Entry information : UmLDS01 (Ssp1)
Entry ID 5340
Creation 2007-05-11 (Marcel Zamocky)
Last sequence changes 2007-05-11 (Marcel Zamocky)
Sequence status complete
Reviewer Christophe Dunand
Last annotation changes 2012-04-03 (Catherine Mathe (Scipio))
Peroxidase information: UmLDS01 (Ssp1)
Name (synonym) UmLDS01 (Ssp1)
Class Linoleate diol synthase (PGHS like)    [Orthogroup: LDS001]
Taxonomy Eukaryota Fungi Basidiomycota Ustilaginomycetes Ustilaginaceae Ustilago
Organism Ustilago maydis    [TaxId: 5270 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type Mycelium
Inducer N/D
Repressor N/D
Best BLASTp hits
Perox score E-value UmLDS01
start..stop
S start..stop
SreLDS 1927 0 1..1063 12..1074
SrosLDS01 570 0 82..1020 3..986
SrosLDS02 516 1e-167 83..668 2..590
NfLDS01 516 7e-166 77..1062 70..1072
Gene structure Fichier Exons
ExonStart..EndSize ExonStart..EndSize ExonStart..EndSize ExonStart..EndSize
N° 1 37484..40675 3192  
join(37484..40675)


exon

Literature and cross-references UmLDS01 (Ssp1)
Literature Huber S.M., et al., Insights from the genome of the biotrophic fungal plant pathogen Ustilago maydis. Nature 444:97-101(2006).
Protein ref. UniProtKB:   Q8X1B9
DNA ref. JGI genome:   contig_1_164 (37484..40675)
Protein sequence: UmLDS01 (Ssp1)
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   1063
PWM (Da):   %s   117546.33  
PI (pH):   %s   6.26
Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
.........1.........2.........3.........4.........5.........6.........7.........8.........9.........0.........1.........2
MKLFVQDKVS QTTDAAGLSA TDGHKKAQNT LKYAQQKTSS AATSSVEALQ SLVDQLNRSR IVNDVKLLGQ APNLLVSGLT GGGLDDRKLL LEQIVTLLAS MPVSSNISRT LSDTLIKIIW  GDLPHPAVSF MGSEHRFRRP DGSDNNVMSP KLGASGQPYS RNVQRMQPQQ VNLPDPGTVY DLLLARDSFE PHPTGISSLL FNFANIIIHD IFSTTRQPGA HSAYNEHSSY LDLQVVYGAN  QEEQRRVRTG TLGLLKADAV GDWRMAMMPP ATAALAVLFS RNHNFIAKRL YEVNENHRFD DLEGEPLDEE LFGIARLVNC GLFLHIILRD YIPVILNTND SEWFVDPLNV IKGVGGPGAL  ERGIGNSVAA EFSILYRWHA AVSQNDEKWM NDFLESQFPG KRPEDVGPRE FVEAAAGLKV SFLDTDPSEW NLHGWERDAQ GKFDDGLLAQ VIKDAVSDVA AAFRARGHPS