Entry information : Ptro2CysPrx03 (PrxIII / PRDX3)
Entry ID 4497
Creation 2007-01-25 (Filippo Passardi)
Last sequence changes 2010-10-20 (Filippo Passardi)
Sequence status complete
Reviewer Not yet reviewed
Last annotation changes 2010-11-23 (Myriam Duval (Scipio))
Peroxidase information: Ptro2CysPrx03 (PrxIII / PRDX3)
Name (synonym) Ptro2CysPrx03 (PrxIII / PRDX3)
Class Typical 2-Cysteine peroxiredoxin    [Orthogroup: 2CysPrx001]
Taxonomy Eukaryota Metazoa Chordata Mammalia Hominidae Pan
Organism Pan troglodytes (chimpanzee)    [TaxId: 9598 ]
Cellular localisation Mitochondria
Tissue type N/D
Inducer N/D
Repressor N/D
Best BLASTp hits
Perox score E-value Ptro2CysPrx03
start..stop
S start..stop
Hs2CysPrx03 530 0 1..256 1..256
Pabe2CysPrx03 521 0 1..256 1..256
Mmul2CysPrx03 516 0 1..256 1..256
Mfa2CysPrx03 511 0 1..256 1..256
Gene structure Fichier Exons
ExonStart..EndSize ExonStart..EndSize ExonStart..EndSize ExonStart..EndSize
N° 1 119936708..119936743 36 N° 2 119934960..119935092 133 N° 3 119932393..119932534 142 N° 4 119931680..119931815 136
N° 5 119930475..119930578 104 N° 6 119927273..119927438 166 N° 7 119926579..119926632 54  
complement(join(119926579..119926632,119927273..119927438,119930475..119930578,1 19931680..119931815,119932393..119932534,119934960..119935092,119936708..1199367 43))


exon

Literature and cross-references Ptro2CysPrx03 (PrxIII / PRDX3)
DNA ref. GenBank:   NC_006477.2 (119936743..119926579)
mRNA ref. GenBank:   XM_001154193.1
EST ref. GenBank:   CB294907.1 [5' end]
Protein sequence: Ptro2CysPrx03 (PrxIII / PRDX3)
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   256
PWM (Da):   %s   27547.12  
PI (pH):   %s   7.88
Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
.........1.........2.........3.........4.........5.........6.........7.........8.........9.........0.........1.........2
MAAAVGRLLRASVARHVSAIPWGISATAALRPAACGRTSLTNLLCSGSSQAKLFSTSSSCHAPAVTQHAPYFKGTAVVNGEFKDLSLDDFKGKYLVLFFYPLDFTFVCPTEIVAFSDKANEFHDVNCEVVAVSVDSHFSHLAWINTPRNGGLGHMNIALLSDLTKQISRDYGVLLEGSGLALRGLFIIDPNGVIKHLSVNDLPVGRSVEETLRLVKAFQYVETHGEVCPANWTPDSPIKPSPAASKEYFQKVNQ*

Retrieve as FASTA  
Remarks Complete sequence from frpm genomic (chromo 10, 6 introns) and 4 ESTs (CB294908.1, CB294905.1, CB294906.1). Transcript variant 2 is identical. Variant 1 lacks a small part in the 3' region.
