Entry information : LePrx19 (Solyc09g072700.2.1[2.3])
Entry ID 617
Creation 2005-06-14 (Christophe Dunand)
Last sequence changes 2014-08-25 (Christophe Dunand)
Sequence status complete
Reviewer Not yet reviewed
Last annotation changes 2014-08-25 (Christophe Dunand)
Peroxidase information: LePrx19 (Solyc09g072700.2.1[2.3])
Name (synonym) LePrx19 (Solyc09g072700.2.1[2.3])
Class Class III peroxidase    [Orthogroup: Prx018]
Taxonomy Eukaryota Viridiplantae Streptophyta Solanaceae Solanum
Organism Lycopersicon esculentum (Tomato)    [TaxId: 4081 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type Flower buds
Inducer N/D
Repressor N/D
Best BLASTp hits
Perox score E-value LePrx19
start..stop
S start..stop
StPrx07 625 0 4..328 1..323
NtPrx28-1B 538 0 17..327 5..317
RcPrx60 414 2e-146 31..328 21..319
PpePrx32 409 1e-144 31..321 22..318
Literature and cross-references LePrx19 (Solyc09g072700.2.1[2.3])
Literature van der Hoeven,R.S. et al., unpublished
Protein sequence: LePrx19 (Solyc09g072700.2.1[2.3])
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   329 (299)
PWM (Da):   %s   35658.33 (32278.6) Transmb domain:   %s   i7-29o
PI (pH):   %s   8.84 (8.74) Peptide Signal:   %s   cut: 30 range:30-328
Sequence
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Send to Peroxiscan
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
MNIMKMKMIL SSLIGLLLFY CCVIHLVSAQ LQVGFYNSTC PQTETIVRQA VQNQFNSDPS ITAALLRMHF HDCFVRGCDA SILIKSTGSK KSEREAGPNK TVRGYELIDK IKKTLETSCP  STVSCADIIT LATRDSVALA GGPNYPIPTG RRDGLISNIA DVNLPGPSLT IPQALQFFTN KGLTLNDMVT LLGAHTVGIA HCNFFQGRLS PVPDKTMDPT LAAQLLKTCT KSSATAFLDQ 
NTSFSVDNEY YRQITLRKGI LTIDQELTLD KSSAPIVTSF AANKDVFSQS FANAMIKMAN IDVLVGSAGE IRKNCGVFNQ KANRKVVN* 

