Entry information : MtRboh07 (Medtr3g098350.1[4.0] / Medtr3g098350.1[3.5] / Medtr3g151570.1[3.0])
Entry ID 4170
Creation 2007-07-23 (Christophe Dunand)
Last sequence changes 2014-07-31 (Christophe Dunand)
Sequence status complete
Reviewer Not yet reviewed
Last annotation changes 2014-07-31 (Christophe Dunand)
Peroxidase information: MtRboh07 (Medtr3g098350.1[4.0] / Medtr3g098350.1[3.5] / Medtr3g151570.1[3.0])
Name (synonym) MtRboh07 (Medtr3g098350.1[4.0] / Medtr3g098350.1[3.5] / Medtr3g151570.1[3.0])
Class Respiratory burst oxidase homolog    [Orthogroup: Rboh001]
Taxonomy Eukaryota Viridiplantae Streptophyta Fabaceae Medicago
Organism Medicago truncatula (barrel medic)    [TaxId: 3880 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type N/D
Inducer N/D
Repressor N/D
Best BLASTp hits
Perox score E-value MtRboh07
start..stop
S start..stop
MtRboh04 1336 0 1..899 1..923
GmRboh07 1236 0 12..899 22..941
GmRboh03 1230 0 47..899 1..859
MtRboh08 1208 0 1..899 1..911
Literature and cross-references MtRboh07 (Medtr3g098350.1[4.0] / Medtr3g098350.1[3.5] / Medtr3g151570.1[3.0])
DNA ref. GenBank:   CT010504.7 (81495..86414)
Other ref. Gene atlas:   Mtr.2439.1.S1_at
Protein sequence: MtRboh07 (Medtr3g098350.1[4.0] / Medtr3g098350.1[3.5] / Medtr3g151570.1[3.0])
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   899
PWM (Da):   %s   102311.73 Transmb domain:   %s   o339-358i417-439o478-500i513-535o550-567i704-721o
PI (pH):   %s   9.08
Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
MGIDEIEEVP VDIELVERVH RNGSLNRRRT ESNSDINKEG DLVDVTLDIQ GKKVALHFTP VTGNNNYEED EKLDLLGKGM EKKRSFGDSF VRTASNHLRK VSQELTRLTS FSKQVGVEKV  KHARTDSVAS HALREFRFIT KNDGDAGWET VEKKFDKLAD NGLLHRDNFA ECIGMKKESK EFGGELFNAI SRRRNIHRHS INKAQLKDCW NQICDHDFES RLRTFFDMVD KDADGMVNEE  EIEEIISLSA TANDLLNIKN QAGEYAALIM EELGRNGEES IRVNDLEELL LHVPTHPKRG ESKYLSEILS IKLKANENNL VRKWHRNTKY FLEHNWKRIW ILALWIGVMC GLFAYKFMQY  RRKAAYEVMG HCVCMAKGAA ETLKLNMAII LLPVCRNTVT WLRDKTKLGI AVPFDDNLHF HQIIAVAIAI GVGIHAIYHL ACDFPSLIHA NSEKYELMEP FFGKQATSYW HFVKSWEGVT  GIIMVVLMTI AFTLASPWLR KRKVGEPQPL INITGFNAFW YSHHLFVFVY ALLIVHGFKL YFTKEWYKKT TWMYLAIPII IYALERLHRA LKSRIKSVSI SKVAVYPAGN VLALHVSKPE  GFRYKSGQYM FVNCAAVSPF EWHPFSITSA PGDDYLSVHI QGSGDWTKSL IKEFSKRCLP PTHGKSGLLR AENVPGDSSP STRPKVRIDG PYGAPAQDYK QYEVVLLVGL GIGATPMISI  IKDILNNSKA IEQEEGSTIE EGTGGKSPRS SQRKKTGLNN FKTRKAYFYW VAAKQGFFDW FKDVMNEVVE EDRRRVIEIH SHLTSVYEDG DAQSALIAML QSLNHAKNGV DILTGTPVKS 
HFARPKWCSV YKRIALNHPQ KRIGVFYCGR PDAIQELRDL AFDFSGKTST KFDFHKENF 

Retrieve as FASTA  
Remarks Complete sequence from genomic (Chromo 3, 10 introns). Incorrect prediction from Phytozome. No EST.
DNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGGGAATTG ATGAAATTGA AGAAGTTCCT GTAGATATAG AACTTGTTGA AAGAGTACAT CGCAATGGTT CACTTAACAG AAGAAGAACT GAGTCTAACT CTGACATAAA TAAAGAAGGA  GATCTTGTTG ATGTAACACT AGATATTCAA GGTAAGAAGG TTGCTTTACA CTTTACACCT GTTACCGGAA ACAATAATTA TGAAGAAGAT GAGAAACTTG ATTTGCTTGG CAAAGGAATG  GAGAAGAAAA GGTCTTTTGG TGATTCGTTT GTGAGAACTG CTTCAAATCA TCTGAGGAAA GTTTCTCAGG AGTTGACTCG TTTAACTTCT TTTTCAAAAC AAGTTGGAGT TGAAAAAGTG  AAGCATGCTA GGACTGATTC TGTAGCTTCT CATGCTCTCC GGGAATTCAG GTTTATCACT AAGAATGATG GTGATGCTGG ATGGGAAACG GTTGAGAAAA AGTTTGATAA GCTTGCTGAC  AACGGGTTAC TTCATCGTGA CAACTTTGCC GAATGCATAG GTACTGCTTA ATACATATCA ATTTTCTAAT CATTTCAATT AACTTATTTA TTTCTATCTA TTAACGTAAT TCCTCAACAA  AAAAAAACTA TTAACATAAA TACTTACTTC AAAAGAATGT TTGAGATAGT TTATGAAAAA TGTTCATGCA TAAGCACTTA ATTCGGCTGT TTGTCTAAGT ATGGACTTTC TCAGGATATT  TTGGATTTTG ATGTAGGAAT GAAAAAGGAG TCTAAGGAAT TTGGAGGCGA GCTTTTTAAT GCTATTTCTA GGAGGAGGAA TATTCATAGG CATTCAATCA ATAAGGCACA ATTGAAGGAT  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AACCTCCACT TTCACCAGGT AATTTTAACA GTTGGTTATA CAAACATCAA ATTGTGTGAT AATGAGAATA TTGATTACAT CAAAGAGTAC AAAAAACTTA TATAGCCAAT GCGAACCACT  AAACTTTAAC TAATGAAATT AATTTGTAAA TAACTATTAA ATCCTGTATT TTGCAGATAA TAGCTGTTGC AATAGCAATT GGAGTTGGTA TACATGCTAT TTATCATCTT GCTTGTGACT  TTCCTAGTCT TATTCACGCG AATAGTGAAA AGTACGAGCT CATGGAACCA TTTTTTGGAA AGCAAGCAAC AAGTTATTGG CATTTTGTGA AATCATGGGA AGGAGTAACA GGGATTATAA  TGGTTGTTTT AATGACAATT GCCTTCACGT TGGCTAGTCC TTGGTTAAGG AAAAGAAAGG TTGGAGAACC CAGAAAGGAC AAAGAACCGA GAAAGGACGA AGAACCCAAA ACACCCAATT  GCCTCCAACC CCTCATTAAT ATAACTGGTT TCAATGCCTT TTGGTACTCT CATCATCTCT TTGTATTTGT CTATGCCCTT TTGATTGTGC ATGGATTCAA ACTTTACTTT ACTAAGGAAT  GGTACAAGAA AACGGTTAGC ACCTTCCTTC AATTAACCTT TTTTTTCCCT TTTAATCTAG TTTCTCAGCT AATTCTTGTA CATTTTAAGG AACTTTATTG TATCTCTTTG GTAGACTTGG  ATGTATTTGG CTATTCCCAT CATCATTTAT GCATTGGAAA GACTGCATAG AGCACTCAAA TCACGCATCA AGTCTGTTAG TATATCAAAG GTGAGTGTTG AATATTAGAT TACTCATACA  CATAAATTAC ATCATATTAT TAATTCATTA GACAAACAAA GGACTTAGTT TCTTGAATTT TGGAAGAAAA AAAAAATTGA TGTTAGCTCT TACCTTTTGG CTAATATTTA AAAGTTACAT  GCATAAAAGG GAACAAAAAA AATACTCCTA TCTCAAAATG CATGTCTGAC CAGATTGTTT ATGTCATATT TGAAGGTGGC TGTTTACCCT GCTGGAAATG TGTTAGCTCT TCATGTGTCA  AAACCTGAGG GGTTTAGATA CAAGAGCGGA CAATACATGT TTGTAAATTG TGCTGCTGTC TCTCCATTTG AATGGTACTG TAAATTTGAA GAACCATGAT