DNA
Send to BLAST
.........1.........2.........3.........4.........5.........6.........7.........8.........9.........0.........1.........2
ATGGCGGCTGCTGTAGGACGGTTGCTCCGAGCGTCGGTGAGTGGCTGTCGGCTGGGGACAGGCGTGGAGACACTGGTGGCTCCGGGAACGTGCTTCTCAGACAGGACCCCGCGCTTCTGG
GCATGAGGGCCATTCGCCCTTCTTGGAGGGTTTCCGCGGGTAACGGACCCAGAGGCCTCCCTCCGGGAAGGTTCCATGCGCCTGCGCAGAACCGCCCTTCCTCACTCCGTCCTCGCGGTC
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GACTGTGTACTTAAGATGGAAAGAATGATGCCTACATCAAGGCGTTGCTGTGAACAGCCCCTTAAATACTGGATAAAAACGCGCAAAGTGCTAAAAAACTCACAAAGGCTTTCCCTCCCA
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CCGAGATCGCGCCACTGCACTGTAGCCTGGGTAAAAGAGCGAGACTCTGTTTCAAAAAAAAAAAAAAAAAGTTGAGTAAACATGTCCCTTGAGCCTTTAACAGACTCCCAGAGGCTGAAT
TTGGCTCTTCTTGTTTACTTGTCGCTGGTGCTGGAGGGGCCTTGTTTTTCTAAGAAAAACCTTGAAATGGTAGAACATACTCAGCAGATAGTGCTGGGAAAAGCCTGCACAAGTCCCCTG
GCTTCTGAACCCTGTGTTGCTTTAAGCGCATGGAGTTTCTGTTTTTTTTGTTTTTTTGTTTTTTTTTTGAGACGGAGTATTGCTCTGTCGCCCAGGTTAGAGTGCAATGGCGCGATCTCG
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TTATAGTTCCTCTCCACCTTCCAGTCTCCTAGGAGAAGGAAGCAGAAGGGAGTGTTAAGAACATGCAGATCCAATCCATGCTCTTAGAGTTTGGGGTTTGCTATTTGGTTCACAGGAACA
GGGACAGCTGAAACCACCGTTGGCACGATGCCCTTTCAGCCTTCAGTCACCAGTCCAGGAAAACTTTCTAATAAAAAGTTTCTCTTTCCAGGTTGCCCGACATGTGAGTGCCATTCCTTG
GGGCATTTCTGCCACTGCAGCCCTCAGGCCTGCTGCATGTGGAAGAACGAGCTTGACAAATTTATTGTGTTCTGGTTCCAGTCAAGCAAAATTATTCAGCACCA
GTAAGTGTTATGTCAT
GTCTTGGCTGGAGCCAGGTAAAGGAAAAATGAACCATCGTCTCTGGACAGGGGCTCTGAACCCTGGCCAAACGTTAGAGTCACCTGGGAGCTTTCAGGAACACAGCACTGCCCCCGTCCC
ACCCCAGACAAGTTAGTCTCTGGGGTGAGACCAGGATGTGCCAGGTGATTCTAACGTGCAGCCAGGGTTGAGAATCACTGAGGCAAACTGCCCTTGTCACATTTCCATGTTGGTTGTCAG
AGCTTCTAATCCACTGTGTTGAGGAGGGTGTTACTGGGAGCTCAGATGCCTTCTGAGTCTAGTGTGTCTGAAGAGCTGTGAGTGGTGGGCAGCCTGTGGGGACCTGAGAGGGCAGCTGCT
CTAAGATTCAAACCTGTGTACTGGCCCCAGCTGGCCACTTAGGAACCAGACCTGTCTAATGGTATCTGTAATCTGAGTGAAATTTAGCTGTTTCTTGAGATTTACACTCCCTTCTCTAGG
ATATGGGCTTTGCTAAGATCAGCCTCAGATAATGAGTGGTAGTTGAAAATACCTTGTCTAGATTTGACTAGCCTTTGAAAAAGCACGTATTTAATATGTAATGGTTTGGGGGGATATACT
TTAGTAAAGCCTTTGTTTGTGGGCAAAATGTTCTAAGAGCTTTCGCAATTTTACTACCCTGGAGCTTCAAAATATTTCTAGTAGTGATGTGATACCACAGGCTTAAAACTTTACTCCACT
