Entry information : LspPxDo01 (LspPOX)
Entry ID 4243
Creation 2006-12-28 (Marcel Zamocky)
Last sequence changes 2013-05-17 (Christophe Dunand)
Sequence status complete
Reviewer Not yet reviewed
Last annotation changes 2013-05-17 (Christophe Dunand)
Peroxidase information: LspPxDo01 (LspPOX)
Name (synonym) LspPxDo01 (LspPOX)
Class Short peroxidockerin    [Orthogroup: PxDo001]
Taxonomy Bacteria Cyanobacteria Lyngbya
Organism Lyngbya sp.    [TaxId: 28073 ]
Cellular localisation Cytosolic
Tissue type N/D
Inducer N/D
Repressor N/D
Best BLASTp hits
Perox score E-value LspPxDo01
start..stop
S start..stop
CYspPxDo-rel 585 0 144..661 27..556
CYspPxDo2 579 0 144..661 27..549
CwaPxDo01 564 0 143..661 26..555
MchtPxDo-rel 547 0 143..661 30..544
Gene structure Fichier Exons
ExonStart..EndSize ExonStart..EndSize ExonStart..EndSize ExonStart..EndSize
N° 1 4786..6771 1986  
complement(4786..6771)


exon

Literature and cross-references LspPxDo01 (LspPOX)
Literature Zamocky M., Jakopitsch C., Furtmüller P.G., Dunand C., Obinger C. (2008) The peroxidase-cyclooxygenase superfamily: reconstructed evolution of critical enzymes of the innate immune system. Proteins 72:589-605
Protein ref. GenBank:   EAW37421.1 UniProtKB:   A0YN25
DNA ref. GenBank:   NZ_AAVU01000010.1 (6771..4786)
Protein sequence: LspPxDo01 (LspPOX)
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   661
PWM (Da):   %s   71564.57  
PI (pH):   %s   3.79
Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
.........1.........2.........3.........4.........5.........6.........7.........8.........9.........0.........1.........2
MQNNGNGNGN GNGNGSSKGS GNDDVYENNN SRRQAYDLTS LEQTPLSEIQ GLAIAKNPDW YKIQVSPGTT SLSVDLQFTH ADGNIDLFLH NANGNEIASS TSQTNNESIN FDSPTAGVYY  IKVKSIGKPG NSYDLVWDDI VPIEFRSIEG LNNNLVNPDW GTPDSQLIRL SESAYNDEIS EPRGGDPSSL VSPREVSNTI FDQSESIPNE TGVSDWFWQW GQFIDHDMDL TPGTSGESFN  ISVPLGDPSF DPFNSGTQEI PLTRSIYDFD TGIDSPREQI NEITAYIDGS NVYGSDSERA EALRTNDGTG KLKTSVSESG EVLLPFNTDG LDNDNPFGIA NDSIFVAGDV RANEQVGLTA  THTLFVREHN RLADDIATRL DNGDAELLDL FAESGLSEGD FIYESARRIV GAEIQAITYN EFVPLLVGSN ALDGYDGYNV TVDSGISNEF STAAFRFGHT MLSPTLQNGT NEGLSLRDTF  FNPDLVVEGG VDSLLLGLAS QEAQEVDTQV IDDVRNFLFG APGSGGLDLV SLNIQRGRDH GLPSYTEVRE ELGLDPITNF GEITSDPIVQ AQLESAYTDV DNIDLWVGGL AEDHVNGSLF 
GETFQVIVVD QFTRLRDGDR FYYENDNLLS VLAPDVAETT LSDVIVANSA ISSIQSNAFL V 