WFRPIEILGM  ITARKDWAMC TMNEFRHFLG LKTYSSFSEW NPDPRISKAA EMLYGDIDNL ELYPGLMAEE AKPSIPGSGL CPGYTISRGI LSDAAALTRG DRFYTNDFST SNLTSAGYEY CTTPQPGSHG  MMGKLIMATL PGQFPYNSIY ALYPFRVPEK TIEMLKGKRV IEHYDTAYPA PARRWYAIES YSASKDILED SRYFTALPPM SYDESLMSSA LASIPRWQDE VTDFYSINTL NVMKNRSVSF  SPTGRQRIVD LLEVVNTVSA QFTSKLFALP TPGSHGLHLG MSPDELSSAL AKPLAYAMYG SFDFQGHQTW QLEEESEACT RRLKTLLWAR LHTVDGILSP VFALVQNISN IVGGPGNLAA  NGMARHFYHT IFASGKSNDE LVKDCLHMMV SLTATHSLVL MQAFKWFFQE ENAEHLSVMY QLAQKNDPVS NAELRHRIME AYRLNSITPP QAKFALQAVA LPDVVANKVY VQVGDGVYIS 
PSALYRDPKL SNDPERFNPS SKAPVRLGLG DAPSQSILEI ALPAIAKQFF KHNGLRLAPA GPPPVVNDAG PTPNQKLPYF ISNHGAEYPL PIDTSMHVIY EAR 

Retrieve as FASTA  
Remarks Complete sequence from genomic (Chromo 13, no intron) and 6 ESTs (3'end: EH027445, CF643961, CF641052, EH018437, EB747762, EB748061). Strain="521". Fusion of heme peroxidase with cytochrome P450
DNA
Send to BLAST
.........1.........2.........3.........4.........5.........6.........7.........8.........9.........0.........1.........2
ATGAAATTGT TCGTCCAGGA CAAGGTATCT CAGACCACCG ATGCGGCAGG TCTTTCCGCT ACTGACGGGC ACAAAAAGGC GCAAAACACC TTGAAGTACG CTCAGCAAAA GACTTCGTCG  GCAGCCACTT CGTCGGTCGA GGCGTTGCAG AGCTTGGTGG ACCAGCTCAA CCGCAGCAGG ATCGTTAACG ATGTCAAGCT GCTCGGTCAA GCGCCCAACC TACTCGTGTC TGGTCTCACG  GGCGGAGGTT TAGATGACCG AAAGCTCCTG CTCGAGCAGA TTGTCACTCT GCTCGCCAGC ATGCCCGTCT CTTCTAATAT CAGCCGAACT CTATCAGACA CCTTGATCAA GATCATTTGG  GGCGATCTGC CACATCCAGC CGTCTCCTTC ATGGGTTCCG AGCATCGCTT TCGACGCCCC GATGGCTCTG ACAACAATGT CATGAGTCCC AAGCTCGGTG CATCAGGCCA GCCCTACTCG  CGCAACGTCC AGCGCATGCA GCCGCAGCAG GTCAACCTAC CAGACCCCGG CACTGTTTAC GACCTCCTCC TAGCACGAGA CAGCTTTGAA CCTCACCCGA CTGGCATCAG CTCACTGCTG  TTCAACTTTG CCAACATTAT CATTCACGAC ATCTTTTCCA CCACCCGACA GCCAGGCGCA CATTCGGCGT ACAACGAGCA CTCATCTTAT CTCGACTTGC AGGTGGTCTA CGGTGCCAAT  CAAGAAGAGC AAAGGCGTGT GCGCACGGGC ACGCTCGGCC TTCTCAAGGC TGATGCCGTC GGCGACTGGC GTATGGCCAT GATGCCGCCC GCAACGGCCG CACTCGCAGT GCTGTTCAGT  CGTAACCACA ACTTCATCGC CAAGCGCCTC TACGAGGTCA ATGAAAACCA CCGTTTTGAC GATCTCGAAG GTGAGCCGCT TGATGAGGAG CTGTTTGGCA