtr4g012865.1 [4.0] / Medtr4g012870.1 / Medtr4g009100.1)
Name (synonym) MtPrx64 (Medtr0147s0010.1 + Medtr4g012865.1 [4.0] / Medtr4g012870.1 / Medtr4g009100.1)
Class Class III peroxidase    [Orthogroup: Prx022]
Taxonomy Eukaryota Viridiplantae Streptophyta Fabaceae Medicago
Organism Medicago truncatula (barrel medic)    [TaxId: 3880 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type N/D
Inducer N/D
Repressor N/D
Best BLASTp hits
Perox score E-value MtPrx64
start..stop
S start..stop
CarPrx48 542 0 1..393 1..375
VvPrx95 412 5e-144 7..393 10..367
EgrPrx93 409 3e-142 7..392 4..397
CsPrx02 408 4e-142 6..392 1..377
Literature and cross-references MtPrx64 (Medtr0147s0010.1 + Medtr4g012865.1 [4.0] / Medtr4g012870.1 / Medtr4g009100.1)
Literature Shaull S., Lin S., Dixon R., May G., Sumner L., Gonzales B., Cook D., Kim D., Roe B.A. Submitted (MAR-2006).
DNA ref. Phytozome 12:   chr4 (3451220..3453923)   scaffold0147 (2001..4702)
Omic ref. Gene atlas:   Mtr.26737.1.S1_at Legoo:   Mtr.26737.1.S1_at
Protein sequence: MtPrx64 (Medtr0147s0010.1 + Medtr4g012865.1 [4.0] / Medtr4g012870.1 / Medtr4g009100.1)
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   394 (367)
PWM (Da):   %s   43439.55 (40368.7)  
PI (pH):   %s   5.1 (4.67) Peptide Signal:   %s   cut: 27 range:27-393
Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
MAPPLILPKL ILLILVLCLL FQHKNHNKNT NSNANTFNSI NIVPIHSFSS FPVSLSAINN SHVSESSSSD SSSNFLLEYD FYRDSCPHAE HIVRSTLHLL YKTNPALVPA LIRLVFHDCF  IQGCDASILL DNDEYIDSEK DSPxNDSLKG FDVIETIKAK LEEACPGVVS CADILVLAAR DSVVLAGGPF YPLNPGRRDG SNSFADIATD ELPSPYADLT QTRASFKSRG FDEREMVTLL  GAHSIGVIPC KFFENCLYNF SGTNEPDPSL DTQFLNVLRS KCNETDALST SASAYSSHAS PSSLVEEQQE ITTDSGESLS NFGTLYYRRL LQGKGILYED QQLMEGEKTR YWVQYASNRT 
LFHQDFALAM MKLSDLRVLT KPMGQIRCSC SKV* 

Retrieve as FASTA  
Remarks Complete sequence from genomic (Chromo 4, 3 introns). No EST. Incorrect prediction from Phytozome: 1 extra intron betwen DAS and SCADIL due to missing residue. Only short fragment found in the Chromo 4 due to indetrmind nucleoted but complete sequence was found thinks to scaffold0147.
Promoter
Send to BLAST
Send to cis Analysis
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
