Entry information : PvPrx13 (Phvul.001G106500)
Entry ID 5413
Creation 2007-06-15 (Christophe Dunand)
Last sequence changes 2014-03-19 (Maxime Neel)
Sequence status complete
Reviewer Christophe Dunand
Last annotation changes 2014-03-20 (Christophe Dunand)
Peroxidase information: PvPrx13 (Phvul.001G106500)
Name (synonym) PvPrx13 (Phvul.001G106500)
Class Class III peroxidase    [Orthogroup: Prx019]
Taxonomy Eukaryota Viridiplantae Streptophyta Fabaceae Phaseolus
Organism Phaseolus vulgaris    [TaxId: 3885 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type N/D
Inducer N/D
Repressor N/D
Best BLASTp hits
Perox score E-value PvPrx13
start..stop
S start..stop
GmPrx125 495 1e-178 4..314 3..312
MtPrx89 439 8e-157 14..314 13..315
MtPrx[P]116 385 1e-135 9..314 4..310
LePrx19 385 2e-135 9..313 19..321
Literature and cross-references PvPrx13 (Phvul.001G106500)
Literature Koinange,E.M., Singh,S.P. and Gepts,P. Genetic Control of the domestication syndrome in common-bean. Crop Sci. 36, 1037-1045 (1996)
DNA ref. GenBank:   AY028716 Phytozome 12:   Chr01
Protein sequence: PvPrx13 (Phvul.001G106500)
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   315 (295)
PWM (Da):   %s   34031.41 (31760.1)  
PI (pH):   %s   7.29 (6.51) Peptide Signal:   %s   cut: 20 range:20-314
Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
MKIIVILPFF CIILPLVFGD LKVGFYESSC PEAESIVKKA VQNRFNRDKT ITAALLRLHF HDCAVRGCDA SILINSTTSN TAEKDSGTND DVRGFDLIDK VKESLESACP STVSCADIIT  LATRSAVALS GGPKYEVPTG RRDGLVSDVR EVNIPGPTSP VSIISEFFNR NLGLTTQEMV TLFGAHTVGV AHCSFFADRL STPDPTMDPA LNTKLVKLCS SRDDDPSTPL DQNTSLLVDN 
KFYQQILAKK GVLQIDQQLA LDKGTKGFVT DFASNGAKFQ KSFANAMVKM GSVDVLVGSQ GEIRKKCSVF NTRN* 

Retrieve as FASTA  
Remarks Complete sequence from genomic. No EST found.
Promoter
Send to BLAST
Send to cis Analysis
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
GTGAACGAAA ATAGTTTGAT GGTCCCTACA TTTTCTTATG AGCATTTTTA ACAAAAGGTG CCCCATTTCC TTTTTTTTTT CTTTAAATAG AATTTATCTT GTATTTTTTT GCATATGGGT  CTATGATTCA GAAGGAAAAT AAAAATGGTG GTTATTGAGC ATTATATGGA TTTGAGGACA GATCCTTCTC AAGATGGAGA TCTGATGGAG GACATCCAAC CACTACAACT TGAACTTATA  AGATTGGGGA AGATGGAGCC TTGATCGAGG AGAGTCCTCT TGTTGAAAAT CTTTTCCTTC TTCTTAGTTT