Entry information : StRboh01 (StRbohA)
Entry ID 4549
Creation 2007-02-07 (Christophe Dunand)
Last sequence changes 2010-07-16 (Christophe Dunand)
Sequence status complete
Reviewer Catherine Mathe
Last annotation changes 2017-01-12 (Catherine Mathe)
Peroxidase information: StRboh01 (StRbohA)
Name (synonym) StRboh01 (StRbohA)
Class Respiratory burst oxidase homolog    [Orthogroup: Rboh001]
Taxonomy Eukaryota Viridiplantae Streptophyta Solanaceae Solanum
Organism Solanum tuberosum (Potato)    [TaxId: 4113 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type N/D
Inducer N/D
Repressor N/D
Best BLASTp hits
Perox score E-value StRboh01
start..stop
S start..stop
LeRboh01 1976 0 1..963 1..963
NbRboh01 1831 0 1..963 1..962
NtRboh06a 1827 0 1..963 1..962
PtRboh03 1610 0 1..963 1..948
Literature and cross-references StRboh01 (StRbohA)
Literature Yoshioka H., Sugie K., Park H.J., Maeda H., Tsuda N., Kawakita K., Doke N. Induction of plant gp91 phox homolog by fungal cell wall, arachidonic acid, and salicylic acid in potato. Mol. Plant Microbe Interact. 14:725-736(2001).
Protein ref. UniProtKB:   Q948U0
mRNA ref. GenBank:   AB050660.1
Protein sequence: StRboh01 (StRbohA)
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   963
PWM (Da):   %s   108930.39 Transmb domain:   %s   o399-421i539-561o581-603i760-777o
PI (pH):   %s   9.54
Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
MRGLPGHERR WTSDTVSSGK DLSGESSPGT DSGNISGFAS EEFVEVILDL QDDDTIILRS VEPATVINID ASDPATGVGI GGVSIETPAS LTSTSGTRSP TMRRSTSNKL RQFSQELKAE  AVAKAKHFSQ ELKAELRRFS WSHGHASRTF SPASFFQNAV VGTGNGVDSA LAARALRRQR AQLDRTRSSA HKALRGLKFI SNNKTNGWNE VENNFAKLAK DGYLYRSDFA QCIGMKDSKE  FALELFDALS RRRRLKVDKI SKEELYEYWS QITDQSFDSR LQIFFDMVDK NEDGRIGEEE VKEIIMLSAS ANKLSRLKEQ AEEYAALIME ELDPERLGYI ELWQLETLLL QKDTYLNYSQ  ALSYTSQALS QNLQGLRKRS PIRRMSTKLV YSLQENWKRI WVLVLWILIM IGLFLWKFYL YKQKSAFQVM GYCLLTAKGA AETLKFNMAL ILLPVCRNTI TFLRSTKLSC FVPFDDNINF  HKTVAAAIVT GIILHAGNHL VCDFPKLIHA NNTNYQKYLV NDFGPSQPQY IDLVKGVEGV TGIIMVILMA IAFTLATRWF RRSLIKFPKP FDRLTGFNAF WYSHHLLIIV YIVLIIHGTF  LYLVHNWYSK TTWMYLAVPV LLYAGERTLR FFRSGLYTVR LLKVAIYPGN VLTLQMSKPP QFRYKSGQYM FVQCPAVSPF EWHPFSITSA PGDDYLSIHI RQLGDWTQEL KRVFSEACEQ  PEAGKSGLLR ADENTKTSLP KLLIDGPYGA PAQDYRKYDV LLLVGLGIGA TPFISILKDL LKNIVTMEEQ ADLVSDFSGN SDMSAATSEQ PALNKISPKK RKSTLKTTNA YFYWVTREQG  SFDWFKGVMN EVAELDQRGV IEMHNYLTSV YEEGDARSAL ITMVQALNHA KNGVDIVSGT SVRTHFARPN WRKVFSKTLT KHANARIGVF YCGAPILAKE LSKLCKEFNQ KGTTKFEFHK 
EHF 

Retrieve as FASTA  
Remarks Complete sequence from 1 mRNA. Cultivar="Rishiri". No EST.