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Remarks Complete sequence from genomic (chromo 9, intron 1) and 6 ESTs.
DNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGAACATCA TGAAGATGAA AATGATATTA TCATCATTAA TAGGATTATT ATTATTTTAT TGTTGTGTAA TCCATTTAGT TTCAGCCCAA CTTCAAGTTG GTTTTTACAA TTCAACATGT  CCACAAACTG AAACTATTGT TAGACAAGCT GTGCAAAATC AGTTCAATAG TGACCCTTCC ATCACTGCAG CTTTGCTTCG CATGCATTTT CATGATTGCT TTGTTAGAGT AAGTCTACTA  CTTTATGTTT TTAGCGAAGG AATCAGGATT ATTAATAAGT GATTCAGAAT ATGAATAAGT AAACACATAC GAACTAGTGA AGAGAATTTG TATTTTGATT ATATATACAT AAAATATAGT  CATAATATTA CATGTTTACT AACTGAGAAT ACCATTGCAA CATTTTTTTG TGAAATAAAT TGCACAAAAT TATATCTTTA CTCAGCATCA CTTCATGTCT TAGTTCTATA TGTCTCTCAA  AACTATAATT TTTATTTTAT TTTTTCTTTG AAATGCATAT TTATTCTTAT ATTATCAATC TATCTTCTTC TTCTTTTTAA CTTCTTTAAC ATTAATATAT TTTTCATTTT TTATTCAAGG  TAACAAATTC TATGTATGTA GCATAGAATA TAAAGGGATG AGAATGTCAA TATTTCAAAA CTCAGGGGTA TATACGTAAT TTAAGAGCGT AAATGATTTT CACCAAAAAA GGAACCAATG  TCATAATACA ATTTGGAATT TCAGTAATGT TTAAGAAATT ACATGAATAT TCATAAAAAA AAAATAGATA TGTGATTCGC GCACATCCCA CTTTTTTATT CAAATCCCTA CTTATAAAAT  TACCTTAGTG TATATTGTTT ACATGATTAT GTTCCTAAAA ATGTAACTTG ATTTTAGGGA TGTGACGCAT CGATACTCAT AAAGTCAACA GGTTCTAAGA AATCGGAGAG AGAAGCTGGC  CCAAACAAAA CGGTACGAGG GTACGAGTTA ATCGATAAAA TCAAGAAAAC CCTAGAAACA TCTTGTCCAT CAACAGTTTC ATGTGCTGAC ATAATAACAC TAGCAACTAG AGACTCTGTA  GCATTAGCTG GAGGCCCAAA TTATCCAATT CCAACAGGTA GACGTGATGG GCTAATTTCA AATATAGCAG ATGTAAATTT ACCAGGCCCA TCATTAACAA TTCCACAAGC ACTCCAATTT  TTCACAAATA AAGGACTTAC TTTAAATGAC ATGGTGACAT TATTAGGCGC TCATACGGTT GGAATCGCAC ATTGTAATTT TTTCCAAGGT AGGCTATCGC CCGTACCTGA TAAGACTATG  GATCCTACGT TAGCGGCTCA ACTATTGAAA ACTTGTACTA AAAGTTCTGC AACGGCGTTT CTGGATCAAA ATACGTCGTT TAGTGTTGAT AATGAGTATT ACAGACAAAT TACGTTACGT  AAAGGTATAT TGACGATCGA TCAAGAGCTT ACGTTGGATA AGTCAAGTGC TCCAATTGTT ACAAGTTTTG CAGCTAATAA GGATGTATTT AGCCAAAGTT TTGCAAATGC GATGATAAAA 
ATGGCAAATA TTGATGTTTT AGTGGGGAGT GCTGGAGAAA TTAGGAAAAA TTGTGGGGTT TTTAATCAAA AGGCTAATCG CAAGGTTGTT AATTAG 

Retrieve as FASTA  
CDS
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGAACATCA TGAAGATGAA AATGATATTA TCATCATTAA TAGGATTATT ATTATTTTAT TGTTGTGTAA TCCATTTAGT TTCAGCCCAA CTTCAAGTTG GTTTTTACAA TTCAACATGT  CCACAAACTG AAACTATTGT TAGACAAGCT GTGCAAAATC AGTTCAATAG TGACCCTTCC ATCACTGCAG CTTTGCTTCG CATGCATTTT CATGATTGCT TTGTTAGAGG ATGTGACGCA  TCGATACTCA TAAAGTCAAC AGGTTCTAAG AAATCGGAGA GAGAAGCTGG CCCAAACAAA ACGGTACGAG GGTACGAGTT AATCGATAAA ATCAAGAAAA CCCTAGAAAC ATCTTGTCCA  TCAACAGTTT CATGTGCTGA CATAATAACA CTAGCAACTA GAGACTCTGT AGCATTAGCT GGAGGCCCAA ATTATCCAAT TCCAACAGGT AGACGTGATG GGCTAATTTC AAATATAGCA  GATGTAAATT TACCAGGCCC ATCATTAACA ATTCCACAAG CACTCCAATT TTTCACAAAT AAAGGACTTA CTTTAAATGA CATGGTGACA TTATTAGGCG CTCATACGGT TGGAATCGCA  CATTGTAATT TTTTCCAAGG TAGGCTATCG CCCGTACCTG ATAAGACTAT GGATCCTACG TTAGCGGCTC AACTATTGAA AACTTGTACT AAAAGTTCTG CAACGGCGTT TCTGGATCAA  AATACGTCGT TTAGTGTTGA TAATGAGTAT TACAGACAAA TTACGTTACG TAAAGGTATA TTGACGATCG ATCAAGAGCT TACGTTGGAT AAGTCAAGTG CTCCAATTGT TACAAGTTTT  GCAGCTAATA AGGATGTATT TAGCCAAAGT TTTGCAAATG CGATGATAAA AATGGCAAAT ATTGATGTTT TAGTGGGGAG TGCTGGAGAA ATTAGGAAAA ATTGTGGGGT TTTTAATCAA 
AAGGCTAATC GCAAGGTTGT TAATTAG 

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