GGTTTCGAATCCTCATCCCCAGCAGCGCCTCCTGTTTCTGTTCATGGCGGTGTCAGGCATTTTGACATTGGAACTACTCTGTCGCTCATTCCTGGGTAGAAGCAAGTCCTTTTCAGTTTT
GACACATCTCTTGCATCCATTCCTTTCTGTTCTTTCTGCCCCATCCCTCCCCTCAATACGTCTAAGATCACTGAAATCGAGGCTGGGCACAGTGGCTCACACCTGTAATCCCAGCACTTT
GAGAGGCCAAGGCAGGCGAATTACTTGAGGTCAGGAGTTCAAGACCATCCTGGCCAACCTGGTGAAATCCCGTCTCTACTAAAAATACTTAAAAAAATAAGCCGGGTGTGGTGGTGTGCT
ACTGGAATCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGCAGGAGAATTGCTTGAACCTGGGAGGCGGAGGTTGCAGTGAGCCGAGACCATGCCACTACACTCCAGCCTAGGTGACAGAGCGAAACTC
TGTCTCAAAAAAAAAAAAATCACTGAAACCACCTCCTAACATGTCTCCCCCTTCCTCCTGCTCCTCTTTCCCTCCTGCCGGACTAATCTTCCTAAAAACCCCCATCTCAGCCAGGCACTG
TGGCTCACGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCGAGGCTGGCAGATCACGAGGTCAGGAGATCGAGACCATCCTGGCTAACACGGTGAAATCCCCTCTCTACTAAAAATACAAAAAA
TTAGCCGGGCGGGGTGGCGGGCGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGCCGGAGAATGGCGTGAACCCAGGAGGCAGAGCTTGCAGCGAGCTGAGATCGTGCCACTGCACTCCA
GCCTGGGTGAACAGAGCGAGACTCCGCCCTTGACTCTGTTATCTTTCCTGTTAAGAAGACCCAGCAGCCTGGTATTTAAGGACTGTTGCAACATGGCCTTCAACTATTCCTGCCTGCTGC
CTGCTCTTCACTCCGTACTCTTAGACACTCTCTGTTCTCATTAGACTGCCACACGCTGCTCCACACACATGTCCTGTCTTCCTTCCTGCTGTTTCCTACATGCCATCTGCCCCATCCCAT
CTAGACTTGACAAAATCTGAACCATATTTAAAATCCATCTCTAGTCTCATGTCTTCCTTAATTCTATCCCTACTTTGTCTTCCTCTTTTTAGTTTCCGTAGCACTTGGAATTGAATTTGT
GCACAATCTAAAACTATAGAAGGAGAAATTACAGTTGGCCCTCTGTATCTGGATTCTGCATCTGTGGTTGGTTGAATCGAAAATATTGGGAGGGAAAAATGGATGGTTGTGTCTATACTG
AACACAAAGTCTTTTTTCTTGTCATTCCCTAAACAATACAGCTTAACGACTATTTACGTAGCATTTACGTCGTATTAGGTATTATGAGTAATCTAGAGATGATTTAAGTATACTGGAGGG
TGTGTGTAGATTATATGCAAATCACCACTTTATGTAAGAGACTTGAGCATCTGTAGATTTCGATATCCTAGAACCAATCCCCCCACAGGTGGCAAAGGATGACTGTGCCTAAGATGTACA
GTTGAACCGAATGTTTTGATTTATACTAAGCACTTTATACTACTAATTAATTATGAGAAGTTTAAATAAAATCATAGGTGCTTGACATAGCAAATGATGAACTCCATATGAGTGTGGGTT
TTTTTTCAGGTTCCTCATGCCATGCACCTGCTGTCACCCAGCATGCACCCTATTTTAAGGGTACAGCCGTTGTCAATGGAGAGTTCAAAGACCTAAGCCTTGATGACTTTAAGGGGAAAT
ATTTGGTGCTTTTCTTCTATCCTTTGGATTT
GTAAGTGTAATTTCTATGATGCTTTCGTGTCATTCTGAGAGCAAGCACATATCCTGTTCCCGCACTGAATTGTCTATCCCTAGATACCC
TTGTGAAAGGAAGGATTCTTTCTGACCCTTTATCACTGATGGCCTTGTTGATTACAGCTGGGATCTGTAGCTTGTTTACAAGTGATAAACTTCGGGGGTGGGATAGGACAGCTTTCTTTA