TAAAATGTTA ATATTGGGAG TAGAAAAATG TATAAGATTA GGGTTTTCTT  TGTGTAAAAA AAATAGATGC ATAAGAGGGG TCAATTTGGA TACTGCATGA GAGTTGATTG GGAAAGTCAA AGCCTAAGTA GAGTGTCAAC TTTGAAGTCA ACATGCAACA TTCTTCATTA  GGAAAGTAAA AAACCCTAAT TGAAGAGACA TGAAGAGAGT TAACCATGTC CTCCCACAAG TCCATGACTA TGCGTCCATC TAATGAGCAT TGGACCTTAT AAACACAATA AAAGAGGTTG  AAATGAGGCA TTTGCGACTT GGTTCCAAGG AGACTAAGAA AATTATAAGT TTAGTTACAC TTTTCACAAT TAGTCACACA TCTCCTAGTT CATTGAGTGT TAAGGAGCTC CTCTAACTAT  AGATAAAACA AAGTAAGAAT TGAGTTTGTA TATTAACTTG TCTTCTTGTT CTTCAAAGTC ACTTAAAAAG GAGAGTATTC CTCTCCTAAA TTCTCCACCG AAGGAACATT TCTTGAAAGT  GGGTACCTCT CAAGTTTCTC TCTTGAAGTT TGAGAAAAAG TTTGAAGTTT TTATAATCTT TCGCTGACGT TTGAAGGGTG TTTCCATCAA CACACAAAAA TCACTATCCT TTCTTTGTTA  CTATTTAAGA GGAAAAATAA GTTTGTGCTT TCACTTCAAG AAAATCATTA AATAGAAACC AATTTAAGAG ACAAACAATA ATTAGTTGTT ATAGTAACTA AATTAGACAC CATTTTAGAG  ACTAAAAATT TTTTTGGATT CTAAATTGGT ATCTAATTAA CTAACAAAGT TTTTGCTACC AAATTTAGAA TCTAAATAAT TGGTAGTTAA AAACATTGGT AGCTAATTAG ATACCAATTT  AGAAACTATT TAATAATAAT AGAAACTAAT TTAGAAACCA AAACTTTTTT TAGTCTTTAA AATGGTCTTT AATTTAGTCA CTATAGCAAC TAATTATTTT TGTCTCTAAA ATTGGTTTTT  ATTTCATGAT TTTCTTCAAA TATTTAAACT TCTTTTAATA ATTTTTTTTT CTATTTCTAA GAGATAAGAC TATTTTTTCT GCTTGGAGTT TAAAAGAGAA GTATTGTAAT TTTTTTTTCC  TTTAATGAAA TTACGTTATT TTCATCTCTT ATTTAGTTGA ATTTTTATGT TAGTAATCTA GTATCTAACA TGTAATAATT TTGTAGTTTT GTGTTGAACA TGTTGCATTG TAACGCTTTC  GAGAAAAGTA ATATGAATAT CATACAGCTA TCAGAATTTC AGCATTACCT TAATGGAGTA ATTTTCAACG ACAAATTCTC ACAGTTTGGC TGTATTAGCT GCATATCGGC AATACAAAAT  TATAAGGCGG CAATTTGCTG TGAACTACAG TTTGTTCTGT CTCTCTATAT ATATATGTAG TCAAATTCCA AGAGTCACAA AACTTCTTGT TGAAAAGGTA AAAATTTTAA GCATCCAAAA  TGATGAAGAT CATTGTTATA TTGCCCTTCT TTTGCATCAT ACTTCCCTTA GTATTTGGGG ACTTGAAGGT TGGATTCTAT GAGTCTTCAT GCCCAGAAGC GGAGTCCATT GTGAAGAAAG 
CTGTGCAGAA TCGATTCAAT CGTGACAAGA CCATTACTGC AGCGTTGCTT CGCTTGCATT TCCATGACTG TGCTGTCAGA 

Retrieve as FASTA  
DNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGAAGATCA TTGTTATATT GCCCTTCTTT TGCATCATAC TTCCCTTAGT ATTTGGGGAC TTGAAGGTTG GATTCTATGA GTCTTCATGC CCAGAAGCGG AGTCCATTGT GAAGAAAGCT  GTGCAGAATC GATTCAATCG TGACAAGACC ATTACTGCAG CGTTGCTTCG CTTGCATTTC CATGACTGTG CTGTCAGAGT AAGATACCCT TAATCTCAAT CTCAGCTCAC ACATATAGAA  AGAGCCAATG CTAGATGCCC ATTCTTTCAA TGTATATAGT CTTTATTCCT TTAAAGCAAA TTGAACAAAT TTTATGAGTT CTGATGTTTT CTGTCCATTT TGAATCGTTA TGCATATCTT  TTATCTGTTA ATTTTGAATT TTTGTGTCTA ATTTCTATAG TTTAATTGAT CATTTGGCTT TTATATCTAA GCTAATTGTT CGTTGTACTT TCTATTTTAA AATCTCAAGT TTTCATTACT  ACACAAAATA ACTTTCTATC TTTTATAGTG TATTTTTATT TGTTTCATGC TAAAATATAA TCTATTGCTT CTTTATTATG AAAGTAAAAT AACAGATAGT CTTTTTTATA TCTATTATAA  TGGTATGATT TTGTTAAGTA AAATTGATTC TCAAACACAC TATTAGTCCA ATATTCTAAA ACTATTAGGA AATGGAGACC TAACACAATG TAATTAAAAG CAATTAATCG TATAGGAACT  AAACATATAA GTTTTATATG TGCTTTTATA AGTATTTTTC ATACTATATA TCATTGTTTT TAAAAGAAAT CGAGAATATG TTGAGTAAAC TATTATAGAT TTGAAAAGTA TTGAAGGTAA  AACTTTGATT TTTGGAATGT GTGGTTAAAA AAGAGAGTAA TAGAGAAAAA GTTGTAAATA TAATGACGTG ATAAAAAAAA TAGGTAACCT TGTCTCTAAT GGATTTAAAT ATTTTATGAT  AAAATATGTT GTTTGAATAT AATTTTTAGA AAAAAATTAA AAGTATAAGA ATTTATAAAA GTAATTTGAT TACTTAAATT AATAAGAGTT TTCTCGACTA ATACTTTTAC AACTATTTTT  TATCTTGATG TGATCTAATT TTTTTAATAA ACATTAATAA AACTATTTTT TTTATAAACA CTGTAAGAAA ATGTTTAATT CTAATGATTT TTTTAATATT TTCTTTTAAT TAACTTATTA  ATATTTTTAA AATGATAACT TTAACTCATT TTACGTCACT TTCTGCACAT ATAAAATATT TTTAACACTA TCTTTTCTTT TTCTTCCGTG TACAATATGT TAATGTGGTG TTATTTTCTG  CACAACCAAC CTACTTGAAC CAACAACAAT TCACAACTAA AGTAATTAAC AAACATTCTT CTTAATTTGG AGCAACAGGG TTGCGATGCA TCCATACTTA TAAACTCCAC AACGTCTAAC  ACAGCAGAGA AAGATTCAGG AACAAACGAC GACGTTCGGG GCTTTGACCT AATCGATAAA GTGAAGGAAA GCCTGGAATC TGCATGCCCT TCAACAGTGT CATGTGCAGA CATCATAACC  CTAGCTACCC GAAGTGCAGT GGCCTTATCT GGAGGACCCA AATACGAAGT TCCCACGGGA AGACGCGATG GATTGGTCTC AGACGTCAGA GAAGTGAACA TTCCAGGACC CACCAGCCCC  GTCTCAATAA TCTCTGAATT TTTCAATAGG AATTTGGGCC TCACAACGCA GGAAATGGTG ACCCTTTTTG GTGCACACAC AGTTGGGGTT GCACACTGCA GTTTCTTTGC TGATAGACTC  TCGACTCCTG ACCCTACAAT GGACCCTGCG TTGAATACTA AGTTGGTGAA GTTGTGCAGC TCCAGAGATG ATGATCCTTC TACTCCCTTA GACCAGAACA CTTCTCTGCT TGTTGATAAC  AAGTTCTACC AGCAGATTCT TGCGAAGAAA GGGGTGCTGC AGATTGATCA GCAACTTGCC TTGGATAAAG GTACCAAAGG GTTTGTCACA GATTTCGCTT CTAATGGGGC TAAGTTCCAA 
AAGAGCTTTG CAAATGCGAT GGTAAAGATG GGGAGTGTTG ATGTTCTGGT TGGGAGTCAA GGAGAAATCC GCAAGAAATG CTCCGTTTTC AATACCCGCA ACTAG 

Retrieve as FASTA  
CDS
Send to BLAST
