Entry information : AlmacCP01
Entry ID 5352
Creation 2007-05-15 (Marcel Zamocky)
Last sequence changes 2015-11-03 (Christophe Dunand)
Sequence status complete
Reviewer Achraf Jemmat
Last annotation changes 2015-11-03 (Achraf Jemmat)
Peroxidase information: AlmacCP01
Name AlmacCP01
Class Catalase peroxidase    [Orthogroup: CP001]
Taxonomy Bacteria Bacteroidetes/Chlorobi Sphingobacteria Cyclobacteriaceae Algoriphagus
Organism Algoriphagus machipongonensis    [TaxId: 388413 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type N/D
Inducer N/D
Repressor N/D
Best BLASTp hits
Perox score E-value AlmacCP01
start..stop
S start..stop
SpliCP01 1184 0 8..747 11..748
GfoCP01 1130 0 3..748 5..750
POsCP01 1121 0 22..747 7..730
BBFL7CP03 1120 0 1..747 10..752
Gene structure Fichier Exons
ExonStart..EndSize ExonStart..EndSize ExonStart..EndSize ExonStart..EndSize
N° 1 3827901..3830147 2247  
complement(join(3827901..3830147))


exon

Literature and cross-references AlmacCP01
Literature Alegado,R.A., Ferriera,S., Nusbaum,C., Young,S.K., Zeng,Q., Imamovic,A., Fairclough,S.R. and King,N. Complete Genome Sequence of Algoriphagus sp. PR1, Bacterial Prey of a Colony-Forming Choanoflagellate J. Bacteriol. 193 (6), 1485-1486 (2011)
Protein ref. UniProtKB:   A3I2Q6
DNA ref. GenBank:   AAXU02000001.1 (3830147..3827901)
Protein sequence: AlmacCP01
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   748
PWM (Da):   %s   81890.34  
PI (pH):   %s   5.23
Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
.........1.........2.........3.........4.........5.........6.........7.........8.........9.........0.........1.........2
MEKHHSHSNG SSFETNSEGG KCPFTGGTMQ HSAGGGTRNR DWWPNSLNLG ILRQHSSLTN PMDKDFNYAE EFKTLDLETV KKDIVETLTT SQDWWPADFG HYGPFMIRMA WHSAGTYRIA  DGRGGGGAGA QRFAPLNSWP DNANLDKARL LLWPIKQKYG RKLSWADLMI LAGNCALESM GLKTFGFGGG REDIWEPEED VYWGSEGEWL GDKERYSGDR ELENPLGASH MGLIYVNPEG  PEGKPDPIGA ARDIRETFGR MAMNDYETVA LIAGGHTFGK THGAGDADKY VAAEPAGAPI EEMSLGWKNT LGKGNAEDTI TSGIEVTWTT TPTQWSNNFF ENLFGYEWEL TKSPGGAHQW  RPKDGGGAGT VPDAHIPGKK HAPAMLTTDL ALKFDPEYEK ISRHFYENPD EFADAFARAW FKLTHRDMGP LALYLGPEVP KEELIWQDPI PKVNHKLVEA SDIASLKAKI LDAGLSVSEL  VSTAWASAST FRGGDKRGGA NGARIRLEPM KNWEVNNPSQ LSKVLKTLEG IQSDFNASQS DGKKVSLADL IVLGGCAAVE KAAKAGGHDI EVSFSPGRSD ASQEQTEIES FDALEPAADG  FRNYYKPKHK ASAEELLVDK AQTLTLTAPE MTVLVGGMRV LKANFDNSKH GVFTSTPGSL TNDFFKNVLD LNTTWSATTD SQSIFVGSDR KTGEPKWTGT RVDLIFGSNS ELRALSEVYA 
CADSDKKFVK DFVAAWNKVM NLDRFDLK 

