Entry information : PvGPx06 (Phvul.002G288700)
Entry ID 5719
Creation 2007-08-15 (Christophe Dunand)
Last sequence changes 2014-03-20 (Maxime Neel)
Sequence status complete
Reviewer Christophe Dunand
Last annotation changes 2014-03-20 (Christophe Dunand)
Peroxidase information: PvGPx06 (Phvul.002G288700)
Name (synonym) PvGPx06 (Phvul.002G288700)
Class Plant glutathione peroxidase    [Orthogroup: Gpx2001]
Taxonomy Eukaryota Viridiplantae Streptophyta Fabaceae Phaseolus
Organism Phaseolus vulgaris    [TaxId: 3885 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type Roots
Inducers Nodulation
Rhizobium inoculation
Repressor N/D
Best BLASTp hits
Perox score E-value PvGPx06
start..stop
S start..stop
MtGPx06 335 4e-118 3..230 5..233
LjGPx06 329 6e-116 2..230 19..236
PsGPx06 309 4e-108 6..227 1..229
CsGPx06 306 8e-107 1..229 1..225
Literature and cross-references PvGPx06 (Phvul.002G288700)
Literature Ramirez,M., Graham,M.A., Blanco-Lopez,L., Silvente,S., Medrano-Soto ,A., Blair,M.W., Hernandez,G., Vance,C.P. and Lara,M. Sequencing and Analysis of Common Bean ESTs. Building a Foundation for Functional Genomics. Plant Physiol. 137 (4), 1211-1227 (2005).
DNA ref. Phytozome 11:   Chr02 (45200806..45203017)
Protein sequence: PvGPx06 (Phvul.002G288700)
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   231
PWM (Da):   %s   25597.01  
PI (pH):   %s   8.84
Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
MLSSSTTRIF IRTTTAIRLA SSTSSSLQFL SNSTLFPPLL HASFKPLPST STTSFFSSFR TDHTMGTSCF KSVYDFTVKD AKGTEINLGD YKGKVLIIVN VASQCGLTNS NYTELSQLYE 
KYKQKGLEIL AFPCNQFGAQ EPGSNEQIQE FVCTRFKAEF PVFDKVDVNG DKADPLYKYL KSSKGGLFGD NIKWNFSKFL VDKEGKVVDR YAPTTSPLSM EKDLLKLLDA * 

Retrieve as FASTA  
Remarks Complete sequence from genomic (5 introns) and 4 ESTs + EG594330 + CV543395. Cultivar="Negro Jamapa 81".
Promoter
Send to BLAST
Send to cis Analysis
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
