Entry information : BrPrx36-1Aa_other (Bra036842/Brara.I03438[1.3])
Entry ID 4247
Creation 2006-12-26 (Christophe Dunand)
Last sequence changes 2017-04-24 (Christophe Dunand)
Sequence status complete
Reviewer Not yet reviewed
Last annotation changes 2017-04-24 (Christophe Dunand)
Peroxidase information: BrPrx36-1Aa_other (Bra036842/Brara.I03438[1.3])
Name (synonym) BrPrx36-1Aa_other (Bra036842/Brara.I03438[1.3])
Class Class III peroxidase    [Orthogroup: Prx001]
Taxonomy Eukaryota Viridiplantae Streptophyta Brassicaceae Brassica
Organism Brassica rapa    [TaxId: 3711 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type N/D
Inducer N/D
Repressor N/D
Best BLASTp hits
Perox score E-value BrPrx36-1Aa_other
start..stop
S start..stop
BoPrx36_other 676 0 1..337 1..337
BnPrx36-1C_other 672 0 1..337 1..337
BnPrx36-1A_other 664 0 1..320 1..320
TsPrx36 608 0 1..337 1..337
Literature and cross-references BrPrx36-1Aa_other (Bra036842/Brara.I03438[1.3])
Literature Kwon,S.J., Yang,T.J., Kim,J.A., Park,J.Y., Kim,J.S., Jin,M., Lim,K.B., Lim,M.H., Choi,B.S., Seol,Y.J. and Park,B.S. Korea Brassica Genome Project (KBGP).
DNA ref. GenBank:   AC189508 (45078..46686)
Protein sequence: BrPrx36-1Aa_other (Bra036842/Brara.I03438[1.3])
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   337 (313)
PWM (Da):   %s   37369.49 (34591.0)  
PI (pH):   %s   6.5 (6.04) Peptide Signal:   %s   cut: 25 range:25-337
Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
MAKPVMCIVL TQIVLVALFH LCMSSQTKEC TSTSSLSPQF YDNSCPKAQA IVQSFVAKAH SNDPRMAASL LRLHFHDCFV NGCDGSLLLD NSGTIESEKR AVTNVDSARG FEVIDDIKSA  LEDECPQTVS CADILALVAR DTTVITGGPS WEVYLGRRDA REASLIASNN NIPVVSSTFE TIVTKFNDQG LGLIDLVALL GGHTIGNSRC KSFRKRLYNH SGNSDRDQTL NQNYASMLQQ 
GCPISGDDQN LFALDYMTPN KFDNYYFKNL MTFKGLLSSD EILYTKSRDS MELVKLYGAN EELFFEQYAK SMVKMGNISP LTGRNGEIRR ICRRVNH* 

Retrieve as FASTA  
Remarks Complete sequence from genomic (3 introns). Cultivar=Inbred line Chiifu,
Promoter
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Send to cis Analysis
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
CGGTGTACAT TTAAAACTTG ATACGTGGCG CTGACCACTA CACCAACGTT TTAGGTGATC GCCACGTGTG ATTCTCGTAA TCAACACTAA ATTATTTTCA TGTATGACAT TCCTATCCGA  TGCCGGTTCT ATAAAAAGCA TTATTGATGA GCTTATGAAT CTTCATCGAG GATAAGACTA TATCTACTCA AAAGCTAAAA CAAGTCGAAG AGGAACATTA ATGGAGTCTT ACCAAAACCA  GTCCGGAGCG CAGCAGACTC ACCCTCAGCT TGACCAGTAC GGGAATCCAG TCCCAATAGG CACCGGGGCA TATGGAGGAG CTCCAGTCAT GGCTGGTCAT CACACAGAAG GTGGTGGTGG  