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Remarks Complete sequence from genomic (no intron). Strains="PCC 8106"&"CCY9616".
DNA
Send to BLAST
.........1.........2.........3.........4.........5.........6.........7.........8.........9.........0.........1.........2
ATGCAAAACA ATGGAAATGG AAATGGAAAT GGAAATGGCA ACGGTTCTTC TAAGGGTTCC GGTAATGATG ATGTCTATGA AAATAATAAT TCTCGCAGAC AAGCCTATGA TTTAACGAGT  CTTGAACAAA CCCCTTTGAG TGAAATTCAA GGACTTGCGA TCGCCAAAAA CCCCGACTGG TATAAAATTC AAGTAAGTCC AGGTACAACG AGTTTATCGG TTGACTTACA ATTTACTCAT  GCAGATGGAA ATATTGATCT TTTCCTTCAT AATGCTAATG GTAATGAAAT TGCGAGTTCA ACTTCACAAA CTAACAACGA AAGTATTAAC TTCGACTCTC CAACTGCGGG TGTATATTAT  ATTAAAGTCA AGTCTATTGG TAAGCCCGGA AATTCTTATG ATCTAGTTTG GGATGATATT GTTCCTATTG AATTTCGCTC AATTGAGGGT TTAAATAATA ATCTAGTAAA TCCTGATTGG  GGAACTCCAG ACTCGCAGTT AATTCGGTTA AGTGAATCGG CTTATAATGA TGAAATTTCT GAACCCCGAG GGGGCGATCC GTCTTCGTTA GTAAGTCCGA GGGAAGTTAG TAATACAATT  TTTGATCAAT CTGAGTCCAT TCCAAATGAA ACAGGGGTGA GTGATTGGTT TTGGCAATGG GGACAGTTTA TTGATCATGA TATGGATTTA ACTCCAGGAA CTTCTGGTGA ATCTTTTAAT  ATTTCTGTTC CTCTTGGTGA TCCATCTTTT GATCCATTTA ATAGCGGAAC TCAAGAAATT CCCTTAACTC GATCTATTTA TGATTTCGAT ACCGGAATAG ATAGTCCCAG AGAACAAATT  AATGAAATAA CTGCTTATAT TGATGGTTCT AATGTGTATG GATCTGATAG CGAACGAGCC GAAGCATTAC GCACCAATGA TGGTACTGGG AAGCTGAAAA CGAGTGTTAG TGAGAGTGGA  GAGGTTTTAC TTCCTTTTAA TACTGATGGG TTAGACAATG ATAATCCATT TGGGATTGCA AATGATTCTA TTTTTGTTGC TGGAGATGTT CGCGCTAACG AACAAGTGGG GTTAACGGCG  ACTCATACAT TATTTGTTCG GGAACACAAT CGACTCGCCG ATGATATTGC GACTAGGTTG GATAATGGAG ATGCAGAATT ACTGGACTTA TTTGCAGAAT CTGGACTGAG TGAAGGTGAT  TTTATTTATG AGTCTGCTCG TCGAATTGTG GGTGCAGAAA TTCAAGCGAT TACTTACAAT GAATTTGTAC CATTATTAGT CGGTTCTAAC GCTTTAGATG GATATGACGG CTACAATGTA  ACGGTTGATA GCGGAATTAG CAATGAATTT TCTACAGCAG CTTTTCGCTT TGGACATACG ATGCTTTCGC CAACTTTGCA AAACGGAACC AATGAGGGTT TATCGCTGCG AGACACCTTC  TTTAATCCCG ATTTAGTTGT TGAAGGTGGA GTTGATTCTC TGTTGTTAGG ATTAGCCTCT CAAGAAGCAC AAGAAGTTGA TACTCAAGTT ATTGATGATG TGCGGAATTT TCTGTTTGGC  GCACCGGGAT CGGGCGGTTT AGACTTAGTT TCACTAAATA TTCAAAGAGG ACGTGATCAT GGTTTACCGA GTTATACTGA AGTTCGTGAA GAATTGGGTT TAGATCCGAT TACCAATTTT  GGTGAGATTA CTTCTGATCC GATTGTACAA GCGCAATTAG AAAGTGCTTA TACTGATGTT GATAATATTG ATTTGTGGGT GGGAGGACTC GCCGAAGATC ATGTTAATGG ATCGTTATTT  GGAGAAACGT TTCAAGTCAT TGTTGTGGAT CAATTTACTC GCTTACGAGA TGGCGATCGC TTTTATTATG AAAATGACAA CTTGTTATCG GTACTTGCTC CTGATGTCGC CGAAACAACC 
CTTTCTGATG TAATTGTTGC CAATTCTGCG ATTAGTAGTA TTCAAAGCAA CGCTTTCTTA GTGTAA 