TAGTACACCTCTGTGCTCTGGAGCACTGCTTCCCTAAGCCAGTCTATGAAAAAGTTTTCACTGGTCTGGGGAAAAATGAGAAAAGTAGGCATAATAAAATGATTTTTTTCAAAAAGCAAC
TTTATTGAACTGTAATTTTTTTTTCTTAAAATATGTGTTCCCTTTCCCCATTTTTTGATACAATTCCTAAAATAAAAAGGTGAGGGGAGGTAGTAGTACTTTTGCCAGCACAACACTATA
GTCCAGTGAGGATGGTAAACCATTTTGCCTTTTTTACCCTTAGCAAGTTGAACTAGTTGTTAGACCACTAATTGTTAAAATCCTTGTTTTTAAATGCTCTAATGAGAATTTCTATCCTTT
TTTTCCAGCACCTTTGTGTGTCCTACAGAAATTGTTGCTTTTAGTGACAAAGCTAACGAATTTCACGACGTGAACTGTGAAGTTGTCGCAGTCTCAGTGGATTCCCACTTTAGCCATCTT
GCCTGGATAAATACACCAAGAAAG
GTATAGCATTGTACCCCTAGCTTTTGCTCTTATAAACTTGCTTGGAAGAATCTAAATTTCTAGCTATGCTGCTGGACTATCAAGATCAAATTACGC
AAGGGTTGGGTTTTTTTGTTTTTTTTTTGAGACGGAGCTTCACTCTTGTGCCCAGGCTGGAGTGCAATGGCACAATCTCAGCTCACTGCAACCTCCGCCACCTGCGTTCAAGCAATTCTC
CTGCCTCAGCTTCCCGAGTAGCTGGGATTACAGGCATGTGTCACCACCCCTGGCTAATTTTGTATTTTTAGTAGAGACGGGGTGTCTCCCATGTGGTCACGCTGGTCTCGAACTCCTGAC
CTCANNNNNNNNNNGCTGGGCGTGGTGGCTCACGCCTGTAATCCCAGCACTTTGAGAGGCCGAGACAGGTGGATCACAAAGTCAGGAGATTGAGACCATCCTGGCTAACACGGTGAAACC
CCATCTCTACTAAAAATAAAAAAAATTAGCCAAGTGTGGTGGTGGGCGCCTGTAGTCCCAGCTACTTGGGAGGCTGAGGCAGGAGAATTGCTTGAACCCAGGAGGCGGTGGTTGCCATGA
GCCAAGATCGCACCACTGCACTCCAGCCTGCGCGACAGAGCGAGACTCCATCTCAAAATAAATAAATAAATAAATAAAATAATAAATAATTAGAAAAAGCATCTGTAGTCCCAGCTACTC
AGGAGACTGGGGTAGGATGATTGCATGAGCCCAGGAGTTTGAGGCTGCTGTGAGCTGTGATCGCATCACTGCATTCCAGCCTGGTGACAGCGAGACTCTGTGTCTTAAAAAAAAAATTGG
AAAAGGTCTGTAGTATTAGCCGGGTGTAAATCTTCCTTCTGCTTCTTTCTAGCTGGGACCTGGAACAAGTTACTTAGGTTTTTCTTGCCTCAGTTTCCTCATTCTGATAGTGTCTTCTCC
AGGGTGGTTTCGAGGAGGCAGTAGGTTAATAGAGTAAGCAGTGCTTGGCCCGTTGTTGAATTACTGTTACCTATCACCGTTATTGTTGGTCTCAAACATTGTGGTACGTGGTCAAGAATG
TTGTGAGGCCACACATTCTAACAGTCATGTTTGCATTTTGATTAGAATGGTGGTTTGGGCCACATGAACATCGCACTCTTGTCAGACTTAACTAAGCAGATTTCCCGAGACTACGGTGTG
CTGTTAGAAGGTTCTGGTCTTGCACTAAG
GTAAGATCCTGTTTCTGATGAACTTAAGATTATTTTTCATGTTTAGTATCATTCTACTTCTTAGGGGATTTATGTAGACCTTGGTAAAGCA
TTTTTAAAACCAGAAGATCCTGGCTGGGCATGGTGGCTCGTGCCTGTAATCGTAGCACTTTGGGAGGCCAAGGCGGGAAGATCACTTGAGTTCAGAAGTTCAAGACCAGCCTGGGCAACA
TAGTGAGACCTCATCCCTATTATATTAAAAAGAATTAAAATGTATAATAATCAAAAAATCCTTAATTTTAGTCTTTAATAAACACTGATAAAATGCCTCCTGCAAGGGTTGGCGGTCTCT
CAGAAATGCTGAGACATGCATGTCCCCTCCACCACCTTGGGTCTCTTTCTGAAGAAGGCTGTCTGCGTCTTGAGGCCACACTGCTCCATACTCCCTATGTGGGAGCCACTTCCATGGGGA