AAAATTGCGC CGCCACGGAG GGTTTGTGTG AGGGATAGTT TGAATGAGTA TGGGGTTTGG AGTGGGTCGG TGGTGATTGC GGTGGTGTTG TAGACTGTGA CGGTGGTGTC TTGTGCCATT  GGGAACAAGG TGTTTGTGAA AATGCGTAGC AGAAGAGTGT AGTGAAATTA ATTGTTGAAA TGCGTAGGTG AAAAGTGATG CATGGAATTG CTTGGTGATG GGAAATAAGT ATACTGAGAA  GAGAAGAATC TAGAATGTTT GAGAATGGGT TCTGGAAAAT TCGAATTTGA ACAAAAAGAA GGTTTGAATG AGTTGGAATG GTTCATGATG TGTAAAGGTT TGATTCTGTT TTTCTGATGG  AATATGGTGA AAATTTGAGA CACACTTGTG GATTTTGAGA AAGTTATGAA AATTGTTGTT AACACATGCT GAGATACATA AATAAAATAC GTTTTTCCCC TCTGCAGTTA ACCGATGAGA  AATTCCAAAA TCGACTGCAG TTAACTGCCA AGAAAACTGA TTATGCAGAC AGTAGCTATC ATTTTTTCGA TGTGAAAATT TTTTCACAAG TATTTCTCGG TGCCTTACTT CCGAGGTTTC  CCATGACAAA GTTCTACGTA ACTGACGTAG ATACCCATAA CAAAACCAAA AAATAAACCG ATTAAAATTT TCAATACCTG TTTTTTTTAC GTCAAAAATG TGTTGATACC TCTTATGCCT  GATGCTTGAA TGATTTTGGA GCAAAATTTG ATGAAAAAAA ATATTGGATT TGGGGATTGG ATGGAAGTGG TATGAAAGTT GATGATGAAA ATAGTGTGTA GGGGGAGCAG GGGACTGTTT  CATCTGATGA AACATATTTC TCGGCTGCCG ATGGGGCAAA ATGATATTTT ACTTGTGTGC CTCAGCCTTA TGAAATATGT CAACAGCAAT TTTCGAAAGT TATTACACTA GCTCCCTCTG  TTTTTTTTAC TGTATAGCAA ATTTTGGTTT CTAAATTTGT GAGATGTTTT TTAATACTAA TTTGATACAT TCAATCACAA TAGTTTTTTA AGACAAAATA GCACATCAAA TTAATGTCGT  GTATAATTGA ACTTGAGACA TTAATAAAAG CACACTTCAA AGTTCTAAGC ACATCATCCG ATCAAACCCC GACTTCATTC AATTACAATA GTAATACAAC TTCAATATAT TTTTATAAAT  AAAAAGCTTA GTTGGATTGG ATCTCATAAG TTCATTGGAA TTAGAGAAAG ATTTGAGTTT TAAGATCACA AATAAAAATC AATATTATGA TTGACACAAA AGACTAGACG TTTTGTTTAT  AAATATTGCA ATAGAGATTA GTGTGATATA ATGTCATGTG ATATTGACAA TTCAAGCGTG ATACGTAGCA ATACAATTTT TTTGTAAATA TAAAGAGATG TTAAAGAGAG AATAGTTGAA  TTGGTTTATA TGTCACAATT GAATTGACCA ACGTCAACGA TATTATACAC AAGTGGAGTC CATTCTAACG GAAATTATGA CATTATGACA TAGTATATAT GTTTTGACAA ATGACATATA  GAATGAATTA GCTAAAAAAC TTCAAATTGA GTTGAACCAA CTTACTAGTA CGAAGTTTTG CCTAAATTTG ACCACATTAC ATTTTCAAGT CTTTATTATA TAATGGAATT AGCCTTTTTT  GTTCATTCAA AAAATTCCTT CCCACCATCA TCTTGCCTTG CAACCAGTTG AAATTCATAT TATGTGAAAT TCAAATAGAT TCACATAATA TGAATTTCAA CCTATAAAAG AGTGTGGGTG  AAAAATTAAA ATAGGGTTGT TGCTAAACAA AATCCATACT CCAATTAACT ATGGTCAAAA GTTAAAACAC TTTTAGCAAG TAACACCCTA AAAGGCTAAA ACAGTTCATG TGACAGTTAT 
GTTAGTTTTC TTTCACTCCA AGAAACTCTT TTACCGTCAT CTTCACTTGC AACTGCAACT GCAATTTTAG TCCAAAAAAA 

Retrieve as FASTA  
Terminator +
Send to BLAST
Send to cis Analysis
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
TGAGAGTGAT GCTATAAGAA TTGTCTCACA TTTTCGTATG CATTACATTC TGCTTAATAA CTGTAAATTT GTATCAGCTG GAAACTTTAA AGCAGTCTCA TATTTTCTAA GACTCTTATC  AAATCTGAGA AAGCATATAA AGATAGAAAA AATGATTAGG GTGTGTTAGG ATTGACTCAT TTGGACTCAT CAACTAGCAT AAGCACTTGT GAGACCTTAG AATAACAACT TATAACATGT  TCATAAGTTG TTTTCAGCTT AACTCCATAA GCTCTCCAAG GTAGCTTATT GTGAACAGCT TATATGAAAA CAGTTTATTT TATCTTTAGT TATAGAAATA GTTTACATAT GAGCACTTAA  ATAATAAGCG CTTATACTAC AAGAGCTTAT AAAATGGGAA AATGAGCAAA GAAGAAACTA AGAGATCAAC GTATTGTATG AAAACATAAA GCTCTAAACA GTTATTAAAA AAAAAAAAAG  