Entry information : HsNOx02 (NOX2 / CYBB)
Entry ID 5962
Creation 2007-11-06 (Christophe Dunand)
Last sequence changes 2010-12-03 (Myriam Duval (Scipio))
Sequence status complete
Reviewer Christophe Dunand
Last annotation changes 2010-12-22 (Christophe Dunand)
Peroxidase information: HsNOx02 (NOX2 / CYBB)
Name (synonym) HsNOx02 (NOX2 / CYBB)
Class Ancestral NADPH oxidase    [Orthogroup: NOx001]
Taxonomy Eukaryota Metazoa Chordata Mammalia Hominidae Homo
Organism Homo sapiens (human)    [TaxId: 9606 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type N/D
Inducer N/D
Repressor N/D
Best BLASTp hits
Perox score E-value HsNOx02
start..stop
S start..stop
RnoNOx02 1006 0 1..506 65..570
CfaNOx02 1003 0 1..506 65..570
MmNOx02 1002 0 1..506 65..570
OcuNOx02 978 0 1..506 65..570
Gene structure Fichier Exons
ExonStart..EndSize ExonStart..EndSize ExonStart..EndSize ExonStart..EndSize
N° 1 37642794..37642853 60 N° 2 37651228..37651312 85 N° 3 37652918..37653063 146 N° 4 37655204..37655394 191
N° 5 37658208..37658337 130 N° 6 37660509..37660601 93 N° 7 37663130..37663383 254 N° 8 37664259..37664421 163
N° 9 37665640..37665786 147 N° 10 37668820..37668944 125 N° 11 37670044..37670170 127  
join(37642794..37642853,37651228..37651312,37652918..37653063,37655204..37655394 ,37658208..37658337,37660509..37660601,37663130..37663383,37664259..37664421,376 65640..37665786,37668820..37668944,37670044..37670170)


exon

Literature and cross-references HsNOx02 (NOX2 / CYBB)
Literature Jirapongsananuruk O., Niemela J.E., Malech H.L., Fleisher T.A. CYBB mutation analysis in X-linked chronic granulomatous disease. Clin. Immunol. 104:73-76(2002).
Protein ref. UniProtKB:   P04839
DNA ref. GenBank:   NC_000023.1 (37642794..37670170)
mRNA ref. GenBank:   X04011
Other ref. UniGene:   Hs.292356
Protein sequence: HsNOx02 (NOX2 / CYBB)
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   506 (486)
PWM (Da):   %s   57821.67 (55637.4) Transmb domain:   %s   o104-126i138-160o (i20-39o84-106i118-140o)
PI (pH):   %s   8.62 (8.47) Peptide Signal:   %s   cut: 21 range:21-506
Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
.........1.........2.........3.........4.........5.........6.........7.........8.........9.........0.........1.........2
MLILLPVCRNLLSFLRGSSACCSTRVRRQLDRNLTFHKMVAWMIALHSAIHTIAHLFNVEWCVNARVNNSDPYSVALSELGDRQNESYLNFARKRINPEGGLYLAVTLLAGITGVVITLCLILIITSSTKTIRRSYFEVFWYTHHLFVIFFIGLAIHGAERIVRGQTAESLAVHNITVCEQKISEWGKIKECPIPQFAGNPPTWKWIVGPMFLYLCERLVRFWRSQQKVVITKVVTHPFKTIELQMKKKGFKMEVGQYIFVKCPKVSKLEWHPFTLTSAPEEDFFSIHIRIVGDWTEGLFNACGCDKQEFQDAWKLPKIAVDGPFGTASEDVFSYEVVMLVGAGIGVTPFASILKSVWYKYCNNATNLKLKIYFYWLCRDTHAFEWFADLLQLLESQMQERNNAGFLSYNIYLTGWDESQANHFAVHHDEEKDVITGLKQKTLYGRPNWDNEFKTIASQHPNTRIGVFLCGPEALAETLSKQSISNSESGPRGVHFIFNKENF

Retrieve as FASTA  
Remarks Complete sequence from genomic (chromo X, 12 introns), 8 mRNA and 233 ESTs.
