Entry information : GgaPGHS01 (COX-1)
Entry ID 4108
Creation 2006-11-28 (Christophe Dunand)
Last sequence changes 2006-11-28 (Christophe Dunand)
Sequence status complete
Reviewer reviewer name not stored
Last annotation changes 2010-05-06 (Christophe Dunand)
Peroxidase information: GgaPGHS01 (COX-1)
Name (synonym) GgaPGHS01 (COX-1)
Class H synthase    [Orthogroup: PGHS001]
Taxonomy Eukaryota Metazoa Chordata Aves Phasianidae Gallus
Organism Gallus gallus    [TaxId: 9031 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type N/D
Inducer N/D
Repressor N/D
Best BLASTp hits
Perox score E-value GgaPGHS01
start..stop
S start..stop
OcuPGHS01 946 0 70..649 31..606
MdoPGHS01 946 0 50..629 22..609
OarPGHS01 945 0 70..629 25..584
BtPGHS01 945 0 70..629 25..584
Literature and cross-references GgaPGHS01 (COX-1)
Literature International Chicken Genome Sequencing Consortium. Sequence and comparative analysis of the chicken genome provide unique perspectives on vertebrate evolution. Nature 432 (7018), 695-716 (2004)
DNA ref. GenBank:   NW_001471503.1 (8973285..8978458)
EST ref. GenBank:   DR424319.1 [3' end]
Protein sequence: GgaPGHS01 (COX-1)
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   649
PWM (Da):   %s   72418.27  
PI (pH):   %s   6.42
Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
MEGLQSGAGG RSSVSHTCGH PAGFLLGVEV AVARQDTLTA PWLGRAALPH PTALLGSSKV PNAVAPRVDG DLSSLSAVNP CCYYPCQHQG VCVRVGLEGY ECDCTRTGYF GANCTSPELW  TRLRDLLKPS PTFYHFVLTH FRWFWDIINS TFIRDTLMRL VLTVRANLIP SPPTFNSQYG YISWEAYANV SYYTRILPPV PEECPTPMGT KGKQQLPDAQ LLAQRFLLRH KFEADPRGTN  LMFAFFAQHF THQFFKTSGK MGRGFTKALG HGVDLGHLYG DNLQRQHQLR LFQDGKLKFQ VVNGEVYPPS VTEVPVHMVY PPAIPKEKQL AMGQEVFGLL PGLCMYATLW LREHNRVCDI  LKQEHPTWGD EQLFQTARLI LIGETIKIVI EDYVQHLSGY FLNLKFDPEL LFEQQFQYRN RIAVEFNQLY HWHALMPDSF TIQGQEYSYE QFLYNTSMLM DYGVEALAES FSMQTAGRIG  GGQNINANVL GVAVGVIEES RQLRLQPFNE YRKRFGLKPY TSFQELTGEE DKAAELEELY GDIDALEFYP GLLLEKPQPN GIFGESMVEI GAPFSLKGLL GNPICSPEYW KPSTFGGATG 
FEIVKTASLE KLVCLNVKKC PYVAFHVPDA AAAGETDSGH AGGASSTEL 

Retrieve as FASTA  
Remarks Complete sequence from genomic (chromo 17), mRNA and 1 EST. Strain="inbred line UCD001".
DNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGGAGGGGC TGCAGTCTGG GGCAGGGGGC AGGAGCAGCG TGTCCCACAC CTGTGGCCAC CCCGCTGGAT TCCTGCTCGG GGTGGAGGTG GCTGTAGCAC GCCAGGACAC GCTCACTGCC  CCCTGGCTGG GACGTGCTGC TCTGCCCCAC CCGTGGGTCC CCACGCACTG ACACTGCTGT GAACCCAGAG CAGGCAGCGG CCTGCAGAGC CCTGGGCATG GAGCGGGGCT GCTCTTGTAG  GTGATGATGT TTGCAGCTGG GCTGAACACG GAGCTAACGG TGCAGCAGTG CTCTGAGGAT GCTCCAGTTG TGCTGCTGCA TGGCCCTGCT GGCAAGTTCA GTGCTACGAA ATGACAGGCG  AGTGGTCTGA AGTTAAATTG TCTGAGATAA ATAAGGACCT ACTGCTGCCC GCATCCAGGG ATTTGACAGC ATCTGGAGAC ATGGAAAGGT CTAAGGTGAA AGGGAGCTCA AAGGAAGGGC  TGGGAGCTGC ACCCTGTGGG CTGGCCCCAT AGCGTGAGGG TTCAGCGTCC CAGCACTGAG AAGAGCCCTG AGATGTCTGG GAAGCTGCGA GGATGCACAA TTAGCGTGAT TTGTCAAAGA  TGTTTGGTTT TAGCTTCAGT TTCCTATGGA AAACGTATTG TGCATTGTGC CAGCCTGCAT GAGAGCCTGG TTCCAGACCC TGCAGAATTT GAACCAGATC AGGCAGAGCC CGCAGAGTCT  GTCCCGGTGC TGCGTCCACC AAGCTCTCCA TGGCAGCTCC GTGCCGGAGG CAGCTGCGTG CTACGTGCCA AGGATGGTTT ACATAGCACA GCCCCACCAC AGCCGCTTCC AGCTCCTGGG  CTGCCCTCAC CCTGCGGCCC CATCGTGCTC CAGCTGTCCT GTGCTGTGGC AGCTGCCCGA GTGCTGGCAG ACTGGCGATG TGATGCCACA GCACGGAGCT TTCAGGCTTC TCCCTGCACA  GCAGAGCCCC CAGGGCTGCA GTGACGCCTC CAGCACGGCT CAGGAGAAGC TGCTGGGATG GACTGGGACC ACAGTGTGCC CCCACCACAG CCGCACTGGC CGGGTGAGGG CAGGATGGGC  GCTTATCTGG TGGCTGCAGC CAGGGTGTGC AGGCAAAGGG GCAGCTGTGA AGGAAGTGAC CGGGCTGGGG CTGGGAGGAA GGAGCCCAGC AGTCAGTCCC TTCCTTCACT GAGGGCAGAA  AAACCCTGTG CCAAAGCAAA CTGCAGCCCA GACAGTTGAC ATTATTAACA GTGATGTTTT CAGGGTTTTC TCCAGCTCTG GGGCACAGCA GTCTGTGCAC AAGGCTCCAG CAGTGCCTTT  CTGCTGCCTC CTGCTGTGCT GGGCTTGGCT GTGTGCAGGG CAGCACAGCC CTGCTGGGGA GCAGCAAAGT GCCCAACGCG GTGGCACCGC GGGTGGATGG TGACCTCTCC TCTCTTTCCG  CAGTTAACCC GTGCTGCTAT TATCCCTGCC AGCACCAAGG CGTGTGTGTG CGGGTCGGCC TGGAAGGCTA TGAGTGCGAC TGCACGCGGA CGGGATACTT CGGGGCCAAC TGCACCTCAC  GTAAGTCCAT GGCACTGTGC TGGGTGAGCA TTGCGCTGTC ATTACCCGGT GCCAAGTGCT GTGCTGCATC TGTGTCCCAC AGCTGAGCTC TGGACGCGCC TACGTGACCT GCTGAAGCCC  AGTCCCACCT TCTACCACTT