Entry information : PvPrx12 (Phvul.011G105900)
Entry ID 5103
Creation 2007-03-30 (Christophe Dunand)
Last sequence changes 2014-03-19 (Maxime Neel)
Sequence status complete
Reviewer Christophe Dunand
Last annotation changes 2014-03-20 (Christophe Dunand)
Peroxidase information: PvPrx12 (Phvul.011G105900)
Name (synonym) PvPrx12 (Phvul.011G105900)
Class Class III peroxidase    [Orthogroup: Prx009]
Taxonomy Eukaryota Viridiplantae Streptophyta Fabaceae Phaseolus
Organism Phaseolus vulgaris    [TaxId: 3885 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type Roots
Inducer Phosphate starvation
Repressor N/D
Best BLASTp hits
Perox score E-value PvPrx12
start..stop
S start..stop
GmPrx10 589 0 1..325 1..324
GmPrx45 583 0 1..325 1..324
MtPrx53 573 0 1..324 3..326
GmPrx162 557 0 1..325 1..325
Literature and cross-references PvPrx12 (Phvul.011G105900)
Literature Ramirez,M., Graham,M.A., Blanco-Lopez,L., Silvente,S., Medrano-Soto ,A., Blair,M.W., Hernandez,G., Vance,C.P. and Lara,M.; Sequencing and Analysis of Common Bean ESTs. Building a Foundation for Functional Genomics; Plant Physiol. 137 (4), 1211-1227 (2005)
DNA ref. Phytozome 12:   Chr11 (12340871..12343106)
EST ref. GenBank:   CV544147 [3' end]
Protein sequence: PvPrx12 (Phvul.011G105900)
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   326 (302)
PWM (Da):   %s   35147.96 (32624.6)  
PI (pH):   %s   7.73 (7.47) Peptide Signal:   %s   cut: 24 range:24-325
Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
MGSQSYFKAL IICLIALIGS TQAQLQPGFY AKSCPNAEKI ILKYVAEHIP NVPSLAAALL RLHFHDCFVN GCDGSVLLSS TPNNQAEKDS IPNLTLRGFD FIDTIKSLLE AACPGVVSCA  DVLALTARDS VHAIGGPFWN VPTGRRDGLI SRAADPLASL PAPFHNLTVQ LTLFGNVGLD ANDLVVLSGA HTIGVSHCST ISTRLYNFTG RGDTDPTLDS NYATNLKTLK CKNINDNTTL 
IEMDPGSRDT FDLGYYKQVV KRRGLFQSDA ALLTSSTTRS IITTQLQSNE GFFAEFAKSM EKMGRINLKL GTEGEIRKHC ARVNN* 

Retrieve as FASTA  
Remarks Complete sequence from genomic and 4 ESTs. Cultivar="Negro Jamapa 81".
Promoter
Send to BLAST
Send to cis Analysis
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