TCCATTCACT CTGTACACAA ACCGTATTCA GATTTCAGAA GGAGACAGAA AAAATTAAAA AGAAAAAGAA AAAGAAAATA TAATTACTTG CAGAAGATGA GAATCGCACG AGATGGCTGG  GACATTCGAT CTGCATAAAC CTTCAGCTTC ATCTTTTCTT TCTTTCTTTC TCTCTCACTT GCTTACGCAC TCAACTCACA ACACCGTTTA TGTTATCTTA CTGTAATAAT GTGAAGGGTA  TCTTTGCTTT CGACAACAGA TTTACTCCAG CGAAGATAGG GGAAGAAAGG ACGAAAATCA ACTAATAAAA AATTAATTAA AAATAAAAAT TGAGCAATAA AAAAAGCAGT TCTTTCTTCT  TGTAATTACG AAGAATTGTG AAAAAAATAT CATTGTTCTA TAGTATATAT AAGAAAATAT GTATTCATTG ATCATCAGTT CGCATAATCG ATCATGAATA TATATGTTTA TAATTATTAT  ATTAAATATA TGTTATGTTT TTATATTATT AATTTATGTA TATTTATATT ATAATTATTA TTTTTATTAT TAAAATAATA AAAATATTAA TAAACATATA AAATGATAAT TAAATAAATA  ATAAATTTAC GAAATACAGC TATAAATAAT AAAATCATTA TGTTTATCTA GTTAAAAATA ATTTATGACA ATAATCCCTT ATTACACGAA ATTAATTATT ATCAACTTAA AATAATTAAT  AATTATGTTC ACAAAAATAA ATAAAAAATA AGTATTTTAA TGTAAAAAAA AAAATTAAAG ATTAATTCAT ACTTCATATT TTTTATCATA TTAAGATAAT GAATAATAGG TAGATAAATC  CAATAATAAA AGCAACATGC ATCATCGAAT CAACATAACA TATTGAACTT TGTGTTGTTA ATTCATGATA TTGGTTTCCA ATTTTGGATT GTTGTCTACA CTAGCATACA AAATTTATAT  TTTGTACACG ATAATGTTGA ACAGTTGAAT ATGATTTAGC CAATAAATTA TTGCAAGTAA GAGATGAGAT TTCATAACTA ATGAAAATAT GTTTGTTGAT GATATTATAT TTGTTATGTC  CATATACGTG TTTATTACTA ATAAGGTTGT TTAGAATTTT TAAAATGAGA AAAATAAATA AAATTGGAAA ATTCTTTTTT GTAATAGAGT TACAAAATTA ATGAAAGATT GAAAGGCTCC  ATGACAATTG ATATTTACTG GAAGAAATAG TGGTTGAGTA AATGAAGAAA ATGAAAAGAG ATAATATGAG TTTATTTATT TATTAGGGAA AAAATGGAAA TTTCACCACT TCTATAGAAG  TGTAGGAAGA AATTACGGGG ATGCAGAAGA AAACGGCCTT CTTCAGTTTG TTTTTGTCAA CGAGCTGGCC CTTATTATGG GGCCTGTTGG GTGTCATGCC TTACGTTCAC AAGTTGCTTC  AAACAAAAAT TAAGTCTAAT TATATTAAAT TTAATTGCAT TTTTTCTCAA TTAAATTTTA TTTCTGCGAA TTAGTTTATT GCTAAAAATG GCATTTAATC TAACAGGCTT TCCATATAGA  TTTAAAAGTA AATTGGATTT CAATATCGAT TTGGAAAAAT TGTTAAAAAA AAGAATAAAA TAGATAGTTC AAATTTATAA TATGTTTATT TTAACAAAGA CAAAGCTTGC CTGCATAAAA  AAAATGACAT AAATAAATAG TTGTCAAATA TGATTGTATA ATAATTAATA AAGAAATAGT TATCAAATAT GATTGTATAT ATAATTAATA ATTAATATAA TATAACTGTT AAAGAAAGTG  TCCACGTGTG AAACGTTTAC CTTGTCACCG TCACCGATAC CGTGACCAGA CAGAAGTACA CGCAAGCGGT TCACATTCAC ATAATAGCAC AACCATGGAA TCCTCGAACT GGACCCAGCT 
ACGTTAATAA GAAGAACCAA GGAAGGTGTC ACTCTACGCG GAATAAAGAC GCTATAGATC ACTATATAAC CCTTTTGCCA 

Retrieve as FASTA  
DNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGCTTTCTT CTTCAACCAC TCGCATCTTT ATCCGCACAA CAACTGCTAT AAGATTAGCC TCTTCCACCT CTTCTTCTCT TCAATTTCTC TCAAATTCTA CCCTCTTCCC TCCTCTTCTT  CACGCCTCTT TCAAACCTCT TCCTTCAACC TCCACCACCT CTTTCTTCTC CTCCTTCAGA ACAGATCACA CTATGGGCAC TTCATGCTTC AAATCAGTCT ATGATTTCAC CGTTAAGGTA  TACATCTTGC TTTTTTTCAT CGATTACTTT GTAAACTGCG TAAACTTTAG ATTTTAGATT AACCCTTTTC TTTATCTTTT TTCAGGATGC TAAGGGAACT GAAATCAATC TGGGCGACTA  CAAAGGGAAG GTCCTTATAA TTGTCAACGT TGCCTCACAA TGGTACCTCT CCAATTTTCA TTTTTCTCAT TTTCTTTATT TAATTGAAAT TGAATTTGAG CAATTTTCAT GTTGATTTGT  TATGCTCTCT GATTTTACCC CAAATTGGCA CAGCTAGTCA TGTGGGTTTA GAATTGGAGG ATTTCGCCCT TAATTTTGTT TCAAACCAAT TCTTTGTGGT ATATGTTGAT GTTGGTTCAA  TGTTCGATGC AGTGGCTTGA CTAATTCGAA TTACACAGAG CTGAGTCAGT TGTACGAGAA ATACAAACAA AAAGGTTTGT TTTTGTCTTC TGTTCATGCG GTTGCGGTTG TTGTACTGCC  GTTTGTTTGT TTCTTGCTGT CCCTTTCTTT TTATCTTATG GTGGTAGTGT CAATGTTATC TCTGTTGCAT GGCAAATTCA TTTTGTTTTA ATCTTGCGTA TTTTACTCTA TTCGCATTGA  AGTGATTACC CTAACACACC CATGTCTTCT TTCTCAAAAC CTTAATCCTC TTTGTTTAGG TCTGGAGATT CTAGCATTCC CATGCAATCA ATTTGGGGCA CAGGAGCCTG GATCTAATGA  ACAGATACAA GAGTTTGTTT GTACTCGCTT CAAGGCTGAG TTTCCTGTTT TTGACAAGGT AAAAAAAAAC CTTTGCTTAT TCTCATTTCC TTCTGACTGT GAATTCATTC CTGTGTATAA  AAATCAATTT CATGCTCTGT CTATATCCTT GGGATTTGCT CTTTGATTAC CAATTTTTTG GGCTGTAGCT CAAATGTTGT TTGAGCCACA ATTTAGCGTA TGCTTTGTGT TCACCTCTAA  TCTCCAATTA GTTTCCCTTG AAGATGTTCT GACTGAGTTC TGAAATTAAC TCTCCCTGAA AATCAGAGAT GATTAGGAGA GAAATGGATA CTTTCAAGAT TTCCTACAGT TTTAGTCCTG  GTTGTGTAAT GCTTTAATAT ATGAACCATT AAAGTAGAGA TGAATAGATT GACTCCAATA CTTGTATTCT TCCTTGGTGT GGTGTTCATA GCCCATCTCC CAATACTAGG CAAATAAGAT  AAACTTCAGA CTAGAGGAAG CTAATTTTTG TTTGTTCATG GTTGATTTAG AATATATTTC ACTTTCCTGT GTCTAAGTAT TCACTGAGAC CATTGTTCTT TTGCATTTAA TATAGGTTGA  TGTGAATGGT GACAAGGCTG ATCCACTCTA CAAATATCTA AAATCAAGCA AAGGTGGACT CTTCGGGGAT AATATCAAAT GGAACTTCTC CAAGTTCCTT GTTGATAAGG AGGGGAAGGT  TGTTGATCGC TATGCACCCA CAACTTCTCC TCTGAGCATG GAGGTAAGAG AATTAGTATT ATGCACCAAT AATTTGGCCT ACACGTATGT GATATTTTCA CACTAACAAT GCTTCTTTTT 
CTGATATCTG CAGAAGGACT TGTTGAAGTT GTTGGATGCT TGA 

Retrieve as FASTA  
CDS
