Entry information : LgNadPrx01
Entry ID 5423
Creation 2007-06-19 (Michele Oliva)
Last sequence changes 2016-01-29 (Achraf Jemmat)
Sequence status complete
Reviewer Christophe Dunand
Last annotation changes 2016-01-29 (Christophe Dunand)
Peroxidase information: LgNadPrx01
Name LgNadPrx01
Class NADH peroxidase    [Orthogroup: NadPrx001]
Taxonomy Bacteria Firmicutes Bacilli Lactobacillaceae Lactobacillus
Organism Lactobacillus gasseri    [TaxId: 1596 ]
Cellular localisation Cytosolic
Tissue type N/D
Inducer N/D
Repressor N/D
Best BLASTp hits
Perox score E-value LgNadPrx01
start..stop
S start..stop
LacNadPrx01 850 0 1..454 1..454
PpenNadPrx01 644 0 1..454 1..456
LcaNadPrx01 615 0 1..454 1..456
LmeNadPrx01 614 0 1..454 1..456
Literature and cross-references LgNadPrx01
Literature Makarova K et al. Comparative genomics of the lactic acid bacteria. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 103:15611-15616(2006).
Protein ref. GenBank:   ABJ60355.1 UniProtKB:   Q043L7
DNA ref. GenBank:   CP000413.1 (973875..975239)
Protein sequence: LgNadPrx01
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   454
PWM (Da):   %s   49886.25  
PI (pH):   %s   4.93
Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
MDKCKIVIVG ASHGGHESAI ELLDKYNDVD VTVYEAGDFI SFMSCGMQLY LENKVTAEDD VRNFAPEDVE KKGGHVYANH EVTAIHPENK TVTVKDLTNN SEEEVQYDRL ILSSGVTPKV  LPVPGNDLKN IYLMRGRDWA SKLMSAVNDP AIKNVAIVGA GYIGTEASEV FAKAGKHVTL MDMIDRPLGT YLNSELLDVL EPTFKKNMDL KMGVKIEGFN GNGKVESVKT DQGDVPADLV  VVSAGVMPNT DWLKGVVDLD QRGWIKTDPY LRTNVKDVYA IGDAILPLSI PAGKPMPIAL ATTTRREAQY VVDHIFEDKP DRAFKGVIGA SALSVFDYHF ATAGLNQFSA AKNKLDYQTS 
FYEDNMRPAY VPEADNPKVY VSLTFNPYTH QILGGAVLSK YDITAQGNVL ALAISHKMRL EDLAEQDFFF QPGFDRQWSL LNLAAQHALG MARF 

Retrieve as FASTA  
Remarks Complete sequence from genomic. Strain="ATCC 33323 / DSM 20243".
DNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGGATAAAT GTAAAATTGT AATTGTTGGT GCTTCACATG GTGGTCATGA ATCAGCAATT GAGCTGTTAG ATAAATATAA TGATGTAGAT GTAACTGTTT ATGAAGCTGG CGACTTTATT  TCATTTATGT CCTGTGGGAT GCAGCTGTAT TTAGAAAATA AAGTTACAGC AGAAGATGAC GTTAGAAACT TTGCCCCAGA AGATGTTGAA AAGAAGGGCG GTCATGTTTA TGCCAACCAT  GAAGTAACTG CTATTCATCC TGAAAATAAG ACTGTTACAG TTAAGGACTT AACTAATAAT TCTGAAGAAG AAGTCCAATA TGATAGGTTG ATTCTTTCTT CAGGCGTAAC TCCTAAAGTT  TTACCTGTGC CAGGTAATGA TCTCAAGAAT ATCTATTTGA TGCGTGGACG TGACTGGGCT TCTAAGTTGA TGAGTGCTGT TAACGATCCA GCAATTAAAA ATGTTGCTAT TGTTGGTGCT  GGTTATATCG GTACTGAAGC TAGCGAAGTA TTTGCTAAAG CTGGCAAGCA TGTAACCTTA ATGGATATGA TTGATCGCCC ATTAGGAACC TATCTTAATT CTGAATTACT CGATGTTTTG  GAACCTACCT TTAAGAAAAA TATGGACTTG AAGATGGGTG TCAAAATTGA AGGCTTTAAT GGTAATGGAA AAGTTGAAAG TGTTAAAACT GATCAAGGTG ATGTCCCAGC TGATCTAGTT  GTTGTTTCAG CAGGTGTAAT GCCTAACACT GACTGGCTAA AGGGCGTAGT TGATTTAGAT CAAAGAGGTT GGATTAAGAC TGATCCATAC TTGAGAACTA ATGTGAAGGA CGTTTACGCC  ATTGGAGATG CAATTCTGCC GCTTTCGATT CCAGCTGGTA AGCCAATGCC AATTGCCTTA GCCACTACTA CTAGAAGAGA AGCTCAATAT GTGGTCGATC ATATCTTCGA GGATAAGCCA  GACCGTGCCT TCAAAGGTGT TATTGGTGCC TCAGCATTAA GTGTATTTGA CTATCATTTT GCTACAGCTG GATTAAATCA ATTCTCAGCT GCTAAGAACA AGCTTGATTA CCAAACTAGT  TTCTATGAAG ATAACATGCG CCCAGCTTAT GTTCCAGAAG CAGATAATCC TAAGGTATAT GTCAGCTTAA CCTTTAATCC ATACACTCAC CAAATTCTAG GTGGTGCAGT ACTTTCTAAG  TATGATATTA CTGCTCAAGG CAATGTTTTG GCTTTAGCAA TTAGTCATAA GATGCGTTTG GAAGACTTAG CTGAACAAGA CTTCTTCTTC CAACCAGGAT TTGATCGTCA ATGGAGTTTG 
CTTAACTTAG CTGCACAACA TGCCTTAGGT ATGGCAAGAT TCTAA 

