Entry information : LePrx12 (Solyc05g046010.2.1[2.3])
Entry ID 605
Creation 2006-01-18 (Christophe Dunand)
Last sequence changes 2014-08-25 (Christophe Dunand)
Sequence status complete
Reviewer Not yet reviewed
Last annotation changes 2014-08-25 (Christophe Dunand)
Peroxidase information: LePrx12 (Solyc05g046010.2.1[2.3])
Name (synonym) LePrx12 (Solyc05g046010.2.1[2.3])
Class Class III peroxidase    [Orthogroup: Prx009]
Taxonomy Eukaryota Viridiplantae Streptophyta Solanaceae Solanum
Organism Lycopersicon esculentum (Tomato)    [TaxId: 4081 ]
Cellular localisation N/D
Tissue types Germinating seeds
Roots
Seeds
Inducers Nutrient deficiency (Al, Zn, P, K, Fe, N)
Salt stress
Repressor N/D
Best BLASTp hits
Perox score E-value LePrx12
start..stop
S start..stop
StPrx49 620 0 1..327 1..327
LePrx100 603 0 1..327 1..327
LePrx33 602 0 1..327 1..327
NtPrx21-1B 559 0 1..327 23..349
Literature and cross-references LePrx12 (Solyc05g046010.2.1[2.3])
Literature The Institute for Genomic Research, TIGR.
Finkers,et al, Saline treated tomato root cDNA library
Protein sequence: LePrx12 (Solyc05g046010.2.1[2.3])
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   328 (306)
PWM (Da):   %s   35878.3 (33458.1)  
PI (pH):   %s   8.25 (8.38) Peptide Signal:   %s   cut: 22 range:22-327
Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
MSTFVYLCPL IFMCILVSSN AQLQQNFYAK SCPKAEKIIL EYVHKHIPNA PSLAAALIRM HFHDCFVRGC DASVLLNFTS SSGSQTEKVG IPNLTLRGFS FIDDIKKIIE AECPGIVSCA  DIISLVARDS IVVIGGPFWN VPTGRRDGTI SIASETLSDI PSPFSNFSTL QNDFAKKGLD LKDLVLLSGA HTIGVSLCTS FSNRLYNFTG TFGTQDPSLD SEYAANLKAN KCKSINDNTT 
IVEMDPGSFK TFDLSYYKLL LKRRGLFQSD AALTTSTTTK RYIDQLVAGS LKEFYVKFAQ SMEKMGRIEV KTGSTGEIRK HCAVVNS* 