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ATGAAGATCA TTGTTATATT GCCCTTCTTT TGCATCATAC TTCCCTTAGT ATTTGGGGAC TTGAAGGTTG GATTCTATGA GTCTTCATGC CCAGAAGCGG AGTCCATTGT GAAGAAAGCT  GTGCAGAATC GATTCAATCG TGACAAGACC ATTACTGCAG CGTTGCTTCG CTTGCATTTC CATGACTGTG CTGTCAGAGG TTGCGATGCA TCCATACTTA TAAACTCCAC AACGTCTAAC  ACAGCAGAGA AAGATTCAGG AACAAACGAC GACGTTCGGG GCTTTGACCT AATCGATAAA GTGAAGGAAA GCCTGGAATC TGCATGCCCT TCAACAGTGT CATGTGCAGA CATCATAACC  CTAGCTACCC GAAGTGCAGT GGCCTTATCT GGAGGACCCA AATACGAAGT TCCCACGGGA AGACGCGATG GATTGGTCTC AGACGTCAGA GAAGTGAACA TTCCAGGACC CACCAGCCCC  GTCTCAATAA TCTCTGAATT TTTCAATAGG AATTTGGGCC TCACAACGCA GGAAATGGTG ACCCTTTTTG GTGCACACAC AGTTGGGGTT GCACACTGCA GTTTCTTTGC TGATAGACTC  TCGACTCCTG ACCCTACAAT GGACCCTGCG TTGAATACTA AGTTGGTGAA GTTGTGCAGC TCCAGAGATG ATGATCCTTC TACTCCCTTA GACCAGAACA CTTCTCTGCT TGTTGATAAC  AAGTTCTACC AGCAGATTCT TGCGAAGAAA GGGGTGCTGC AGATTGATCA GCAACTTGCC TTGGATAAAG GTACCAAAGG GTTTGTCACA GATTTCGCTT CTAATGGGGC TAAGTTCCAA 
AAGAGCTTTG CAAATGCGAT GGTAAAGATG GGGAGTGTTG ATGTTCTGGT TGGGAGTCAA GGAGAAATCC GCAAGAAATG CTCCGTTTTC AATACCCGCA ACTAG 

Retrieve as FASTA  
cDNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGAAGATCA TTGTTATATT GCCCTTCTTT TGCATCATAC TTCCCTTAGT ATTTGGGGAC TTGAAGGTTG GATTCTATGA GTCTTCATGC CCAGAAGCGG AGTCCATTGT GAAGAAAGCT  GTGCAGAATC GATTCAATCG TGACAAGACC ATTACTGCAG CGTTGCTTCG CTTGCATTTC CATGACTGTG CTGTCAGAGG TTGCGATGCA TCCATACTTA TAAACTCCAC AACGTCTAAC  ACAGCAGAGA AAGATTCAGG AACAAACGAC GACGTTCGGG GCTTTGACCT AATCGATAAA GTGAAGGAAA GCCTGGAATC TGCATGCCCT TCAACAGTGT CATGTGCAGA CATCATAACC  CTAGCTACCC GAAGTGCAGT GGCCTTATCT GGAGGACCCA AATACGAAGT TCCCACGGGA AGACGCGATG GATTGGTCTC AGACGTCAGA GAAGTGAACA TTCCAGGACC CACCAGCCCC  GTCTCAATAA TCTCTGAATT TTTCAATAGG AATTTGGGCC TCACAACGCA GGAAATGGTG ACCCTTTTTG GTGCACACAC AGTTGGGGTT GCACACTGCA GTTTCTTTGC TGATAGACTC  TCGACTCCTG ACCCTACAAT GGACCCTGCG TTGAATACTA AGTTGGTGAA GTTGTGCAGC TCCAGAGATG ATGATCCTTC TACTCCCTTA GACCAGAACA CTTCTCTGCT TGTTGATAAC  AAGTTCTACC AGCAGATTCT TGCGAAGAAA GGGGTGCTGC AGATTGATCA GCAACTTGCC TTGGATAAAG GTACCAAAGG GTTTGTCACA GATTTCGCTT CTAATGGGGC TAAGTTCCAA 
AAGAGCTTTG CAAATGCGAT GGTAAAGATG GGGAGTGTTG ATGTTCTGGT TGGGAGTCAA GGAGAAATCC GCAAGAAATG CTCCGTTTTC AATACCCGCA ACTAG 

Retrieve as FASTA