TGTCCTCACC CACTTCAGGT GGTTCTGGGA CATCATCAAC AGCACATTCA TCAGAGACAC GCTGATGAGG CTCGTGCTCA CAGGTACCAG GGGTGGCGTC  AGGACTCTGG GCATCGGCGT GGGCATGGGT GGCACCAGGC TGGGTCACTT TGCTCAGAGC CACCCGCATG CAGGTGATGT TGGCTGTGGG AGGCACGGGG AGGCTGAGCC CCGCACGCAG  GCTGAGCGCC AGGCAACGGC TGCTGTCGGC ACGCCACGCT CCCCCTACAA AGGGCTCTGG AGCGGCCGCG CAGGGAGCAG CTGGTGGAAA TATGGAGTTG GCCCTTGTTA CTCATGTCCT  TGCATTTATC ACTTTGCATA AATATTTAGG TTCCAGCTCT TGGAGCCGTA GGGACGTGTT CACAAGGCTC TGGCTGTTGA TTTCAGCATT TATGCATGTT TGTCGTCTAA TTCATCATCC  AGGAATCCAT TAGTGCAGAA GTAGAACCAT CCGCTCGTGT AGGGACCTGC ACAGCACAGG ATATGCACAG CACAGCACAG CGGGACGTGG CCGGGCCCTC TGGTTCCTGG GATGCCTGGG  GTCTGTGCTG CTCCATGGCA CTGACTCAGC TCTCTCCTTC CAGTTCGCGC CAACCTCATC CCCAGCCCTC CCACCTTCAA CTCCCAGTAC GGCTACATCA GCTGGGAGGC CTACGCCAAT  GTCAGTTATT ACACCCGCAT CCTCCCGCCG GTGCCGGAGG AGTGCCCCAC ACCCATGGGG ACCAAAGGTA CGTGGTTGGC ACAGGAACAC GGGAGGTGAT GAGCACGGGC TGAGTCTGCA  GAGCAGCGTC TGGCTCCTAC CTGGTGCCAC ATGGCCATCA CGCACTGCCT GCATTGTGCT GCAGTGGTTG AACTGCACGG CCCCGGCATC ACCCCCTGTC CTCCACAGGG AAGCAGCAGC  TCCCCGATGC CCAGCTGCTG GCTCAGCGCT TCCTGCTGCG GCACAAATTT GAAGCTGACC CCAGGGGCAC CAACTTGATG TTTGCCTTCT TCGCTCAGCA TTTCACCCAC CAGTTCTTCA  AGACCTCCGG GAAGATGGGA CGTGGTTTCA CCAAGGCGCT GGGGCACGGG GTGAGGGCAT GGGGTGAGGG CGCAGGGCTC GGTGCAGCGG GCACACGGCG ATGGGCACAG GCAGGCTGCC  GCCCCACTCA CACCGTGTGC TCCCGCAGGT GGACCTGGGG CACCTGTATG GGGACAACCT GCAGCGGCAG CACCAGCTGC GGCTCTTCCA AGATGGGAAG CTCAAATTTC AGGTACTGCA  CGGCATGATA TAATGAGATG CGTCTTGGTC CCATGCCCCA AGATAGCTGG AAGCCCACAT CCCTCTGGCA GCTGCCAGGA CCACGTGGCT TCCTCCCCAG CTCACTTTCT GTTCCTGTCC  CCCTGAGGTG GTGAACGGGG AGGTGTACCC ACCGTCCGTC ACCGAGGTGC CGGTGCACAT GGTCTACCCA CCCGCCATCC CCAAGGAGAA GCAGCTGGCA ATGGGGCAGG AGGTGTTCGG  GCTGCTGCCA GGGCTCTGCA TGTATGCCAC GCTCTGGCTG CGTGAGCACA ACCGTGTCTG TGACATTCTG AAGCAGGAGC ATCCCACCTG GGGCGACGAG CAGCTCTTCC AGACAGCGCG  GCTCATCCTC ATCGGTGGGT GCTGCAGCAT TGGGGGCTGG GGAGTTCCTC TCACAGCCTT CTGGAGATCA TTGCCTTTGG TCTGTCAACC