Retrieve as FASTA  
Remarks Complete sequence from genomic (chromo 5, 3 introns) and 6 ESTs. .
DNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGTCTACAT TTGTGTATTT GTGTCCTCTA ATATTTATGT GTATCTTAGT GTCTAGCAAT GCTCAATTAC AACAAAACTT CTATGCCAAG AGTTGTCCAA AAGCAGAGAA GATCATTTTA  GAGTATGTCC ATAAACACAT TCCAAATGCA CCATCTCTTG CTGCTGCCTT AATCAGAATG CATTTCCACG ATTGCTTTGT TAGGGTAATT ATAATTACTT TATCCATTTC AACTTTCTTA  TCTTATTTTT TCTAAATTTT GTTTCAAAAT GATTTTCCTT TTTATATCTA GTATTCTCTC TGCTTCAGTT TTTTTTTAGT CTGTTTAAAA AATAATGTTT TTTGTTTTTC TTTTTTGACA  ACTTTTAATT TTAACTTTGC ACATTACATA TTTATGATGA TAAGTTTAAA GGATATTTAA ATACATTCTA CATATCATTA GTTTAAATTC ACTAGATTTA AGTTAAAATT AAACAAATAA  ATTAAAATAT GGAAAGTAAC TTTTTTAACT TCAACATCTC ATATAACATG TTTAAGATTA TAAGATTCAA TAACACTACA ATGTATTTCG CATTTCTTTA ATTAAAGATT ATAAGATGTA  AAAGTATTTA AAAAAAAAAA AGAATCTTGT CTAGTAAAAC TAAGATGCAA AAAATGAAGT ACTATATATG TGTTGTATTA ATTGTTTCAC TAATTGCATT ATTGATGTAG TTCTATTTTT  TTTTGTGTGT GGTGATTGAA GGGATGTGAC GCATCTGTGC TCTTGAATTT TACTTCAAGT TCTGGAAGTC AAACTGAAAA AGTTGGTATC CCAAATCTAA CACTTAGAGG ATTTTCATTT  ATTGATGATA TCAAGAAAAT AATTGAAGCT GAATGTCCTG GGATTGTGTC ATGTGCTGAT ATTATCTCAT TGGTTGCTAG AGACTCTATT GTGGTCATAG TAAGTTAACA ACTTGAACTA  TCTAATTTTC AATTTATCAA ACCGTATTAT ATATATTTTT TTATATAATC TTATGCATGA CATATACATA TAGGGAGGTC CTTTTTGGAA TGTACCAACC GGAAGAAGAG ATGGAACAAT  CTCTATTGCT TCAGAAACTT TATCAGACAT ACCATCACCA TTTAGTAACT TTTCTACTCT CCAAAATGAT TTTGCTAAGA AGGGTCTTGA CCTCAAAGAC TTGGTCCTAT TATCTGGTAA  GTCAAAATTA TTACTTCCTT CGTTTCATTA GATGTGACAC ATTTGACTAA GTTTGAAATT TAAGAATTAA AGGAATAGTA CTCTTACAAT GTTTCAGGTG CTCATACTAT TGGAGTCTCT  CTTTGCACGT CATTTTCAAA CCGTCTATAC AATTTTACTG GAACTTTTGG TACTCAAGAT CCATCTCTAG ACAGCGAATA TGCAGCTAAC TTGAAGGCTA ATAAATGTAA ATCAATCAAC  GATAACACAA CAATAGTTGA GATGGATCCA GGGAGTTTCA AGACATTTGA TCTTAGCTAT TACAAGCTTT TACTCAAAAG AAGAGGACTC TTCCAATCTG ATGCAGCCCT AACAACAAGT  ACAACAACAA AGAGATACAT TGATCAACTT GTCGCGGGAT CACTTAAAGA GTTCTATGTT AAATTTGCTC AATCGATGGA GAAAATGGGA AGGATTGAAG TTAAAACAGG CTCAACTGGT 
GAAATTAGGA AGCATTGTGC AGTAGTGAAT AGTTAA 

Retrieve as FASTA  
CDS
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGTCTACAT TTGTGTATTT GTGTCCTCTA ATATTTATGT GTATCTTAGT GTCTAGCAAT GCTCAATTAC AACAAAACTT CTATGCCAAG AGTTGTCCAA AAGCAGAGAA GATCATTTTA  GAGTATGTCC ATAAACACAT TCCAAATGCA CCATCTCTTG CTGCTGCCTT AATCAGAATG CATTTCCACG ATTGCTTTGT TAGGGGATGT GACGCATCTG TGCTCTTGAA TTTTACTTCA  AGTTCTGGAA GTCAAACTGA AAAAGTTGGT ATCCCAAATC TAACACTTAG AGGATTTTCA TTTATTGATG ATATCAAGAA AATAATTGAA GCTGAATGTC CTGGGATTGT GTCATGTGCT  GATATTATCT CATTGGTTGC TAGAGACTCT ATTGTGGTCA TAGGAGGTCC TTTTTGGAAT GTACCAACCG GAAGAAGAGA TGGAACAATC TCTATTGCTT CAGAAACTTT ATCAGACATA  CCATCACCAT TTAGTAACTT TTCTACTCTC CAAAATGATT TTGCTAAGAA GGGTCTTGAC CTCAAAGACT TGGTCCTATT ATCTGGTGCT CATACTATTG GAGTCTCTCT TTGCACGTCA  TTTTCAAACC GTCTATACAA TTTTACTGGA ACTTTTGGTA CTCAAGATCC ATCTCTAGAC AGCGAATATG CAGCTAACTT GAAGGCTAAT AAATGTAAAT CAATCAACGA TAACACAACA  ATAGTTGAGA TGGATCCAGG GAGTTTCAAG ACATTTGATC TTAGCTATTA CAAGCTTTTA CTCAAAAGAA GAGGACTCTT CCAATCTGAT GCAGCCCTAA CAACAAGTAC AACAACAAAG  AGATACATTG ATCAACTTGT CGCGGGATCA CTTAAAGAGT TCTATGTTAA ATTTGCTCAA TCGATGGAGA AAATGGGAAG GATTGAAGTT AAAACAGGCT CAACTGGTGA AATTAGGAAG 
CATTGTGCAG TAGTGAATAG TTAA 

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