Entry information : LeRboh01 (RBOH1)
Entry ID 5573
Creation 2007-07-23 (Christophe Dunand)
Last sequence changes 2010-07-16 (Christophe Dunand)
Sequence status complete
Reviewer Not yet reviewed
Last annotation changes 2010-07-16 (Christophe Dunand)
Peroxidase information: LeRboh01 (RBOH1)
Name (synonym) LeRboh01 (RBOH1)
Class Respiratory burst oxidase homolog    [Orthogroup: Rboh001]
Taxonomy Eukaryota Viridiplantae Streptophyta Solanaceae Solanum
Organism Lycopersicon esculentum (Tomato)    [TaxId: 4081 ]
Cellular localisation N/D
Tissue types Flowers
Leaves
Inducer N/D
Repressor N/D
Best BLASTp hits
Perox score E-value LeRboh01
start..stop
S start..stop
StRboh01 1976 0 1..963 1..963
NtRboh06a 1823 0 1..963 1..962
NbRboh01 1823 0 1..963 1..962
PtRboh03 1605 0 1..963 1..948
Literature and cross-references LeRboh01 (RBOH1)
Literature Amicucci E., Gaschler K., Ward J.M. NADPH oxidase genes from tomato (Lycopersicon esculentum) and curly-leaf pondweed (Potamogeton crispus). Plant Biol. 1:524-528(1999).
Protein ref. UniProtKB:   Q9XEG2 [Incorrect prediction]
mRNA ref. GenBank:   AF088276 [Incorrect prediction]
Cluster/Prediction ref. UniGene:   ls.26
Protein sequence: LeRboh01 (RBOH1)
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   963
PWM (Da):   %s   108862.16 Transmb domain:   %s   o400-419i539-561o581-603i760-777o
PI (pH):   %s   9.4
Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
MRGLPGHERR WTSDTVSSGK DLSGESSPGT DSGNISGFAS EEFVEVILDL QDDDTIILRS VEPATVINID GSDPASGVGI GGASIETPAS VTSTSETRSP MMRRSTSNKF RQFSQELKAE  AVAKAKHFSQ ELKAELRRFS WSHGHASRAF SPASFFQNAV VGTGNGVDSA LAARALRRQR AQLDRTRSSA HKALRGLKFI SNNKTNGWNE VENNFAKLAK DGYLYRSDFA QCIGMKDSKE  FALELFDALS RRRRLKVDKI SQEELYEYWS QITDQSFDSR LQIFFDMVDK NEDGRIGEEE VKEIIMLSAS ANKLSRLKEQ AEEYAALIME ELDPERLGYI ELWQLETLLL QKDTYLNYSQ  ALSYTSQALS QNLQGLRKRS PIRRMSTKLV YSLQENWKRI WVLVLWILIM IGLFLWKFYQ YKQKSAFQVM GYCLLTAKGA AETLKFNMAL ILLPVCRNTI TFLRSTKLSC FVPFDDNINF  HKTVAAAIVT GIILHAGNHL VCDFPKLIHA NSTNYQKYLV NDFGPSQPQY IDLVKGVEGV TGIVMVILMA IAFTLATRWF RRSLIKLPKP FDRLTGFNAF WYSHHLLIIV YIVLIIHGTF  LYLVHNWYSK TTWMYIAVPV LLYAGERTLR FFRSGLYSVR LLKVAIYPGN VLTLQMSKPP QFRYKSGQYM FVQCPAVSPF EWHPFSITSA PGDDYLSIHI RQLGDWTQEL KRVFSEACEQ  PEAGKSGLLR ADENTKTSLP KLLIDGPYGA PAQDYRKYDV LLLVGLGIGA TPFISILKDL LKNIVAMEEQ ADLVSDFSGN SDMSAATSEQ PALNKISPKK RKSTLKTTNA YFYWVTREQG  SFDWFKGVMN EVAELDQRGV IEMHNYLTSV YEEGDARSAL ITMVQALNHA KNGVDIVSGT SVRTHFARPN WRKVFSKTLT KHANARIGVF YCGAPILAKE LSQLCKEFNQ KGTTKFEFHK 
EHF 

Retrieve as FASTA  
Remarks Complete sequence from mRNA and 5 ESTs. Extra sequence found in the prediction (intron 1, QYSRRRSLQFNYRLITLILINYLVKG).
