Entry information : MpAPx-R (Mapoly0059s0017)
Entry ID 5764
Creation 2007-08-22 (Christophe Dunand)
Last sequence changes 2017-11-21 (Christophe Dunand)
Sequence status complete
Reviewer Not yet reviewed
Last annotation changes 2018-04-23 (Christophe Dunand)
Peroxidase information: MpAPx-R (Mapoly0059s0017)
Name (synonym) MpAPx-R (Mapoly0059s0017)
Class Ascorbate peroxidase related    [Orthogroup: APx-R001]
Taxonomy Eukaryota Viridiplantae Streptophyta Marchantiaceae Marchantia
Organism Marchantia polymorpha    [TaxId: 3197 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type Thallus
Inducer N/D
Repressor N/D
Best BLASTp hits
Perox score E-value MpAPx-R
start..stop
S start..stop
AcoAPx-R 322 6e-110 56..327 60..325
RcAPx-R 320 2e-109 31..328 33..324
GhAPx-R 321 2e-109 64..328 64..330
VvAPx-R 320 4e-109 67..328 65..326
Literature and cross-references MpAPx-R (Mapoly0059s0017)
Literature Yamato,K.T., et al.,. Gene organization of the liverwort Y chromosome reveals distinct sex chromosome evolution in a haploid system. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 104 (15), 6472-6477 (2007).
EST ref. GenBank:   BJ850114
Protein sequence: MpAPx-R (Mapoly0059s0017)
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   330
PWM (Da):   %s   35893.38  
PI (pH):   %s   6.29
Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
MAALGVRQPC ASSAVFRTQS PKWTSCIVPV TLNCRAQQRS CCPSRVCAIC GTDSAENDTH AFKLQRRRSL VVSILLPLLP AIINSDPGST ASAAEEEAVR LEQIRAAVRK FVTKAKAAGV  LRLVFHDAGP FNLATKQGGM NGSIVLELER PENQGLNRSI KVLSKVKAAL EPDVEVSWAD LIAVAGAEAV SICGGPKIDV QLGRLDSSLP DPEGQMPEET LTGSQLREAF QAKGFSTQEL 
VALSGAHSVG GKGFGDPYTF DNIYYKILLD KPWLTKENET KMIGLDSDRA LPEDEECLRW VNAYAQDQDL FFRDFTSAYM KLVDTGVRRL * 

Retrieve as FASTA  
Remarks Complete sequence from genomic, 1 EST (thalus) and RNA seq. Strain="E".
DNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGGCAGCAC TCGGTGTCAG GCAGCCCTGT GCTTCTTCTG CTGTGTTCAG AACCCAGTCT CCGAAATGGA CCAGCTGCAT TGTGCCGGTG ACTCTGAATT GCCGAGCGCA GCAGCGATCG  TGCTGCCCGT CGAGAGTTTG TGCTATTTGT GGGACTGATT CAGCTGAAAA TGGTTTGATT GGTCTTGCCC TGTGACTTCA CATCCTTTTC TTCAGTCTTT TCTTAACCTG TCATGTAATT  TGAGTTCGAC CATTTCGTAA TTTTTGTTAT ATTTGCTTTC TTTGTATTCT ACCTGCAAAT TCGTCATAAC AAGATGGGAG GGTCTCGTTC TTTGAAAACT TTTCCCTGGG TATTTGGTGT  AGAACTGATT TGTAAAGATC CGGCTGGAAA TTCTGAAATC CACTGAACAC AGGGACGCCA TTTTCAGATA CCCACGCTTT CAAGCTTCAG AGGAGGAGGT CGCTGGTCGT TTCTATCCTG  TTACCTCTTC TTCCTGCGAT CATTAATTCT GATCCAGGAA GCACAGCCTC TGCAGCGGAG TAATTTCCTT TTCCAACTGA TTCTGCCATT TTCATTCGAT GCAGTTCTTT GTTAGATATA  ATCTGTGTGT GGTATACCGC TGTCCATGTT GAAGAAAGAT GTCCACACCC CTAACAATGG TGCTGCCACT GCCAACTTTT GTGATTGTGT TTTATGTGAG AACTCATCTA CATTGGTAGA  TGTGGAGCCA TATCGGAATT TTCATATTGT TCTGTAGCTA CCGCATGAAC GTAATGTTGC ATTGTTAAAA TATCTGCAAC CACATAAACG TAATGTCGCA TTATGTTATC TGGATGGTGT  ACACTTTTCT TGGCAACTAA GTTCAGAGTG GTCAACGGCT TCTCTTCACT CACTAAAACT TCGTCAGTAG TCTTGATAGA CTGTTCTGTA ATGACAGTTA GATGTGTTGC ACTTTCATAG  CTATCACAAC TTGTACAGGA AATCGTTACA TAGGAAGAAG TTGGCAGGAA GTATGGTATT CATTCGTACT GTGGTTTTTC TTTTTTTACT CTGAATTGCA GAGGATCTTA TATATTGCGA  GTTTGCAGTA CTTGCTGTCT TCAGAAATTT CTGAGTTGGA ACCATGTACT TACTGTGACA TGTTCTGCTT ACTCCAGGGA AGAGGCAGTG CGACTGGAGC AAATCAGGGC TGCTGTGCGG  AAATTTGTCA CTAAAGCCAA GGCAGCTGGA GTTTTGAGAC TGGTCTTCCA CGACGCTGGT CCCTTCAATC TTGCCACCAA GCAAGGTAAG AAGTATTTAA AATCTTCGTA CAAGTTCGGA  TGCATTGTAG AAATTTACAT GTACCAACGC TATCACCGTT CCAGTCCATG GATTGGATGC TGCTACCAAG GGTAGAAACA CGTGCCAAGA TGCCATGGTT GTTGTCATGT ACCCATGCTA  CGTACTGCTG TGAAACCAAT TTGCCAATTA CTTCGTGCAG GAGGCATGAA TGGATCTATT GTATTGGAGC TTGAAAGACC GGAAAATCAA GGCCTCAACC GATCTATTAA GGTACTTGCT  TATCCTACAT GTATGATGTG TAATCTTCTG CTGCTAGAAT GCTAAATAAG CATCTGGAAT TTTGTGGAAG GAGCTGATAA TTGCACATGC TATCTGATGG AAATCTTAAT GAGCCGCTTT  CTTCAGGTTT TGTCGAAAGT CAAGGCTGCG CTGGAGCCGG ATGTTGAGGG TGTGTACTTG GATCGTCGAG ACTGTTTCTA TACTTCATCA AGCAGGCGTG TCGTTTGTCA AACATTCTTC  AGAATACCTG TTACTCAGGT TGGTAAAAGT GGCAATTCTT GTACTCGCAG TGTCATGGGC AGACTTGATC GCAGTTGCTG GAGCAGAAGC CGTGAGTATA TGCGGGGGTC CGAAGATTGA  TGTTCAACTG GGTCGACTAG ACTCCTCGTA AGTGTCTCTC TATCATTGCT CTTTGAATAG TATTTACACA AAGTATTACA TTGTTGTTTA CTTTGAGCCG AACATGCTAC GCTTGGTCAA  CTCAGGTGCA TGACATCGGA