Entry information : LacNadPrx01 ( Npx)
Entry ID 5422
Creation 2007-06-18 (Michele Oliva)
Last sequence changes 2016-01-29 (Achraf Jemmat)
Sequence status complete
Reviewer Christophe Dunand
Last annotation changes 2016-01-29 (Christophe Dunand)
Peroxidase information: LacNadPrx01 ( Npx)
Name (synonym) LacNadPrx01 ( Npx)
Class NADH peroxidase    [Orthogroup: NadPrx001]
Taxonomy Bacteria Firmicutes Bacilli Lactobacillaceae Lactobacillus
Organism Lactobacillus acidophilus    [TaxId: 1579 ]
Cellular localisation Cytosolic
Tissue type N/D
Inducer N/D
Repressor N/D
Best BLASTp hits
Perox score E-value LacNadPrx01
start..stop
S start..stop
LgNadPrx01 850 0 1..454 1..454
PpenNadPrx01 652 0 1..454 1..456
LcaNadPrx01 626 0 1..454 1..456
LbrNadPrx01 613 0 1..454 1..456
Literature and cross-references LacNadPrx01 ( Npx)
Literature Altermann et al.,Complete genome sequence of the probiotic lactic acid bacterium Lactobacillus acidophilus NCFM. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 102:3906-3912(2005).
Protein ref. GenBank:   AAV43226.1 UniProtKB:   Q5FJ98
DNA ref. GenBank:   CP000033.3 (1392345..1393724) [Sequencing error]
Protein sequence: LacNadPrx01 ( Npx)
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   454
PWM (Da):   %s   49757.2  
PI (pH):   %s   4.68
Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
MDKRKVIIVG ASHGGHESAI ELLDKYDDVD VTIYEAGDFI SFMSCGMQLF LENKVTAEDD VRNFAPEDIE KKGGHVYANH EVTAVHPDKK TVTVKDLTND SEEEVSYDKL ILSSGVTPKV  LPVPGSDLKN IYLMRGRDWA SKLKAATTDP AIKNVAIIGA GYIGTEASEV FAKAGKHVTL MDMIDRPLGT YLNPELLDIL EPTFKDHMDL KMGVKIEGFN GTDKVESVET DNGDVSADLV  VVSAGVSPNT DWLKGTVDLD QRGWIKTDPY LRTNVKDVYA IGDAILPYSI PAGKPMPIAL ATTARREAQY LVDHLFEAKP DQVFKGVIGA SALSVFDYHF ATAGLNQFSA EKNDIPYGTS 
FYEDSMRPAY IPEKDNPKVY VSLTFNPYNH QILGGAVLSK YDVTAQGNVL ALAISHKMTL EDLAEQDFFF QPGFDRQWSL LNLAAQHALG LARF 

Retrieve as FASTA  
Remarks Complete sequence from genomic. Strain="NCFM"
DNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGGATAAGA GAAAAGTAAT TATTGTTGGT GCTTCACATG GTGGTCATGA ATCAGCAATT GAGTTATTAG ACAAGTACGA TGACGTTGAC GTAACTATTT ACGAAGCCGG TGACTTCATT  TCATTCATGT CATGCGGGAT GCAATTATTC CTTGAAAATA AAGTTACTGC AGAAGATGAT GTAAGAAACT TTGCACCTGA AGATATTGAG AAAAAAGGCG GTCATGTTTA TGCCAATCAT  GAAGTGACTG CTGTTCATCC CGACAAGAAG ACAGTTACTG TAAAAGACTT AACTAATGAT TCTGAAGAAG AAGTTAGTTA TGATAAATTA ATTTTATCTT CTGGTGTAAC GCCAAAAGTT  TTGCCTGTTC CAGGTAGTGA TTTAAAGAAT ATCTACTTAA TGCGTGGACG TGACTGGGCT TCTAAGTTAA AAGCGGCAAC CACTGATCCA GCAATTAAGA ACGTAGCTAT CATTGGTGCA  GGTTACATTG GTACTGAAGC TAGCGAAGTA TTTGCCAAAG CAGGCAAGCA TGTAACCTTG ATGGATATGA TTGATCGTCC TTTAGGAACT TACCTTAATC CTGAATTATT GGATATCTTA  GAACCAACAT TTAAGGATCA TATGGATCTT AAAATGGGCG TTAAGATTGA GGGATTTAAT GGCACTGATA AAGTTGAAAG TGTCGAGACA GACAACGGTG ATGTATCTGC TGACTTAGTT  GTGGTTTCTG CTGGTGTAAG TCCTAACACT GATTGGTTAA AGGGCACTGT TGATCTTGAT CAAAGAGGCT GGATTAAGAC TGATCCATAC TTGAGAACTA ATGTTAAAGA TGTTTATGCA  ATTGGAGATG CTATTTTGCC ATATTCAATT CCTGCAGGTA AACCAATGCC AATTGCATTA GCAACAACTG CTCGTCGTGA AGCACAATAT TTAGTCGATC ACTTATTTGA AGCTAAACCT  GATCAAGTAT TCAAAGGTGT AATTGGTGCT TCTGCATTAA GCGTATTTGA TTATCATTTT GCTACAGCAG GTTTGAATCA ATTCTCAGCT GAAAAGAATG ATATTCCATA TGGAACTAGT  TTTTATGAAG ATTCAATGCG TCCAGCTTAT ATTCCAGAAA AGGATAATCC TAAGGTTTAT GTAAGTTTAA CTTTCAATCC ATATAACCAT CAAATTTTGG GTGGTGCTGT TCTTTCTAAA  TATGACGTTA CTGCTCAAGG CAATGTTTTG GCTTTGGCAA TCAGTCATAA AATGACTCTT GAAGATTTGG CTGAGCAAGA TTTCTTCTTC CAACCCGGAT TTGACCGCCA ATGGAGCTTA 
CTCAACTTAG CCGCACAACA TGCCTTAGGT TTAGCTAGAT TT 

