Entry information : LePrx20 (Solyc06g076630.2.1[2.3])
Entry ID 618
Creation 2005-06-14 (Christophe Dunand)
Last sequence changes 2014-08-25 (Christophe Dunand)
Sequence status complete
Reviewer Not yet reviewed
Last annotation changes 2014-08-25 (Christophe Dunand)
Peroxidase information: LePrx20 (Solyc06g076630.2.1[2.3])
Name (synonym) LePrx20 (Solyc06g076630.2.1[2.3])
Class Class III peroxidase    [Orthogroup: Prx029]
Taxonomy Eukaryota Viridiplantae Streptophyta Solanaceae Solanum
Organism Lycopersicon esculentum (Tomato)    [TaxId: 4081 ]
Cellular localisation N/D
Tissue types Callus
Roots
Inducer N/D
Repressor N/D
Best BLASTp hits
Perox score E-value LePrx20
start..stop
S start..stop
NtPrx07-1A 568 0 1..317 1..328
NtPrx07-1B 563 0 1..317 1..317
InPrx04 501 0 1..316 1..323
MguPrx56 488 3e-176 8..317 1..305
Literature and cross-references LePrx20 (Solyc06g076630.2.1[2.3])
Literature van der Hoeven,R.S. et al., unpublished
Protein sequence: LePrx20 (Solyc06g076630.2.1[2.3])
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   318
PWM (Da):   %s   35159.29  
PI (pH):   %s   6.09
Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
MGKYELFMVI LLVSGYGFVD GLRMDYYFMM GCPFAEGIVK NIVNRHLQAD PTLAAALVRM HFHDCFVQGC DASVLIDSTK GNTAEKDSPA NLSVRGYEVI DEVKEQLEIQ CPGVVSCADI  LAMAARDAVF FAGGPVYDIP KGRKDGTRSR IEDTINLPPP TLNSSELIRL FGQHGFTAQE MVALSGAHTL GVARCSSFKH RLSNFDSTHD VDPTLDAQFA KTLSKRCANS DKSEQAFDNT 
KDSFDNDYYY GLQRNTGVLF SDQTLYNHPR TRGIVNAYAF NQAMFFLDFQ QAMIKMGLLD VKEGSKGEVR ANCRIIN* 

Retrieve as FASTA  
Remarks Complete sequence from genomic (chromo 6, 3 introns and extra intron in 5'UTR) and 4 ESTs.
DNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGGGGAAGT ATGAGTTGTT TATGGTGATA TTACTGGTGA GTGGATATGG TTTTGTTGAT GGTCTGAGAA TGGATTATTA TTTCATGATG GGTTGCCCAT TTGCTGAGGG AATAGTGAAG  AACATTGTGA ATAGGCATTT GCAAGCTGAT CCTACTCTTG CTGCTGCCCT TGTCAGGATG CACTTCCACG ATTGCTTTGT TCAGGTAACT AAAGTATTAC TTTAACATGC ATGAGATCGA  GTTGAGACAT GAAATTTTTG TTTGTCTTGA AAGGGATGTG ATGCGTCGGT GTTGATTGAT TCAACAAAGG GTAACACAGC AGAAAAGGAT TCGCCAGCAA ATTTAAGCGT AAGAGGCTAT  GAAGTCATTG ATGAAGTCAA GGAACAACTC GAAATCCAAT GCCCTGGAGT CGTTTCTTGT GCTGATATTC TTGCCATGGC TGCAAGGGAT GCTGTCTTCT TTGTAAGATA TATATATATA  TATATTCATC TCTCTCTATA TACGAATAAT TAAATTAATT GTTATGTATA TATATGCTAG GCTGGAGGTC CAGTGTATGA CATACCAAAA GGAAGAAAGG ATGGAACAAG ATCAAGAATA  GAGGACACAA TCAATCTACC TCCTCCCACA CTTAATAGTT CTGAACTTAT CAGATTGTTT GGCCAACATG GCTTCACTGC TCAAGAGATG GTGGCTCTAT CTGGTAAAAT ATTTGTCATA  CATACATACA TACATATATA TATGAATTAG GGTTATTAAT CTATGTGATG AATATATAGG GGCACATACA CTAGGAGTGG CAAGATGCTC ATCATTCAAG CATAGATTGA GTAACTTTGA  CTCAACCCAT GATGTGGATC CAACTTTGGA TGCCCAATTT GCCAAGACTC TATCAAAAAG ATGCGCTAAT AGTGACAAGT CTGAGCAGGC CTTTGACAAC ACAAAAGATA GTTTTGACAA  TGACTACTAT TATGGTTTAC AAAGAAACAC TGGTGTCCTC TTCTCAGATC AAACTCTTTA CAACCACCCT AGAACTAGAG GCATTGTAAA TGCTTATGCC TTTAATCAAG CTATGTTCTT 
CCTTGATTTT CAACAAGCCA TGATTAAAAT GGGGTTACTT GATGTCAAAG AAGGCTCCAA GGGTGAAGTG CGAGCCAACT GTCGTATCAT CAATTGA 

Retrieve as FASTA  
CDS
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGGGGAAGT ATGAGTTGTT TATGGTGATA TTACTGGTGA GTGGATATGG TTTTGTTGAT GGTCTGAGAA TGGATTATTA TTTCATGATG GGTTGCCCAT TTGCTGAGGG AATAGTGAAG  AACATTGTGA ATAGGCATTT GCAAGCTGAT CCTACTCTTG CTGCTGCCCT TGTCAGGATG CACTTCCACG ATTGCTTTGT TCAGGGATGT GATGCGTCGG TGTTGATTGA TTCAACAAAG  GGTAACACAG CAGAAAAGGA TTCGCCAGCA AATTTAAGCG TAAGAGGCTA TGAAGTCATT GATGAAGTCA AGGAACAACT CGAAATCCAA TGCCCTGGAG TCGTTTCTTG TGCTGATATT  CTTGCCATGG CTGCAAGGGA TGCTGTCTTC TTTGCTGGAG GTCCAGTGTA TGACATACCA AAAGGAAGAA AGGATGGAAC AAGATCAAGA ATAGAGGACA CAATCAATCT ACCTCCTCCC  ACACTTAATA GTTCTGAACT TATCAGATTG TTTGGCCAAC ATGGCTTCAC TGCTCAAGAG ATGGTGGCTC TATCTGGGGC ACATACACTA GGAGTGGCAA GATGCTCATC ATTCAAGCAT  AGATTGAGTA ACTTTGACTC AACCCATGAT GTGGATCCAA CTTTGGATGC CCAATTTGCC AAGACTCTAT CAAAAAGATG CGCTAATAGT GACAAGTCTG AGCAGGCCTT TGACAACACA  AAAGATAGTT TTGACAATGA CTACTATTAT GGTTTACAAA GAAACACTGG TGTCCTCTTC TCAGATCAAA CTCTTTACAA CCACCCTAGA ACTAGAGGCA TTGTAAATGC TTATGCCTTT 
AATCAAGCTA TGTTCTTCCT TGATTTTCAA CAAGCCATGA TTAAAATGGG GTTACTTGAT GTCAAAGAAG GCTCCAAGGG TGAAGTGCGA GCCAACTGTC GTATCATCAA TTGA 

Retrieve as FASTA