CDS
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGAGGGGTT TACCTGGGCA TGAACGCCGG TGGACGTCGG ATACGGTGTC TTCCGGGAAG GATTTAAGTG GTGAGTCATC GCCGGGAACT GATTCCGGGA ATATTTCCGG TTTTGCTTCG  GAGGAGTTTG TTGAAGTTAT ACTTGATCTT CAGGATGATG ATACGATTAT TTTACGGAGC GTTGAACCGG CTACTGTAAT CAACATTGAT GGTTCTGATC CTGCTTCCGG AGTCGGTATT  GGTGGAGCAT CGATTGAAAC TCCGGCGTCG GTGACGTCGA CGTCGGAAAC TCGATCGCCG ATGATGCGTC GGAGTACATC TAATAAGTTT CGTCAGTTTT CACAGGAGTT GAAAGCTGAG  GCTGTTGCGA AAGCGAAGCA TTTCTCGCAA GAGCTTAAAG CGGAGCTAAG GAGATTCTCA TGGAGCCATG GACATGCGTC TCGTGCTTTT TCGCCGGCGT CGTTTTTCCA AAACGCTGTC  GTCGGAACAG GCAACGGTGT AGACTCGGCT TTAGCGGCTC GAGCATTACG TCGGCAGCGT GCTCAGCTCG ACCGGACTCG TTCCAGCGCA CACAAGGCTC TTCGTGGACT CAAATTCATC  AGCAATAACA AAACTAACGG ATGGAATGAA GTTGAAAACA ATTTCGCTAA GCTCGCTAAA GACGGTTACC TTTATCGTTC CGATTTCGCA CAATGCATCG GTCAGTACTC ACGCCGGCGA  TCACTACAGT TTAATTATAG ATTAATTACA TTAATTTTGA TTAATTATTT GGTTAAAGGT ATGAAGGATT CAAAGGAATT TGCGTTGGAA TTGTTTGATG CTTTAAGTAG AAGAAGAAGA  TTGAAGGTTG ATAAGATTAG CCAAGAGGAA TTGTATGAGT ATTGGTCTCA AATCACCGAT CAGAGTTTCG ATTCTCGGCT TCAGATCTTC TTCGACATGG TGGACAAGAA TGAAGATGGT  CGAATTGGTG AAGAAGAAGT AAAAGAGATC ATCATGCTAA GTGCCTCTGC AAACAAATTA TCAAGATTAA AAGAACAAGC AGAGGAGTAT GCAGCTCTGA TCATGGAAGA ATTAGATCCT  GAAAGACTTG GCTACATTGA GCTATGGCAG CTGGAAACAC TTCTCCTCCA AAAGGACACT TACCTCAACT ACAGTCAAGC ACTAAGCTAC ACAAGCCAAG CTTTGAGCCA AAATCTGCAA  GGGTTGAGGA AGAGAAGCCC AATAAGAAGA ATGAGCACAA AACTTGTCTA TTCACTGCAA GAGAATTGGA AGAGAATTTG GGTTCTGGTC TTGTGGATTT TGATAATGAT TGGACTTTTT  CTTTGGAAGT TCTATCAGTA CAAACAGAAA AGTGCATTTC AAGTCATGGG TTATTGCCTT CTAACAGCTA AGGGTGCTGC TGAGACTCTC AAGTTCAACA TGGCTTTAAT ATTGTTGCCA  GTATGCAGGA ACACCATTAC ATTCCTCAGG TCTACTAAAT TGAGCTGTTT TGTACCCTTT GATGACAACA TAAACTTTCA CAAGACTGTT GCTGCAGCCA TTGTCACTGG TATCATACTC  CATGCCGGTA ATCACCTTGT ATGTGATTTC CCAAAGCTTA TACATGCAAA TAGTACGAAT TATCAGAAAT ATTTGGTGAA TGATTTTGGC CCAAGCCAGC CTCAGTACAT AGATCTTGTT  AAAGGAGTGG AGGGTGTGAC TGGAATAGTT ATGGTAATCC TCATGGCCAT TGCTTTCACT CTTGCAACGC GATGGTTTAG GCGGAGCCTC ATTAAGTTAC CCAAACCTTT TGATAGACTC  ACTGGTTTCA ATGCGTTCTG GTACTCGCAC CACCTTCTCA TCATTGTCTA CATCGTACTG ATCATCCATG GCACATTCCT CTACCTTGTG CATAACTGGT ACTCCAAAAC GACATGGATG  TATATAGCAG TTCCTGTACT TCTTTACGCA GGGGAAAGAA CTCTTAGATT CTTCCGATCA GGCTTATACA GTGTCCGGCT TCTAAAAGTA GCAATATATC CTGGAAATGT CCTTACTCTG  CAAATGTCTA AGCCTCCGCA ATTTCGATAC AAGAGTGGAC AGTATATGTT