GAAAGCTTTA AACAGTAGGA ACTAAACCAA ATAAAGTAAA TAGTAACTGA ATTGGTTTTT CCTATACACT AGAATTGTGA TTAGATGATA TTTCCTTTAT GTAACTGAAT TTGATAGAGT  CTTTCCTTTG CTGCTCGACA CATTTCTTTC AGCACTTTAT TTTAAGTTTA TGGTTTAATA ACTTAGCTTT CTATTTGGTT TAACTAATAG TGCTTTGGAT GAAAATTTTG TCTATTCTTG  TTTTTGTTTC TCAAAGAAGA AAATTGCTCA TGAACATTAA TGTTTGAAGT GCTCGGAAGA GCCAAAAGAT TGAGCAAACA AACAGGTGTG TGATAATGAT TTAGTTGTGA AAAAAGCGCA  AAGCCAAGGT ATTGGTTTCC TGTTTTTCTA GGTCTTTACT AGAATTTGAA CGAGTACTTT GCACAAAATT TATCTCATTT AGTTCTTCTC ATAAACATGT TTACTCTTGA ACCATGTAGT 
ACTTAGCCTA AATGTGAGGT AGCTTCAAAC TGTTATACTA 

Retrieve as FASTA  
DNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGGCACCAC CATTGATACT ACCAAAATTA ATTCTTCTGA TTCTTGTGTT ATGTCTTTTA TTTCAACACA AAAATCACAA CAAGAACACC AATTCTAACG CCAACACATT CAACTCCATC  AACATTGTTC CAATACATTC TTTTTCAAGT TTCCCAGTTT CTTTATCTGC CATCAACAAC AGCCATGTAT CAGAATCATC TTCTTCTGAT TCTTCTTCCA ACTTTCTTCT TGAATATGAT  TTCTACCGTG ATTCATGTCC TCATGCTGAG CACATTGTTC GTTCTACGCT TCACCTGCTT TACAAAACTA ATCCTGCTTT GGTTCCTGCT CTTATTCGTC TTGTTTTTCA TGATTGCTTC  ATTCAGGTCC ATTTTTCTTT GTTTCTATTT ATAATGATGC ATTTTCTTGT GTATTATTAT TTCATAACAA TGAAGAAAAA AATAGGGTTT TATTGTGTAT TTTAATAATT GTTATTATTA  TTTGGTCATT TCTGATTCTG GGTCTATTAT CTTATTCCAG GTTTTTGTTC TTATCTTTAA TCAATAATTT CTTGGACAAA TTTGTGGTTG TTTTGATTGA AATTAGATTT TTGAATTTTT  TGATTCAACA ACCTTTTTAC TTTTATATCT CAGTTTGACT GAAGTCATGT TGTTAAGTTG ATTTTGTTTT AGATTTAGGT AATGTTTGGA TAAACAGTTT GATTAAGCAC ATTTACTTTA  AGCGATTTTG TTTATGTATA CGTTATTTCA ATAAAATTAT TTTCAATATA TGCTATACTA TATTAGAGAA CTTAAAGAAA TAAGCTGAAA ACAACTTATG GACGTATTAT AAACTGTTTC  CATAAGTTTT TTCATATACT CTCAGAGTTG CTTATCCATT AGATAAACTC AAATAAATCA ATCCAAATAG ATACTTAATG TTTGGTGTGT ATTTCTGATG TTTACCTTTT CTCTATGGTA  TAGTTGAGTC AGCACAATTA GACCTCATTT ATGTTTTGAA ACTAAACTAT TGATTTTAAT TGGGTTTGCA TCAGGGATGT GATGCTTCTA TTTTGTTGGA TAATGATGAA TACATTGATT  CAGAGAAAGA TTCACCTCCn AATGATAGCC TCAAAGGATT TGATGTAATC GAGACCATTA AAGCCAAGCT TGAAGAAGCA TGTCCTGGAG TTGTTTCTTG TGCTGATATT CTTGTACTTG  CTGCAAGAGA TTCTGTTGTT CTGGTAACAT TATTTATTTC CCTATATATT TCGTCATCAT TGTATGTGTA TATGTTTAAG AGATTAAAAC CTTTTTACAC ATGCATTTCT TGGATATGAC  TCGTAGTTTA CTAATAAGTG GGTACGGTTC AAGGTAATCT TGTTAATTGA ACAGTAGTAT TTAAACACTG GTCTTACGAT GTAAACTCTA AGCTTGAATA GTAGAAAGTC ATTGTGGCCA  CTTTGCGGTC TGTCGGAGAC GTAGATACAA TTGACCAAAC TACGTGATCA TATATCTTGT GTTCTCCATT TGAACCAGGG TTTTTGTTCT AACTTCTAAC AAGATCCAAT CAAGTTATAA  CATAATGTCA TTTTATTATA TTTGTTTCTA AAATATTTTC ACAAATGTCT AAATGGTGAA ATGTGATTAG ATACATACAA ATTAAACCTT ATGTTTGATT ATTTTGAATA GACTTTTGAA  CATAATTGAA