TTTGAGCGGA ATGCTTCACC GCTCTGGAAG TAGCTCTAGC TCTAGTTCTA GCTCGGTACG ATATACTTGC TTCTCTTTCC TTTATTTTCT ATACAACTAA ATTTGTTACG CAACATTTTA  AATTTTCAAT AAATTAATGT GTACTAATTC ACTCTAGTAG TTACTTTAGT ATCATAAACG ATATCAAATG TTTCATTTAT TTTAACTTCA AGTCACAGGA ACATGTTGGT TAGAAGTTTA  GACTATAAAC CATGTAGTAA ACTAGTGATC GCATATTCTC ATATATAAAC AATCCCTAGT AATGATCATG TTTTCCAATA CCAGAGTTCA TTACAATACC TTTTGTTTGG TTTTATTTTA  GGGTAATATT TTTGTTGTAG TGATTCTTTT CATCCCTTAA AATTTATGGT AACCACTCAT TATATTTACA CCATTTAATA GAACTAATTT TTATATTCAT TCTCATTCTT TTATTTTTTA  CAAAATTATA TAACAAAATA TTATTTATCA AACTTTGAAA GGAAACAATC ATTAAAAAAA ATCATTTTGT TTGTATTATC TTTTCATTCC TTTTATTCTT TTAGCGGACA TCGGCTAAAT  GATTAATTTA AGTTATGGTT GGCGTTTTGA AGTATATATC ACAATTGGCA TGCAGGAGGA CGATGGACTA GGTGGGAGGA GGAAGAAGAA GGGAATCACG GCGAAGATAA AAGAGAAGCT  GCCAGGTCAT CATGGGTCCC ACCAGACTTC TTCAGCGACC AGCACCATAC CCGTTTATGA TGCAACCGGC ACTGGCGCCG TTCACCACGA GAAGAAAGGC ATCATGGAGA AGATCAAAGA  GAAGCTTCCC GGCGGTCATC ATTAGATTAA TTTTAATCAA ACTTTCTTGC ATGTACTAAA GTGTTGTGTA TCACGTAATA ATGTAACGAC GTGGCTTTTT AAGTCAGAAT GTACATAAAC  ATAATGACGT GGCTTTGTAA GGCATATTTT TGTTACGCGT ATGGTGGTTG CATGTGATGT AATGCAACTG ATAGGGTTAA ATTTCGTGGA ATTGATATAA AATCTCTATT TTGGCTTTTG  CTTTCAAATT GTTTTAAGTG AGTAGAGATC ATGTTTTTCA GTACACGGGT CGATTCCCGA GTCCATTGGC ATCTTCCTAA TTTGATTAAC AAAAAGATAC TGACGTCTAT CGTAAGCGAC  GTAATGCCTA ACCAATCATT TATGACAGCA TTTTCAACCC CAAAGAAACA AGCAGTCGTT ATAATTCGTA TTTTTTACCT TTTTTCACCC AAAAGACAAT ACACCATGAC CAAGTGATAG  TCCAAATGTT CAATGCATAC ATGGATACAT ATAATACTGA TGACGCTTTT GGGTACTACT TGAAGTTCTG TAAGACTGTA CTTAATTAAT AACACATTAA CATTTTATTG GGGTATACAT  AAAACTAAAT ATTAACTAGA AATTTAGAAT ATAATAGACA GTATGAGTAC CAAATACTCA CATTGAATGT GCCCATCTAA CTGTCCAGAA AGCAAAGTTT AGGTAAGTAC AGTATAAGGT 
AACTAATCAA GTCCATCTAT AAATTAAATG AAACCATGCA TTCCACGCAA TAATCACTAG TCCCAAAAAC TCGAAAAAGA ATCAA 

Retrieve as FASTA  
DNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGGCAAAGC CAGTAATGTG CATTGTTCTC ACTCAAATCG TCCTCGTTGC CTTATTTCAT CTTTGTATGA GTTCTCAAAC CAAAGAATGC ACGAGCACAT CCTCCCTCTC CCCTCAGTTT  TACGACAACT CGTGCCCTAA AGCCCAAGCC ATTGTCCAAT CTTTCGTCGC CAAAGCACAC TCCAACGACC CTCGCATGGC GGCCTCATTG CTTAGGCTTC ATTTCCATGA CTGCTTCGTC  AATGTTTGAC AAAATTTAGT TTCTTTTCAA TAACAATGTT TATGGATAAA ACTTAATAAT GCCTTCTTTT CTTGGGTGGT ACAGGGATGT GATGGTTCTT TATTATTAGA CAATAGTGGA  ACCATAGAAA GCGAGAAACG AGCAGTCACA AACGTAGACT CTGCCCGAGG GTTTGAAGTC ATCGACGATA TCAAGTCTGC CTTGGAAGAT GAGTGTCCCC AAACAGTTTC TTGCGCTGAT  ATTTTGGCTC TCGTTGCTAG AGACACTACT GTTATTGTAA GTCAATTCCC