CGAGCAACGA AAAATGTCAT TGTGAGCTGA TTCATAGAGT GGATGCACTA CACTTACTGA CTGTGTTGAC AAAGGCAGTT GCTGGTCTCA CAGAGACTGT  AAACAGGGAT GTAACAAACA GCAAATCAGA CCTTTTCTTG ACCACACTGA ACCTCGATAT CTTCATCTGC AAGATGAAAA TAAACTCAGA TTCCTTGTTC AGGTCATCCC CCTTTTCCCA  TTCCCCAACT TACATGTATG GGAGGGAGGG GAAAACTCTT GTGATCATAT TTGATGTAAT GACTCCGTCT AGAATGAGAG CGATTCGTTA GTAACCTTTG CGTTGCTGGT TGAGTCCAAG  CTATCTACGT AAATAACTAG CTTTGTTCCA AAGTCCAAAC AAGCTGCCTT ACAAATGAGT AATAAATACT GAGGACTCAT AGTTGTTAGG ACGATGAGTT CGTTCAGAGT TTCTTGGTTG  ATAGCTAGAA AACTCCAACG TCATCCCCAC TCGTGGAGAA AAATCTCACT AGAAGAGAAA TCCTTTTCTT CGGATCAGAT ACGGACTAAT GTAATTTTCT TTCTATTCCT TCTTCGTCTC  CTCTGGTCTC CTGGTCTTCT ACTTCTCTTT AAACTAGCAC ACTGAGCAAG GGCGTGGGAT CTATCGTCTT CAGGCTGGGA CAGGTCATAC TAATCAGCAC AGTTTAAGTT GAACATGTGC  AGCCCAATGT TGAAGTTGAT GGATAATAAC GGTGTTTATC GGTGCAGACA CCTCACTAAG TTTCTACACC ATGTCTTATC TACTTCTATT TGTGGCTGCC ACGATGAATA CTGTGTCAAT  CATGTCATCA CTGACGTCCA CGTTGTACCT GTATAAGAGG TTATCCCGAT TCCTCTCGAT ATATCTATGC TTTTCGAAAA TGTTCGTAGG ACCTTGATTC ACTGACTAGA CAATCCCATT  TCTCACTATC AAGCGCCGAA GATTCCTTTC GTTTGAGAGA AAGTTTCATT TCACTTCCTC TAATACCTCT TTTAGATATT GTAAACTTCA CTGTCAAAGC GCAGAATTTC AACGTCGAGA  TAGTGTACTG TTTCATCGTA TGCTTGTGTT TTCGTGTATA AACCGTTCTT CTTGTGGTAT TCTTTCGACT ATTGTATTTA CGTTGCATGT TGCTGTGTTT TGTATACTCA GAGATTAATG  TCTTTCATTT TCTCCAGTCA AACGGCTCAT TTACCGTTTT TTACAGTAAA GTATACCGTA AACTCTCTGG TTTCCTTGGA CGTTTTCACT GTAAAGTTGC TTGTTATATC TCCTGTCAAG  TTTCATTTTC CTTCACGTGG CATTTTTAAG GCTTTTATAA TGGAACGTGA AAGAACATGC AACTTGTAGA AGGTAAAATT CATTGTCAGG TTTCACTTCC TGTCCTGGCC ATCCCCTTTG  TGAAATCAGG AGCTTCGCTG TCCTATTCCT CATCTACATC TAAATCGCTC GTTAACTGTT TTTTGCCCAT GCAATACCTT CTTGCAGTTC GGAATACATT TCTTTCTTTA TCCTACACAT  ACATGTATAG AAACTGGCTT CTGACCATTA CGTCTAATTG CACTCTTCAA TCTATAAACA TCACTGCTTT TTACTCTATT GAAATTTCTA CAGCTCTATT GGTCCATGAC AGGATAACTT  CAATGCACAC AAATGATTTA CCTCTCTCTT TTCTTATAGA TAGTCCATAT CCCCCCGCTT CTTTTCAGAT TTATATGACT CGAGCGGTTC GAGCCTGTGG GCTCGCCCTT TGTCCGTTGG  ATTTTTAACG TTTTTATCTC AGGTTACTCG GATACCGCTT CCCGAAACTT GTTTTCCTAA CCTTTTATCC TATTTGAATA AAACTTATGA ATATATTTCT