TATCGTGTAT TTTATAGGCC GGTGGTCCAT TCTATCCTTT GAATCCAGGA AGGAGGGATG GTTCGAACTC TTTTGCTGAC ATAGCAACAG ATGAGCTTCC TTCACCCTAT  GCAGATTTAA CTCAAACTCG TGCATCCTTC AAATCAAGGG GATTTGATGA AAGAGAAATG GTCACTCTCT TAGGTTAAGT TCTAATTATT CTTTCTTCTT TTTCTTTGTA TTATTGTACT  AAAACAATGC TTTCTGTCTT ATTCTTTTCG TATTTCCTTC TAGCCAAAGT TTTAAAACAA ATGTTTGTGA TCTGGATCAC AATATCAAGT TTTTTATGGT TCTACGATTA TGATTGAGGC  TGAATTTAGC CACAATTCTC TCAGAGCATA GTTAGGATAT ATTTGTTGGA AAAAGAAAAA AAATTGTTGA GATTCATGTT ATTTTACCCG CATCCGTCCA TGCTTTGGAT ATCAATGCAC  TCATGGCCTT AACTCTTCGT TTCTTTGATC ATTTTAGTGT CATTGTTCCT GATGACTTAA TCTGTCCATT TTTACCTTCC AGGTGCCCAC AGCATTGGTG TAATCCCCTG TAAATTCTTC  GAAAACTGTC TCTATAACTT CAGTGGAACT AATGAACCTG ACCCTTCTTT GGATACTCAA TTTCTAAATG TACTAAGATC AAAATGCAAT GAAACTGATG CATTATCCAC TTCAGCATCA  GCATATTCAT CACATGCCTC ACCTTCTTCC TTAGTTGAAG AGCAACAAGA AATCACTACG GACTCCGGGG AATCTCTATC GAATTTCGGG ACGTTATACT ACCGCAGACT ATTACAAGGT  AAAGGAATCC TCTATGAAGA TCAGCAGCTG ATGGAAGGGG AAAAAACCAG ATATTGGGTT CAATACGCAT CTAATCGTAC TTTGTTCCAT CAAGATTTTG CCCTTGCAAT GATGAAACTC 
TCCGATCTCC GAGTTTTGAC AAAGCCTATG GGACAGATTC GGTGCAGTTG TTCAAAAGTT TAG 

Retrieve as FASTA  
CDS
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGGCACCAC CATTGATACT ACCAAAATTA ATTCTTCTGA TTCTTGTGTT ATGTCTTTTA TTTCAACACA AAAATCACAA CAAGAACACC AATTCTAACG CCAACACATT CAACTCCATC  AACATTGTTC CAATACATTC TTTTTCAAGT TTCCCAGTTT CTTTATCTGC CATCAACAAC AGCCATGTAT CAGAATCATC TTCTTCTGAT TCTTCTTCCA ACTTTCTTCT TGAATATGAT  TTCTACCGTG ATTCATGTCC TCATGCTGAG CACATTGTTC GTTCTACGCT TCACCTGCTT TACAAAACTA ATCCTGCTTT GGTTCCTGCT CTTATTCGTC TTGTTTTTCA TGATTGCTTC  ATTCAGGGAT GTGATGCTTC TATTTTGTTG GATAATGATG AATACATTGA TTCAGAGAAA GATTCACCTC CnAATGATAG CCTCAAAGGA TTTGATGTAA TCGAGACCAT TAAAGCCAAG  CTTGAAGAAG CATGTCCTGG AGTTGTTTCT TGTGCTGATA TTCTTGTACT TGCTGCAAGA GATTCTGTTG TTCTGGCCGG TGGTCCATTC TATCCTTTGA ATCCAGGAAG GAGGGATGGT  TCGAACTCTT TTGCTGACAT AGCAACAGAT GAGCTTCCTT CACCCTATGC AGATTTAACT CAAACTCGTG CATCCTTCAA ATCAAGGGGA TTTGATGAAA GAGAAATGGT CACTCTCTTA  GGTGCCCACA GCATTGGTGT AATCCCCTGT AAATTCTTCG AAAACTGTCT CTATAACTTC AGTGGAACTA ATGAACCTGA CCCTTCTTTG GATACTCAAT TTCTAAATGT ACTAAGATCA  AAATGCAATG AAACTGATGC ATTATCCACT TCAGCATCAG CATATTCATC ACATGCCTCA CCTTCTTCCT TAGTTGAAGA GCAACAAGAA ATCACTACGG ACTCCGGGGA ATCTCTATCG  AATTTCGGGA CGTTATACTA CCGCAGACTA TTACAAGGTA AAGGAATCCT CTATGAAGAT CAGCAGCTGA TGGAAGGGGA AAAAACCAGA TATTGGGTTC AATACGCATC TAATCGTACT 
TTGTTCCATC AAGATTTTGC CCTTGCAATG ATGAAACTCT CCGATCTCCG AGTTTTGACA AAGCCTATGG GACAGATTCG GTGCAGTTGT TCAAAAGTTT AG 

Retrieve as FASTA