Retrieve as FASTA  
Remarks Complete sequence from genomic. Strain="PR1".
DNA
Send to BLAST
.........1.........2.........3.........4.........5.........6.........7.........8.........9.........0.........1.........2
ATGGAAAAAC ATCATTCACA TTCGAATGGC TCAAGTTTTG AAACCAACTC AGAAGGAGGA AAATGTCCTT TTACTGGAGG TACAATGCAA CACAGCGCTG GTGGAGGAAC TAGAAACCGA  GACTGGTGGC CAAACTCCTT GAATCTTGGA ATCTTAAGAC AGCATTCTTC TTTGACTAAT CCAATGGATA AGGATTTCAA TTATGCCGAA GAATTCAAGA CTTTGGATTT GGAAACTGTA  AAGAAGGATA TTGTAGAAAC GTTGACCACC TCCCAAGATT GGTGGCCTGC AGATTTTGGT CATTATGGCC CTTTTATGAT ACGTATGGCT TGGCATAGTG CAGGTACTTA CCGGATTGCC  GATGGTAGAG GAGGGGGCGG TGCAGGCGCT CAGAGATTTG CTCCATTAAA TTCCTGGCCT GATAATGCCA ATTTGGATAA AGCCAGATTG TTGCTTTGGC CAATCAAACA GAAGTACGGA  AGAAAATTGT CTTGGGCAGA TTTGATGATT CTGGCAGGAA ACTGCGCTTT GGAATCAATG GGACTGAAAA CCTTTGGTTT TGGTGGAGGT AGAGAAGACA TCTGGGAGCC AGAGGAAGAT  GTTTATTGGG GATCTGAAGG AGAATGGCTT GGTGATAAGG AAAGGTATAG TGGAGACCGA GAGCTTGAAA ATCCGCTTGG TGCCTCGCAC ATGGGATTGA TTTATGTGAA CCCAGAAGGT  CCGGAAGGAA AGCCTGATCC AATTGGTGCT GCGAGAGATA TCAGAGAAAC CTTTGGACGC ATGGCGATGA ACGATTACGA AACCGTGGCT TTGATAGCTG GAGGTCATAC TTTTGGCAAG  ACTCACGGTG CTGGAGATGC TGATAAATAT GTAGCTGCTG AGCCAGCTGG AGCACCCATT GAGGAGATGA GTCTTGGTTG GAAAAATACC TTAGGTAAAG GAAATGCTGA AGATACAATC  ACCAGTGGCA TTGAGGTTAC TTGGACAACC ACTCCAACAC AGTGGAGTAA TAACTTCTTC GAAAATCTTT TTGGCTATGA ATGGGAATTA ACCAAAAGTC CAGGAGGAGC ACATCAGTGG  AGACCAAAAG ATGGTGGAGG AGCAGGAACC GTTCCTGATG CACATATCCC AGGTAAAAAA CATGCTCCAG CGATGTTGAC AACAGATTTG GCCTTAAAGT TTGATCCTGA ATACGAGAAG  ATTTCAAGAC ACTTCTATGA AAATCCAGAT GAGTTTGCTG ATGCTTTTGC CCGCGCTTGG TTCAAATTGA CTCATAGAGA TATGGGTCCT TTGGCACTTT ATCTAGGCCC AGAAGTACCT  AAAGAAGAGT TGATCTGGCA AGATCCTATT CCAAAAGTGA ATCATAAACT TGTAGAAGCG TCTGACATTG CTTCCCTAAA AGCAAAAATT CTTGATGCCG GGTTATCCGT GTCGGAATTG  GTTTCCACTG CATGGGCTTC TGCTTCTACA TTTAGAGGTG GAGATAAAAG AGGTGGTGCC AATGGAGCAA GAATCCGTCT GGAACCAATG AAAAATTGGG AAGTAAATAA TCCTTCTCAA  TTGTCTAAAG TTTTGAAGAC TTTGGAAGGA ATTCAATCCG ATTTTAATGC TTCACAATCT GATGGAAAGA AAGTTTCTTT GGCAGATTTG ATTGTTTTAG GTGGATGTGC AGCAGTAGAG  AAAGCTGCTA AAGCCGGAGG ACATGATATA GAAGTTTCAT TCTCTCCAGG TAGATCTGAT GCATCTCAGG AACAAACAGA AATCGAATCA TTTGATGCAC TAGAACCTGC TGCTGATGGA  TTTAGAAATT ATTATAAACC AAAGCATAAA GCTTCTGCTG AAGAGCTATT GGTAGACAAA GCGCAAACAT TGACTTTGAC TGCTCCAGAA ATGACTGTTT TGGTAGGTGG AATGAGAGTT  TTGAAGGCGA ATTTTGATAA TTCTAAACAT GGGGTGTTTA CCTCTACTCC GGGTTCTTTG ACAAACGACT TCTTCAAAAA CGTTTTGGAT TTGAATACAA CTTGGAGCGC AACCACAGAT  TCCCAATCCA TCTTTGTAGG TAGCGATAGA AAAACCGGTG AACCAAAATG GACAGGAACT CGAGTGGATT TGATTTTCGG TTCTAACTCT GAGCTTCGTG CTTTATCTGA AGTCTATGCT 
TGTGCGGATT CTGACAAGAA ATTTGTCAAA GACTTCGTAG CAGCTTGGAA CAAAGTGATG AATCTGGATC GATTTGATTT AAAATAA 