TTGTTATCAA CTTGAATTTT  TGTAGAATGA GCCAATTATG CTTCAGTTCT CTCACTGGTG TCCGTGACAG ATTTACATAC GATCAAAAGA AGCTCACATA TTGCTTCCAT ATTTCACTTC AGACTACCTG ATCCTGAAGG  ACAAATGCCA GAGGAAACCC TCACTGGCAG TCAGCTGAGG GAAGCATTTC AAGCCAAAGG GTTCTCGTGA GTTACCTTTA AACCTGATGG ATTTGATTGT GGATGCATTA GCAGGCTTAT  TTACCTATAG ATTTAGAGAT CCATAGGTCT CAAGTTGTTC GATACTAGTG ATCGACAAGA TGCCATTTAT ATTTTCTTTA TTTTTTTTCC CACTTCCTTT TGTTTTAGTC AATGACAAAT  GTATTGTCTT GAATCGGTAG AACACAGGAG CTCGTAGCGC TATCTGGTGC TCACAGTGTT GGAGGCAAAG GATTTGGAGA CCCGTACACA TTTGACAACA TCTACTACAA AATCCTTCTG  GATAAACCAT GGCTTACTAA AGGTGGTTAA CTCACAAAAC CTTGAACTTG TGTCTTCACT GTTCACTGAA TTCAGACGAA TCTATCATGT GCTTCGATCT AAAGGAACAC AGCCGCTGTC  CATGTCCTTC ATCATGTATG CTCGAGGGAT TCTTATTAAA TTGCAAGCGA GGTTATTTTT AGGAGGAAAA AACTTCCAAG CCTTTAATGT TACACGTCAA TCTCTTGCCT CCTACACACT  GATTAGACAG ATTATACTGA GCATCTTTCT TGACTTTCAA CAAATTCCAC AGAAAATGAG ACAAAAATGA TAGGCTTGGA TTCAGATCGT GCTCTTCCAG AAGACGAAGA GTGCCTGAGG  TACGTTTCTG CCCCTATCTT GCTCTTGCAA TTTTAGTCCA CCGAACTGTT GTTACTTATT GACTTCTACA AACATAGATC TGTCGTTTTT TATAAAGATA AGAAACTACG CATTGGATTT  TGCTTCGTTC GCAAGTCTCA CGTTCTGAAT TTGCTTCTCG ACTGCAGGTG GGTCAATGCA TATGCTCAAG ACCAGGACCT CTTTTTCCGA GACTTTACTA GTGCATATAT GAAACTCGTG 
GACACAGGAG TACGGAGACT TTAA 

Retrieve as FASTA  
CDS
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGGCAGCAC TCGGTGTCAG GCAGCCCTGT GCTTCTTCTG CTGTGTTCAG AACCCAGTCT CCGAAATGGA CCAGCTGCAT TGTGCCGGTG ACTCTGAATT GCCGAGCGCA GCAGCGATCG  TGCTGCCCGT CGAGAGTTTG TGCTATTTGT GGGACTGATT CAGCTGAAAA TGATACCCAC GCTTTCAAGC TTCAGAGGAG GAGGTCGCTG GTCGTTTCTA TCCTGTTACC TCTTCTTCCT  GCGATCATTA ATTCTGATCC AGGAAGCACA GCCTCTGCAG CGGAGGAAGA GGCAGTGCGA CTGGAGCAAA TCAGGGCTGC TGTGCGGAAA TTTGTCACTA AAGCCAAGGC AGCTGGAGTT  TTGAGACTGG TCTTCCACGA CGCTGGTCCC TTCAATCTTG CCACCAAGCA AGGAGGCATG AATGGATCTA TTGTATTGGA GCTTGAAAGA CCGGAAAATC AAGGCCTCAA CCGATCTATT  AAGGTTTTGT CGAAAGTCAA GGCTGCGCTG GAGCCGGATG TTGAGGTGTC ATGGGCAGAC TTGATCGCAG TTGCTGGAGC AGAAGCCGTG AGTATATGCG GGGGTCCGAA GATTGATGTT  CAACTGGGTC GACTAGACTC CTCACTACCT GATCCTGAAG GACAAATGCC AGAGGAAACC CTCACTGGCA GTCAGCTGAG GGAAGCATTT CAAGCCAAAG GGTTCTCAAC ACAGGAGCTC  GTAGCGCTAT CTGGTGCTCA CAGTGTTGGA GGCAAAGGAT TTGGAGACCC GTACACATTT GACAACATCT ACTACAAAAT CCTTCTGGAT AAACCATGGC TTACTAAAGA AAATGAGACA  AAAATGATAG GCTTGGATTC AGATCGTGCT CTTCCAGAAG ACGAAGAGTG CCTGAGGTGG GTCAATGCAT ATGCTCAAGA CCAGGACCTC TTTTTCCGAG ACTTTACTAG TGCATATATG 