GTATTAATAT TATTACGAGG ACTCGTTAAT TAACTCAGTT ATATACAGAC TGGTGGCCCG AGTTGGGAAG  TATATTTAGG AAGAAGAGAT GCAAGGGAAG CAAGCTTGAT TGCTTCTAAC AACAATATTC CTGTTGTCAG CTCTACGTTT GAGACAATTG TCACCAAGTT CAACGACCAA GGACTCGGTC  TTATCGATCT TGTTGCTCTC TTAGGTACTA TAGTTCATTC AAATTATTGG TGGTAAACAT ATTATTCGAT CAACTTATAA TTTTTTTATT TTTTGAAAAA GGCTAAAAAT ATAGATTTGA  AAATACTAAT TAGTTATGCT AATATTAAGA AAATGTACCA ACCGAGTCTA TGATTATGTT TTGTAGTCTA CGATTTAGTT GTTCTTGGGT AAAGTTTAGG AATTGAATGT TAAGTTTAAT  TTTAATTAGT TATAAGAAAA TCAAATTTTA CCGGTTTAGA GTTTGTGTTA CAGTTTTTGT TAATTTGGAA AAAAACTATA TAATATGTGT ATATATATTT ATATATATAT ATATATATAC  AGTTTTCTTT ATTGTGGCAA AATACATTTT GTCTCTGTTT CAACATAATG CCTCATACGT TCTGTCAAAT TGCATGAACC ATTACGTAAT AGTAGTATTG TTATATTTTA GAATTAAAAG  CTATCATTTG AATGTAGGAG GTCATACGAT AGGAAATTCG AGGTGCAAGA GCTTCCGAAA AAGGCTATAC AACCATTCTG GAAATAGCGA TCGTGACCAG ACTTTGAATC AAAACTACGC  CTCAATGTTG CAGCAGGGAT GTCCTATTTC TGGTGACGAC CAGAACCTCT TTGCTCTCGA CTATATGACG CCAAATAAGT TTGATAACTA CTACTTCAAG AATCTGATGA CGTTTAAAGG  ACTCCTGAGC TCTGATGAGA TTTTGTACAC AAAGAGTCGA GACTCCATGG AGCTGGTCAA GCTTTACGGG GCGAATGAGG AATTGTTCTT TGAGCAGTAT GCAAAGTCAA TGGTGAAGAT 
GGGAAACATC TCGCCGTTAA CGGGGAGAAA TGGTGAGATC CGGAGGATCT GTAGGAGAGT TAACCATTGA 

Retrieve as FASTA  
CDS
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGGCAAAGC CAGTAATGTG CATTGTTCTC ACTCAAATCG TCCTCGTTGC CTTATTTCAT CTTTGTATGA GTTCTCAAAC CAAAGAATGC ACGAGCACAT CCTCCCTCTC CCCTCAGTTT  TACGACAACT CGTGCCCTAA AGCCCAAGCC ATTGTCCAAT CTTTCGTCGC CAAAGCACAC TCCAACGACC CTCGCATGGC GGCCTCATTG CTTAGGCTTC ATTTCCATGA CTGCTTCGTC  AATGGATGTG ATGGTTCTTT ATTATTAGAC AATAGTGGAA CCATAGAAAG CGAGAAACGA GCAGTCACAA ACGTAGACTC TGCCCGAGGG TTTGAAGTCA TCGACGATAT CAAGTCTGCC  TTGGAAGATG AGTGTCCCCA AACAGTTTCT TGCGCTGATA TTTTGGCTCT CGTTGCTAGA GACACTACTG TTATTACTGG TGGCCCGAGT TGGGAAGTAT ATTTAGGAAG AAGAGATGCA  AGGGAAGCAA GCTTGATTGC TTCTAACAAC AATATTCCTG TTGTCAGCTC TACGTTTGAG ACAATTGTCA CCAAGTTCAA CGACCAAGGA CTCGGTCTTA TCGATCTTGT TGCTCTCTTA  GGAGGTCATA CGATAGGAAA TTCGAGGTGC AAGAGCTTCC GAAAAAGGCT ATACAACCAT TCTGGAAATA GCGATCGTGA CCAGACTTTG AATCAAAACT ACGCCTCAAT GTTGCAGCAG  GGATGTCCTA TTTCTGGTGA CGACCAGAAC CTCTTTGCTC TCGACTATAT GACGCCAAAT AAGTTTGATA ACTACTACTT CAAGAATCTG ATGACGTTTA AAGGACTCCT GAGCTCTGAT  GAGATTTTGT ACACAAAGAG TCGAGACTCC ATGGAGCTGG TCAAGCTTTA CGGGGCGAAT GAGGAATTGT TCTTTGAGCA GTATGCAAAG TCAATGGTGA AGATGGGAAA CATCTCGCCG 
TTAACGGGGA GAAATGGTGA GATCCGGAGG ATCTGTAGGA GAGTTAACCA TTGA 

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