CACACACCTGACATTGAAGCCATCAGACTCTTTGCAGAAGGGGGGACTAGCAGGGTAAGAGGTAGTCTCTTGGAATGGTGACCATCTTCAGCCCTGGAACCAAACAATCCTTGGTTTGAG
TTTTTCTTTTTTTTTTAACTCAGCTACTTAATAGCTGTGTGACTTTGGGTAACTGATTTGATTTAACCTTGTTGAGCCCCAGTTTTCCCATAACTAAAATGAGGTGGTACCTCAAAGGTG
GGTGTGAGGATTAAATAGTGACACAGCTAGAGTTTTTAGCATAGTTACTGGCAGCAGTTGTTAGGATTTCTGCCCCAGAACATCATTTCTATCTGTATTCAGTCCCTTATTAAACCTTTA
TTCCTTTGAGTGTGAAAAGCTTTCAGTCCTCAGCAGCCCCACATTCAAACACAACCTTCCTGGGAGGGATGAGAACTTGGGTCTTAGAATTGGCATCTTGAAGTCTGCTGAGAATAGGAG
TGAAGGAGGGATAGGGCAGAACTTGACCTCCAGGAAGGAAGAGAGGGGATCCCCCTTTGATATGCTGTGCCTCACAGTTTTGCTGGGGGCTGATCAGCTTAAAGCCAGCTCACCTGGCCG
GGCGCGGTGGCTCACACCTGTAATGCCAGCACTTTGGGAGGCCGAGGCGGGTGGATCACGAGGTCAGGAGATCGAGACCATCCTGGTCAACATGGTGAAACCCCATCTCTACTAAAAATA
CAAAAAATTAGCTGGGCGTGGTGGTGGGCGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGCAGGAGAATGGCGTGAACCCGGGAGGCGGAGCTTGCAGTGAGCTGAGATCGCACCACTG
CACTCCAGCCTGGGCAACAGAGCAAGACTCTGTCTCAAAAGCAAACAAACAAACAAACAAAGCCAGCTCACCTGCCTCTCTTGTAGGTGACCTCTGGCCTGCTCTTTCTTGGGTTACACC
TTGGATTTTAGCGCTGAGTGGCATCTTAGAGTTTGGGCCTTTTTTTCCTCTCTTTTTTTTTTTCTTTTCTTTTCGAGACGGTGTCTTGCTTTATCGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGTGTG
ATCTCGGCTCACTGCAGCCTCCATCTCCCGGGTTCAAGCAGTTCTCCTGCCTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGATTACAGGTACACGCCATCACGCCCGGCCAATTTTTGTATTCTTAGTA
GAGATGGGGTTTCACCGTGTTGGCCAGGCTGGTCTCAAAACTCTTGACTTCGTGATCTGCCTGCCTCGGCCTCTCAAAAGTGCTGGGATTACAGGCATGAGCCACCGCACCTGGCAGACC
AATTTTTTTTTTTTAACTTTATAGAGATTATCAAACGAATGCCTAGGTCTTTCAGAATTGTCAATGGCCAGAGAAAGGGTACTGGCTATTTTTCTCCTACGGTCCCTTTCCCTATGAGAA
CTCACTAATTTTGCAGTTACCTCTGTACCCGTTTTAATATTGAGATTAACAAGAGAGAGAAGCTGAGTCTGGCTTATAAGATAAAGACTTTTGGGAGTCTGTGGGCCCTGCTCTGTCCCA
GCTCTGCCTCACCTTCTATTGGTGGACTTCAGCTGGCTGCACCCTCTGGGAACAGTTTCACCTCAAACCCCAGGCTTCCAGTGCCTGACCCAGGGAGGGAGAAGCATCTTTTACCCTGAG
TTTTCTTTAACCTGCCTTTTCCATGAGTGATTGATACCTGAAATTTCCACATCCTTTTAAGACAGACTGTTAAAACCTGTAGGTTAAATAACCGGACACAGTGATACACACCTATAGTCA
CGCTACTTGGGAGTCTGAGGTGGGAGGATCAGTTGAGCCAGAAGTTCGAGGCTGCAGCCTGCTGTGATCACACCTGAGAAGAGCACTGCACTCCAGCGTGGGCAATATAGTGAGACCCTA
TATTTAAACCAAACAACCAAAAAAACTTCTAGGCTAAACATATCTGCATCTGTCACAGTAACACCAACACAGAAGATAAACACAGACCACTGTGGTAGCGTGGTTCATCTCATTACATGC
