Entry information : DrGPx02
Entry ID 5604
Creation 2007-07-25 (Christophe Dunand)
Last sequence changes 2015-12-28 (Achraf Jemmat)
Sequence status complete
Reviewer Christophe Dunand
Last annotation changes 2015-12-30 (Christophe Dunand)
Peroxidase information: DrGPx02
Name DrGPx02
Class Animal glutathione peroxidase    [Orthogroup: Gpx1004]
Taxonomy Eukaryota Metazoa Chordata Actinopterygii Cyprinidae Danio
Organism Danio rerio (Zebrafish)    [TaxId: 7955 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type N/D
Inducer N/D
Repressor N/D
Best BLASTp hits
Perox score E-value DrGPx02
start..stop
S start..stop
PretGPx01 320 1e-113 1..189 1..188
CapGPx02 303 7e-107 1..189 1..188
BtGPx02 302 1e-106 1..189 1..188
PpyGPx02 301 4e-106 1..189 1..188
Literature and cross-references DrGPx02
DNA ref. GenBank:   CAAK03052773 (1447..4522)
Protein sequence: DrGPx02
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   189
PWM (Da):   %s   21615.97  
PI (pH):   %s   5.28
Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
MTFIAKTFYD LHATTLEGDT IDFNIYRGRV VLIENVASLU GTTTQDYTQL NELQSRYPHR LVVLGFPCNQ FGYQENCSDG EILNSLKYVR PGEGYKPSFT IFQKCVVNGS DAHPVFSYLK 
DKLPYPDDDP IVTLIQDPKY LVWNPVSRND ISWNFEKFLI GPEGEPFKRY SKKFQTINIE PDIQRLLKL 

Retrieve as FASTA  
Remarks Complete sequence from genomic (chromo 20, 1 introns). No EST. Strain="Tuebingen".
DNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGACGTTCA TAGCGAAGAC TTTTTATGAT CTGCACGCAA CTACTCTGGA AGGGGACACC ATAGACTTTA ATATTTACCG GGGAAGAGTG GTGCTAATTG AGAATGTGGC CTCGCTGTGA  GGGACGACCA CCCAGGACTA CACGCAGCTT AATGAGCTCC AGAGCAGATA TCCTCATCGG CTTGTAGTCC TGGGCTTTCC CTGCAACCAG TTTGGATACC AGGTTTGTAA ATTAGGAATT  TTTACCCACT TTTTGTGACT CTGGACCAAT AACCCAATCA GTTATTTGGA AATTGAGATT TAGGCATCTG AAAGCTGAAT AAATATAAAG AGTTAAAATG GAAATCTCTA AGTGTCATCT  GAAATGAGCA TTTTTCTCTG CCTCCTATGT TTATGTGCAG TTGTTTTACT TTAAATGCAA TAAAAAGAAC CAATTTGTTG CCATAAAAGT GGACTTACTG AACCCATACA TAGGACCCTA  AGGAAAATGC TCATGTCAGA ATTCAATTCA ATTCATCTTT GTTTCTATAG TGCTTTTACA ATGTAGGTTG TGTCAAAGCA GCTTAAGATA GAAGTTATTA AGTAAATTGA AACTGTCAGT  CCAGTCTTCA GAGTTGAAGT TCAGTTCAGA GTGGTTTAAT TTTCATGGCT GAAAGTCCAA ACACTTTAGA GCAAATCCAG CGATGCGCAG TCCCATACCA AGCAAGCCAG TGCTTCAGTT  GGGCACGACC ATCTCTCCTC TGGCCAAACT TCCTGTGCAG AGCTGCAGTC TAGGTGCTGG AGGCTGGAAA ACTCTGGACA TCCATCGTGG AGAAGCTGTA GGTGGGAGTA GGTCACCGGT  GGGTGTTCAG GCTGGCCCAC GGGATCAATG CGGAGACTCG TCTGTCATTC AGTCTCATGC TCTCAACGAC