TTATATTCTA AATTTGATAA CAAAAGCCTT GGTAGCTAAT TAGATACCAA TTTAAAAACT ATTTATCAAT AATTAATAGA AACTAATTTA GAAATCAATA ATTTTTTTAG TATCTAATTT  GTTACTATTA ACAACTAATT ATTTTTTATT TCTAAAATTG ATTTTTATTC AATTATTTTC TTGTAGTGCT AATTAATTAT TTTATATTTT CATGTTGTAT CACCTTATTT ATTTTAATTT  ATTTAATCAC GACACATTGT CAAACCAGTT GATCTAAAGA AACATAAATA ATTGATTTCA TTGATTGCTT CCTCCTAAAT GATACCGATG GAGTTTGAAA AATTCAAGTT ACTATTCTCT  AAAGCATATA CATTGTACTC ACTTTTCGAG CATTGGATCC CAAAATATGT AGTTTATCTA ATTTTTATTT GAGTGTGGGT TCACGCTAAT GATTTAATTG TTATTTAATT TTTTATTGTA  TGAAAAAAAA AATACAAAAA AAAAATACAT TCATTCTAAG AAATTTAATG TTAAAAAAAC TCATAAAACT CGTGAGTTCT TTTAAAGACT ATTTTAAAGA ACCTTTTAAT AAATAGATGC  AGATTCCATA TAGGTAACTC TCCTATAGTT ATCCATATCC ATTAGGGTTC TTGCGTAAAT TGGTCAGTGC TTAAAACATA TTAACAAAAG CTAATGTTGA TTTTGGTCAT GTCCACGCTG  CGATATTCTC TGCACAACAT TAGCCATAAC AATCTCCGTT TACGTACTTC TGACTTTAAA TTTTAAACCT TATCATTCTA ATGCTTAGTT GCTTATGAAC ATAGTCAACT TAGTCTCCAC  GTGTCTTAAG ATGAGATCCC AGCAAAGCAA TCTCAACTTT TCAACGTTTC ATAACATGCA CCCCATTTTT TTCCATGCAT TTGATAAATT AGGTTTATAC TATTTCGTTC AATTTTTTTC  TGAAAAACCA TTCGTTATTT TTACCAATAT GAAAAAAAAG TGATTATTTT CAACATAATG TCTTTATGAA CCTTTTTTGT CTCGATGTAT CTACGTCTGT TAAGAAGAGT TTGAAAGAAC  TTATGACATG ACTATAAATC GGTTTTGGTT TATTCATTAA GCTCTCTGTA ATAACTTATA AAAATATATT AAAACAGTTT AACTTTGTAG TTTTCTCTCT TGTAGTAAAA ACCATTCATA  CGTATAGTGC TTATAGAAAA ACAATTAAAA AAATATATTA TTTTATGTTT TATTTTTTAA CAGTTATTCA TAAAAAAGTT GGTGGAAATT ACACATATTC AATAAACCCT TAATTAAGGA  TCACCCAAAC AAACCCTTAC TCTATCTTTG TTTGCCAAAA GAAAGGACGA CTGTTTGTCT CTATCTTTGT CGTTTTCGAG TGTTTTATTT ATTATATTAT AATGATAATG CTTTAGAACC  ATGCAACTAT TCTTCACCCA CTCTATAATT CATGTGCCAC GTTCTCACTT CTTATATATC CAAATAATTT GTCCATAGTT GGCTGCTACA AGCTACCCCT TATTTACTTT GAATCATGGA  CAGCTCAAGT GTGCTACAGG ATAATACATG TAGCCTCATA TATGCCAACA AAGTCAACTT TTTTATTCTT AAATTCCTCC ATAAAACCTG CATTCTACAC AGTAATATTT GCTGTTAGCA  AGTTCACATC AGTTCCTTGT ACATATGCGT TAACCACCCC CAATAATCTC CTTAAAATGT TACTACTATG ATATATATGA CAAGTTTATA AAAGAGACAT GCCCAACAAA CTAATTATTT  AGCCTTCTGT TTTTATATAA TTTTCTTTTT ATCCCATTAT TAGACTACTA ACATTTTTAA ATGGAAGGAA GTAGTAAAGT AACATGAACG TAACATGCTG CATGGACCAT TTGCCTTGAT  ACTGTAACAC ATATGCTGAG GACTATAAAT AACTAGACAC TCTCTGAATT CAACCAAGGA CATGAAGTTG CTTCTTGCAA GAAGTATCTG AGTTTTAATA TCCTCTATAT AGTTTCTCTG 
GTAATTGAGG TCTGAGCCAA CTAAGTGGAA 

Retrieve as FASTA  
DNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGGGAAGCC AGAGTTACTT CAAGGCTTTG ATTATTTGTC TCATAGCACT GATTGGGTCA ACTCAAGCTC AATTGCAGCC AGGTTTCTAT GCCAAAAGTT GTCCAAATGC TGAGAAGATC  ATTTTGAAGT ATGTTGCTGA GCATATCCCC AATGTTCCAT CTCTAGCAGC TGCTCTCTTA AGACTTCACT TCCATGATTG TTTTGTCAAT GTAGGTACAC ATTTTTGTTT CATTTTCTGT  TGAAACCTAG GAGGTGAGTT TAACTGACAT GTAGTATCTG TTAATTTCAG GGTTGTGATG GATCAGTGCT TCTGAGCTCA ACACCAAACA ATCAAGCTGA AAAGGACTCT ATTCCAAATC  TTACTCTACG AGGCTTTGAC TTCATTGACA CAATAAAGAG CCTTCTTGAA GCTGCATGCC CCGGAGTAGT CTCTTGTGCT GATGTCTTGG CTTTGACTGC TAGAGACTCT GTTCATGCCA  TTGTAAGTAT AAAAATAAAC TGTTTCATCC TCATCTCCAA GGAAACATTG GCTCTTAGAA TAACAGACAA TTTGTCTCCT ATTTTTGTAT GAAAAAATCA TATTGCATCT TACTTGAATT  GAACATGTGC CTGTATATAT TCTTCACAAA TAATTTCAAC AGTGTTGTTG TTTCTTCTAT AAAATTATTT ACCTTAATTC ACAATATTAA AATACATAAA CAGCTTAAAT ATATCTTTAT  TTCTATAAAA TTAAAGTGAG TTGTTAATGT AATTTTTTAA AAAGAGTGTC AAACAAACAT TTTTCTTCTT CTTCTAAATA GTGATATGTT GACATCCTAT TTTTTAAAAT ACAATCATTT  AACAATTCTC TCTATTAATT AATAACATAA TAAACAAAAA ATATTAAAAT TTAAATTTTT ACTATTATTA TATCAGTAGT AAAAGTAGTT GTGAAATAAT TGTAATTTCA GAAGAGATTG  GCAAAATATA TTTTCCCTAA AACTTCATTG ATCCTTATAA TTGTCTAGGT TGTATTAAGA TCATGCTTGT GTTCTTTATT CTCTAGGCTT TTGTTATAGA ATGGAAATGA CCAATTTGTT  TGTTGTGCCA TGCTTGACAT GGGTTTGCAG GGGGGGCCCT TTTGGAATGT TCCAACAGGT CGAAGGGATG GACTCATTTC TAGGGCAGCA GATCCTTTAG CGAGCCTTCC TGCTCCATTT  CACAACCTCA CTGTCCAACT AACACTCTTT GGCAATGTTG GACTTGATGC AAACGACCTT GTAGTGCTTT CTGGTATGTC CAACGTTGCA TCATAGAACT CAATAAACAT ATATATAATT  TTTTTTTCTT TTGTTTTGTT TCATATTTAA GATTTTGTGT TTCTAACCAC CAAATATTTA ATTTCATCAG GTGCTCACAC GATTGGTGTT TCCCACTGCT CAACAATTTC AACTCGTTTA  TACAATTTCA CTGGCAGAGG TGACACTGAC CCAACTCTAG ATAGTAATTA TGCAACAAAT CTGAAGACCT TAAAGTGCAA GAACATCAAT GATAACACCA CACTTATTGA GATGGACCCT  GGAAGTCGCG ATACATTCGA TCTTGGCTAT TATAAACAAG TGGTTAAGAG AAGAGGCTTG TTCCAATCAG ATGCTGCATT GCTCACAAGC TCTACCACAA GGTCTATTAT CACTACGCAA  CTTCAATCAA ATGAAGGATT CTTTGCAGAA TTTGCCAAGT CCATGGAGAA AATGGGACGA ATTAATCTTA AGCTTGGAAC CGAAGGAGAG ATAAGGAAAC ATTGTGCACG AGTAAACAAC 
TAA 

Retrieve as FASTA  
CDS
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGGGAAGCC AGAGTTACTT CAAGGCTTTG ATTATTTGTC TCATAGCACT GATTGGGTCA ACTCAAGCTC AATTGCAGCC AGGTTTCTAT GCCAAAAGTT GTCCAAATGC TGAGAAGATC  ATTTTGAAGT ATGTTGCTGA GCATATCCCC AATGTTCCAT CTCTAGCAGC TGCTCTCTTA AGACTTCACT TCCATGATTG TTTTGTCAAT GGTTGTGATG GATCAGTGCT TCTGAGCTCA  ACACCAAACA ATCAAGCTGA AAAGGACTCT ATTCCAAATC TTACTCTACG AGGCTTTGAC TTCATTGACA CAATAAAGAG CCTTCTTGAA GCTGCATGCC CCGGAGTAGT CTCTTGTGCT  GATGTCTTGG CTTTGACTGC TAGAGACTCT