AAACTCGTGG ACACAGGAGT ACGGAGACTT TAA 

Retrieve as FASTA  
cDNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
GACTTCCGAA AGTGATCGAG AGTGGGACTG TGCCATCTCC AGGACTGCAT CTCGAGCTGA TTCGGGCTCA GAGTGCCGAT TTCTTTTCCA GGCGATGGCA GCACTCGGTG TCAGGCAGCC  CTGTGCTTCT TCTGCTGTGT TCAGAACCCA GTCTCCGAAA TGGACCAGCT GCATTGTGCC GGTGACTCTG AATTGCCGAG CGCAGCAGCG ATCGTGCTGC CCGTCGAGAG TTTGTGCTAT  TTGTGGGACT GATTCAGCTG AAAATGATAC CCACGCTTTC AAGCTTCAGA GGAGGAGGTC GCTGGTCGTT TCTATCCTGT TACCTCTTCT TCCTGCGATC ATTAATTCTG ATCCAGGAAG  CACAGCCTCT GCAGCGGAGG AAGAGGCAGT GCGACTGGAG CAAATCAGGG CTGCTGTGCG GAAATTTGTC ACTAAAGCCA AGGCAGCTGG AGTTTTGAGA CTGGTCTTCC ACGACGCTGG  TCCCTTCAAT CTTGCCACCA AGCAAGGAGG CATGAATGGA TCTATTGTAT TGGAGCTTGA AAGACCGGAA AATCAAGGCC TCAACCGATC TATTAAGGTT TTGTCGAAAG TCAAGGCTGC  GCTGGAGCCG GATGTTGAGG TGTCATGGGC AGACTTGATC GCAGTTGCTG GAGCAGAAGC CGTGAGTATA TGCGGGGGTC CGAAGATTGA TGTTCAACTG GGTCGACTAG ACTCCTCACT  ACCTGATCCT GAAGGACAAA TGCCAGAGGA AACCCTCACT GGCAGTCAGC TGAGGGAAGC ATTTCAAGCC AAAGGGTTCT CAACACAGGA GCTCGTAGCG CTATCTGGTG CTCACAGTGT  TGGAGGCAAA GGATTTGGAG ACCCGTACAC ATTTGACAAC ATCTACTACA AAATCCTTCT GGATAAACCA TGGCTTACTA AAGAAAATGA GACAAAAATG ATAGGCTTGG ATTCAGATCG  TGCTCTTCCA GAAGACGAAG AGTGCCTGAG GTGGGTCAAT GCATATGCTC AAGACCAGGA CCTCTTTTTC CGAGACTTTA CTAGTGCATA TATGAAACTC GTGGACACAG GAGTACGGAG  ACTTTAATGA TTCAAGGACG AAACTCACCA GGGAGATTGA CTTTTTGCCG GGCAGACATT GTGGAGTGAG ACAAAATCAT CGCCGCCAAG GCAAAGGCAC GCGTAGAACA TGCCTTCCGT  TGCCGAGAAT AGTACGAGTT AGCTGACCTG CACAAAAGTT GCTCCCTGCC TTGCTCTCCA CGTTTCAGTG TAAATTACCT CGTTCTATCG CAAAGCGATT CCTTCCACTA TCTTCCGTCT  GGATCCACTC GTCTAGGTGA GTCAATGAGT CTCTTCAAGG TTGTTGAATG GTGTCAAATT CTGAGGACTC GGCCATATGC GAGGGCTCGC CCACAGATTG GAGCATTAAG AGGTAATACT 
GGTGAATAAT GTGCTCACTG TCAGTATGCA GAGGTTCTT 

Retrieve as FASTA