CDS
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGAGGGGTT TACCTGGGCA TGAACGCCGG TGGACGTCGG ATACGGTATC TTCCGGCAAG GATTTAAGTG GTGAGTCATC GCCGGGAACT GATTCCGGGA ATATTTCCGG TTTTGCTTCC  GAGGAGTTTG TTGAAGTTAT ACTTGATCTT CAGGATGATG ATACGATTAT TCTACGGAGC GTTGAACCGG CTACTGTAAT CAACATTGAT GCTTCTGATC CTGCTACCGG AGTCGGTATT  GGTGGAGTAT CGATTGAAAC TCCGGCGTCG CTGACTTCGA CGTCGGGAAC TCGATCGCCG ACGATGCGTC GGAGTACATC GAATAAATTA CGTCAGTTTT CACAGGAGTT GAAAGCTGAG  GCTGTCGCGA AAGCGAAGCA TTTCTCGCAA GAGCTTAAAG CGGAGCTAAG GAGATTCTCA TGGAGCCATG GACATGCGTC TCGCACTTTT TCGCCGGCGT CGTTTTTCCA AAACGCCGTC  GTCGGTACAG GCAACGGTGT AGATTCGGCT TTAGCAGCTC GAGCATTACG ACGGCAGCGC GCTCAGCTCG ATCGGACTCG TTCCAGCGCT CACAAGGCTC TTCGTGGACT CAAATTCATC  AGCAATAACA AAACTAACGG ATGGAATGAA GTTGAAAACA ATTTTGCTAA GCTCGCTAAA GACGGTTACC TTTATCGCTC CGATTTCGCA CAATGCATCG GTATGAAGGA TTCAAAGGAA  TTTGCATTGG AATTGTTTGA TGCTTTGAGT AGAAGAAGAA GATTGAAGGT TGATAAGATT AGCAAAGAGG AATTGTATGA GTATTGGTCT CAAATCACCG ATCAGAGTTT CGATTCTCGG  CTTCAGATCT TCTTCGACAT GGTGGACAAG AATGAAGATG GTCGAATTGG TGAAGAAGAA GTAAAAGAGA TCATCATGCT AAGTGCCTCT GCAAACAAAT TATCAAGATT AAAAGAACAA  GCAGAGGAGT ATGCAGCTCT GATCATGGAA GAATTAGATC CTGAAAGACT TGGCTACATT GAGCTATGGC AGCTGGAAAC GCTTCTCCTC CAAAAGGACA CTTACCTCAA CTACAGTCAA  GCACTAAGCT ACACAAGCCA AGCTTTGAGC CAAAACCTGC AAGGGTTGAG GAAGAGAAGC CCAATAAGAA GAATGAGCAC AAAACTTGTC TATTCACTGC AAGAGAATTG GAAGAGAATT  TGGGTTCTGG TCTTGTGGAT TTTGATAATG ATTGGACTTT TTCTTTGGAA GTTCTATCTG TACAAACAGA AAAGTGCATT TCAAGTTATG GGTTATTGCC TTCTAACAGC TAAGGGTGCT  GCTGAGACTC TAAAGTTCAA CATGGCTTTG ATATTGTTGC CAGTTTGCAG GAACACCATT ACATTCCTCA GGTCTACTAA ATTGAGTTGT TTTGTACCCT TTGATGACAA CATCAACTTC  CACAAGACTG TTGCTGCAGC CATTGTTACT GGTATCATAC TCCATGCCGG TAATCATCTT GTATGTGATT TCCCAAAGCT TATACATGCA AATAATACGA ATTATCAGAA ATATTTGGTG  AATGATTTTG GCCCAAGCCA GCCTCAGTAC ATAGATCTTG TTAAAGGAGT GGAGGGTGTG ACAGGAATAA TAATGGTAAT