Entry information : LePrxII02(Solyc07g020860.2.1/TPx1 / LePrxIIB)
Entry ID 4445
Creation 2007-01-30 (Nicolas Rouhier)
Last sequence changes 2007-01-30 (Christophe Dunand)
Sequence status complete
Reviewer Not yet reviewed
Last annotation changes 2019-10-24 (Christophe Dunand)
Peroxidase information: LePrxII02(Solyc07g020860.2.1/TPx1 / LePrxIIB)
Name LePrxII02(Solyc07g020860.2.1/TPx1 / LePrxIIB)
Class Atypical 2-Cysteine peroxiredoxin (type II)    [Orthogroup: PrxII001]
Taxonomy Eukaryota Viridiplantae Streptophyta Solanaceae Solanum
Organism Lycopersicon esculentum (Tomato)    [TaxId: 4081 ]
Cellular localisation N/D
Tissue types Callus
Fruits
Leaves
Mixed tissues
Roots
Seeds
Inducer N/D
Repressor N/D
Best BLASTp hits
Perox score E-value LePrxII02
start..stop
S start..stop
CanPrxII 306 3e-109 1..162 1..162
NtPrxII02a 304 2e-108 1..162 1..162
NtPrxII02b 304 3e-108 1..162 1..162
EguPrxII03 292 1e-103 1..162 1..162
Literature and cross-references LePrxII02(Solyc07g020860.2.1/TPx1 / LePrxIIB)
Literature Kampranis,S.C., Sheikhali,J. and Makris,A.M. Lycopersicon esculentum thioredoxin peroxidase 1
Protein ref. UniProtKB:   Q7Y240
Cluster/Prediction ref. UniGene:   Les.4388
Protein sequence: LePrxII02(Solyc07g020860.2.1/TPx1 / LePrxIIB)
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   162
PWM (Da):   %s   17312.89  
PI (pH):   %s   4.99
Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
MAPIAVGDVI PDGTVSYFDE QDQMQTVSVY SLAKGKKVII FAVPGAFTPT CSMKHVPGFI EKAAELKSKG VDEILCISVN DPFVMKAWAK TYPENKHVKF LADGAGKYTH ALGLELDLSD 
KGLGVRSRRY ALLVDDLEVK VANIESGGEF TVSGADEIVN AL 

Retrieve as FASTA  
Remarks Complete sequence from genomic and 44 ESTs.
DNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGGCTCCAA TCGCCGTTGG TGACGTCATC CCCGATGGTA CCGTATCTTA CTTCGACGAG CAAGATCAGA TGCAGACCGT CTCAGTATAC TCACTTGCTA AGGGCAAGAA GGTCATCATC  TTCGCCGTTC CCGGAGCTTT CACTCCCACT TGCAGGTTCT AATTAATTTT ATCCTTTTTT CTAACGAATG GTGAATCCGA TCTATGATAT TTAACTATGA AATGTTGTAT TCAGCATGAA  GCATGTGCCT GGCTTTATTG AAAAGGCTGC TGAGTTGAAG TCAAAGGGTG TCGATGAAAT CCTCTGCATC AGTGGTATCT TTCTTCTCCA TCTATATTTA ATTTTTTTAT TTCGTTGTTT  AACTTATTAG CGATCAGTAA ACATTTACCT TTAAGATCTG AGAAAGCTTC TTAGCGATTG AAAGTTCCTA TGGTTTGAGT TTAGGCTCTT TTGCAGAGTA TATATCTTTT GGAAAGATTT  CACGTGGTTA TATGGCAGAT ACCGCCAATG AAGTTCTCAA TAAAACTTGT TAAGAGTCTT AAAATGAACT AAAGCTGATA AGAATGACTG GAAGCTTTGT ATTTCTTTTT CTTCTTGGTT  TGAAAAATAC AAAATTCAAT CCTCATTGCA TTTTAAAGCT ACGGAAAACA ATATATGATT TTTCATTACT TTACTCGTAG CAATAAGCAC AAGGAGTTGA GAATTTGTTC TGAGGTGGGT  TGAAACTTGA AACTCTCGGG AGTTAATGCT CTTCTTATTG TTCTTAAAAA ACTACCCTCA CTGTCTAGTT TACCACTGTG TAACCACCGT CATGCTTCAT GTCTTCTTCA CCTTTTTTCT  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TGAAAGTAGC TAACATTGAA TCTGGAGGGG AGTTCACGGT CTCCGGTGCT GATGAAATCG TCAATGCTCT TTAA 

