Entry information : LePrx65 (Solyc02g064970.2.1[2.3])
Entry ID 597
Creation 2006-05-24 (Christophe Dunand)
Last sequence changes 2014-08-27 (Christophe Dunand)
Sequence status complete
Reviewer Not yet reviewed
Last annotation changes 2014-08-27 (Christophe Dunand)
Peroxidase information: LePrx65 (Solyc02g064970.2.1[2.3])
Name (synonym) LePrx65 (Solyc02g064970.2.1[2.3])
Class Class III peroxidase    [Orthogroup: Prx005]
Taxonomy Eukaryota Viridiplantae Streptophyta Solanaceae Solanum
Organism Lycopersicon esculentum (Tomato)    [TaxId: 4081 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type Roots
Inducer N/D
Repressor N/D
Best BLASTp hits
Perox score E-value LePrx65
start..stop
S start..stop
RcPrx09 516 0 1..323 1..321
CclPrx45 507 0 1..323 1..322
PtPrx78 503 0 1..323 1..321
CsPrx29 499 4e-180 9..323 1..314
Literature and cross-references LePrx65 (Solyc02g064970.2.1[2.3])
Literature van der Hoeven,R., et al, Generation of ESTs from tomato root tissue
Cluster/Prediction ref. UniGene:   Les.12341
Protein sequence: LePrx65 (Solyc02g064970.2.1[2.3])
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   327 (306)
PWM (Da):   %s   35426.75 (33063.4) Transmb domain:   %s   i5-24o
PI (pH):   %s   6.65 (6.99) Peptide Signal:   %s   cut: 21 range:21-326
Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
MENLCLVFLL IVSIVFPVLG QGGLKTGFYS SSCPNAESIV KSTVQAEFDK DPTIAAGLLR LHFHDCFVRG CDGSVLISGS SAERNAVTNT GLRGFEVIDD AKSKLEASCL GVVSCADILA  LAARDAVDLV GGPSWGVPTG RRDGRNSSSS EAMNLPSPFD TVEVQRSKFA AKGLDDHDLV TLVGAHTIGQ TDCRFVSYRL YNFTKTGNAD PSIDQQFLTQ LKTMCPKDGD GSKKVDLDKD 
SQLNFDVSFF KNIRNGNGIL ESDQRLFGDS STKDVVDKYA GSIRGLLGLR FNYNFKQAMI KMSSIEVKTG TDGEIRKVCS RFNHYY* 