CCTCATGGCC ATTGCTTTCA CTCTTGCAAC GCGATGGTTT  AGGCGGAGCC TCATTAAGTT TCCCAAACCT TTTGATAGAC TCACTGGTTT CAATGCGTTC TGGTACTCGC ACCACCTTCT CATCATTGTC TACATCGTAC TGATCATCCA TGGCACATTC  CTCTACCTTG TGCATAACTG GTACTCCAAA ACGACATGGA TGTATCTAGC AGTTCCTGTA CTTCTCTACG CAGGGGAAAG AACTCTTAGA TTCTTCCGAT CAGGCTTATA TACAGTCCGG  CTTCTAAAAG TAGCAATATA TCCTGGAAAT GTCCTTACTC TGCAAATGTC TAAGCCTCCG CAATTTCGAT ACAAGAGTGG ACAATATATG TTTGTCCAGT GTCCAGCTGT TTCTCCATTC  GAGTGGCATC CATTTTCCAT TACTTCAGCT CCTGGGGATG ACTACTTGAG CATTCATATC CGACAACTTG GTGACTGGAC TCAAGAACTC AAGCGGGTGT TTTCCGAGGC TTGCGAGCAG  CCAGAGGCTG GAAAGAGTGG CCTGCTCAGA GCTGACGAAA ACACCAAAAC AAGTTTGCCA AAGCTATTGA TAGATGGACC TTATGGAGCT CCAGCACAAG ATTACCGAAA GTATGATGTC  TTACTGCTTG TTGGTCTTGG CATTGGAGCA ACTCCCTTTA TAAGTATCCT GAAAGACTTG CTCAAAAACA TCGTCACAAT GGAGGAGCAA GCAGATTTAG TCTCGGATTT TTCAGGGAAC  TCAGACATGA GCGCTGCAAC AAGTGAACAA CCAGCTCTCA ACAAGATTTC TCCAAAAAAG AGAAAGAGTA CTCTAAAAAC CACAAATGCA TATTTTTATT GGGTGACCCG GGAGCAAGGA  TCATTTGATT GGTTCAAAGG TGTTATGAAC GAAGTGGCTG AACTTGATCA AAGGGGGGTC ATCGAGATGC ATAACTACTT AACGAGTGTT TATGAGGAAG GGGATGCACG TTCAGCTCTC  ATTACCATGG TCCAGGCGCT TAACCATGCT AAGAATGGGG TTGATATTGT ATCAGGCACC AGTGTGAGGA CACATTTTGC CAGACCGAAT TGGAGGAAAG TATTTTCCAA GACCTTAACC  AAGCATGCAA ATGCAAGAAT AGGAGTTTTC TACTGCGGTG CACCCATATT AGCTAAAGAA CTCAGCAAAC TCTGCAAAGA GTTTAACCAA AAGGGCACAA CGAAGTTCGA GTTTCACAAA 
GAACATTTTT AG 

Retrieve as FASTA  
cDNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
GGCACGAGAA TAACCAAAAC TTTTGGTCAG GCTTCTGCAG AAAACTCTGT TTTCAACATA TATTTATTTA TTGTGCTTTG ATTTGGGACA AATGAGGGGT TTACCTGGGC ATGAACGCCG  GTGGACGTCG GATACGGTAT CTTCCGGCAA GGATTTAAGT GGTGAGTCAT CGCCGGGAAC TGATTCCGGG AATATTTCCG GTTTTGCTTC CGAGGAGTTT GTTGAAGTTA TACTTGATCT  TCAGGATGAT GATACGATTA TTCTACGGAG CGTTGAACCG GCTACTGTAA TCAACATTGA TGCTTCTGAT CCTGCTACCG GAGTCGGTAT TGGTGGAGTA TCGATTGAAA CTCCGGCGTC  GCTGACTTCG