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CDS
Send to BLAST
.........1.........2.........3.........4.........5.........6.........7.........8.........9.........0.........1.........2
ATGCAAAACA ATGGAAATGG AAATGGAAAT GGAAATGGCA ACGGTTCTTC TAAGGGTTCC GGTAATGATG ATGTCTATGA AAATAATAAT TCTCGCAGAC AAGCCTATGA TTTAACGAGT  CTTGAACAAA CCCCTTTGAG TGAAATTCAA GGACTTGCGA TCGCCAAAAA CCCCGACTGG TATAAAATTC AAGTAAGTCC AGGTACAACG AGTTTATCGG TTGACTTACA ATTTACTCAT  GCAGATGGAA ATATTGATCT TTTCCTTCAT AATGCTAATG GTAATGAAAT TGCGAGTTCA ACTTCACAAA CTAACAACGA AAGTATTAAC TTCGACTCTC CAACTGCGGG TGTATATTAT  ATTAAAGTCA AGTCTATTGG TAAGCCCGGA AATTCTTATG ATCTAGTTTG GGATGATATT GTTCCTATTG AATTTCGCTC AATTGAGGGT TTAAATAATA ATCTAGTAAA TCCTGATTGG  GGAACTCCAG ACTCGCAGTT AATTCGGTTA AGTGAATCGG CTTATAATGA TGAAATTTCT GAACCCCGAG GGGGCGATCC GTCTTCGTTA GTAAGTCCGA GGGAAGTTAG TAATACAATT  TTTGATCAAT CTGAGTCCAT TCCAAATGAA ACAGGGGTGA GTGATTGGTT TTGGCAATGG GGACAGTTTA TTGATCATGA TATGGATTTA ACTCCAGGAA CTTCTGGTGA ATCTTTTAAT  ATTTCTGTTC CTCTTGGTGA TCCATCTTTT GATCCATTTA ATAGCGGAAC TCAAGAAATT CCCTTAACTC GATCTATTTA TGATTTCGAT ACCGGAATAG ATAGTCCCAG AGAACAAATT  AATGAAATAA CTGCTTATAT TGATGGTTCT AATGTGTATG GATCTGATAG CGAACGAGCC GAAGCATTAC GCACCAATGA TGGTACTGGG AAGCTGAAAA CGAGTGTTAG TGAGAGTGGA  GAGGTTTTAC TTCCTTTTAA TACTGATGGG TTAGACAATG ATAATCCATT TGGGATTGCA AATGATTCTA TTTTTGTTGC TGGAGATGTT CGCGCTAACG AACAAGTGGG GTTAACGGCG  ACTCATACAT TATTTGTTCG GGAACACAAT CGACTCGCCG ATGATATTGC GACTAGGTTG GATAATGGAG ATGCAGAATT ACTGGACTTA TTTGCAGAAT CTGGACTGAG TGAAGGTGAT  TTTATTTATG AGTCTGCTCG TCGAATTGTG GGTGCAGAAA TTCAAGCGAT TACTTACAAT GAATTTGTAC CATTATTAGT CGGTTCTAAC GCTTTAGATG GATATGACGG CTACAATGTA  ACGGTTGATA GCGGAATTAG CAATGAATTT TCTACAGCAG CTTTTCGCTT TGGACATACG ATGCTTTCGC CAACTTTGCA AAACGGAACC AATGAGGGTT TATCGCTGCG AGACACCTTC  TTTAATCCCG ATTTAGTTGT TGAAGGTGGA GTTGATTCTC TGTTGTTAGG ATTAGCCTCT CAAGAAGCAC AAGAAGTTGA TACTCAAGTT ATTGATGATG TGCGGAATTT TCTGTTTGGC  GCACCGGGAT CGGGCGGTTT AGACTTAGTT TCACTAAATA TTCAAAGAGG ACGTGATCAT GGTTTACCGA GTTATACTGA AGTTCGTGAA GAATTGGGTT TAGATCCGAT TACCAATTTT  GGTGAGATTA CTTCTGATCC GATTGTACAA GCGCAATTAG AAAGTGCTTA TACTGATGTT GATAATATTG ATTTGTGGGT GGGAGGACTC GCCGAAGATC ATGTTAATGG ATCGTTATTT  GGAGAAACGT TTCAAGTCAT TGTTGTGGAT CAATTTACTC GCTTACGAGA TGGCGATCGC TTTTATTATG AAAATGACAA CTTGTTATCG GTACTTGCTC CTGATGTCGC CGAAACAACC 
CTTTCTGATG TAATTGTTGC CAATTCTGCG ATTAGTAGTA TTCAAAGCAA CGCTTTCTTA GTGTAA 

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