Retrieve as FASTA  
CDS
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGGATAAGA GAAAAGTAAT TATTGTTGGT GCTTCACATG GTGGTCATGA ATCAGCAATT GAGTTATTAG ACAAGTACGA TGACGTTGAC GTAACTATTT ACGAAGCCGG TGACTTCATT  TCATTCATGT CATGCGGGAT GCAATTATTC CTTGAAAATA AAGTTACTGC AGAAGATGAT GTAAGAAACT TTGCACCTGA AGATATTGAG AAAAAAGGCG GTCATGTTTA TGCCAATCAT  GAAGTGACTG CTGTTCATCC CGACAAGAAG ACAGTTACTG TAAAAGACTT AACTAATGAT TCTGAAGAAG AAGTTAGTTA TGATAAATTA ATTTTATCTT CTGGTGTAAC GCCAAAAGTT  TTGCCTGTTC CAGGTAGTGA TTTAAAGAAT ATCTACTTAA TGCGTGGACG TGACTGGGCT TCTAAGTTAA AAGCGGCAAC CACTGATCCA GCAATTAAGA ACGTAGCTAT CATTGGTGCA  GGTTACATTG GTACTGAAGC TAGCGAAGTA TTTGCCAAAG CAGGCAAGCA TGTAACCTTG ATGGATATGA TTGATCGTCC TTTAGGAACT TACCTTAATC CTGAATTATT GGATATCTTA  GAACCAACAT TTAAGGATCA TATGGATCTT AAAATGGGCG TTAAGATTGA GGGATTTAAT GGCACTGATA AAGTTGAAAG TGTCGAGACA GACAACGGTG ATGTATCTGC TGACTTAGTT  GTGGTTTCTG CTGGTGTAAG TCCTAACACT GATTGGTTAA AGGGCACTGT TGATCTTGAT CAAAGAGGCT GGATTAAGAC TGATCCATAC TTGAGAACTA ATGTTAAAGA TGTTTATGCA  ATTGGAGATG CTATTTTGCC ATATTCAATT CCTGCAGGTA AACCAATGCC AATTGCATTA GCAACAACTG CTCGTCGTGA AGCACAATAT TTAGTCGATC ACTTATTTGA AGCTAAACCT  GATCAAGTAT TCAAAGGTGT AATTGGTGCT TCTGCATTAA GCGTATTTGA TTATCATTTT GCTACAGCAG GTTTGAATCA ATTCTCAGCT GAAAAGAATG ATATTCCATA TGGAACTAGT  TTTTATGAAG ATTCAATGCG TCCAGCTTAT ATTCCAGAAA AGGATAATCC TAAGGTTTAT GTAAGTTTAA CTTTCAATCC ATATAACCAT CAAATTTTGG GTGGTGCTGT TCTTTCTAAA  TATGACGTTA CTGCTCAAGG CAATGTTTTG GCTTTGGCAA TCAGTCATAA AATGACTCTT GAAGATTTGG CTGAGCAAGA TTTCTTCTTC CAACCCGGAT TTGACCGCCA ATGGAGCTTA 
CTCAACTTAG CCGCACAACA TGCCTTAGGT TTAGCTAGAT TT 

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