ACGTCGGGAA CTCGATCGCC GACGATGCGT CGGAGTACAT CGAATAAATT ACGTCAGTTT TCACAGGAGT TGAAAGCTGA GGCTGTCGCG AAAGCGAAGC ATTTCTCGCA  AGAGCTTAAA GCGGAGCTAA GGAGATTCTC ATGGAGCCAT GGACATGCGT CTCGCACTTT TTCGCCGGCG TCGTTTTTCC AAAACGCCGT CGTCGGTACA GGCAACGGTG TAGATTCGGC  TTTAGCAGCT CGAGCATTAC GACGGCAGCG CGCTCAGCTC GATCGGACTC GTTCCAGCGC TCACAAGGCT CTTCGTGGAC TCAAATTCAT CAGCAATAAC AAAACTAACG GATGGAATGA  AGTTGAAAAC AATTTTGCTA AGCTCGCTAA AGACGGTTAC CTTTATCGCT CCGATTTCGC ACAATGCATC GGTATGAAGG ATTCAAAGGA ATTTGCATTG GAATTGTTTG ATGCTTTGAG  TAGAAGAAGA AGATTGAAGG TTGATAAGAT TAGCAAAGAG GAATTGTATG AGTATTGGTC TCAAATCACC GATCAGAGTT TCGATTCTCG GCTTCAGATC TTCTTCGACA TGGTGGACAA  GAATGAAGAT GGTCGAATTG GTGAAGAAGA AGTAAAAGAG ATCATCATGC TAAGTGCCTC TGCAAACAAA TTATCAAGAT TAAAAGAACA AGCAGAGGAG TATGCAGCTC TGATCATGGA  AGAATTAGAT CCTGAAAGAC TTGGCTACAT TGAGCTATGG CAGCTGGAAA CGCTTCTCCT CCAAAAGGAC ACTTACCTCA ACTACAGTCA AGCACTAAGC TACACAAGCC AAGCTTTGAG  CCAAAACCTG CAAGGGTTGA GGAAGAGAAG CCCAATAAGA AGAATGAGCA CAAAACTTGT CTATTCACTG CAAGAGAATT GGAAGAGAAT TTGGGTTCTG GTCTTGTGGA TTTTGATAAT  GATTGGACTT TTTCTTTGGA AGTTCTATCT GTACAAACAG AAAAGTGCAT TTCAAGTTAT GGGTTATTGC CTTCTAACAG CTAAGGGTGC TGCTGAGACT CTAAAGTTCA ACATGGCTTT  GATATTGTTG CCAGTTTGCA GGAACACCAT TACATTCCTC AGGTCTACTA AATTGAGTTG TTTTGTACCC TTTGATGACA ACATCAACTT CCACAAGACT GTTGCTGCAG CCATTGTTAC  TGGTATCATA CTCCATGCCG GTAATCATCT TGTATGTGAT TTCCCAAAGC TTATACATGC AAATAATACG AATTATCAGA AATATTTGGT GAATGATTTT GGCCCAAGCC AGCCTCAGTA  CATAGATCTT GTTAAAGGAG TGGAGGGTGT GACAGGAATA ATAATGGTAA TCCTCATGGC CATTGCTTTC ACTCTTGCAA CGCGATGGTT TAGGCGGAGC CTCATTAAGT TTCCCAAACC  TTTTGATAGA CTCACTGGTT TCAATGCGTT CTGGTACTCG CACCACCTTC TCATCATTGT CTACATCGTA CTGATCATCC ATGGCACATT CCTCTACCTT GTGCATAACT GGTACTCCAA  AACGACATGG ATGTATCTAG CAGTTCCTGT ACTTCTCTAC GCAGGGGAAA GAACTCTTAG ATTCTTCCGA TCAGGCTTAT ATACAGTCCG GCTTCTAAAA GTAGCAATAT ATCCTGGAAA  TGTCCTTACT CTGCAAATGT