TTGCACGTCT GGTCAACTGC  GGCCTCTTCC TGCATATTAT CCTACGTGAC TATATTCCAG TCATTCTCAA CACCAACGAC TCGGAATGGT TTGTCGACCC CTTGAACGTG ATCAAGGGTG TCGGCGGACC AGGTGCTCTT  GAACGTGGCA TTGGTAATTC CGTCGCTGCC GAGTTCTCGA TTCTCTACCG ATGGCACGCA GCTGTGTCGC AGAACGACGA AAAGTGGATG AACGACTTCC TCGAATCTCA GTTTCCCGGC  AAGAGACCTG AAGATGTGGG TCCCAGAGAG TTCGTCGAAG CAGCCGCGGG CCTCAAGGTC TCTTTCCTTG ACACGGATCC GAGCGAGTGG AACCTTCATG GCTGGGAGCG CGACGCCCAG  GGCAAGTTCG ACGATGGATT GCTAGCACAG GTCATCAAGG ATGCCGTGTC GGACGTGGCT GCAGCTTTCC GTGCTCGTGG ACATCCCAGC TGGTTCCGTC CCATCGAAAT CCTCGGCATG  ATCACGGCTC GCAAGGATTG GGCTATGTGC ACCATGAACG AGTTCCGACA CTTTTTGGGC CTCAAGACCT ATTCTTCGTT CAGCGAGTGG AATCCTGATC CCAGAATTTC GAAGGCAGCG  GAGATGCTCT ACGGCGACAT TGACAATCTC GAGCTCTATC CTGGCCTGAT GGCGGAAGAG GCCAAGCCCA GTATCCCTGG AAGTGGTCTC TGCCCCGGTT ACACCATCTC GCGAGGAATT  CTCAGCGACG CTGCTGCCCT GACCCGCGGC GACCGCTTCT ACACGAACGA CTTTTCGACG TCCAATCTGA CGAGCGCCGG CTATGAGTAC TGCACCACAC CTCAGCCTGG CAGTCACGGC  ATGATGGGCA AGCTCATCAT GGCTACGCTA CCTGGTCAGT TCCCGTACAA CTCGATCTAT GCGCTCTACC CCTTCCGCGT GCCCGAGAAG ACCATCGAAA TGCTCAAGGG CAAGCGTGTG  ATCGAGCACT ACGACACAGC TTACCCTGCG CCTGCTCGCC GATGGTACGC CATTGAATCG TATTCAGCGA GCAAGGACAT TCTGGAAGAC AGCCGATACT TTACTGCGCT GCCACCCATG  TCGTATGACG AGAGCCTGAT GTCCTCGGCG CTAGCCTCAA TCCCACGTTG GCAAGATGAA GTGACGGACT TCTACAGCAT CAACACCCTC AATGTGATGA AGAATCGAAG CGTCTCGTTT  TCGCCTACGG GTCGTCAGCG CATCGTTGAT CTGCTCGAGG TTGTCAACAC GGTCTCGGCT CAGTTCACGT CGAAGCTCTT TGCGCTGCCC ACGCCTGGCA GTCATGGCCT GCATCTCGGC  ATGTCGCCCG ATGAGCTCTC CTCGGCACTT GCCAAGCCTC TCGCCTACGC CATGTATGGC TCGTTTGACT TCCAGGGTCA TCAGACATGG CAGCTCGAGG AGGAGTCCGA AGCTTGCACG  CGTCGTCTCA AGACGCTTCT TTGGGCACGT CTTCACACGG TGGACGGCAT TCTGTCGCCC GTGTTTGCTC TTGTGCAGAA CATATCAAAC ATTGTCGGTG GCCCCGGCAA CCTTGCTGCT  AACGGCATGG CTAGGCACTT CTACCACACG ATCTTTGCTT CAGGAAAGAG CAACGACGAG CTCGTCAAAG ACTGCCTGCA CATGATGGTG TCGCTGACGG CAACGCACTC GCTTGTACTC  ATGCAGGCGT TTAAATGGTT CTTCCAGGAG GAGAATGCCG AGCACCTTTC GGTCATGTAC CAGCTGGCCC AGAAGAACGA CCCTGTCTCA AATGCTGAGC TGCGCCACCG CATTATGGAG  GCTTACCGAC TCAACAGCAT CACCCCGCCG CAAGCCAAGT TTGCGCTCCA