TGTCCAGTGT CCAGCTGTTT CTCCATTCGA GTGGCATCCA TTTTCCATTA CTTCAGCTCC TGGGGATGAC  TACTTGAGCA TTCATATCCG ACAACTTGGT GACTGGACTC AAGAACTCAA GCGAGTGTTT TCCGAGGCTT GCGAGCAGCC AGAGGCTGGA AAGAGTGGCC TGCTCAGAGC TGACGAAAAC  ACCAAAACAA GTTTGCCAAA GCTATTAATA GATGGACCTT ATGGAGCTCC AGCACAAGAT TACCGGAAGT ATGATGTCTT ACTGCTTGTT GGTCTTGGCA TTGGAGCAAC TCCCTTTATA  AGTATCCTGA AAGACTTGCT CAAAAACATC GTCGCAATGG AGGAGCAAGC AGATTTAGTC TCGGATTTCA GTGGAAACTC GGACATGAGT GCTGCAACAA GTGAACAACC AGCTCTCAAC  AAGATTTCTC CAAAAAAGAG AAAGAGTACT CTAAAAACCA CAAATGCATA TTTTTATTGG GTGACCCGGG AGCAAGGATC ATTTGATTGG TTCAAAGGTG TTATGAATGA AGTGGCTGAA  CTTGATCAAA GGGGTGTCAT CGAGATGCAT AACTACTTGA CGAGTGTTTA TGAGGAAGGG GATGCACGTT CAGCTCTCAT TACCATGGTC CAGGCACTTA ACCATGCTAA GAATGGGGTT  GATATTGTAT CAGGCACCAG TGTGAGGACA CATTTCGCCA GGCCGAATTG GAGGAAAGTA TTTTCCAAGA CCTTAACCAA GCATGCAAAT GCAAGAATAG GAGTTTTCTA CTGTGGTGCA 
CCCATATTAG CTAAAGAACT CAGCCAACTC TGCAAAGAGT TTAACCAAAA GGGCACAACA AAGTTCGAGT TTCACAAAGA ACATTTTTAG 

Retrieve as FASTA  
cDNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
CGCCACTCGT GCCGAATTCG GCACGAGGCT CTGAAAAACT TTTCATACAA AGCCAATCTA TTTCTCTCTC TTTCTTTTGG TCAGGCTTCT ACAGAAAACT CTGTTTTCAA CGTATATTTA  TTTATTGTCA TTTGATTTGG GACAGATGAG GGGTTTACCT GGGCATGAAC GCCGGTGGAC GTCGGATACG GTGTCTTCCG GGAAGGATTT AAGTGGTGAG TCATCGCCGG GAACTGATTC  CGGGAATATT TCCGGTTTTG CTTCGGAGGA GTTTGTTGAA GTTATACTTG ATCTTCAGGA TGATGATACG ATTATTTTAC GGAGCGTTGA ACCGGCTACT GTAATCAACA TTGATGGTTC  TGATCCTGCT TCCGGAGTCG GTATTGGTGG AGCATCGATT GAAACTCCGG CGTCGGTGAC GTCGACGTCG GAAACTCGAT CGCCGATGAT GCGTCGGAGT ACATCTAATA AGTTTCGTCA  GTTTTCACAG GAGTTGAAAG CTGAGGCTGT TGCGAAAGCG AAGCATTTCT CGCAAGAGCT TAAAGCGGAG CTAAGGAGAT TCTCATGGAG CCATGGACAT GCGTCTCGTG CTTTTTCGCC  GGCGTCGTTT TTCCAAAACG CTGTCGTCGG AACAGGCAAC GGTGTAGACT CGGCTTTAGC GGCTCGAGCA TTACGTCGGC AGCGTGCTCA GCTCGACCGG ACTCGTTCCA GCGCACACAA  GGCTCTTCGT GGACTCAAAT TCATCAGCAA TAACAAAACT AACGGATGGA ATGAAGTTGA AAACAATTTC GCTAAGCTCG CTAAAGACGG TTACCTTTAT CGTTCCGATT TCGCACAATG  CATCGGTCAG TACTCACGCC GGCGATCACT ACAGTTTAAT TATAGATTAA TTACATTAAT TTTGATTAAT TATTTGGTTA AAGGTATGAA GGATTCAAAG GAATTTGCGT TGGAATTGTT  TGATGCTTTA AGTAGAAGAA GAAGATTGAA GGTTGATAAG ATTAGCCAAG AGGAATTGTA TGAGTATTGG TCTCAAATCA CCGATCAGAG TTTCGATTCT CGGCTTCAGA TCTTCTTCGA  CATGGTGGAC AAGAATGAAG ATGGTCGAAT TGGTGAAGAA GAAGTAAAAG AGATCATCAT GCTAAGTGCC TCTGCAAACA AATTATCAAG ATTAAAAGAA CAAGCAGAGG