CTAAGCCTCC GCAATTTCGA TACAAGAGTG GACAATATAT GTTTGTCCAG TGTCCAGCTG TTTCTCCATT CGAGTGGCAT CCATTTTCCA TTACTTCAGC  TCCTGGGGAT GACTACTTGA GCATTCATAT CCGACAACTT GGTGACTGGA CTCAAGAACT CAAGCGGGTG TTTTCCGAGG CTTGCGAGCA GCCAGAGGCT GGAAAGAGTG GCCTGCTCAG  AGCTGACGAA AACACCAAAA CAAGTTTGCC AAAGCTATTG ATAGATGGAC CTTATGGAGC TCCAGCACAA GATTACCGAA AGTATGATGT CTTACTGCTT GTTGGTCTTG GCATTGGAGC  AACTCCCTTT ATAAGTATCC TGAAAGACTT GCTCAAAAAC ATCGTCACAA TGGAGGAGCA AGCAGATTTA GTCTCGGATT TTTCAGGGAA CTCAGACATG AGCGCTGCAA CAAGTGAACA  ACCAGCTCTC AACAAGATTT CTCCAAAAAA GAGAAAGAGT ACTCTAAAAA CCACAAATGC ATATTTTTAT TGGGTGACCC GGGAGCAAGG ATCATTTGAT TGGTTCAAAG GTGTTATGAA  CGAAGTGGCT GAACTTGATC AAAGGGGGGT CATCGAGATG CATAACTACT TAACGAGTGT TTATGAGGAA GGGGATGCAC GTTCAGCTCT CATTACCATG GTCCAGGCGC TTAACCATGC  TAAGAATGGG GTTGATATTG TATCAGGCAC CAGTGTGAGG ACACATTTTG CCAGACCGAA TTGGAGGAAA GTATTTTCCA AGACCTTAAC CAAGCATGCA AATGCAAGAA TAGGAGTTTT  CTACTGCGGT GCACCCATAT TAGCTAAAGA ACTCAGCAAA CTCTGCAAAG AGTTTAACCA AAAGGGCACA ACGAAGTTCG AGTTTCACAA AGAACATTTT TAGAAGGCCC TGGAGTACAA  TTAATCTTGC ATCAACGGTA CACACATCGG TAAACCAGTA TTTACCACAT CTATCTTTGG TACCTGATTT GATGATTCTA CTGAAGACAT AACATTAGTA AGGAATAAGT CAGAGACAAA  TTGTACATAA TAGGAGGAAG CACATTTACA GAGAAAATAC ATACCAATAT GATATGTGTA TAGGTTTTGT ATATTCAGTC ATCTGTTATC ACATACCAAA CTTCAGAACT CCAAAAGGGA  GACTCTGCTT TGGTCTGATG GCTTAGAATA TGGGAGGGAA AAAAAGACGA CAATTGAATG GTCACGATAC ACATGAAGAA TGAGAATATT GGGAAACAGC TAATAAGAAG TTGACCTTCT  TGATAAAGAA ACACTATGAA AATGGCAAGC ATGAAAGGAC AGACAATCAT GGCTTGGATG GGGAAAACAA AATACAATTT TGAAAGAAGA AGATAATATT AGTAGGAGTA GTGGGGGACT  GATAGCTTTG TTGGTGGAAC TTATAATGGG GCTAAGGGAA TCCTTCCAAA AAATGTCTAT GTAGTAACTA CTTTTTCTTT TGCTTTGTGA GTATTTTTTG GGGTATTTTA ATATACTACT  TATTAGATAA GAGGATAGAA AATACGTGTA TATGCAATTC TTATTAGTAA AGTTTATCTG TAGTAGTTCT TTAATCTGGA GAAAGGTACT ATCAAAGGAA ATATCTCATC GAAAAAAAAA 
AAAAAAAAAA AAA 

Retrieve as FASTA