TGCAACATGATTAAAAGTGATGGGCATGGTTTTCTGTTTTGCATAGACTTAGAGCCTATACATTCTTTCTATGAAGATTTTTCCCATGGGATTTCCCCCCATTTACCCAATAATTCATTC
ATAATAAACAGTTGTTGAACCTAGATAAAATACACCTCTGTCTCTTCCCATTTGCCTATAAGTTTCTTGCCAAGATGTGATACAGCAGCTCAAAGAATGCTTGCCAAGTCACTAATAGTC
TTTGCTCTCTCTAGTTCAGTGACTTTCCGATACTGTGTAACATTCAGGGCACTATGTGAACTTGTAAGTGTGACCATACCGCATGTTTTATGGTGACCTGGTCCAGTACTGCCTTTGTTA
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GAAGAAGTTAGACTGTTCTACTTCTGGTACTGTTGAGGCACTGATGAGGATAAATGATCATGCAGAGGTCTCTTCATAATTGACCCCAATGGAGTCATCAAGCACTTAAGCGTCAACGAT
CTCCCAGTGGGCCGAAGCGTGGAAGAAACCCTCCGCTTGGTGAAGGCGTTCCAGTATGTAGAAACACATGGGGAAGTCTGCCCAGCGAACTGGACACCGGATTCTCCTACG
GTAGGTTTT
TTCCCCAAAAGCAGTGAGGTCCATGTTCTCTCAGCCTCGAGAGCTATTGACCTGAAATATCCACAAAAGGGAGCCCACTCTTGGAGCAAGCGTGCAGATGATGTGCAAATGGGTGAAGCT
GCTGTGGGGTAGAGGGGGTGGGGTGGGGAGCCAGGAACCAATTATCAGAGACAGGCAGGCCTTTTTTTTTTTTTGAGACGGAGTCTTGCTCTCGCCCAGGGTGGAGTGCAGTGGCGCTCT
CTCAGCTCACTGCAAGCTCCGCCTCCTGGGTTCACGCCATTGTCCTGCCTCAGCCTCCTGAGTAGCTAGGACTACAGGGTGCCCACCACCATGGCTAATTTTTTGAATTTTAGTAGAGAC
GGGGTTTCACCATGTTAGCCAGGATGGTCTGGATCTCCTGACCTCGTGATCCACCCGCCTTGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACCGGCGTGAGCCACCGTGCCCGGCCTAGAGACAGGC
AGGCCTTAATGAAACTTTCATCTTTATGTTTTAAAGGAAATCTTTAAAAGTTTAAAGAACTTTAGGTTAAAAATTGGGAGATTGCCACTCACTTTTGGGACTATTATTATGGTAAAGTCA
CAGTTACCTAATTAAGCTTTTCTATTTTCAGATCAAGCCAAGTCCAGCTGCTTCCAAAGAGTACTTTCAGAAGGTAAATCAGTAG

Retrieve as FASTA  
CDS
Send to BLAST
.........1.........2.........3.........4.........5.........6.........7.........8.........9.........0.........1.........2
ATGGCGGCTGCTGTAGGACGGTTGCTCCGAGCGTCGGTTGCCCGACATGTGAGTGCCATTCCTTGGGGCATTTCTGCCACTGCAGCCCTCAGGCCTGCTGCATGTGGAAGAACGAGCTTG
ACAAATTTATTGTGTTCTGGTTCCAGTCAAGCAAAATTATTCAGCACCA
GTTCCTCATGCCATGCACCTGCTGTCACCCAGCATGCACCCTATTTTAAGGGTACAGCCGTTGTCAATGGA
GAGTTCAAAGACCTAAGCCTTGATGACTTTAAGGGGAAATATTTGGTGCTTTTCTTCTATCCTTTGGATTT
CACCTTTGTGTGTCCTACAGAAATTGTTGCTTTTAGTGACAAAGCTAAC
GAATTTCACGACGTGAACTGTGAAGTTGTCGCAGTCTCAGTGGATTCCCACTTTAGCCATCTTGCCTGGATAAATACACCAAGAAAG
AATGGTGGTTTGGGCCACATGAACATCGCACTC
TTGTCAGACTTAACTAAGCAGATTTCCCGAGACTACGGTGTGCTGTTAGAAGGTTCTGGTCTTGCACTAAG
AGGTCTCTTCATAATTGACCCCAATGGAGTCATCAAGCACTTAAGCGTC