CGCCATAGCA TCTGCTCAGG ATGCGGCCTG GTCTAGGATT ATGGACACCT  CGGGATTTTG AAAAACAGAC TAACATAAGT GTAGATGCCG TTCAAATAAT GTCTTTTGGG AAGTGTTCCT GAACAAGAAA ATTTGAGATG ACATTTAGAG TCTTTTTCAT TAAAACTCTT  TGCATATATA TATATATATA TATGTATTTA TTTATTTATT TATATATATA TATATATATA TATATATATA TATATATATA TATATATATA TATATATATA TATTTATACA TATATATATA  TATTTATTTA TAAATATTAT AAATATTATT ATATAAAAAT ACAGATTAGT TGTTCTGAGT TTAGAGTTTT GTTTTGAGTT TAGACTGAAG AGTATTCAAG GACGAGGGGG TTGCATGACT  AAAGGCTTGT TTCACTATTT CAGTCCGAAC CCAGGGAACA GTCAAATGAT AAGATTCACT TGAACGTATA GGGCATACTG GCTTTTTGAC TTATGAAGAA GGGAACTTGG GTATAAAGGC  ACCAGTCCCG GAAGAGCTTT ATAGACCAGA GTCATCCAGT GAGTGTACCT TCTTACATAC AGAGAAAACC ACTCAGCTTT GGCCTAAAAT TGACAATGGT GAGTAAGTCT CTGACAGCCT  GTAACAAACC TCAGAGTGCT GGGATTGACG GAGTTTAAAG GCTGAAGACA TTTGGTTGAA GCATTCATAT ATAAAACATG TCCATAGTCC ATAAATGGTA AAAATGATGC AGACACCAAA  TGTTTACGAC CTTTAAGAGA ATAGCAGGAT GCATTTCAAT AGAAAACCCA AGCTTAACAC AGGAGTTTGT GCAGAATTTG TGAAAATCGT TAATTTAGAT TTGTCTACAT TTATAACCAA  TTTAAGATCC TTAAGACGAG ACTGAACAAT ATTAAAAGCA CACTGTAAAA ATTGTTTGCT GCAGACTGTA ATGTGCTTTG CTTTGCTTCA TCAAAGCTGT CCTATAACTA TGGATAACTA  TTGTACAACC ATTCTTTCTT AGGACAGGAT CTTTGTTTCA CATCAAAGGT TGACTGCCGT AATATTTGGC TGAGATCCAA CTATTTCAAA ATCTGTTATT TGAAAGTCTT TCACACTTAA  AAGTTATAGA TGATATATTC ATATTTTTTT ATTATTTTTT AAGATAAGTA CCGGTTTAAG ACTGGAAGGC CATCCGCTGC AAAAAAAAAT AAAAAATAAG TATGGGATAG CGACAGTTAG  GAACTTTCAT GTCAAAATCA ATGTTAAATA CTTAGCAATG CATATGACTA CTCAAAGAAT TTATGTTTTA ATATTTGATT TACAGTAAGA AATGTACAAG GTATAATCAT GGAACAATAT  TTACTTAAAG GAATAGTTCA TTGAAAAAAA TTTACTCTGT CATCATTTAC TCATGACAAC ATGACTTGTT TCAAACCAGT TTGAGTTTAA GGGTTTTGTC AAACACAAAA GAAGATATTT  TGGAAAGTGT TGGAACCTTT GAGTTTCATG GTATTTGCTT TTCCTAATAT GGAAGTCAAA AGTTTCAGAA TATTGAAACT CATAAAGGTT TGGAACCACT CAAGGATGAG TAAATAGCGA  GTCATTTTTA ATTTTGGGGT GAACAATCTA TTTAAAACTC TAATGATTTT TGGATTATAA TAAAAATGAG ACATTTTGAC CCTCACAATG TATTTCTGCT GTTGCAAGGA CTGGATTTGT  GGTCCAGGGT CACATTTTCG GTGTTAGTGT ATAGGGCTTT ATATTTTTAA ATATAATATT TAATGTTCTC TACTTTGTTC TTGTTGTTTT CCAGGAGAAC TGCTCTGATG GAGAAATTCT  TAATTCCTTA AAGTATGTTC GTCCAGGTGA AGGGTATAAG CCTTCGTTCA CTATTTTTCA GAAGTGCGTT GTAAACGGGA GTGATGCGCA TCCTGTCTTT TCCTACTTAA AAGACAAGCT  CCCTTATCCA GACGATGACC CTGTGACTTT AATTCAAGAC CCTAAATATC TAGTCTGGAA TCCAGTCAGT CGAAATGATA TTTCGTGGAA TTTTGAAAAG TTTTTAATTG GGCCAGAAGG 
CGAGCCCTTC AAAAGATACA GTAAGAAGTT TCAAACGATC AATATTGAAC CTGACATTCA AAGGCTACTG AAGCTGA 

Retrieve as FASTA