DNA
Send to BLAST
.........1.........2.........3.........4.........5.........6.........7.........8.........9.........0.........1.........2
ATGCTGATTCTCTTGCCAGTCTGTCGAAATCTGCTGTCCTTCCTCAGGGGTTCCAGTGCGGTAAGAGAAAATGTTTTACTAAGTTCCTCTAATTTTCAAAGGCCATCAAGCAAAATGCCC
TTTTTTAGGTAAAAACAAATGAATGATTTGGGAGGATTCCAGCTTCTGTAGAATACTCATGAGCCAAGCCATTATCTAGTATATTTCTGTGCTATTTGGGGATGGAGCTCCCTAAGACAA
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CAGAGTGACCTCCTCAGAAGCTGGTGTTTTGTGAAATTATTTATGTGAAGTAGGGAACATCCTGGCCTAAGTATTAGTGTAAGGCCAGCCACCAGCTGACAGTTGTGTGATGCCTTTTTC
TTTTCTTACCAACAACATCTGAGGGATGGCCTGTGTCTACAGATTGTCATTCCTTGAGAAGCACATGTGCACTGGGAGTAACTCAGCATTTCTCTAGGGGTAGCCAGGAGGGTATCCAGA
AGTAAGAACTTCTTCTATCCCAGCAGTTGTTGAAGCTTCCTACACTCAAAGACAGAAGCTCCAAGTCTTCATGCACCCAATGACTTGGGAAGATGACTAAATCACATTAATATGCACTGA
ATTCTAAAAATGTTTTCTTGTGTTTAGAAAACATCCTTAGTTTTGGAAAAAATAATTATTATTCTCAGACTTACATGAGAAAAACTTGCCTGATATACTTAGGGAGGGAATTAAACAGCA
TCATAAAAAACAGATTTTTTCTACAATATATTGGGTAATTTTTCTTTTACATTATTCATTGTTTGCCCAATGATATATGAGGGTGGCAACATTAACATAACTAGGTAAATCTACACTATC
ATGCTCTATTCAGTTGTTCCTGGATCACTTTTACTGTATCTATGCTCTCCTACTCTTCTAAATGTTTTCATTTTCAATAACCTGTAACTGTTTCCTCCTCAGAGGACTGCCCTGGGGCTA
CTAAAGTCCCTTTTCTCACAGGCTCAGAGATCTTGGAAGGTTGGTGGGGGGTGGCTGAATGGTTACCTGTTCCTGTGCAAACCGTTAGCCAATAACTGGTGGATGCAGACTATGAAACCT
GGCTTCCTTGCCTTGAGACAGGATAAACTCTAAGTTGTAACTTACCCTCCAGAGTTGCCTTGCAGGATCAGGCTGAAGCTATCCCCTGTGAGACTGCCTGATTTCACCCCCTTGCTTGAC
TTGTTTGTCTTTTCTATCCTATTCCCTACTCTCTTACCAGTTTCTCTTGGAGCACATGTTTTCTAAGTCACTTGCCCATGAAGTCTCATCTCAGGATCTGCTTCTGGGGAGCACAGCTGA
TGATGTTCAGCATTCCCAGAATATATTTGCAAACTAAGCACTGTGGCCCTTTCAAAATCAAAGGGAGAAAGAGCCTTCAGACACTTTTAGGACATCCTGTAGTTGATTGATTTCCTTTAT
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GCCTCATATTAATTATCACTTCCTCCACCAAAACCATCCGGAGGTCTTACTTTGAAGTCTTTTGGTACACACATCATCTCTTTGTGATCTTCTTCATTGGCCTTGCCATCCATGGAGCTG
A
GTGAGTGTTTAAATTCTGAAGTGAAGGATTTCATGTCCCTCAATTTCTAGGCAGGATGCTCCATTAGAGGCACAGTGACCTCCTTGCCTGTGTGTGGTTAGCCTGTCTGCTAAGGGAAT
GTGAGAGGATAGCAGAGGTCAGTTTGATAGAAACCAGTCAACATTGGCATTTTTGTTTCATGCACCCATGTAATTGCTATTCATGGTGAAGTTATATATAGCAAGCTTGAAAAATACACC