Retrieve as FASTA  
Remarks Complete sequence from genomic (chromo 2, 3 introns) and 25 ESTs.
DNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGGAGAATT TGTGTTTGGT TTTTCTTTTG ATAGTATCAA TTGTTTTTCC TGTCCTCGGT CAGGGAGGAC TAAAAACAGG GTTTTATTCA TCTTCATGCC CAAATGCAGA GTCCATAGTG  AAGTCAACAG TTCAAGCAGA GTTTGATAAA GATCCTACAA TTGCTGCTGG TTTACTCAGG CTTCATTTTC ATGATTGCTT TGTTCGGGTA ACTCTCCTTA ATTTCCAGTC TTACATACTA  TACAGAATTA GAATTTTGAG TTTATGCGTT CTGAATTAAA ATACAGTTTA TTAAATTCTT GATAAATTAT GTATACATGT CACGTGGATT CTTAAATATA AATACTAAGA TTTGAGCCAA  AATTTTCAAC CTATAAGCAA AACTCTCAAT TTAGCACAAA TCCTGTATTT GTTTTAAAAG CTAAGTTTCA CTAGTTACTA ATTTCCTCTA TAATTTTCTT TGATGACAAC ATATACAATT  TGTGAACTTA GCTTTTAAGC CTAAAGACAG GAGGATTGTC CAAGCGTTAT AAGAAGTTCA CCCATCTCAT TAACTATCGA TGTGAAATTA GTTTTAGGCC TAACTCGCCC CTAAAAGCTA  AGCTCTAAGT GAGGAGGATT GTCCAAGCCT TACAAAGAGT TCACTCATCT CATTAACCAC CGATGTGAGA CCATTCTTTT AACGCAATTT ATTTTTCAGG GTTGTGATGG TTCTGTTTTG  ATATCTGGAA GCTCAGCTGA AAGAAATGCA GTGACTAATA CGGGACTGAG AGGATTTGAA GTGATTGATG ATGCAAAATC AAAGCTTGAA GCTTCATGCC TTGGCGTTGT CTCTTGTGCT  GATATCCTAG CTTTAGCAGC TCGTGATGCA GTAGACTTGG TAACTAACTA CACAATAACT TTTACTTTCA CAAATTATTA ACCAATTAAC CTACCTATGT TGCTCTGACT CTTTGAAATT  TTCATAATAG AGCGATTGTG ACGTACAATT TGCATGTTTT GGCAAAACTA TATGTTAATA TTTGATGTTG TTGATAGGTT GGAGGTCCAA GCTGGGGAGT ACCTACTGGT AGAAGAGATG  GTAGAAACTC TTCATCCTCA GAAGCAATGA ACTTACCTTC ACCATTTGAC ACAGTTGAGG TCCAGAGGAG CAAGTTTGCA GCTAAAGGCC TCGATGATCA TGATCTCGTC ACCCTTGTTG  GTAAATCTTC ATTCTTCAAC ATACTATATT CTCTCTGTCC TAATTTATAT GACACTCTTT TAATTCCTTT GTTGTCGTCA GTCTAAAAAA AAACTAACAG TTGTCTAAAC TTTCCATTTT  GTTGAAAATA TGTACATGTA GGGGCACATA CAATTGGACA AACGGATTGC AGATTCGTTA GTTATCGACT ATACAACTTT ACAAAAACAG GAAATGCAGA TCCAAGCATA GACCAACAAT  TCTTAACACA ACTTAAGACT ATGTGTCCGA AAGATGGTGA TGGATCGAAG AAGGTTGATT TAGACAAAGA CAGCCAGTTG AATTTTGATG TGAGTTTTTT CAAGAATATT AGAAATGGAA  ATGGGATTCT TGAGTCAGAT CAGAGGTTGT TTGGTGACTC TTCAACAAAA GATGTTGTAG ATAAATATGC AGGGAGTATA AGGGGACTGT TGGGGTTAAG ATTCAATTAT AACTTTAAAC 
AAGCTATGAT TAAAATGAGT AGCATTGAAG TTAAGACTGG CACTGATGGG GAGATTAGAA AAGTGTGTTC CAGGTTCAAT CACTATTATT AA 

Retrieve as FASTA  
CDS
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGGAGAATT TGTGTTTGGT TTTTCTTTTG ATAGTATCAA TTGTTTTTCC TGTCCTCGGT CAGGGAGGAC TAAAAACAGG GTTTTATTCA TCTTCATGCC CAAATGCAGA GTCCATAGTG  AAGTCAACAG TTCAAGCAGA GTTTGATAAA GATCCTACAA TTGCTGCTGG TTTACTCAGG CTTCATTTTC ATGATTGCTT TGTTCGGGGT TGTGATGGTT CTGTTTTGAT ATCTGGAAGC  TCAGCTGAAA GAAATGCAGT GACTAATACG GGACTGAGAG GATTTGAAGT GATTGATGAT GCAAAATCAA AGCTTGAAGC TTCATGCCTT GGCGTTGTCT CTTGTGCTGA TATCCTAGCT  TTAGCAGCTC GTGATGCAGT AGACTTGGTT GGAGGTCCAA GCTGGGGAGT ACCTACTGGT AGAAGAGATG GTAGAAACTC TTCATCCTCA GAAGCAATGA ACTTACCTTC ACCATTTGAC  ACAGTTGAGG TCCAGAGGAG CAAGTTTGCA GCTAAAGGCC TCGATGATCA TGATCTCGTC ACCCTTGTTG GGGCACATAC AATTGGACAA ACGGATTGCA GATTCGTTAG TTATCGACTA  TACAACTTTA CAAAAACAGG AAATGCAGAT CCAAGCATAG ACCAACAATT CTTAACACAA CTTAAGACTA TGTGTCCGAA AGATGGTGAT GGATCGAAGA AGGTTGATTT AGACAAAGAC  AGCCAGTTGA ATTTTGATGT GAGTTTTTTC AAGAATATTA GAAATGGAAA TGGGATTCTT GAGTCAGATC AGAGGTTGTT TGGTGACTCT TCAACAAAAG ATGTTGTAGA TAAATATGCA  GGGAGTATAA GGGGACTGTT GGGGTTAAGA TTCAATTATA ACTTTAAACA AGCTATGATT AAAATGAGTA GCATTGAAGT TAAGACTGGC ACTGATGGGG AGATTAGAAA AGTGTGTTCC 
AGGTTCAATC ACTATTATTA A 

Retrieve as FASTA