AACGATCTCCCAGTGGGCCGAAGCGTGGAAGAAACCCTCCGCTTGGTGAAGGCGTTCCAGTATGTAGAAACACATGGGGAAGTCTGCCCAGCGAACTGGACACCGGATTCTCCTACG
ATC
AAGCCAAGTCCAGCTGCTTCCAAAGAGTACTTTCAGAAGGTAAATCAGTAG

Retrieve as FASTA  
cDNA
Send to BLAST
.........1.........2.........3.........4.........5.........6.........7.........8.........9.........0.........1.........2
GCCCCTGCGT CTCTGCCCGC CCCGTGGCGC CCGAGTGCAC TGAAGATGGC GGCTGCTGTA GGACGGTTGC TCCGAGCGTC GGTTGCCCGA CATGTGAGTG CCATTCCTTG GGGCATTTCT  GCCACTGCAG CCCTCAGGCC TGCTGCATGT GGAAGAACGA GCTTGACAAA TTTATTGTGT TCTGGTTCCA GTCAAGCAAA ATTATTCAGC ACCAGTTCCT CATGCCATGC ACCTGCTGTC  ACCCAGCATG CACCCTATTT TAAGGGTACA GCCGTTGTCA ATGGAGAGTT CAAAGACCTA AGCCTTGATG ACTTTAAGGG GAAATATTTG GTGCTTTTCT TCTATCCTTT GGATTTCACC  TTTGTGTGTC CTACAGAAAT TGTTGCTTTT AGTGACAAAG CTAACGAATT TCACGACGTG AACTGTGAAG TTGTCGCAGT CTCAGTGGAT TCCCACTTTA GCCATCTTGC CTGGATAAAT  ACACCAAGAA AGAATGGTGG TTTGGGCCAC ATGAACATCG CACTCTTGTC AGACTTAACT AAGCAGATTT CCCGAGACTA CGGTGTGCTG TTAGAAGGTT CTGGTCTTGC ACTAAGAGGT  CTCTTCATAA TTGACCCCAA TGGAGTCATC AAGCACTTAA GCGTCAACGA TCTCCCAGTG GGCCGAAGCG TGGAAGAAAC CCTCCGCTTG GTGAAGGCGT TCCAGTATGT AGAAACACAT  GGGGAAGTCT GCCCAGCGAA CTGGACACCG GATTCTCCTA CGATCAAGCC AAGTCCAGCT GCTTCCAAAG AGTACTTTCA GAAGGTAAAT CAGTAGATCA CCCATGTGTA TCTGCACCTT  CTCAACCGAG AGAAGAACCA CAGTTGAAAC CTGCTTTTAT CATTTTCAAG ATGGTTATTT GTAGAAGGCA AGGAACCAAT TATGCTTGTA TTCATAAGTA TTACTCTAAA TGTTTTGTTT  TTGTAATTCT GGCTAAGACC TTTTAAACAT GGTTAGTTGC TAGTACAAGG AATCCTTTAT TGGTAACATC TTGGTGGCTG GCTAGCTAGT TTCTACAGAA CATAATTTGC CTCTATAGAA  GGCTATTCTT AGATCATGTC TGAATGGAAA CACTCTTCTT TCTTAGCCTT ACTTGAATCT TGCCTATAAT AAAGTAGAGC AACACACATT GAAAGCTTCT GATCAACGGT CCTGAAATTT  TCATCTTGAA TGTCTTTGTA TTAAACTGAA TTTTCTTTTA AGCTAACAAA GATCATAATT TTCAATGATT AGCCGTCTAA CTCCTGCAAT GAATGTTTAT GTGATTGAAG CAAATGTGAA  TCGTATTATT TTAAAAAGTG GCAGAGTGAC TTAACTGATC ATGCATGATC CCTCATCCCT GAAATTGAGT TTATGTAGTC ATTTTACTTA TTTTATTCAT TAGCTAACTT TGTCTATGTA  TATTTCTAGA TATTGATTAG TGTAATCGAT TATAAAGGAT ATTTATCAAA TCCAGGGATT GCATTTTGAA ATTATAATTA TTTTCTTTGC TGAAGTATTC ATTGTAAAAC ATACAAAATA 
AACATTTTAA AACATTTGCA TTTTGCCACC ATTAA 

Retrieve as FASTA