Retrieve as FASTA  
CDS
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGGATAAAT GTAAAATTGT AATTGTTGGT GCTTCACATG GTGGTCATGA ATCAGCAATT GAGCTGTTAG ATAAATATAA TGATGTAGAT GTAACTGTTT ATGAAGCTGG CGACTTTATT  TCATTTATGT CCTGTGGGAT GCAGCTGTAT TTAGAAAATA AAGTTACAGC AGAAGATGAC GTTAGAAACT TTGCCCCAGA AGATGTTGAA AAGAAGGGCG GTCATGTTTA TGCCAACCAT  GAAGTAACTG CTATTCATCC TGAAAATAAG ACTGTTACAG TTAAGGACTT AACTAATAAT TCTGAAGAAG AAGTCCAATA TGATAGGTTG ATTCTTTCTT CAGGCGTAAC TCCTAAAGTT  TTACCTGTGC CAGGTAATGA TCTCAAGAAT ATCTATTTGA TGCGTGGACG TGACTGGGCT TCTAAGTTGA TGAGTGCTGT TAACGATCCA GCAATTAAAA ATGTTGCTAT TGTTGGTGCT  GGTTATATCG GTACTGAAGC TAGCGAAGTA TTTGCTAAAG CTGGCAAGCA TGTAACCTTA ATGGATATGA TTGATCGCCC ATTAGGAACC TATCTTAATT CTGAATTACT CGATGTTTTG  GAACCTACCT TTAAGAAAAA TATGGACTTG AAGATGGGTG TCAAAATTGA AGGCTTTAAT GGTAATGGAA AAGTTGAAAG TGTTAAAACT GATCAAGGTG ATGTCCCAGC TGATCTAGTT  GTTGTTTCAG CAGGTGTAAT GCCTAACACT GACTGGCTAA AGGGCGTAGT TGATTTAGAT CAAAGAGGTT GGATTAAGAC TGATCCATAC TTGAGAACTA ATGTGAAGGA CGTTTACGCC  ATTGGAGATG CAATTCTGCC GCTTTCGATT CCAGCTGGTA AGCCAATGCC AATTGCCTTA GCCACTACTA CTAGAAGAGA AGCTCAATAT GTGGTCGATC ATATCTTCGA GGATAAGCCA  GACCGTGCCT TCAAAGGTGT TATTGGTGCC TCAGCATTAA GTGTATTTGA CTATCATTTT GCTACAGCTG GATTAAATCA ATTCTCAGCT GCTAAGAACA AGCTTGATTA CCAAACTAGT  TTCTATGAAG ATAACATGCG CCCAGCTTAT GTTCCAGAAG CAGATAATCC TAAGGTATAT GTCAGCTTAA CCTTTAATCC ATACACTCAC CAAATTCTAG GTGGTGCAGT ACTTTCTAAG  TATGATATTA CTGCTCAAGG CAATGTTTTG GCTTTAGCAA TTAGTCATAA GATGCGTTTG GAAGACTTAG CTGAACAAGA CTTCTTCTTC CAACCAGGAT TTGATCGTCA ATGGAGTTTG 
CTTAACTTAG CTGCACAACA TGCCTTAGGT ATGGCAAGAT TCTAA 

Retrieve as FASTA