GGCGGTGGCT CTCCCCGACG TGGTCGCAAA CAAGGTGTAC GTGCAAGTGG GCGACGGCGT TTACATTTCC  CCTTCGGCTC TGTACCGCGA TCCAAAGCTA TCGAACGATC CCGAGCGTTT TAACCCGAGC AGCAAGGCGC CCGTCCGTCT TGGTCTCGGC GATGCACCCA GCCAGTCGAT TCTCGAAATT  GCCCTTCCTG CCATTGCTAA GCAGTTCTTC AAGCACAACG GTCTTCGCTT GGCTCCTGCT GGTCCACCTC CTGTTGTCAA CGATGCGGGT CCGACTCCCA ACCAGAAGTT GCCCTACTTT 
ATCAGTAACC ATGGCGCCGA GTACCCGCTT CCCATTGACA CCTCTATGCA CGTCATCTAC GAGGCCCGCT GA 

Retrieve as FASTA  
CDS
Send to BLAST
.........1.........2.........3.........4.........5.........6.........7.........8.........9.........0.........1.........2
ATGAAATTGT TCGTCCAGGA CAAGGTATCT CAGACCACCG ATGCGGCAGG TCTTTCCGCT ACTGACGGGC ACAAAAAGGC GCAAAACACC TTGAAGTACG CTCAGCAAAA GACTTCGTCG  GCAGCCACTT CGTCGGTCGA GGCGTTGCAG AGCTTGGTGG ACCAGCTCAA CCGCAGCAGG ATCGTTAACG ATGTCAAGCT GCTCGGTCAA GCGCCCAACC TACTCGTGTC TGGTCTCACG  GGCGGAGGTT TAGATGACCG AAAGCTCCTG CTCGAGCAGA TTGTCACTCT GCTCGCCAGC ATGCCCGTCT CTTCTAATAT CAGCCGAACT CTATCAGACA CCTTGATCAA GATCATTTGG  GGCGATCTGC CACATCCAGC CGTCTCCTTC ATGGGTTCCG AGCATCGCTT TCGACGCCCC GATGGCTCTG ACAACAATGT CATGAGTCCC AAGCTCGGTG CATCAGGCCA GCCCTACTCG  CGCAACGTCC AGCGCATGCA GCCGCAGCAG GTCAACCTAC CAGACCCCGG CACTGTTTAC GACCTCCTCC TAGCACGAGA CAGCTTTGAA CCTCACCCGA CTGGCATCAG CTCACTGCTG  TTCAACTTTG CCAACATTAT CATTCACGAC ATCTTTTCCA CCACCCGACA GCCAGGCGCA CATTCGGCGT ACAACGAGCA CTCATCTTAT CTCGACTTGC AGGTGGTCTA CGGTGCCAAT  CAAGAAGAGC AAAGGCGTGT GCGCACGGGC ACGCTCGGCC TTCTCAAGGC TGATGCCGTC GGCGACTGGC GTATGGCCAT GATGCCGCCC GCAACGGCCG CACTCGCAGT GCTGTTCAGT  CGTAACCACA ACTTCATCGC CAAGCGCCTC TACGAGGTCA ATGAAAACCA CCGTTTTGAC GATCTCGAAG GTGAGCCGCT TGATGAGGAG CTGTTTGGCA TTGCACGTCT GGTCAACTGC  GGCCTCTTCC TGCATATTAT CCTACGTGAC TATATTCCAG TCATTCTCAA CACCAACGAC TCGGAATGGT TTGTCGACCC CTTGAACGTG ATCAAGGGTG TCGGCGGACC AGGTGCTCTT  GAACGTGGCA TTGGTAATTC CGTCGCTGCC GAGTTCTCGA TTCTCTACCG ATGGCACGCA GCTGTGTCGC AGAACGACGA AAAGTGGATG AACGACTTCC TCGAATCTCA GTTTCCCGGC  AAGAGACCTG AAGATGTGGG TCCCAGAGAG TTCGTCGAAG CAGCCGCGGG CCTCAAGGTC TCTTTCCTTG ACACGGATCC GAGCGAGTGG AACCTTCATG GCTGGGAGCG CGACGCCCAG  GGCAAGTTCG ACGATGGATT