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGCTTTCTT CTTCAACCAC TCGCATCTTT ATCCGCACAA CAACTGCTAT AAGATTAGCC TCTTCCACCT CTTCTTCTCT TCAATTTCTC TCAAATTCTA CCCTCTTCCC TCCTCTTCTT  CACGCCTCTT TCAAACCTCT TCCTTCAACC TCCACCACCT CTTTCTTCTC CTCCTTCAGA ACAGATCACA CTATGGGCAC TTCATGCTTC AAATCAGTCT ATGATTTCAC CGTTAAGGAT  GCTAAGGGAA CTGAAATCAA TCTGGGCGAC TACAAAGGGA AGGTCCTTAT AATTGTCAAC GTTGCCTCAC AATGTGGCTT GACTAATTCG AATTACACAG AGCTGAGTCA GTTGTACGAG  AAATACAAAC AAAAAGGTCT GGAGATTCTA GCATTCCCAT GCAATCAATT TGGGGCACAG GAGCCTGGAT CTAATGAACA GATACAAGAG TTTGTTTGTA CTCGCTTCAA GGCTGAGTTT  CCTGTTTTTG ACAAGGTTGA TGTGAATGGT GACAAGGCTG ATCCACTCTA CAAATATCTA AAATCAAGCA AAGGTGGACT CTTCGGGGAT AATATCAAAT GGAACTTCTC CAAGTTCCTT 
GTTGATAAGG AGGGGAAGGT TGTTGATCGC TATGCACCCA CAACTTCTCC TCTGAGCATG GAGAAGGACT TGTTGAAGTT GTTGGATGCT TGA 

Retrieve as FASTA  
cDNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
CCGATACCGT GACCAGACAG AAGTACACGC AAGCGGTTCA CATTCACATA ATAGCACAAC CATGGAATCC TCGAACTGGA CCCAGCTACG TTAATAAGAA GAACCAAGGA AGGTGTCACT  CTACGCGGAA TAAAGACGCT ATAGATCACT ATATAACCCT TTTGCCAATG CTTTCTTCTT CAACCACTCG CATCTTTATC CGCACAACAA CTGCTATAAG ATTAGCCTCT TCCACCTCTT  CTTCTCTTCA ATTTCTCTCA AATTCTACCC TCTTCCCTCC TCTTCTTCAC GCCTCTTTCA AACCTCTTCC TTCAACCTCC ACCACCTCTT TCTTCTCCTC CTTCAGAACA GATCACACTA  TGGGCACTTC ATGCTTCAAA TCAGTCTATG ATTTCACCGT TAAGGATGCT AAGGGAACTG AAATCAATCT GGGCGACTAC AAAGGGAAGG TCCTTATAAT TGTCAACGTT GCCTCACAAT  GTGGCTTGAC TAATTCGAAT TACACAGAGC TGAGTCAGTT GTACGAGAAA TACAAACAAA AAGGTCTGGA GATTCTAGCA TTCCCATGCA ATCAATTTGG GGCACAGGAG CCTGGATCTA  ATGAACAGAT ACAAGAGTTT GTTTGTACTC GCTTCAAGGC TGAGTTTCCT GTTTTTGACA AGGTTGATGT GAATGGTGAC AAGGCTGATC CACTCTACAA ATATCTAAAA TCAAGCAAAG  GTGGACTCTT CGGGGATAAT ATCAAATGGA ACTTCTCCAA GTTCCTTGTT GATAAGGAGG GGAAGGTTGT TGATCGCTAT GCACCCACAA CTTCTCCTCT GAGCATGGAG AAGGACTTGT  TGAAGTTGTT GGATGCTTGA AGTTACAGAT GGCTGCGTCT GTCAATAAAT GAATAGTGAT TAGAACATTA TTATAAATAA GAAATGTGTT GCAGATGTTT TTGCACTTTC TTGTCTGTTT 
TCTTACATTA TTACCTGATA TTATGTTCAT AACCATGACA TTGTTTACTT ATTACTGTGA GCATAGTAAA CTTAAAGCTT TCTATTTCAT TGCTGTCTTG TC 

Retrieve as FASTA