GTTCATGCCA TTGGGGGGCC CTTTTGGAAT GTTCCAACAG GTCGAAGGGA TGGACTCATT TCTAGGGCAG CAGATCCTTT AGCGAGCCTT  CCTGCTCCAT TTCACAACCT CACTGTCCAA CTAACACTCT TTGGCAATGT TGGACTTGAT GCAAACGACC TTGTAGTGCT TTCTGGTGCT CACACGATTG GTGTTTCCCA CTGCTCAACA  ATTTCAACTC GTTTATACAA TTTCACTGGC AGAGGTGACA CTGACCCAAC TCTAGATAGT AATTATGCAA CAAATCTGAA GACCTTAAAG TGCAAGAACA TCAATGATAA CACCACACTT  ATTGAGATGG ACCCTGGAAG TCGCGATACA TTCGATCTTG GCTATTATAA ACAAGTGGTT AAGAGAAGAG GCTTGTTCCA ATCAGATGCT GCATTGCTCA CAAGCTCTAC CACAAGGTCT  ATTATCACTA CGCAACTTCA ATCAAATGAA GGATTCTTTG CAGAATTTGC CAAGTCCATG GAGAAAATGG GACGAATTAA TCTTAAGCTT GGAACCGAAG GAGAGATAAG GAAACATTGT 
GCACGAGTAA ACAACTAA 

Retrieve as FASTA  
cDNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
GAACGTAACA TGCTGCATGG ACCATTTGCC TTGATACTGT AACACATATG CTGAGGACTA TAAATAACTA GACACTCTCT GAATTCAACC AAGGACATGA AGTTGCTTCT TGCAAGAAGT  ATCTGAGTTT TAATATCCTC TATATAGTTT CTCTGGTAAT TGAGGTCTGA GCCAACTAAG TGGAAATGGG AAGCCAGAGT TACTTCAAGG CTTTGATTAT TTGTCTCATA GCACTGATTG  GGTCAACTCA AGCTCAATTG CAGCCAGGTT TCTATGCCAA AAGTTGTCCA AATGCTGAGA AGATCATTTT GAAGTATGTT GCTGAGCATA TCCCCAATGT TCCATCTCTA GCAGCTGCTC  TCTTAAGACT TCACTTCCAT GATTGTTTTG TCAATGGTTG TGATGGATCA GTGCTTCTGA GCTCAACACC AAACAATCAA GCTGAAAAGG ACTCTATTCC AAATCTTACT CTACGAGGCT  TTGACTTCAT TGACACAATA AAGAGCCTTC TTGAAGCTGC ATGCCCCGGA GTAGTCTCTT GTGCTGATGT CTTGGCTTTG ACTGCTAGAG ACTCTGTTCA TGCCATTGGG GGGCCCTTTT  GGAATGTTCC AACAGGTCGA AGGGATGGAC TCATTTCTAG GGCAGCAGAT CCTTTAGCGA GCCTTCCTGC TCCATTTCAC AACCTCACTG TCCAACTAAC ACTCTTTGGC AATGTTGGAC  TTGATGCAAA CGACCTTGTA GTGCTTTCTG GTGCTCACAC GATTGGTGTT TCCCACTGCT CAACAATTTC AACTCGTTTA TACAATTTCA CTGGCAGAGG TGACACTGAC CCAACTCTAG  ATAGTAATTA TGCAACAAAT CTGAAGACCT TAAAGTGCAA GAACATCAAT GATAACACCA CACTTATTGA GATGGACCCT GGAAGTCGCG ATACATTCGA TCTTGGCTAT TATAAACAAG  TGGTTAAGAG AAGAGGCTTG TTCCAATCAG ATGCTGCATT GCTCACAAGC TCTACCACAA GGTCTATTAT CACTACGCAA CTTCAATCAA ATGAAGGATT CTTTGCAGAA TTTGCCAAGT  CCATGGAGAA AATGGGACGA ATTAATCTTA AGCTTGGAAC CGAAGGAGAG ATAAGGAAAC ATTGTGCACG AGTAAACAAC TAAGAATGGG TTGGTAATGA CCAATCTAAT TGCAATTTGT  ATGTCTTCTT TTCAATTTGT TTTGGTCTCT TATGTTACGC CAATCGTGTG CTAATATATA AGATCTCATG TGGTCTAGTT GTTTTTCCAA GTGATGTGGG AGGAATTGGA GAGTGATTCC 
TAGGTTTAGT TATTCTAGGT TTGAAGGGAA GTAATGTTCA CCACCACGAA CAAATAAGCA GAGTTAAGAG ATAGAATTTA TTGTAATAAA T 

Retrieve as FASTA