GCTAGCACAG GTCATCAAGG ATGCCGTGTC GGACGTGGCT GCAGCTTTCC GTGCTCGTGG ACATCCCAGC TGGTTCCGTC CCATCGAAAT CCTCGGCATG  ATCACGGCTC GCAAGGATTG GGCTATGTGC ACCATGAACG AGTTCCGACA CTTTTTGGGC CTCAAGACCT ATTCTTCGTT CAGCGAGTGG AATCCTGATC CCAGAATTTC GAAGGCAGCG  GAGATGCTCT ACGGCGACAT TGACAATCTC GAGCTCTATC CTGGCCTGAT GGCGGAAGAG GCCAAGCCCA GTATCCCTGG AAGTGGTCTC TGCCCCGGTT ACACCATCTC GCGAGGAATT  CTCAGCGACG CTGCTGCCCT GACCCGCGGC GACCGCTTCT ACACGAACGA CTTTTCGACG TCCAATCTGA CGAGCGCCGG CTATGAGTAC TGCACCACAC CTCAGCCTGG CAGTCACGGC  ATGATGGGCA AGCTCATCAT GGCTACGCTA CCTGGTCAGT TCCCGTACAA CTCGATCTAT GCGCTCTACC CCTTCCGCGT GCCCGAGAAG ACCATCGAAA TGCTCAAGGG CAAGCGTGTG  ATCGAGCACT ACGACACAGC TTACCCTGCG CCTGCTCGCC GATGGTACGC CATTGAATCG TATTCAGCGA GCAAGGACAT TCTGGAAGAC AGCCGATACT TTACTGCGCT GCCACCCATG  TCGTATGACG AGAGCCTGAT GTCCTCGGCG CTAGCCTCAA TCCCACGTTG GCAAGATGAA GTGACGGACT TCTACAGCAT CAACACCCTC AATGTGATGA AGAATCGAAG CGTCTCGTTT  TCGCCTACGG GTCGTCAGCG CATCGTTGAT CTGCTCGAGG TTGTCAACAC GGTCTCGGCT CAGTTCACGT CGAAGCTCTT TGCGCTGCCC ACGCCTGGCA GTCATGGCCT GCATCTCGGC  ATGTCGCCCG ATGAGCTCTC CTCGGCACTT GCCAAGCCTC TCGCCTACGC CATGTATGGC TCGTTTGACT TCCAGGGTCA TCAGACATGG CAGCTCGAGG AGGAGTCCGA AGCTTGCACG  CGTCGTCTCA AGACGCTTCT TTGGGCACGT CTTCACACGG TGGACGGCAT TCTGTCGCCC GTGTTTGCTC TTGTGCAGAA CATATCAAAC ATTGTCGGTG GCCCCGGCAA CCTTGCTGCT  AACGGCATGG CTAGGCACTT CTACCACACG ATCTTTGCTT CAGGAAAGAG CAACGACGAG CTCGTCAAAG ACTGCCTGCA CATGATGGTG TCGCTGACGG CAACGCACTC GCTTGTACTC  ATGCAGGCGT TTAAATGGTT CTTCCAGGAG GAGAATGCCG AGCACCTTTC GGTCATGTAC CAGCTGGCCC AGAAGAACGA CCCTGTCTCA AATGCTGAGC TGCGCCACCG CATTATGGAG  GCTTACCGAC TCAACAGCAT CACCCCGCCG CAAGCCAAGT TTGCGCTCCA GGCGGTGGCT CTCCCCGACG TGGTCGCAAA CAAGGTGTAC GTGCAAGTGG GCGACGGCGT TTACATTTCC  CCTTCGGCTC TGTACCGCGA TCCAAAGCTA TCGAACGATC CCGAGCGTTT TAACCCGAGC AGCAAGGCGC CCGTCCGTCT TGGTCTCGGC GATGCACCCA GCCAGTCGAT TCTCGAAATT  GCCCTTCCTG CCATTGCTAA GCAGTTCTTC AAGCACAACG GTCTTCGCTT GGCTCCTGCT GGTCCACCTC CTGTTGTCAA CGATGCGGGT CCGACTCCCA ACCAGAAGTT GCCCTACTTT 
ATCAGTAACC ATGGCGCCGA GTACCCGCTT CCCATTGACA CCTCTATGCA CGTCATCTAC GAGGCCCGCT GA 

Retrieve as FASTA