Retrieve as FASTA  
CDS
Send to BLAST
.........1.........2.........3.........4.........5.........6.........7.........8.........9.........0.........1.........2
ATGGAAAAAC ATCATTCACA TTCGAATGGC TCAAGTTTTG AAACCAACTC AGAAGGAGGA AAATGTCCTT TTACTGGAGG TACAATGCAA CACAGCGCTG GTGGAGGAAC TAGAAACCGA  GACTGGTGGC CAAACTCCTT GAATCTTGGA ATCTTAAGAC AGCATTCTTC TTTGACTAAT CCAATGGATA AGGATTTCAA TTATGCCGAA GAATTCAAGA CTTTGGATTT GGAAACTGTA  AAGAAGGATA TTGTAGAAAC GTTGACCACC TCCCAAGATT GGTGGCCTGC AGATTTTGGT CATTATGGCC CTTTTATGAT ACGTATGGCT TGGCATAGTG CAGGTACTTA CCGGATTGCC  GATGGTAGAG GAGGGGGCGG TGCAGGCGCT CAGAGATTTG CTCCATTAAA TTCCTGGCCT GATAATGCCA ATTTGGATAA AGCCAGATTG TTGCTTTGGC CAATCAAACA GAAGTACGGA  AGAAAATTGT CTTGGGCAGA TTTGATGATT CTGGCAGGAA ACTGCGCTTT GGAATCAATG GGACTGAAAA CCTTTGGTTT TGGTGGAGGT AGAGAAGACA TCTGGGAGCC AGAGGAAGAT  GTTTATTGGG GATCTGAAGG AGAATGGCTT GGTGATAAGG AAAGGTATAG TGGAGACCGA GAGCTTGAAA ATCCGCTTGG TGCCTCGCAC ATGGGATTGA TTTATGTGAA CCCAGAAGGT  CCGGAAGGAA AGCCTGATCC AATTGGTGCT GCGAGAGATA TCAGAGAAAC CTTTGGACGC ATGGCGATGA ACGATTACGA AACCGTGGCT TTGATAGCTG GAGGTCATAC TTTTGGCAAG  ACTCACGGTG CTGGAGATGC TGATAAATAT GTAGCTGCTG AGCCAGCTGG AGCACCCATT GAGGAGATGA GTCTTGGTTG GAAAAATACC TTAGGTAAAG GAAATGCTGA AGATACAATC  ACCAGTGGCA TTGAGGTTAC TTGGACAACC ACTCCAACAC AGTGGAGTAA TAACTTCTTC GAAAATCTTT TTGGCTATGA ATGGGAATTA ACCAAAAGTC CAGGAGGAGC ACATCAGTGG  AGACCAAAAG ATGGTGGAGG AGCAGGAACC GTTCCTGATG CACATATCCC AGGTAAAAAA CATGCTCCAG CGATGTTGAC AACAGATTTG GCCTTAAAGT TTGATCCTGA ATACGAGAAG  ATTTCAAGAC ACTTCTATGA AAATCCAGAT GAGTTTGCTG ATGCTTTTGC CCGCGCTTGG TTCAAATTGA CTCATAGAGA TATGGGTCCT TTGGCACTTT ATCTAGGCCC AGAAGTACCT  AAAGAAGAGT TGATCTGGCA AGATCCTATT CCAAAAGTGA ATCATAAACT TGTAGAAGCG TCTGACATTG CTTCCCTAAA AGCAAAAATT CTTGATGCCG GGTTATCCGT GTCGGAATTG  GTTTCCACTG CATGGGCTTC TGCTTCTACA TTTAGAGGTG GAGATAAAAG AGGTGGTGCC AATGGAGCAA GAATCCGTCT GGAACCAATG AAAAATTGGG AAGTAAATAA TCCTTCTCAA  TTGTCTAAAG TTTTGAAGAC TTTGGAAGGA ATTCAATCCG ATTTTAATGC TTCACAATCT GATGGAAAGA AAGTTTCTTT GGCAGATTTG ATTGTTTTAG GTGGATGTGC AGCAGTAGAG  AAAGCTGCTA AAGCCGGAGG ACATGATATA GAAGTTTCAT TCTCTCCAGG TAGATCTGAT GCATCTCAGG AACAAACAGA AATCGAATCA TTTGATGCAC TAGAACCTGC TGCTGATGGA  TTTAGAAATT ATTATAAACC AAAGCATAAA GCTTCTGCTG AAGAGCTATT GGTAGACAAA GCGCAAACAT TGACTTTGAC TGCTCCAGAA ATGACTGTTT TGGTAGGTGG AATGAGAGTT  TTGAAGGCGA ATTTTGATAA TTCTAAACAT GGGGTGTTTA CCTCTACTCC GGGTTCTTTG ACAAACGACT TCTTCAAAAA CGTTTTGGAT TTGAATACAA CTTGGAGCGC AACCACAGAT  TCCCAATCCA TCTTTGTAGG TAGCGATAGA AAAACCGGTG AACCAAAATG GACAGGAACT CGAGTGGATT TGATTTTCGG TTCTAACTCT GAGCTTCGTG CTTTATCTGA AGTCTATGCT 
TGTGCGGATT CTGACAAGAA ATTTGTCAAA GACTTCGTAG CAGCTTGGAA CAAAGTGATG AATCTGGATC GATTTGATTT AAAATAA 

Retrieve as FASTA