AGTATGCAGC  TCTGATCATG GAAGAATTAG ATCCTGAAAG ACTTGGCTAC ATTGAGCTAT GGCAGCTGGA AACACTTCTC CTCCAAAAGG ACACTTACCT CAACTACAGT CAAGCACTAA GCTACACAAG  CCAAGCTTTG AGCCAAAATC TGCAAGGGTT GAGGAAGAGA AGCCCAATAA GAAGAATGAG CACAAAACTT GTCTATTCAC TGCAAGAGAA TTGGAAGAGA ATTTGGGTTC TGGTCTTGTG  GATTTTGATA ATGATTGGAC TTTTTCTTTG GAAGTTCTAT CAGTACAAAC AGAAAAGTGC ATTTCAAGTC ATGGGTTATT GCCTTCTAAC AGCTAAGGGT GCTGCTGAGA CTCTCAAGTT  CAACATGGCT TTAATATTGT TGCCAGTATG CAGGAACACC ATTACATTCC TCAGGTCTAC TAAATTGAGC TGTTTTGTAC CCTTTGATGA CAACATAAAC TTTCACAAGA CTGTTGCTGC  AGCCATTGTC ACTGGTATCA TACTCCATGC CGGTAATCAC CTTGTATGTG ATTTCCCAAA GCTTATACAT GCAAATAGTA CGAATTATCA GAAATATTTG GTGAATGATT TTGGCCCAAG  CCAGCCTCAG TACATAGATC TTGTTAAAGG AGTGGAGGGT GTGACTGGAA TAGTTATGGT AATCCTCATG GCCATTGCTT TCACTCTTGC AACGCGATGG TTTAGGCGGA GCCTCATTAA  GTTACCCAAA CCTTTTGATA GACTCACTGG TTTCAATGCG TTCTGGTACT CGCACCACCT TCTCATCATT GTCTACATCG TACTGATCAT CCATGGCACA TTCCTCTACC TTGTGCATAA  CTGGTACTCC AAAACGACAT GGATGTATAT AGCAGTTCCT GTACTTCTTT ACGCAGGGGA AAGAACTCTT AGATTCTTCC GATCAGGCTT ATACAGTGTC CGGCTTCTAA AAGTAGCAAT  ATATCCTGGA AATGTCCTTA CTCTGCAAAT GTCTAAGCCT CCGCAATTTC GATACAAGAG TGGACAGTAT ATGTTTGTCC AGTGTCCAGC TGTTTCTCCA TTCGAGTGGC ATCCATTTTC  CATTACTTCA GCTCCTGGGG ATGACTACTT GAGCATTCAT ATCCGACAAC TTGGTGACTG GACTCAAGAA CTCAAGCGAG TGTTTTCCGA GGCTTGCGAG CAGCCAGAGG CTGGAAAGAG  TGGCCTGCTC AGAGCTGACG AAAACACCAA AACAAGTTTG CCAAAGCTAT TAATAGATGG ACCTTATGGA GCTCCAGCAC AAGATTACCG GAAGTATGAT GTCTTACTGC TTGTTGGTCT  TGGCATTGGA GCAACTCCCT TTATAAGTAT CCTGAAAGAC TTGCTCAAAA ACATCGTCGC AATGGAGGAG CAAGCAGATT TAGTCTCGGA TTTCAGTGGA AACTCGGACA TGAGTGCTGC  AACAAGTGAA CAACCAGCTC TCAACAAGAT TTCTCCAAAA AAGAGAAAGA GTACTCTAAA AACCACAAAT GCATATTTTT ATTGGGTGAC CCGGGAGCAA GGATCATTTG ATTGGTTCAA  AGGTGTTATG AATGAAGTGG CTGAACTTGA TCAAAGGGGT GTCATCGAGA TGCATAACTA CTTGACGAGT GTTTATGAGG AAGGGGATGC ACGTTCAGCT CTCATTACCA TGGTCCAGGC  ACTTAACCAT GCTAAGAATG GGGTTGATAT TGTATCAGGC ACCAGTGTGA GGACACATTT CGCCAGGCCG AATTGGAGGA AAGTATTTTC CAAGACCTTA ACCAAGCATG CAAATGCAAG  AATAGGAGTT TTCTACTGTG GTGCACCCAT ATTAGCTAAA GAACTCAGCC AACTCTGCAA AGAGTTTAAC CAAAAGGGCA CAACAAAGTT CGAGTTTCAC AAAGAACATT TTTAGAAGGG  CCTGGAGTAT GATTAATCTT GCATCAACGG TACACACATC TATCTTCGGT ACCTTATTTG ATTATTCTAC TGAAGAGATA ACATTAGTAA GGAATAAGTC AGAGATAAAT TGTACATAAT 
AGGGAAGAAG ACTATTTCAA GAGAAAATAC ATACCAATAA GATGTGAAAA AAAAAAAAAA AAAAAAACTC GTGCCG 

Retrieve as FASTA