GATTTAGTTT TGAGTGATTT AGCTAAAAAC  CTGAATTATT TCATTCTAAT ATTCTTTTCT GGATTCTGGA TGGAAGTGAC TTGGTGTGAG ATTACAGAAA AGCAATTAAA GACCCACACC AACATGTTAT ATTAAGCACC ATGCTGGGGT  CGGCTTTCTC AAAAACCATT TCTGTTTCGG CAAAATGACC TTTTTTTGGT GGAAAAGTAA TTGACAGAGA AATTCCCCAC CAAGTGCCCA GCACAGAGTC AGGCGGGTCC CGCACTGCAC  GTGAGTAGCG CACCCAGCCC AGCGCCCTGC AGCAGTGGGG CTGAGGGGGC CGCCCCCGCT GATGCTTTCT TCTCTCACCT CCTGCCCAGG GGAGACCATC AAGATCGTCA TTGAGGACTA  CGTCCAGCAC CTCAGTGGGT ACTTCTTGAA CCTCAAGTTC GACCCTGAGC TGCTGTTCGA GCAGCAGTTC CAGTACCGGA ATCGCATTGC GGTGGAGTTC AACCAGCTCT ACCACTGGCA  CGCGCTGATG CCCGACTCCT TCACCATCCA GGGACAGGAG TACAGCTACG AGCAGTTCCT CTACAACACC TCCATGCTCA TGGACTATGG CGTGGAGGCC CTGGCGGAGT CCTTTTCCAT  GCAGACTGCA GGAAGGGTAA GGCCCCGTGC TGCTGCTGCA TCCCGTGGGG CTGCGGTGCC CCATCTGTCC CACCTGCCTG TAGCATTTGC CAACTTTTCC TGGCAGTGCT ATGCATGCTG  TGGGCCCTCC CCACAAGCAG TGCAGTGAGC TGGGCCTTGG CAGCACCGTG TGCTCGGTCC TGGGACACTG CAGTAAACAC AGTGGTGCAG CCAGGAGCCT GTGGTGCGCG GGCGGCCCCA  GGCTGGGCTG TGTCGCATGG AACAGATTGT CTCGTACTGT TCTTTGCTGC CATCACATGG ATGTTCTCTT CCAAGTGATT GCATCAACAT TTCTGACTCC TGTGAAGCAG CAAGGCTGCC  ACACAGACCT GCTGCTCTCG GTACTCCTGC TGTGACCCCA AACCCAGCGA CCCCCATCCC AGGGCCTGGG TGTCAGCAGG GCCGGGATGA GGCTGGGGCC TACTCATGTG GGCATGCTCC  TCCTCATCCT CTCCTCCTGC AGATCGGTGG GGGGCAAAAC ATTAATGCCA ACGTACTGGG AGTGGCTGTT GGAGTCATTG AGGAGTCGAG GCAGCTGAGG CTGCAGCCCT TCAATGAGTA  CCGGAAGAGG TTTGGCCTGA AGCCCTACAC GTCCTTCCAG GAGCTCACAG GTAGGGCTCC ACTCCCCCAG CTGGGCTCAG GGGCTGCAGC CCGGCCTGTG CTGAGGCCTC TGGGGTTCTC  TCGGTGCAGG AGAGGAGGAC AAGGCAGCAG AGCTGGAGGA GCTGTATGGA GACATCGACG CTCTGGAGTT TTATCCAGGA TTGCTGCTTG AGAAACCCCA ACCCAACGGC ATCTTTGGGG  AAAGCATGGT GGAGATTGGC GCTCCATTTT CACTGAAGGG ACTTCTTGGG AACCCCATCT GCTCCCCAGA GTACTGGAAG CCCAGTACCT TTGGTGGAGC AACCGGCTTC GAGATCGTCA  AGACAGCATC CCTGGAGAAA CTCGTGTGCC TCAACGTGAA GAAGTGTCCG TACGTGGCGT TCCATGTGCC GGATGCTGCA GCAGCAGGTG AGACTGACAG CGGCCATGCA GGTGGAGCAT 
CATCCACAGA GCTGTAG 

Retrieve as FASTA