Retrieve as FASTA  
CDS
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGGCTCCAA TCGCCGTTGG TGACGTCATC CCCGATGGTA CCGTATCTTA CTTCGACGAG CAAGATCAGA TGCAGACCGT CTCAGTATAC TCACTTGCTA AGGGCAAGAA GGTCATCATC  TTCGCCGTTC CCGGAGCTTT CACTCCCACT TGCAGCATGA AGCATGTGCC TGGCTTTATT GAAAAGGCTG CTGAGTTGAA GTCAAAGGGT GTCGATGAAA TCCTCTGCAT CAGTGTCAAT  GACCCCTTTG TGATGAAGGC CTGGGCAAAA ACTTACCCTG AGAACAAACA TGTAAAATTT CTTGCTGATG GAGCTGGAAA ATACACCCAT GCCCTTGGGC TGGAGCTTGA TCTGTCGGAT  AAGGGGCTTG GTGTTCGATC ACGAAGGTAT GCTCTTTTGG TTGATGACCT TGAGGTGAAA GTAGCTAACA TTGAATCTGG AGGGGAGTTC ACGGTCTCCG GTGCTGATGA AATCGTCAAT 
GCTCTTTAA 

Retrieve as FASTA  
cDNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
TAATATGACG GATGATATAT TTGTGTACCA CTTGCGAGTA TATTTATCCT TCGCCCATTA TAATTTAATA TTTATATATA TAAATCCCAC GGACCTCAAA ACTTATTAAT ATATATTATT  GGCCCTTCAC CTTCGCAGGA AGCTCAACAC AAATCTGTCA TCACTGTGCA ATCTCGTGTC AACCTAAGTA GCAGAAAAAT GGCTCCAATC GCCGTTGGTG ACGTCATCCC CGATGGTACC  GTATCTTACT TCGACGAGCA AGATCAGATG CAGACCGTCT CAGTATACTC ACTTGCTAAG GGCAAGAAGG TCATCATCTT CGCCGTTCCC GGAGCTTTCA CTCCCACTTG CAGCATGAAG  CATGTGCCTG GCTTTATTGA AAAGGCTGCT GAGTTGAAGT CAAAGGGTGT CGATGAAATC CTCTGCATCA GTGTCAATGA CCCCTTTGTG ATGAAGGCCT GGGCAAAAAC TTACCCTGAG  AACAAACATG TAAAATTTCT TGCTGATGGA GCTGGAAAAT ACACCCATGC CCTTGGGCTG GAGCTTGATC TGTCGGATAA GGGGCTTGGT GTTCGATCAC GAAGGTATGC TCTTTTGGTT  GATGACCTTG AGGTGAAAGT AGCTAACATT GAATCTGGAG GGGAGTTCAC GGTCTCCGGT GCTGATGAAA TCGTCAATGC TCTTTAAGCT TATCACTACT GCCTCCCAAG TGTTCTGGCT  CTACAATGAG CTTCTAGAAT CTATGCCAAT AATGTTTTTG ATATATCTGT AGTCGCTAAT ATCAAACTTT GTATGAAGAA TGCTTTGTGG AAATAAGAAT TTCTTGCTTT ACTAATGTGT  TGGAGGCAAA GAAACTGGCA ATATGTAAAA TTACTCTGGG GTGAGGTGTG GACAGTAGCG TTGTAACTAA AAAAAAAAAT ACTGAGATCT CGCAAATTAT TCACTCAATT TGCAACAGTA 
TCTTGTTCAC AAATTAAGGC TTAACTTAAG GCTATACATG TAAAAATTGG CTAAAT 

Retrieve as FASTA