TAGCTCTTAG GTTAAATATA  TTATAATCGA ACCCCGAGCA TTTTGTTAAA TACTATTGTT TATGCTTTCA CAGGCATCCA TTTTCTATAA CCTCCGCCCC AGGGGATGAC TACCTCAGCG TTCACATCCA AGGTTCAGGT  GACTGGACCA AGAGTCTCAT AAAAGAATTC TCAAAGGTGT GTATCCAATT TAACTTTTGT TGGTTATGCA GCGTAACTTA TGCCATTACA ATTATATATA TTTGGACATT TTAGGTAGGC  CAAACTCACT ACTACATGTA TATCAGTCGC TTATATGTTT ATTTGAACTT TTTAGAACAA AAATCTTGGA CACACATTGC TATTACTACA ATATTTATTT TATTCGCGTT CGGGTGCAAA  TGCAAATATC ACAAGAAAAA AAAAAAAAAA AAAAAAAAAA CTATTAATTA GTTATTTGCA AATGAAAAAT GCTATGTGTA TTGAATTGAT GCATGTGAAT CTTTACAGAA GTGAAATTAG  CCTGTTTTGA TTGTATCTCA AATGTTGTTG ACTCTGGTTT TAACAGCCAT ATCACCGCTT TGATTGGCCA ATTTTTTTTC GGGAAGCCTT CCTGGACAAT AATTCTTTTG CTGTATATAG  CAAATACACA TTCAATCCAA ATTTCTATGC AAATAAACTC TAGGTTATTG ATTTGCTTCT TTCAGAGATA TCATCAAACG GCCCATGGGA ATAATGGACT CCTAAGAGCT GAAAACGTGC  CAGGAGATAG CAGCCCAAGG TAACATGCAC ATACTTACTC CGTATTTCTT TTCATAAGCA CTTTGTAGTT TCCCCAAAAA GGGAGGAGGG AGTAACAAGT AACAAGTGAT GTTTTATTAT  TGTATTATTA TTACTATGCA CTTGCAGTAC TCGCCCTAAA GTTCGGATTG ACGGTCCTTA TGGAGCGCCT GCACAGGACT ACAAGCAGTA CGAGGTGGTT TTACTTGTTG GCCTGGGAAT  TGGGGCTACC CCAATGATAA GTATAATAAA GGACATTTTG AATAATTCCA AGGCCATAGA ACAGGAGGAA GGGAGCACCA TAGAAGAGGG AACAGGTGGC AAATCACCAA GATCATCACA  ACGCAAGAAA ACCGGTTTAA ATAACTTCAA AACTAGAAAG GCTTATTTTT ATTGGGTGGC GGCGAAACAA GGTTTCTTTG ATTGGTTTAA AGATGTAATG AATGAGGTGG TGGAAGAAGA  CCGTAGGAGA GTAATTGAGA TCCACAGTCA CTTGACTAGT GTATATGAAG ACGGTGATGC TCAATCTGCT CTTATTGCTA TGCTTCAATC ACTAAACCAT GCTAAAAATG GTGTGGATAT  CTTGACTGGA ACACCCGTCA AGTCTCACTT TGCTAGACCA AAATGGTGCA GCGTCTACAA GCGCATTGCA CTTAATCATC CACAAAAACG CATTGGTGAG TTCCTATATA ATTCTTCGTG  TTTCTTTGGT TTCACTTGTG TTACTGCAAT TTTTTTAAAA ACTTTTTTTA GTGCTTCAAT AAAATTATTA TTCACTGTAA TTTGTGAAAT TTCCCGTGAT TTTAAACATA AACTTCAACT  AACATCTTTT AACTTCAGTC AAAAATCTAA CATCTCTGTA TTTTATGTAG TAACTTAAAA ATAGAAATCA AGTGGGATTG TATCACATAA ATGGTTACTC TTCCAACTTT AAAAATAATT  CTTTTTCTTC AAAAAAACTA GTCATTTAAT TATTAATTTA ACGGTTTGGG GTATCATCAA TAGTATACTC AAATTTTTGG GTGTACCATA GAATTTGTCT TATCGATATC TATCTACATT  GACATGGAGA CACCTTCCTT GTACTAGTAC CATTTTGATT ATGAATTTTA AAGTTTTTTC TGTTGTTCAA AAAAGAAATG GTGCGGTTAA TGTTTAGTCT GTGTCACTGA GGAGTCAAGT  TTATGTGATG CAGGAGTGTT TTACTGTGGG AGACCTGATG CTATTCAAGA GCTTCGCGAC TTAGCTTTTG ATTTTTCTGG TAAGACAAGC ACCAAATTTG ATTTCCACAA GGAGAATTTC 
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