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AATACAAGCAGGAAAAATATGTGGTTGTTGCCTTCAAACATTCTAATATAATGAAAGTAGCAGCTAACTTCTATTAAGGGTCTGTGCTAAGGGTTTGACATGATATATTTCTTTTAACCC
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TGAGATTGGAGCCAGGCAGTCTAAAGCAGGCTGTGATAAATGTTCTCTTAGAGACACACAGTTCCTGGCTATGTGGTTAGGAGAGTTTGCCTGATTGGAGATCCTCTTTCATACCAAGTT
TCCTTTTTTGTGCAGTTTCATACCACCTGCACACAAAGGCAGGCCTGGGGAAGTTCCCTGGTGGGTATAGGGCTCCAGGAAATTAGGGTTGGAGGAAGTAGAAGCTCAAGACTCACTCTG
CCCAGAGCCCAGTTGGTGGCCAAGACATGACTGTGAAAAAGGGGAAGGGTGGGGAAAGCTGCATTGGGCACTGCATTCTTAAACTACTTGCTGACTGTGACCCCTGATAAACTCTTTGTA
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TCTTCCCCTCTCCAATTTAGTAATTCCACCACTTTCTGTTTGTATGGTTTCGCAGATACTCATCTTCCTTTGAAGCAGACAGAGGAGATATGTTTATCTCCTTCTCCACTTGAAGAGAAT
CTGCTCTTTACACTGGTTAGGTGATTTCTCACAGTCTCATGGCTCCGTAGCAGCTGAATTGGGTTTAAAATGCAGGTTTCTGGACTCCTGGTCCTGGCATTGAGAAGAGAAGGAGAAAAT
CAGATTATTTTCCTATCATTTACTTACCATGGGAACTTAGGCATTTTGAACTTTAATAGTTATTTTTTGGACTCTTACTTTGTGTCTGGCATTTTTTATACATCATGCAAATTGCTTATT
ATAATGAACCTTTAATGAGGTACTATTACATCTGTTTTACAGCTGAAGGAACTGAGGCTCAGAAGAAGTTAAATAATTTGCCTGAGTCCACCAAACTAGTAAGGGGTAGAAATGAGATTT
GAACCCAAGTCTGTCTGACACAAAACACAATTGTTTTCACCAAAACATTCTGCTTTGAGTTACTAAATCATTCTGATTTACATTCTCATGTAAAATGGGGGTAATAATACTTGCCTCTCA
GGCTTGTCATGAGGATTAACTGAGATAATTTGTGTAAAATGACTTTCCCCAAGCCTGGCACATGATAAGTGCTCAATACATGATAATTCTCTTCCCCAAGACCTAAGGATAGAAAGGAGT
GGTTAATGAACTTGAATTAAAACATTCTCAGAATACACCAAATGACACAATAAATTTTAGGTCTCCAAAACAAACCTTTACAATGGGTTTTCTGTGTCTTTTCTTCTTATATATTCTGAA
GATGCTGTCATTTATGTTCCTTGAAGTCTACTCAACGTTGGGCCTTCCTCTCTCTATCACCAATAATTGTCTTATGATTTGGTAGTTGCTCAACTAGCATTTATTGAATTGAAATGAATG
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AACCCACAAATAAGGCACTTCTTGTAAGCTTCAGGGCTACTGTATATGACTGTCTCAGTTGTCTACTATAGTGGGTGCCTGGCCAAGGACAATAAAGTTAGCCCACACTTTGATGATTGA
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Retrieve as FASTA  
CDS
Send to BLAST
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Retrieve as FASTA